MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 7424 chromosome

Total Repeats: 101350

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011729	A	7	7	256	262	100 %	0 %	0 %	0 %	218437014
2	NC_011729	ATT	2	6	273	278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218437014
3	NC_011729	TGT	2	6	284	289	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218437014
4	NC_011729	TTA	2	6	380	385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218437014
5	NC_011729	GTC	2	6	453	458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218437014
6	NC_011729	AAT	2	6	465	470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218437014
7	NC_011729	TGC	2	6	482	487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218437014
8	NC_011729	TG	3	6	538	543	0 %	50 %	50 %	0 %	218437014
9	NC_011729	T	6	6	622	627	0 %	100 %	0 %	0 %	218437014
10	NC_011729	TTA	2	6	723	728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218437014
11	NC_011729	GAT	2	6	732	737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218437014
12	NC_011729	T	6	6	777	782	0 %	100 %	0 %	0 %	218437014
13	NC_011729	GGT	2	6	818	823	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218437014
14	NC_011729	CCT	2	6	840	845	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218437014
15	NC_011729	AGA	2	6	863	868	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218437014
16	NC_011729	A	6	6	951	956	100 %	0 %	0 %	0 %	218437014
17	NC_011729	AT	3	6	998	1003	50 %	50 %	0 %	0 %	218437014
18	NC_011729	ATTTCG	2	12	1068	1079	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	218437014
19	NC_011729	TCC	2	6	1121	1126	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218437014
20	NC_011729	CGC	2	6	1218	1223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218437014
21	NC_011729	GA	3	6	1225	1230	50 %	0 %	50 %	0 %	218437014
22	NC_011729	GAA	2	6	1302	1307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218437014
23	NC_011729	AAG	2	6	1368	1373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218437014
24	NC_011729	CATT	2	8	1415	1422	25 %	50 %	0 %	25 %	218437014
25	NC_011729	TCT	2	6	1609	1614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218437015
26	NC_011729	GCT	2	6	1699	1704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218437015
27	NC_011729	TAAT	2	8	1715	1722	50 %	50 %	0 %	0 %	218437015
28	NC_011729	ATT	2	6	1800	1805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218437015
29	NC_011729	TAA	2	6	1827	1832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218437015
30	NC_011729	ATC	2	6	1885	1890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218437015
31	NC_011729	ATT	2	6	1915	1920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218437015
32	NC_011729	TTA	2	6	1969	1974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218437015
33	NC_011729	CCT	2	6	1993	1998	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218437015
34	NC_011729	GCT	2	6	2026	2031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218437015
35	NC_011729	GAG	2	6	2051	2056	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218437015
36	NC_011729	T	6	6	2083	2088	0 %	100 %	0 %	0 %	218437015
37	NC_011729	GGA	2	6	2101	2106	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218437015
38	NC_011729	TG	3	6	2127	2132	0 %	50 %	50 %	0 %	218437015
39	NC_011729	ACTTTA	2	12	2134	2145	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	218437015
40	NC_011729	GGAG	2	8	2199	2206	25 %	0 %	75 %	0 %	218437015
41	NC_011729	T	6	6	2354	2359	0 %	100 %	0 %	0 %	218437015
42	NC_011729	A	6	6	2414	2419	100 %	0 %	0 %	0 %	218437015
43	NC_011729	ATTT	2	8	2445	2452	25 %	75 %	0 %	0 %	218437015
44	NC_011729	ATT	2	6	2457	2462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218437015
45	NC_011729	T	6	6	2479	2484	0 %	100 %	0 %	0 %	218437015
46	NC_011729	CCG	2	6	2486	2491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218437015
47	NC_011729	TAT	2	6	2498	2503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218437015
48	NC_011729	ATG	2	6	2617	2622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218437016
49	NC_011729	AAAT	2	8	2637	2644	75 %	25 %	0 %	0 %	218437016
50	NC_011729	GATG	2	8	2674	2681	25 %	25 %	50 %	0 %	218437016
51	NC_011729	T	7	7	2691	2697	0 %	100 %	0 %	0 %	218437016
52	NC_011729	GGT	2	6	2702	2707	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218437016
53	NC_011729	A	6	6	2857	2862	100 %	0 %	0 %	0 %	218437016
54	NC_011729	GA	3	6	2874	2879	50 %	0 %	50 %	0 %	218437016
55	NC_011729	TCA	2	6	2994	2999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218437016
56	NC_011729	AAT	2	6	3003	3008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218437016
57	NC_011729	TAA	2	6	3024	3029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218437016
58	NC_011729	TGGG	2	8	3066	3073	0 %	25 %	75 %	0 %	218437016
59	NC_011729	CAA	2	6	3091	3096	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218437016
60	NC_011729	CCG	2	6	3101	3106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218437016
61	NC_011729	TGGA	2	8	3174	3181	25 %	25 %	50 %	0 %	218437016
62	NC_011729	GAATG	2	10	3184	3193	40 %	20 %	40 %	0 %	218437016
63	NC_011729	A	6	6	3194	3199	100 %	0 %	0 %	0 %	218437016
64	NC_011729	TGGTTT	2	12	3265	3276	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218437016
65	NC_011729	TAA	2	6	3282	3287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218437016
66	NC_011729	AGG	3	9	3321	3329	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218437016
67	NC_011729	TAT	2	6	3341	3346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218437016
68	NC_011729	GGT	2	6	3347	3352	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218437016
69	NC_011729	AGA	2	6	3354	3359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218437016
70	NC_011729	GAG	2	6	3475	3480	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218437016
71	NC_011729	AAC	2	6	3501	3506	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218437016
72	NC_011729	T	6	6	3554	3559	0 %	100 %	0 %	0 %	218437016
73	NC_011729	CTT	2	6	3622	3627	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218437016
74	NC_011729	GGA	2	6	3706	3711	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218437016
75	NC_011729	TGAC	2	8	3799	3806	25 %	25 %	25 %	25 %	218437017
76	NC_011729	ATA	2	6	3861	3866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218437017
77	NC_011729	CATGG	2	10	3867	3876	20 %	20 %	40 %	20 %	218437017
78	NC_011729	CAT	2	6	3890	3895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218437017
79	NC_011729	TTTC	2	8	3965	3972	0 %	75 %	0 %	25 %	218437017
80	NC_011729	AATT	2	8	4043	4050	50 %	50 %	0 %	0 %	218437017
81	NC_011729	GAT	2	6	4069	4074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218437017
82	NC_011729	CGA	2	6	4082	4087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218437017
83	NC_011729	T	6	6	4088	4093	0 %	100 %	0 %	0 %	218437017
84	NC_011729	GGT	2	6	4152	4157	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218437017
85	NC_011729	TG	3	6	4211	4216	0 %	50 %	50 %	0 %	218437017
86	NC_011729	TTC	2	6	4824	4829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218437018
87	NC_011729	A	6	6	4859	4864	100 %	0 %	0 %	0 %	218437018
88	NC_011729	TCCTTC	2	12	4905	4916	0 %	50 %	0 %	50 %	218437018
89	NC_011729	TAA	2	6	4956	4961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218437018
90	NC_011729	ACT	2	6	4972	4977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218437018
91	NC_011729	AGC	2	6	5059	5064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218437018
92	NC_011729	AATA	2	8	5083	5090	75 %	25 %	0 %	0 %	218437018
93	NC_011729	AGC	2	6	5111	5116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218437018
94	NC_011729	TTA	2	6	5119	5124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218437018
95	NC_011729	AGA	2	6	5223	5228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218437018
96	NC_011729	CAG	2	6	5258	5263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218437018
97	NC_011729	A	8	8	5272	5279	100 %	0 %	0 %	0 %	218437018
98	NC_011729	A	6	6	5374	5379	100 %	0 %	0 %	0 %	218437018
99	NC_011729	T	7	7	5392	5398	0 %	100 %	0 %	0 %	218437018
100	NC_011729	TAA	2	6	5417	5422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218437018
101	NC_011729	CAG	2	6	5436	5441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218437018
102	NC_011729	TAT	2	6	5448	5453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218437018
103	NC_011729	ATA	2	6	5459	5464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218437018
104	NC_011729	ATT	2	6	5484	5489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218437018
105	NC_011729	GA	3	6	5739	5744	50 %	0 %	50 %	0 %	218437019
106	NC_011729	TTA	2	6	5756	5761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218437019
107	NC_011729	CTT	2	6	5894	5899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218437019
108	NC_011729	TTG	2	6	5940	5945	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218437019
109	NC_011729	A	6	6	5989	5994	100 %	0 %	0 %	0 %	218437019
110	NC_011729	ACA	2	6	6006	6011	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218437019
111	NC_011729	A	6	6	6025	6030	100 %	0 %	0 %	0 %	218437019
112	NC_011729	GAA	2	6	6089	6094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218437019
113	NC_011729	T	6	6	6096	6101	0 %	100 %	0 %	0 %	218437019
114	NC_011729	CCCT	2	8	6102	6109	0 %	25 %	0 %	75 %	218437019
115	NC_011729	CAA	2	6	6112	6117	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218437019
116	NC_011729	GAT	2	6	6133	6138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218437019
117	NC_011729	ATT	2	6	6193	6198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218437019
118	NC_011729	TTA	2	6	6212	6217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218437019
119	NC_011729	AGC	2	6	6336	6341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218437019
120	NC_011729	AAG	2	6	6352	6357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218437019
121	NC_011729	ATTA	2	8	6390	6397	50 %	50 %	0 %	0 %	218437019
122	NC_011729	GCA	2	6	6406	6411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218437019
123	NC_011729	CGG	2	6	6512	6517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218437019
124	NC_011729	ATTT	2	8	6525	6532	25 %	75 %	0 %	0 %	218437019
125	NC_011729	GGA	2	6	6601	6606	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218437019
126	NC_011729	ATTT	2	8	6661	6668	25 %	75 %	0 %	0 %	218437019
127	NC_011729	GTC	2	6	6683	6688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218437019
128	NC_011729	GAAG	2	8	6693	6700	50 %	0 %	50 %	0 %	218437019
129	NC_011729	ATG	2	6	6706	6711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218437019
130	NC_011729	AT	3	6	6730	6735	50 %	50 %	0 %	0 %	218437019
131	NC_011729	GCG	2	6	6808	6813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218437019
132	NC_011729	GGC	2	6	6855	6860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218437019
133	NC_011729	GTG	2	6	6952	6957	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218437019
134	NC_011729	AGG	2	6	7056	7061	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218437019
135	NC_011729	CCA	2	6	7079	7084	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218437019
136	NC_011729	ATC	2	6	7106	7111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218437019
137	NC_011729	G	6	6	7115	7120	0 %	0 %	100 %	0 %	218437019
138	NC_011729	TGA	2	6	7134	7139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218437019
139	NC_011729	GTC	2	6	7160	7165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218437019
140	NC_011729	AAG	2	6	7202	7207	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218437019
141	NC_011729	ATTT	2	8	7217	7224	25 %	75 %	0 %	0 %	218437019
142	NC_011729	AAT	2	6	7694	7699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218437020
143	NC_011729	CGA	2	6	7706	7711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218437020
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145	NC_011729	TCTTT	2	10	7821	7830	0 %	80 %	0 %	20 %	218437020
146	NC_011729	GTT	2	6	7849	7854	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218437020
147	NC_011729	CCTG	2	8	7883	7890	0 %	25 %	25 %	50 %	218437020
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150	NC_011729	GAC	2	6	8070	8075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218437020
151	NC_011729	GTT	2	6	8085	8090	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218437020
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153	NC_011729	TAA	2	6	8166	8171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218437020
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155	NC_011729	TCT	2	6	8223	8228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218437021
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158	NC_011729	GTT	2	6	8425	8430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218437021
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162	NC_011729	AATT	2	8	8636	8643	50 %	50 %	0 %	0 %	218437021
163	NC_011729	T	7	7	8648	8654	0 %	100 %	0 %	0 %	218437021
164	NC_011729	TCC	2	6	8711	8716	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218437021
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166	NC_011729	GTT	2	6	8733	8738	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218437021
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168	NC_011729	AAT	2	6	8839	8844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218437021
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171	NC_011729	TCA	2	6	8881	8886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218437021
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240	NC_011729	AATT	2	8	12573	12580	50 %	50 %	0 %	0 %	218437024
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249	NC_011729	TGGG	2	8	12978	12985	0 %	25 %	75 %	0 %	218437024
250	NC_011729	T	6	6	12987	12992	0 %	100 %	0 %	0 %	218437024
251	NC_011729	GGAA	2	8	13057	13064	50 %	0 %	50 %	0 %	218437024
252	NC_011729	GCG	3	9	13096	13104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218437024
253	NC_011729	AGC	2	6	13110	13115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218437024
254	NC_011729	CGT	2	6	13222	13227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218437024
255	NC_011729	GGC	2	6	13233	13238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218437024
256	NC_011729	AT	3	6	13249	13254	50 %	50 %	0 %	0 %	218437024
257	NC_011729	GGT	2	6	13272	13277	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218437024
258	NC_011729	GA	3	6	13338	13343	50 %	0 %	50 %	0 %	218437024
259	NC_011729	TCA	2	6	13381	13386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218437024
260	NC_011729	ATA	2	6	13396	13401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218437024
261	NC_011729	CTT	2	6	13418	13423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218437024
262	NC_011729	TTC	2	6	13443	13448	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218437024
263	NC_011729	CTAAA	2	10	13493	13502	60 %	20 %	0 %	20 %	218437024
264	NC_011729	TTCT	2	8	13646	13653	0 %	75 %	0 %	25 %	218437024
265	NC_011729	TTG	2	6	13701	13706	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218437024
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267	NC_011729	ATTA	2	8	13824	13831	50 %	50 %	0 %	0 %	218437024
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392	NC_011729	T	7	7	21105	21111	0 %	100 %	0 %	0 %	218437032
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