MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Coxiella burnetii CbuK_Q154 plasmid pQpRS_K_Q154

Total Repeats: 582

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011526	GGGT	2	8	166	173	0 %	25 %	75 %	0 %	212208406
2	NC_011526	GGT	2	6	246	251	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212208406
3	NC_011526	AGA	2	6	363	368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212208406
4	NC_011526	GAAC	2	8	412	419	50 %	0 %	25 %	25 %	212208406
5	NC_011526	A	8	8	455	462	100 %	0 %	0 %	0 %	212208406
6	NC_011526	GAA	2	6	529	534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212208406
7	NC_011526	ATTG	2	8	1290	1297	25 %	50 %	25 %	0 %	212208407
8	NC_011526	TGC	2	6	1317	1322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212208407
9	NC_011526	GCC	2	6	1364	1369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212208407
10	NC_011526	T	6	6	1395	1400	0 %	100 %	0 %	0 %	212208407
11	NC_011526	TTCA	2	8	1721	1728	25 %	50 %	0 %	25 %	212208408
12	NC_011526	CTA	2	6	1742	1747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212208408
13	NC_011526	AC	3	6	1751	1756	50 %	0 %	0 %	50 %	212208408
14	NC_011526	TGG	2	6	1757	1762	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212208408
15	NC_011526	TGC	2	6	1785	1790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212208408
16	NC_011526	TC	3	6	1839	1844	0 %	50 %	0 %	50 %	212208408
17	NC_011526	CAA	2	6	1862	1867	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212208408
18	NC_011526	TTA	2	6	1928	1933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212208408
19	NC_011526	AGCA	2	8	2051	2058	50 %	0 %	25 %	25 %	212208408
20	NC_011526	A	6	6	2121	2126	100 %	0 %	0 %	0 %	212208408
21	NC_011526	TGT	2	6	2144	2149	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212208408
22	NC_011526	T	6	6	2158	2163	0 %	100 %	0 %	0 %	212208408
23	NC_011526	TCG	2	6	2172	2177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212208408
24	NC_011526	GGGGAA	2	12	2269	2280	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212208408
25	NC_011526	TG	3	6	2284	2289	0 %	50 %	50 %	0 %	212208408
26	NC_011526	TCG	2	6	2376	2381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212208408
27	NC_011526	GCCGCG	2	12	2455	2466	0 %	0 %	50 %	50 %	212208408
28	NC_011526	GGC	2	6	2615	2620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212208408
29	NC_011526	CTG	2	6	2996	3001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212208409
30	NC_011526	CCA	2	6	3009	3014	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212208409
31	NC_011526	TG	3	6	3257	3262	0 %	50 %	50 %	0 %	212208410
32	NC_011526	CTT	2	6	3268	3273	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212208410
33	NC_011526	T	6	6	3291	3296	0 %	100 %	0 %	0 %	212208410
34	NC_011526	AGT	2	6	3332	3337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212208410
35	NC_011526	AAC	2	6	3369	3374	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212208410
36	NC_011526	CCA	2	6	3399	3404	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212208410
37	NC_011526	CCA	2	6	3433	3438	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212208410
38	NC_011526	TTGG	2	8	3502	3509	0 %	50 %	50 %	0 %	212208410
39	NC_011526	TTA	2	6	3517	3522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212208410
40	NC_011526	AGT	2	6	3534	3539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212208410
41	NC_011526	TAA	2	6	3548	3553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212208410
42	NC_011526	AAC	2	6	3616	3621	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212208410
43	NC_011526	T	8	8	3635	3642	0 %	100 %	0 %	0 %	212208410
44	NC_011526	TAT	2	6	3953	3958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212208411
45	NC_011526	ACC	2	6	4011	4016	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212208411
46	NC_011526	TCTG	2	8	4053	4060	0 %	50 %	25 %	25 %	212208411
47	NC_011526	GGT	2	6	4073	4078	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212208411
48	NC_011526	TGA	2	6	4331	4336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212208412
49	NC_011526	GA	3	6	4419	4424	50 %	0 %	50 %	0 %	212208412
50	NC_011526	CAA	2	6	4570	4575	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212208412
51	NC_011526	AG	3	6	4600	4605	50 %	0 %	50 %	0 %	212208412
52	NC_011526	CGA	2	6	4661	4666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212208412
53	NC_011526	A	6	6	4672	4677	100 %	0 %	0 %	0 %	212208412
54	NC_011526	GTT	2	6	4717	4722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212208412
55	NC_011526	TTA	2	6	4723	4728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212208412
56	NC_011526	TTC	2	6	4731	4736	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212208412
57	NC_011526	AC	3	6	4801	4806	50 %	0 %	0 %	50 %	212208412
58	NC_011526	ATTT	3	12	4854	4865	25 %	75 %	0 %	0 %	212208412
59	NC_011526	GGT	2	6	4867	4872	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212208412
60	NC_011526	GAG	2	6	4903	4908	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212208412
61	NC_011526	CATT	2	8	4930	4937	25 %	50 %	0 %	25 %	212208412
62	NC_011526	ACC	2	6	4945	4950	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212208412
63	NC_011526	ATT	2	6	4995	5000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212208412
64	NC_011526	ATT	2	6	5027	5032	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212208412
65	NC_011526	A	6	6	5054	5059	100 %	0 %	0 %	0 %	212208412
66	NC_011526	ATG	2	6	5075	5080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212208412
67	NC_011526	ACT	2	6	5092	5097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212208412
68	NC_011526	ATT	2	6	5105	5110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212208412
69	NC_011526	GC	3	6	5225	5230	0 %	0 %	50 %	50 %	212208412
70	NC_011526	A	8	8	5257	5264	100 %	0 %	0 %	0 %	212208412
71	NC_011526	ATT	2	6	5270	5275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212208412
72	NC_011526	TCAA	2	8	5315	5322	50 %	25 %	0 %	25 %	212208412
73	NC_011526	TAT	2	6	5335	5340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212208412
74	NC_011526	AAG	2	6	5357	5362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212208412
75	NC_011526	TTATC	2	10	5369	5378	20 %	60 %	0 %	20 %	212208412
76	NC_011526	A	7	7	5422	5428	100 %	0 %	0 %	0 %	212208412
77	NC_011526	A	6	6	5458	5463	100 %	0 %	0 %	0 %	212208412
78	NC_011526	TTA	2	6	5482	5487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212208412
79	NC_011526	T	6	6	5518	5523	0 %	100 %	0 %	0 %	212208412
80	NC_011526	TTCA	2	8	5743	5750	25 %	50 %	0 %	25 %	212208413
81	NC_011526	CTA	2	6	5764	5769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212208413
82	NC_011526	AC	3	6	5773	5778	50 %	0 %	0 %	50 %	212208413
83	NC_011526	TGG	2	6	5779	5784	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212208413
84	NC_011526	TGC	2	6	5807	5812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212208413
85	NC_011526	TC	3	6	5861	5866	0 %	50 %	0 %	50 %	212208413
86	NC_011526	CAA	2	6	5884	5889	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212208413
87	NC_011526	TTA	2	6	5950	5955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212208413
88	NC_011526	AGCA	2	8	6073	6080	50 %	0 %	25 %	25 %	212208413
89	NC_011526	A	6	6	6143	6148	100 %	0 %	0 %	0 %	212208413
90	NC_011526	TGT	2	6	6166	6171	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212208413
91	NC_011526	T	6	6	6180	6185	0 %	100 %	0 %	0 %	212208413
92	NC_011526	TCG	2	6	6194	6199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212208413
93	NC_011526	GTTT	2	8	6623	6630	0 %	75 %	25 %	0 %	212208414
94	NC_011526	AGG	2	6	6684	6689	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212208414
95	NC_011526	T	6	6	6765	6770	0 %	100 %	0 %	0 %	212208414
96	NC_011526	GTT	2	6	6778	6783	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212208414
97	NC_011526	ATT	2	6	6863	6868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212208414
98	NC_011526	AATT	2	8	6989	6996	50 %	50 %	0 %	0 %	212208414
99	NC_011526	TGA	2	6	7040	7045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212208414
100	NC_011526	AGA	2	6	7062	7067	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212208414
101	NC_011526	CAC	2	6	7109	7114	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212208414
102	NC_011526	TGAT	2	8	7115	7122	25 %	50 %	25 %	0 %	212208414
103	NC_011526	GAA	2	6	7165	7170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212208414
104	NC_011526	A	6	6	7189	7194	100 %	0 %	0 %	0 %	212208414
105	NC_011526	GGT	2	6	7198	7203	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212208414
106	NC_011526	A	7	7	7286	7292	100 %	0 %	0 %	0 %	212208414
107	NC_011526	CGG	2	6	7300	7305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212208414
108	NC_011526	GTG	2	6	7328	7333	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212208414
109	NC_011526	CCGG	2	8	7360	7367	0 %	0 %	50 %	50 %	212208414
110	NC_011526	AAT	2	6	7386	7391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212208414
111	NC_011526	GGC	2	6	7461	7466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212208414
112	NC_011526	AGC	2	6	7517	7522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212208414
113	NC_011526	CATCAA	2	12	7550	7561	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	212208414
114	NC_011526	AAG	2	6	7569	7574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212208414
115	NC_011526	CTG	2	6	7802	7807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212208415
116	NC_011526	TG	3	6	7820	7825	0 %	50 %	50 %	0 %	212208415
117	NC_011526	GCCAC	2	10	7892	7901	20 %	0 %	20 %	60 %	212208415
118	NC_011526	A	6	6	7947	7952	100 %	0 %	0 %	0 %	212208415
119	NC_011526	ATG	2	6	8008	8013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212208415
120	NC_011526	AAT	2	6	8076	8081	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212208415
121	NC_011526	ATT	2	6	8097	8102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212208415
122	NC_011526	T	6	6	8206	8211	0 %	100 %	0 %	0 %	212208415
123	NC_011526	CAG	2	6	8243	8248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212208415
124	NC_011526	TTC	2	6	8262	8267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212208415
125	NC_011526	ATT	2	6	8292	8297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212208415
126	NC_011526	ATT	2	6	8316	8321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212208415
127	NC_011526	CTTG	2	8	8323	8330	0 %	50 %	25 %	25 %	212208415
128	NC_011526	T	6	6	8348	8353	0 %	100 %	0 %	0 %	212208415
129	NC_011526	CTT	2	6	8372	8377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212208415
130	NC_011526	TTC	2	6	8397	8402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212208415
131	NC_011526	ATA	2	6	8448	8453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212208415
132	NC_011526	TCA	2	6	8455	8460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212208415
133	NC_011526	CGC	2	6	8466	8471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212208415
134	NC_011526	ATC	2	6	8490	8495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212208415
135	NC_011526	ATT	2	6	8589	8594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212208415
136	NC_011526	CTT	3	9	8612	8620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212208415
137	NC_011526	CAA	3	9	8640	8648	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212208415
138	NC_011526	TTGA	2	8	8649	8656	25 %	50 %	25 %	0 %	212208415
139	NC_011526	TTCT	2	8	8686	8693	0 %	75 %	0 %	25 %	212208415
140	NC_011526	A	6	6	8728	8733	100 %	0 %	0 %	0 %	212208415
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144	NC_011526	A	6	6	9111	9116	100 %	0 %	0 %	0 %	212208416
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150	NC_011526	ATA	2	6	9445	9450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212208417
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156	NC_011526	GAA	2	6	9597	9602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212208417
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163	NC_011526	A	6	6	9849	9854	100 %	0 %	0 %	0 %	212208417
164	NC_011526	AAAT	2	8	9913	9920	75 %	25 %	0 %	0 %	212208417
165	NC_011526	GA	3	6	9961	9966	50 %	0 %	50 %	0 %	212208417
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263	NC_011526	CAT	2	6	22405	22410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212208426
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266	NC_011526	GC	3	6	22919	22924	0 %	0 %	50 %	50 %	212208427
267	NC_011526	AAATGG	2	12	22954	22965	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	212208427
268	NC_011526	CTT	2	6	23075	23080	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212208428
269	NC_011526	T	6	6	23079	23084	0 %	100 %	0 %	0 %	212208428
270	NC_011526	CTT	2	6	23096	23101	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212208428
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273	NC_011526	A	6	6	23499	23504	100 %	0 %	0 %	0 %	212208429
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280	NC_011526	GAA	2	6	23643	23648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212208429
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282	NC_011526	A	6	6	23731	23736	100 %	0 %	0 %	0 %	212208429
283	NC_011526	AG	3	6	23776	23781	50 %	0 %	50 %	0 %	212208429
284	NC_011526	GT	3	6	23796	23801	0 %	50 %	50 %	0 %	212208429
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288	NC_011526	CT	3	6	24126	24131	0 %	50 %	0 %	50 %	212208429
289	NC_011526	TTA	2	6	24140	24145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212208429
290	NC_011526	AAG	2	6	24153	24158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212208429
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292	NC_011526	T	6	6	24224	24229	0 %	100 %	0 %	0 %	212208429
293	NC_011526	ATC	2	6	24232	24237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212208429
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299	NC_011526	T	6	6	24457	24462	0 %	100 %	0 %	0 %	212208429
300	NC_011526	A	6	6	24500	24505	100 %	0 %	0 %	0 %	212208429
301	NC_011526	AG	3	6	24638	24643	50 %	0 %	50 %	0 %	212208429
302	NC_011526	AT	3	6	24653	24658	50 %	50 %	0 %	0 %	212208429
303	NC_011526	ATA	2	6	24714	24719	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212208429
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322	NC_011526	CTT	2	6	26084	26089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212208432
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387	NC_011526	TTC	2	6	29212	29217	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212208436
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393	NC_011526	TCT	2	6	29399	29404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212208436
394	NC_011526	CCA	2	6	29499	29504	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212208436
395	NC_011526	TTA	2	6	29531	29536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212208436
396	NC_011526	ATT	2	6	29551	29556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212208436
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