MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chloroflexus aggregans DSM 9485 chromosome

Total Repeats: 82252

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_011831	AGT	2	6	365033	365038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847242
6502	NC_011831	TAC	2	6	365044	365049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847242
6503	NC_011831	CGG	2	6	365155	365160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847242
6504	NC_011831	CCGTA	2	10	365217	365226	20 %	20 %	20 %	40 %	219847242
6505	NC_011831	GCGG	2	8	365280	365287	0 %	0 %	75 %	25 %	219847242
6506	NC_011831	AAT	2	6	365300	365305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219847242
6507	NC_011831	TAACGG	2	12	365361	365372	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	219847242
6508	NC_011831	TAC	2	6	365413	365418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847242
6509	NC_011831	CGC	2	6	365421	365426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219847242
6510	NC_011831	CGG	2	6	365452	365457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847242
6511	NC_011831	CCA	2	6	365495	365500	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219847242
6512	NC_011831	CGG	2	6	365533	365538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847242
6513	NC_011831	GTA	2	6	365595	365600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847242
6514	NC_011831	TTA	2	6	365620	365625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219847242
6515	NC_011831	CCGC	2	8	365643	365650	0 %	0 %	25 %	75 %	219847242
6516	NC_011831	TAA	2	6	365677	365682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219847242
6517	NC_011831	ACA	2	6	365768	365773	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219847242
6518	NC_011831	TGA	2	6	365827	365832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847242
6519	NC_011831	GCG	2	6	365879	365884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847242
6520	NC_011831	AGT	2	6	365909	365914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847242
6521	NC_011831	GGT	2	6	365915	365920	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219847242
6522	NC_011831	CCG	2	6	365942	365947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219847242
6523	NC_011831	ACA	2	6	365951	365956	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219847242
6524	NC_011831	TTC	2	6	365969	365974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219847242
6525	NC_011831	TCT	2	6	366000	366005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219847242
6526	NC_011831	CCGGC	2	10	366018	366027	0 %	0 %	40 %	60 %	219847242
6527	NC_011831	GCG	2	6	366060	366065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847242
6528	NC_011831	GTT	2	6	366076	366081	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219847242
6529	NC_011831	CGG	2	6	366088	366093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847242
6530	NC_011831	TACC	2	8	366166	366173	25 %	25 %	0 %	50 %	219847242
6531	NC_011831	CGC	2	6	366193	366198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219847242
6532	NC_011831	GCC	2	6	366218	366223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219847242
6533	NC_011831	ATA	2	6	366234	366239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219847242
6534	NC_011831	TCACCG	2	12	366282	366293	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	219847242
6535	NC_011831	CAT	2	6	366322	366327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847242
6536	NC_011831	CGTT	2	8	366354	366361	0 %	50 %	25 %	25 %	219847242
6537	NC_011831	ACG	2	6	366372	366377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847242
6538	NC_011831	CAA	2	6	366429	366434	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219847242
6539	NC_011831	ACA	2	6	366455	366460	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219847242
6540	NC_011831	GGT	2	6	366518	366523	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219847242
6541	NC_011831	CGAG	2	8	366531	366538	25 %	0 %	50 %	25 %	219847242
6542	NC_011831	CGAC	2	8	366618	366625	25 %	0 %	25 %	50 %	219847242
6543	NC_011831	CGA	2	6	366628	366633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847242
6544	NC_011831	TAC	2	6	366670	366675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847242
6545	NC_011831	TAT	2	6	366695	366700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219847242
6546	NC_011831	GC	3	6	366719	366724	0 %	0 %	50 %	50 %	219847242
6547	NC_011831	TACC	2	8	366888	366895	25 %	25 %	0 %	50 %	219847242
6548	NC_011831	CCGG	2	8	366997	367004	0 %	0 %	50 %	50 %	219847242
6549	NC_011831	AGT	2	6	367106	367111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847242
6550	NC_011831	TGA	2	6	367135	367140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847242
6551	NC_011831	TTCA	2	8	367147	367154	25 %	50 %	0 %	25 %	219847242
6552	NC_011831	ACCG	2	8	367171	367178	25 %	0 %	25 %	50 %	219847242
6553	NC_011831	CGT	2	6	367191	367196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847242
6554	NC_011831	CCG	2	6	367218	367223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219847242
6555	NC_011831	ACC	2	6	367256	367261	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219847242
6556	NC_011831	AAC	2	6	367265	367270	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219847242
6557	NC_011831	TGGT	2	8	367353	367360	0 %	50 %	50 %	0 %	219847242
6558	NC_011831	AG	3	6	367414	367419	50 %	0 %	50 %	0 %	219847242
6559	NC_011831	CCA	2	6	367464	367469	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219847242
6560	NC_011831	CAC	2	6	367513	367518	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219847242
6561	NC_011831	ACA	2	6	367560	367565	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219847242
6562	NC_011831	GTA	2	6	367575	367580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847242
6563	NC_011831	CGGTT	2	10	367604	367613	0 %	40 %	40 %	20 %	219847242
6564	NC_011831	CAC	2	6	367726	367731	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219847242
6565	NC_011831	TCTGG	2	10	367744	367753	0 %	40 %	40 %	20 %	219847242
6566	NC_011831	CAATGG	2	12	367762	367773	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	219847242
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6569	NC_011831	GCCG	2	8	367927	367934	0 %	0 %	50 %	50 %	219847242
6570	NC_011831	CAA	2	6	367948	367953	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219847242
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6572	NC_011831	ACG	2	6	367986	367991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847242
6573	NC_011831	TGG	2	6	368074	368079	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219847242
6574	NC_011831	GAC	2	6	368215	368220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847242
6575	NC_011831	CCA	2	6	368258	368263	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219847242
6576	NC_011831	GGTCA	2	10	368264	368273	20 %	20 %	40 %	20 %	219847242
6577	NC_011831	ACCG	2	8	368285	368292	25 %	0 %	25 %	50 %	219847242
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6579	NC_011831	CGT	2	6	368389	368394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847242
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6581	NC_011831	CCGG	2	8	368552	368559	0 %	0 %	50 %	50 %	219847242
6582	NC_011831	ACC	2	6	368596	368601	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219847242
6583	NC_011831	AACG	2	8	368609	368616	50 %	0 %	25 %	25 %	219847242
6584	NC_011831	TC	3	6	368626	368631	0 %	50 %	0 %	50 %	219847242
6585	NC_011831	TTC	2	6	368651	368656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219847242
6586	NC_011831	GCCT	2	8	368766	368773	0 %	25 %	25 %	50 %	219847242
6587	NC_011831	AAT	2	6	368876	368881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219847242
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6591	NC_011831	GAT	3	9	369129	369137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847243
6592	NC_011831	CCG	2	6	369173	369178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219847243
6593	NC_011831	CAC	2	6	369197	369202	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219847243
6594	NC_011831	CCG	2	6	369214	369219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219847243
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6602	NC_011831	CTA	2	6	369548	369553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847243
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6604	NC_011831	ATCG	2	8	369655	369662	25 %	25 %	25 %	25 %	219847243
6605	NC_011831	ACC	2	6	369691	369696	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219847243
6606	NC_011831	CGG	2	6	369747	369752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847243
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6608	NC_011831	CAT	2	6	369788	369793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847243
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6610	NC_011831	CCG	4	12	369835	369846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219847243
6611	NC_011831	CAT	3	9	369850	369858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847243
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6983	NC_011831	GAC	2	6	389270	389275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847260
6984	NC_011831	GGAT	2	8	389313	389320	25 %	25 %	50 %	0 %	219847260
6985	NC_011831	CAA	2	6	389330	389335	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219847260
6986	NC_011831	CAA	3	9	389389	389397	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219847260
6987	NC_011831	AG	3	6	389452	389457	50 %	0 %	50 %	0 %	219847260
6988	NC_011831	GC	3	6	389687	389692	0 %	0 %	50 %	50 %	219847260
6989	NC_011831	ACC	2	6	389843	389848	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219847260
6990	NC_011831	GCACA	2	10	389878	389887	40 %	0 %	20 %	40 %	219847260
6991	NC_011831	CAA	2	6	389936	389941	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219847260
6992	NC_011831	GCTC	2	8	389979	389986	0 %	25 %	25 %	50 %	219847260
6993	NC_011831	CTG	2	6	389992	389997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847260
6994	NC_011831	CGG	2	6	390007	390012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847260
6995	NC_011831	TAC	2	6	390050	390055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847260
6996	NC_011831	CGG	2	6	390074	390079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847260
6997	NC_011831	AGC	2	6	390156	390161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847260
6998	NC_011831	ATT	2	6	390244	390249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219847261
6999	NC_011831	GTTG	2	8	390272	390279	0 %	50 %	50 %	0 %	219847261
7000	NC_011831	CAT	2	6	390353	390358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847261

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