MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Coprothermobacter proteolyticus DSM 5265 chromosome

Total Repeats: 24215

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_011295	CAT	2	6	810905	810910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206895819
14002	NC_011295	CTT	2	6	811142	811147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206895931
14003	NC_011295	TCGT	2	8	811163	811170	0 %	50 %	25 %	25 %	206895931
14004	NC_011295	CCAT	2	8	811173	811180	25 %	25 %	0 %	50 %	206895931
14005	NC_011295	CAT	2	6	811279	811284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206895931
14006	NC_011295	CTA	2	6	811285	811290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206895931
14007	NC_011295	GCA	2	6	811314	811319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206895931
14008	NC_011295	GAA	2	6	811333	811338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206895931
14009	NC_011295	TTCT	2	8	811364	811371	0 %	75 %	0 %	25 %	206895931
14010	NC_011295	ACC	2	6	811445	811450	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	206895931
14011	NC_011295	CAG	2	6	811483	811488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206895931
14012	NC_011295	TTC	2	6	811551	811556	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206895931
14013	NC_011295	TA	3	6	811616	811621	50 %	50 %	0 %	0 %	206895931
14014	NC_011295	ATC	2	6	811631	811636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206895931
14015	NC_011295	ACT	2	6	811647	811652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206896100
14016	NC_011295	TTA	2	6	811707	811712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	206896100
14017	NC_011295	AGT	2	6	811729	811734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206896100
14018	NC_011295	CAGG	2	8	811740	811747	25 %	0 %	50 %	25 %	206896100
14019	NC_011295	AGC	2	6	811777	811782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206896100
14020	NC_011295	CTG	2	6	811851	811856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206896100
14021	NC_011295	TAC	2	6	811903	811908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206896100
14022	NC_011295	GAA	2	6	811978	811983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206896100
14023	NC_011295	CAA	2	6	812020	812025	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	206896100
14024	NC_011295	GCT	2	6	812036	812041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206896100
14025	NC_011295	AGT	2	6	812081	812086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206896100
14026	NC_011295	TCA	2	6	812162	812167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206896100
14027	NC_011295	ACTAGC	2	12	812173	812184	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	206896100
14028	NC_011295	TGCC	2	8	812283	812290	0 %	25 %	25 %	50 %	206896100
14029	NC_011295	ACC	2	6	812356	812361	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	206896100
14030	NC_011295	CAA	2	6	812430	812435	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	206896100
14031	NC_011295	AAC	2	6	812440	812445	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	206896100
14032	NC_011295	CTT	2	6	812464	812469	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206896100
14033	NC_011295	AAC	2	6	812479	812484	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	206896100
14034	NC_011295	AAACC	2	10	812513	812522	60 %	0 %	0 %	40 %	206896100
14035	NC_011295	ACCCA	2	10	812628	812637	40 %	0 %	0 %	60 %	206896277
14036	NC_011295	TAC	2	6	812694	812699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206896277
14037	NC_011295	ATG	2	6	812815	812820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206896277
14038	NC_011295	ACC	2	6	812856	812861	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	206896277
14039	NC_011295	AT	4	8	812899	812906	50 %	50 %	0 %	0 %	206896277
14040	NC_011295	TCC	2	6	812952	812957	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	206896277
14041	NC_011295	TAT	2	6	812973	812978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	206896277
14042	NC_011295	AGA	2	6	812984	812989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206896277
14043	NC_011295	TATGGC	2	12	812991	813002	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	206896277
14044	NC_011295	GCA	2	6	813004	813009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206896277
14045	NC_011295	CAC	2	6	813101	813106	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	206896277
14046	NC_011295	AG	3	6	813113	813118	50 %	0 %	50 %	0 %	206896277
14047	NC_011295	AGGAG	2	10	813198	813207	40 %	0 %	60 %	0 %	206896277
14048	NC_011295	ACCC	2	8	813243	813250	25 %	0 %	0 %	75 %	206896277
14049	NC_011295	CAT	2	6	813263	813268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206896277
14050	NC_011295	CTT	2	6	813273	813278	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206896277
14051	NC_011295	CGA	2	6	813389	813394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206896277
14052	NC_011295	A	6	6	813418	813423	100 %	0 %	0 %	0 %	206896277
14053	NC_011295	CCA	2	6	813479	813484	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	206896277
14054	NC_011295	ATC	2	6	813507	813512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206896277
14055	NC_011295	CAT	2	6	813581	813586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206896277
14056	NC_011295	ACA	2	6	813752	813757	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	206896277
14057	NC_011295	CAC	2	6	813762	813767	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	206896277
14058	NC_011295	GCA	2	6	813778	813783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206896277
14059	NC_011295	TAT	2	6	813883	813888	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	206895601
14060	NC_011295	GCT	2	6	813950	813955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206895601
14061	NC_011295	TTG	2	6	814170	814175	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	206895601
14062	NC_011295	CAA	2	6	814218	814223	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	206895601
14063	NC_011295	CAT	2	6	814246	814251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206895601
14064	NC_011295	TTC	2	6	814312	814317	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206895601
14065	NC_011295	CCA	2	6	814337	814342	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	206895601
14066	NC_011295	CAGT	2	8	814371	814378	25 %	25 %	25 %	25 %	206895601
14067	NC_011295	CATC	2	8	814491	814498	25 %	25 %	0 %	50 %	206895601
14068	NC_011295	T	6	6	814501	814506	0 %	100 %	0 %	0 %	206895601
14069	NC_011295	TTCACT	2	12	814510	814521	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	206895601
14070	NC_011295	CA	3	6	814538	814543	50 %	0 %	0 %	50 %	206895601
14071	NC_011295	AGA	2	6	814608	814613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206895601
14072	NC_011295	TCT	2	6	814755	814760	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206895601
14073	NC_011295	GTT	2	6	814895	814900	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	206895601
14074	NC_011295	AAAG	2	8	814916	814923	75 %	0 %	25 %	0 %	206895601
14075	NC_011295	TAA	2	6	815168	815173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	206896247
14076	NC_011295	ATG	2	6	815177	815182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206896247
14077	NC_011295	TCA	2	6	815212	815217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206896247
14078	NC_011295	TGC	2	6	815220	815225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206896247
14079	NC_011295	ACC	2	6	815242	815247	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	206896247
14080	NC_011295	GTT	2	6	815248	815253	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	206896247
14081	NC_011295	GAA	2	6	815322	815327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206896247
14082	NC_011295	TGA	2	6	815335	815340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206896247
14083	NC_011295	CTCTT	2	10	815347	815356	0 %	60 %	0 %	40 %	206896247
14084	NC_011295	TTC	2	6	815431	815436	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206896247
14085	NC_011295	GCA	2	6	815444	815449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206896247
14086	NC_011295	TTC	2	6	815523	815528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206896247
14087	NC_011295	TCT	2	6	815541	815546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206896247
14088	NC_011295	TA	3	6	815547	815552	50 %	50 %	0 %	0 %	206896247
14089	NC_011295	AGG	2	6	815553	815558	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	206896247
14090	NC_011295	TC	3	6	815634	815639	0 %	50 %	0 %	50 %	206896247
14091	NC_011295	CCG	2	6	815668	815673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	206896247
14092	NC_011295	AGG	2	6	815719	815724	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	206896247
14093	NC_011295	CCA	2	6	815776	815781	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	206896247
14094	NC_011295	TTA	2	6	815824	815829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	206896247
14095	NC_011295	TCC	2	6	815884	815889	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	206896247
14096	NC_011295	TAG	2	6	815916	815921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206896247
14097	NC_011295	AGT	2	6	815986	815991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206896247
14098	NC_011295	TCC	2	6	815992	815997	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	206896247
14099	NC_011295	GCT	2	6	816025	816030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206895109
14100	NC_011295	AAC	2	6	816067	816072	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	206895109
14101	NC_011295	CT	3	6	816110	816115	0 %	50 %	0 %	50 %	206895109
14102	NC_011295	ATA	2	6	816152	816157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	206895109
14103	NC_011295	GCTT	2	8	816172	816179	0 %	50 %	25 %	25 %	206895109
14104	NC_011295	CTTTG	2	10	816264	816273	0 %	60 %	20 %	20 %	206895109
14105	NC_011295	TCT	2	6	816320	816325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206895109
14106	NC_011295	CTT	2	6	816350	816355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206895109
14107	NC_011295	CA	4	8	816397	816404	50 %	0 %	0 %	50 %	206895109
14108	NC_011295	AAGA	2	8	816408	816415	75 %	0 %	25 %	0 %	206895109
14109	NC_011295	TTC	2	6	816584	816589	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206895949
14110	NC_011295	CAT	2	6	816618	816623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206895949
14111	NC_011295	CAA	2	6	816635	816640	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	206895949
14112	NC_011295	TCA	2	6	816766	816771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206895949
14113	NC_011295	GAT	2	6	816824	816829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206895949
14114	NC_011295	CCA	2	6	816845	816850	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	206895949
14115	NC_011295	CG	3	6	816875	816880	0 %	0 %	50 %	50 %	206895949
14116	NC_011295	CAG	2	6	816920	816925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206895949
14117	NC_011295	TTC	2	6	816951	816956	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206895949
14118	NC_011295	GTA	2	6	816987	816992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206895949
14119	NC_011295	CTTA	2	8	817032	817039	25 %	50 %	0 %	25 %	206895949
14120	NC_011295	AGAA	2	8	817040	817047	75 %	0 %	25 %	0 %	206895949
14121	NC_011295	GTC	2	6	817054	817059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206895949
14122	NC_011295	ACCA	2	8	817119	817126	50 %	0 %	0 %	50 %	206895949
14123	NC_011295	A	8	8	817206	817213	100 %	0 %	0 %	0 %	206895949
14124	NC_011295	AAG	2	6	817233	817238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206895949
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14129	NC_011295	CTT	2	6	817389	817394	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206895949
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14139	NC_011295	CAT	2	6	817753	817758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206895983
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14142	NC_011295	A	6	6	817883	817888	100 %	0 %	0 %	0 %	206895983
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14151	NC_011295	CTT	2	6	818581	818586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206896191
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14240	NC_011295	T	6	6	823405	823410	0 %	100 %	0 %	0 %	206895860
14241	NC_011295	CAG	2	6	823433	823438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206895860
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14244	NC_011295	ATC	2	6	823476	823481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206895860
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14271	NC_011295	GCC	2	6	825295	825300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	206896544
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14477	NC_011295	ATC	2	6	836712	836717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206895323
14478	NC_011295	ATG	2	6	836751	836756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206895323
14479	NC_011295	AC	3	6	836806	836811	50 %	0 %	0 %	50 %	206895323
14480	NC_011295	CCT	2	6	836848	836853	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	206896238
14481	NC_011295	ACT	2	6	836931	836936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206896238
14482	NC_011295	A	7	7	836987	836993	100 %	0 %	0 %	0 %	206896238
14483	NC_011295	ACC	2	6	837038	837043	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	206896238
14484	NC_011295	CAC	2	6	837130	837135	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	206896238
14485	NC_011295	CCT	2	6	837159	837164	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	206896238
14486	NC_011295	GA	3	6	837220	837225	50 %	0 %	50 %	0 %	206896238
14487	NC_011295	TTC	2	6	837262	837267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206895154
14488	NC_011295	ACCAG	2	10	837296	837305	40 %	0 %	20 %	40 %	206895154
14489	NC_011295	GTATC	2	10	837341	837350	20 %	40 %	20 %	20 %	206895154
14490	NC_011295	TAC	2	6	837376	837381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206895154
14491	NC_011295	CAC	2	6	837405	837410	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	206895154
14492	NC_011295	TTA	2	6	837431	837436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	206895154
14493	NC_011295	CTG	2	6	837442	837447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206895154
14494	NC_011295	A	6	6	837593	837598	100 %	0 %	0 %	0 %	206895154
14495	NC_011295	TTC	2	6	837636	837641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206895154
14496	NC_011295	CCT	2	6	837644	837649	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	206895933
14497	NC_011295	GAA	2	6	837669	837674	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206895933
14498	NC_011295	ACA	4	12	837685	837696	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	206895933
14499	NC_011295	AGA	2	6	837736	837741	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206895933
14500	NC_011295	CAA	2	6	837755	837760	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	206895933

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