MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chloroflexus aggregans DSM 9485 chromosome

Total Repeats: 82252

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_011831	CG	3	6	614358	614363	0 %	0 %	50 %	50 %	219847438
11002	NC_011831	TCG	2	6	614420	614425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847439
11003	NC_011831	GCA	2	6	614494	614499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847439
11004	NC_011831	TCGC	2	8	614522	614529	0 %	25 %	25 %	50 %	219847439
11005	NC_011831	GATG	2	8	614578	614585	25 %	25 %	50 %	0 %	219847439
11006	NC_011831	GGT	2	6	614634	614639	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219847439
11007	NC_011831	GTCAC	2	10	614651	614660	20 %	20 %	20 %	40 %	219847439
11008	NC_011831	GAGC	2	8	614674	614681	25 %	0 %	50 %	25 %	219847439
11009	NC_011831	GATT	2	8	614718	614725	25 %	50 %	25 %	0 %	219847439
11010	NC_011831	CAC	2	6	615028	615033	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219847440
11011	NC_011831	CGG	2	6	615209	615214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847440
11012	NC_011831	GAAC	2	8	615226	615233	50 %	0 %	25 %	25 %	219847440
11013	NC_011831	CCT	2	6	615255	615260	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219847440
11014	NC_011831	GTG	2	6	615326	615331	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219847440
11015	NC_011831	GTA	2	6	615353	615358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847440
11016	NC_011831	CAC	2	6	615397	615402	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219847440
11017	NC_011831	GTC	2	6	615418	615423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847440
11018	NC_011831	GATC	2	8	615426	615433	25 %	25 %	25 %	25 %	219847440
11019	NC_011831	CG	3	6	615472	615477	0 %	0 %	50 %	50 %	219847440
11020	NC_011831	GGC	2	6	615559	615564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847440
11021	NC_011831	CGTG	2	8	615768	615775	0 %	25 %	50 %	25 %	219847440
11022	NC_011831	CGT	2	6	616019	616024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847441
11023	NC_011831	TGA	2	6	616049	616054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847441
11024	NC_011831	ATC	2	6	616074	616079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847441
11025	NC_011831	TGG	2	6	616091	616096	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219847441
11026	NC_011831	ACC	2	6	616127	616132	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219847441
11027	NC_011831	CCT	2	6	616196	616201	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219847441
11028	NC_011831	GCGAC	2	10	616255	616264	20 %	0 %	40 %	40 %	219847441
11029	NC_011831	ATC	2	6	616284	616289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847441
11030	NC_011831	GCC	2	6	616305	616310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219847441
11031	NC_011831	GCT	2	6	616311	616316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847441
11032	NC_011831	CTG	2	6	616348	616353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847441
11033	NC_011831	CCAA	2	8	616779	616786	50 %	0 %	0 %	50 %	219847442
11034	NC_011831	CGG	2	6	616840	616845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847442
11035	NC_011831	GCC	2	6	616850	616855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219847442
11036	NC_011831	CGCAA	2	10	617006	617015	40 %	0 %	20 %	40 %	219847442
11037	NC_011831	CGC	2	6	617054	617059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219847442
11038	NC_011831	GCA	2	6	617115	617120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847442
11039	NC_011831	CTT	2	6	617128	617133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219847442
11040	NC_011831	AAT	2	6	617138	617143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219847442
11041	NC_011831	TCC	2	6	617208	617213	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219847442
11042	NC_011831	CTG	2	6	617215	617220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847442
11043	NC_011831	TGC	2	6	617257	617262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847442
11044	NC_011831	GTT	2	6	617279	617284	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219847442
11045	NC_011831	GGT	2	6	617285	617290	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219847442
11046	NC_011831	CGC	2	6	617348	617353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219847442
11047	NC_011831	CAAC	2	8	617403	617410	50 %	0 %	0 %	50 %	219847442
11048	NC_011831	TCA	2	6	617512	617517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847442
11049	NC_011831	GCG	2	6	617586	617591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847442
11050	NC_011831	GTG	2	6	617628	617633	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219847442
11051	NC_011831	ACACC	2	10	617648	617657	40 %	0 %	0 %	60 %	219847442
11052	NC_011831	CGG	2	6	617667	617672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847442
11053	NC_011831	CGAG	2	8	617674	617681	25 %	0 %	50 %	25 %	219847442
11054	NC_011831	TGC	2	6	617817	617822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847442
11055	NC_011831	GGTT	2	8	617906	617913	0 %	50 %	50 %	0 %	219847442
11056	NC_011831	GGCT	2	8	617924	617931	0 %	25 %	50 %	25 %	219847442
11057	NC_011831	GTC	2	6	618065	618070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847442
11058	NC_011831	ATG	2	6	618075	618080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847442
11059	NC_011831	ATC	2	6	618097	618102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847442
11060	NC_011831	ATC	2	6	618151	618156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847443
11061	NC_011831	CCA	2	6	618165	618170	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219847443
11062	NC_011831	GTG	2	6	618179	618184	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219847443
11063	NC_011831	AAC	2	6	618236	618241	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219847443
11064	NC_011831	CAA	2	6	618366	618371	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219847443
11065	NC_011831	GATC	2	8	618459	618466	25 %	25 %	25 %	25 %	219847443
11066	NC_011831	CAA	2	6	618574	618579	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219847443
11067	NC_011831	CGT	2	6	618602	618607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847443
11068	NC_011831	CGTAC	2	10	618979	618988	20 %	20 %	20 %	40 %	219847444
11069	NC_011831	ATC	3	9	619003	619011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847444
11070	NC_011831	CCACC	2	10	619142	619151	20 %	0 %	0 %	80 %	219847444
11071	NC_011831	CGC	2	6	619176	619181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219847444
11072	NC_011831	CCAA	2	8	619199	619206	50 %	0 %	0 %	50 %	219847444
11073	NC_011831	CTT	2	6	619254	619259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219847444
11074	NC_011831	CGA	2	6	619263	619268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847444
11075	NC_011831	GGCC	2	8	619317	619324	0 %	0 %	50 %	50 %	219847444
11076	NC_011831	AGCGC	2	10	619351	619360	20 %	0 %	40 %	40 %	219847444
11077	NC_011831	GCAC	2	8	619384	619391	25 %	0 %	25 %	50 %	219847444
11078	NC_011831	TCA	2	6	619463	619468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847444
11079	NC_011831	CAAT	2	8	619484	619491	50 %	25 %	0 %	25 %	219847444
11080	NC_011831	GCC	2	6	619838	619843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219847445
11081	NC_011831	GCA	2	6	619852	619857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847445
11082	NC_011831	CAA	2	6	619863	619868	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219847445
11083	NC_011831	TGG	2	6	619925	619930	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219847445
11084	NC_011831	ACA	2	6	619960	619965	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219847445
11085	NC_011831	CGA	2	6	619989	619994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847445
11086	NC_011831	TAC	2	6	620002	620007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847445
11087	NC_011831	GCT	3	9	620386	620394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847445
11088	NC_011831	GTTT	2	8	620468	620475	0 %	75 %	25 %	0 %	219847445
11089	NC_011831	GCA	2	6	620488	620493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847445
11090	NC_011831	TCTG	2	8	620761	620768	0 %	50 %	25 %	25 %	219847446
11091	NC_011831	TTG	2	6	620784	620789	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219847446
11092	NC_011831	CAA	3	9	620824	620832	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219847446
11093	NC_011831	TGCG	2	8	620898	620905	0 %	25 %	50 %	25 %	219847446
11094	NC_011831	AGC	2	6	620958	620963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847446
11095	NC_011831	TCGGTG	2	12	620976	620987	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	219847446
11096	NC_011831	GAC	2	6	621084	621089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847446
11097	NC_011831	CCG	2	6	621161	621166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219847446
11098	NC_011831	GC	3	6	621285	621290	0 %	0 %	50 %	50 %	219847446
11099	NC_011831	GCC	2	6	621297	621302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219847446
11100	NC_011831	CCG	2	6	621303	621308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219847446
11101	NC_011831	GGCT	2	8	621342	621349	0 %	25 %	50 %	25 %	219847446
11102	NC_011831	CCG	2	6	621357	621362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219847446
11103	NC_011831	TGG	2	6	621402	621407	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219847446
11104	NC_011831	GAC	2	6	621463	621468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847446
11105	NC_011831	TAA	2	6	621493	621498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219847446
11106	NC_011831	TGG	2	6	621528	621533	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219847446
11107	NC_011831	AG	3	6	621571	621576	50 %	0 %	50 %	0 %	219847446
11108	NC_011831	ATC	2	6	621602	621607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847446
11109	NC_011831	GGT	2	6	621616	621621	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219847446
11110	NC_011831	CCG	2	6	621823	621828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219847446
11111	NC_011831	TTGGG	2	10	621984	621993	0 %	40 %	60 %	0 %	219847446
11112	NC_011831	TGG	2	6	622079	622084	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219847446
11113	NC_011831	CGG	2	6	622113	622118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847446
11114	NC_011831	ACA	2	6	622135	622140	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219847446
11115	NC_011831	TGG	2	6	622223	622228	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219847447
11116	NC_011831	CTG	2	6	622241	622246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847447
11117	NC_011831	ACC	2	6	622292	622297	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219847447
11118	NC_011831	TAC	2	6	622390	622395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847447
11119	NC_011831	CCG	2	6	622422	622427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219847447
11120	NC_011831	TGC	2	6	622749	622754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847447
11121	NC_011831	CGC	2	6	622780	622785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219847447
11122	NC_011831	CTA	2	6	622797	622802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847447
11123	NC_011831	GCT	2	6	622837	622842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847447
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11125	NC_011831	CTG	2	6	622920	622925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847447
11126	NC_011831	TGA	2	6	622933	622938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847447
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11210	NC_011831	TGGG	2	8	629449	629456	0 %	25 %	75 %	0 %	219847452
11211	NC_011831	CT	3	6	629632	629637	0 %	50 %	0 %	50 %	219847452
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11220	NC_011831	GCCGC	2	10	630279	630288	0 %	0 %	40 %	60 %	219847452
11221	NC_011831	TGGCCG	2	12	630292	630303	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	219847452
11222	NC_011831	ACA	2	6	630435	630440	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219847453
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11224	NC_011831	CGA	2	6	630503	630508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847453
11225	NC_011831	AGC	2	6	630520	630525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847453
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11227	NC_011831	GCT	2	6	630660	630665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847453
11228	NC_011831	AAG	2	6	630697	630702	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219847453
11229	NC_011831	GGCC	2	8	630755	630762	0 %	0 %	50 %	50 %	219847453
11230	NC_011831	GC	3	6	630810	630815	0 %	0 %	50 %	50 %	219847453
11231	NC_011831	GC	3	6	630880	630885	0 %	0 %	50 %	50 %	219847453
11232	NC_011831	ATT	2	6	630898	630903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219847453
11233	NC_011831	CAGA	2	8	630913	630920	50 %	0 %	25 %	25 %	219847453
11234	NC_011831	TGC	2	6	630971	630976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847453
11235	NC_011831	TCG	2	6	631021	631026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847453
11236	NC_011831	GC	3	6	631030	631035	0 %	0 %	50 %	50 %	219847453
11237	NC_011831	CGAC	2	8	631062	631069	25 %	0 %	25 %	50 %	219847453
11238	NC_011831	ACT	2	6	631133	631138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847453
11239	NC_011831	GGC	2	6	631266	631271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847453
11240	NC_011831	TTATC	2	10	631293	631302	20 %	60 %	0 %	20 %	219847453
11241	NC_011831	GCT	2	6	631450	631455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847453
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11243	NC_011831	AAT	2	6	631500	631505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219847453
11244	NC_011831	CGG	2	6	631566	631571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847453
11245	NC_011831	GAT	2	6	631575	631580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847453
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11247	NC_011831	GAAT	2	8	631707	631714	50 %	25 %	25 %	0 %	219847453
11248	NC_011831	AAG	2	6	631781	631786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219847453
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11251	NC_011831	GCT	2	6	632009	632014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847453
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11340	NC_011831	TGC	2	6	636873	636878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847456
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11344	NC_011831	GC	3	6	637108	637113	0 %	0 %	50 %	50 %	219847456
11345	NC_011831	ACC	2	6	637137	637142	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219847456
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11351	NC_011831	TAAA	2	8	637441	637448	75 %	25 %	0 %	0 %	219847457
11352	NC_011831	GAG	2	6	637487	637492	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219847457
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11354	NC_011831	CTA	2	6	637527	637532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847458
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11476	NC_011831	AGC	3	9	643452	643460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847463
11477	NC_011831	CAC	2	6	643576	643581	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219847464
11478	NC_011831	TA	3	6	643650	643655	50 %	50 %	0 %	0 %	219847464
11479	NC_011831	GCAC	2	8	643682	643689	25 %	0 %	25 %	50 %	219847464
11480	NC_011831	GTGG	2	8	643801	643808	0 %	25 %	75 %	0 %	219847464
11481	NC_011831	C	6	6	643824	643829	0 %	0 %	0 %	100 %	219847464
11482	NC_011831	TGC	2	6	643832	643837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847464
11483	NC_011831	CCG	2	6	643852	643857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219847464
11484	NC_011831	GGTT	2	8	643891	643898	0 %	50 %	50 %	0 %	219847464
11485	NC_011831	GC	4	8	643934	643941	0 %	0 %	50 %	50 %	219847464
11486	NC_011831	CACG	2	8	644043	644050	25 %	0 %	25 %	50 %	219847464
11487	NC_011831	GCT	2	6	644112	644117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847464
11488	NC_011831	CAA	2	6	644179	644184	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219847464
11489	NC_011831	GTC	2	6	644231	644236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847464
11490	NC_011831	CAC	2	6	644277	644282	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219847464
11491	NC_011831	CGGAT	2	10	644544	644553	20 %	20 %	40 %	20 %	219847465
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11493	NC_011831	CGGA	2	8	644660	644667	25 %	0 %	50 %	25 %	219847465
11494	NC_011831	TCT	2	6	644859	644864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219847466
11495	NC_011831	GTC	2	6	644879	644884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847466
11496	NC_011831	AAC	2	6	644933	644938	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219847466
11497	NC_011831	CTG	2	6	644981	644986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847466
11498	NC_011831	GTT	2	6	644993	644998	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219847466
11499	NC_011831	CTCG	2	8	645001	645008	0 %	25 %	25 %	50 %	219847466
11500	NC_011831	GCA	2	6	645021	645026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847466

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