MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chloroflexus aggregans DSM 9485 chromosome

Total Repeats: 82252

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_011831	AC	3	6	548763	548768	50 %	0 %	0 %	50 %	219847389
10002	NC_011831	GC	3	6	548802	548807	0 %	0 %	50 %	50 %	219847389
10003	NC_011831	GTA	2	6	548875	548880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847389
10004	NC_011831	AGC	2	6	548882	548887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847389
10005	NC_011831	ACC	2	6	548900	548905	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219847389
10006	NC_011831	CGCC	2	8	548920	548927	0 %	0 %	25 %	75 %	219847389
10007	NC_011831	AGC	2	6	548945	548950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847389
10008	NC_011831	GACC	2	8	548958	548965	25 %	0 %	25 %	50 %	219847389
10009	NC_011831	GAT	2	6	548994	548999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847389
10010	NC_011831	A	6	6	549062	549067	100 %	0 %	0 %	0 %	219847389
10011	NC_011831	GGC	2	6	549081	549086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847389
10012	NC_011831	AACC	2	8	549117	549124	50 %	0 %	0 %	50 %	219847389
10013	NC_011831	CAG	2	6	549151	549156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847389
10014	NC_011831	GTG	2	6	549282	549287	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219847389
10015	NC_011831	GGTA	2	8	549303	549310	25 %	25 %	50 %	0 %	219847389
10016	NC_011831	ACCC	2	8	549321	549328	25 %	0 %	0 %	75 %	219847389
10017	NC_011831	CCA	2	6	549361	549366	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219847389
10018	NC_011831	GCC	2	6	549407	549412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219847389
10019	NC_011831	CAG	2	6	549421	549426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847389
10020	NC_011831	ACG	2	6	549474	549479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847389
10021	NC_011831	TGC	2	6	549493	549498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847389
10022	NC_011831	CAG	2	6	549507	549512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847389
10023	NC_011831	CGC	2	6	549515	549520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219847389
10024	NC_011831	ACA	2	6	549645	549650	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219847389
10025	NC_011831	TCA	2	6	549740	549745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847389
10026	NC_011831	CAAC	2	8	549813	549820	50 %	0 %	0 %	50 %	219847389
10027	NC_011831	TGA	2	6	549841	549846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847389
10028	NC_011831	CTA	2	6	549861	549866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847389
10029	NC_011831	AC	3	6	549921	549926	50 %	0 %	0 %	50 %	219847389
10030	NC_011831	CAG	3	9	549937	549945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847389
10031	NC_011831	ACC	2	6	549946	549951	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219847389
10032	NC_011831	AAC	2	6	549961	549966	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219847389
10033	NC_011831	CAC	2	6	549979	549984	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219847389
10034	NC_011831	CAG	2	6	550006	550011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847389
10035	NC_011831	AG	3	6	550010	550015	50 %	0 %	50 %	0 %	219847389
10036	NC_011831	AGC	2	6	550064	550069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847389
10037	NC_011831	CCA	2	6	550072	550077	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219847389
10038	NC_011831	CA	3	6	550193	550198	50 %	0 %	0 %	50 %	219847389
10039	NC_011831	CAG	2	6	550216	550221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847389
10040	NC_011831	GCA	2	6	550356	550361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847389
10041	NC_011831	AGC	2	6	550375	550380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847389
10042	NC_011831	GGCA	2	8	550381	550388	25 %	0 %	50 %	25 %	219847389
10043	NC_011831	AAT	2	6	550650	550655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219847389
10044	NC_011831	GCCG	2	8	550658	550665	0 %	0 %	50 %	50 %	219847389
10045	NC_011831	GCA	3	9	550674	550682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847389
10046	NC_011831	ACA	2	6	550683	550688	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219847389
10047	NC_011831	CGGC	2	8	550725	550732	0 %	0 %	50 %	50 %	219847389
10048	NC_011831	ACG	2	6	550769	550774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847389
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10051	NC_011831	TGC	2	6	550904	550909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847390
10052	NC_011831	CCG	2	6	550932	550937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219847390
10053	NC_011831	CG	3	6	551089	551094	0 %	0 %	50 %	50 %	219847390
10054	NC_011831	CCGG	2	8	551098	551105	0 %	0 %	50 %	50 %	219847390
10055	NC_011831	TAG	2	6	551124	551129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847390
10056	NC_011831	GCT	2	6	551191	551196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847390
10057	NC_011831	CTC	2	6	551243	551248	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219847390
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10059	NC_011831	ACC	2	6	551298	551303	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219847390
10060	NC_011831	GAT	2	6	551362	551367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847390
10061	NC_011831	CGG	2	6	551413	551418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847390
10062	NC_011831	CGAT	2	8	551445	551452	25 %	25 %	25 %	25 %	219847390
10063	NC_011831	GGCGC	2	10	551482	551491	0 %	0 %	60 %	40 %	219847390
10064	NC_011831	TGA	2	6	551556	551561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847390
10065	NC_011831	TGC	2	6	551571	551576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847390
10066	NC_011831	CCTCA	2	10	551597	551606	20 %	20 %	0 %	60 %	219847390
10067	NC_011831	CAA	2	6	551615	551620	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219847390
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10073	NC_011831	GTA	2	6	552101	552106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847391
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10078	NC_011831	CA	3	6	552311	552316	50 %	0 %	0 %	50 %	219847391
10079	NC_011831	CAT	2	6	552322	552327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847391
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10085	NC_011831	ACT	2	6	552632	552637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847391
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10087	NC_011831	AT	3	6	552781	552786	50 %	50 %	0 %	0 %	219847392
10088	NC_011831	TCGC	2	8	552812	552819	0 %	25 %	25 %	50 %	219847392
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10090	NC_011831	CCAC	2	8	552849	552856	25 %	0 %	0 %	75 %	219847392
10091	NC_011831	GA	3	6	552866	552871	50 %	0 %	50 %	0 %	219847392
10092	NC_011831	CAC	2	6	552885	552890	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219847392
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10098	NC_011831	AAC	3	9	553247	553255	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219847392
10099	NC_011831	GC	3	6	553279	553284	0 %	0 %	50 %	50 %	219847392
10100	NC_011831	TGAC	2	8	553400	553407	25 %	25 %	25 %	25 %	219847392
10101	NC_011831	CAA	2	6	553413	553418	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219847392
10102	NC_011831	ATA	2	6	553455	553460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219847392
10103	NC_011831	TGA	2	6	553484	553489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847392
10104	NC_011831	TCA	2	6	553493	553498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847392
10105	NC_011831	CG	3	6	553588	553593	0 %	0 %	50 %	50 %	219847392
10106	NC_011831	GAT	2	6	553648	553653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847392
10107	NC_011831	GACTT	2	10	553763	553772	20 %	40 %	20 %	20 %	219847392
10108	NC_011831	CTG	2	6	553880	553885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847392
10109	NC_011831	A	6	6	553906	553911	100 %	0 %	0 %	0 %	219847392
10110	NC_011831	TGAA	2	8	553943	553950	50 %	25 %	25 %	0 %	219847392
10111	NC_011831	CAC	2	6	553977	553982	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219847392
10112	NC_011831	AAT	2	6	554132	554137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219847392
10113	NC_011831	CCA	2	6	554200	554205	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219847392
10114	NC_011831	TCGC	2	8	554546	554553	0 %	25 %	25 %	50 %	219847393
10115	NC_011831	TCAA	2	8	554694	554701	50 %	25 %	0 %	25 %	219847393
10116	NC_011831	GAT	2	6	554708	554713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847393
10117	NC_011831	AGC	2	6	554840	554845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847393
10118	NC_011831	GTT	2	6	554962	554967	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219847393
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10120	NC_011831	TCAC	2	8	555052	555059	25 %	25 %	0 %	50 %	219847394
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10362	NC_011831	ATC	2	6	576400	576405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847410
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10476	NC_011831	GCTG	2	8	582543	582550	0 %	25 %	50 %	25 %	219847415
10477	NC_011831	GCCATC	2	12	582562	582573	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	219847415
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