MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Coprothermobacter proteolyticus DSM 5265 chromosome

Total Repeats: 24215

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_011295	AGA	2	6	579362	579367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206896085
10002	NC_011295	GTG	2	6	579399	579404	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	206896085
10003	NC_011295	AGA	2	6	579413	579418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206896085
10004	NC_011295	GTT	2	6	579462	579467	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	206896085
10005	NC_011295	TAA	2	6	579526	579531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	206895271
10006	NC_011295	GAA	2	6	579535	579540	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206895271
10007	NC_011295	CTT	2	6	579554	579559	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206895271
10008	NC_011295	AAC	2	6	579583	579588	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	206895271
10009	NC_011295	GTG	2	6	579597	579602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	206895271
10010	NC_011295	CTT	2	6	579611	579616	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206895271
10011	NC_011295	ACA	2	6	579666	579671	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	206895271
10012	NC_011295	AGA	2	6	579748	579753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206895271
10013	NC_011295	TGG	3	9	579774	579782	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	206895271
10014	NC_011295	TGGCC	2	10	579785	579794	0 %	20 %	40 %	40 %	206895271
10015	NC_011295	GGA	2	6	579847	579852	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	206895271
10016	NC_011295	T	8	8	579958	579965	0 %	100 %	0 %	0 %	206895917
10017	NC_011295	AGA	2	6	580008	580013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206895917
10018	NC_011295	ATC	2	6	580289	580294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206895917
10019	NC_011295	AAG	2	6	580385	580390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206895917
10020	NC_011295	ATA	2	6	580416	580421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	206895917
10021	NC_011295	AGA	2	6	580445	580450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206895370
10022	NC_011295	TTG	2	6	580555	580560	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	206895370
10023	NC_011295	CTT	2	6	580566	580571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206895370
10024	NC_011295	ACT	2	6	580682	580687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206895370
10025	NC_011295	T	7	7	580732	580738	0 %	100 %	0 %	0 %	206895370
10026	NC_011295	ACT	2	6	580816	580821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206895370
10027	NC_011295	A	6	6	580866	580871	100 %	0 %	0 %	0 %	206895370
10028	NC_011295	GAG	2	6	580882	580887	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	206895370
10029	NC_011295	TGA	2	6	580934	580939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206896031
10030	NC_011295	CTG	2	6	581113	581118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206896031
10031	NC_011295	TTG	2	6	581127	581132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	206896031
10032	NC_011295	GTA	2	6	581211	581216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206896031
10033	NC_011295	GCGGCA	2	12	581226	581237	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	206896031
10034	NC_011295	GAA	2	6	581245	581250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206896031
10035	NC_011295	TGG	2	6	581272	581277	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	206896031
10036	NC_011295	GCTGG	2	10	581333	581342	0 %	20 %	60 %	20 %	206896031
10037	NC_011295	TGC	2	6	581354	581359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206896031
10038	NC_011295	GCT	2	6	581520	581525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206896031
10039	NC_011295	CT	3	6	581567	581572	0 %	50 %	0 %	50 %	206896031
10040	NC_011295	AAG	2	6	581622	581627	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206896031
10041	NC_011295	TGG	2	6	581644	581649	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	206896031
10042	NC_011295	GGA	2	6	581652	581657	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	206896031
10043	NC_011295	TTC	2	6	581674	581679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206896031
10044	NC_011295	GC	3	6	581725	581730	0 %	0 %	50 %	50 %	206896031
10045	NC_011295	TGG	2	6	581755	581760	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	206896031
10046	NC_011295	AAG	2	6	581785	581790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206896031
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10048	NC_011295	GGA	2	6	581964	581969	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	206895265
10049	NC_011295	A	6	6	581975	581980	100 %	0 %	0 %	0 %	206895265
10050	NC_011295	GAA	2	6	582056	582061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206895265
10051	NC_011295	TTG	2	6	582110	582115	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	206895265
10052	NC_011295	GAA	2	6	582157	582162	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206895265
10053	NC_011295	GA	4	8	582178	582185	50 %	0 %	50 %	0 %	206895265
10054	NC_011295	AGG	2	6	582216	582221	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	206895265
10055	NC_011295	TTAC	2	8	582279	582286	25 %	50 %	0 %	25 %	206895844
10056	NC_011295	TTA	2	6	582376	582381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	206895844
10057	NC_011295	ATG	2	6	582385	582390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206895844
10058	NC_011295	AGG	2	6	582457	582462	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	206895844
10059	NC_011295	AAC	2	6	582497	582502	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	206895844
10060	NC_011295	GAA	2	6	582545	582550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206895844
10061	NC_011295	AAG	2	6	582627	582632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206895844
10062	NC_011295	CCA	2	6	582676	582681	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	206895844
10063	NC_011295	CAA	2	6	582696	582701	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	206895844
10064	NC_011295	GCA	2	6	582706	582711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206895844
10065	NC_011295	GAA	2	6	582762	582767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206895844
10066	NC_011295	TTG	2	6	582796	582801	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	206895844
10067	NC_011295	GGA	2	6	582875	582880	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	206895844
10068	NC_011295	AAG	2	6	582903	582908	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206895844
10069	NC_011295	TCCT	2	8	582966	582973	0 %	50 %	0 %	50 %	206895844
10070	NC_011295	GTT	2	6	583017	583022	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	206895844
10071	NC_011295	AG	3	6	583211	583216	50 %	0 %	50 %	0 %	206895844
10072	NC_011295	GCA	2	6	583240	583245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206895844
10073	NC_011295	GAA	2	6	583248	583253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206895844
10074	NC_011295	AGC	2	6	583282	583287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206895844
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10076	NC_011295	TGG	2	6	583349	583354	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	206895844
10077	NC_011295	GCT	2	6	583377	583382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206895844
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10079	NC_011295	TGG	3	9	583469	583477	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	206895844
10080	NC_011295	AGA	2	6	583636	583641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206895844
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10082	NC_011295	GCA	2	6	583746	583751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206895844
10083	NC_011295	TGC	2	6	583757	583762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206895844
10084	NC_011295	GAA	2	6	583836	583841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206895844
10085	NC_011295	TCA	2	6	584038	584043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206896466
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10087	NC_011295	CTT	2	6	584201	584206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206896466
10088	NC_011295	TGCT	2	8	584308	584315	0 %	50 %	25 %	25 %	206896466
10089	NC_011295	ACT	2	6	584327	584332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206896466
10090	NC_011295	CAG	2	6	584368	584373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206896466
10091	NC_011295	CAT	2	6	584416	584421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206896466
10092	NC_011295	TTC	2	6	584445	584450	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206896466
10093	NC_011295	TAA	2	6	584455	584460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	206896466
10094	NC_011295	TGA	2	6	584485	584490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206896466
10095	NC_011295	GCA	2	6	584511	584516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206896466
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10097	NC_011295	CGCT	2	8	584609	584616	0 %	25 %	25 %	50 %	206896466
10098	NC_011295	GCAC	2	8	584699	584706	25 %	0 %	25 %	50 %	206896466
10099	NC_011295	CTT	2	6	584736	584741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206896466
10100	NC_011295	TAG	2	6	584893	584898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206896466
10101	NC_011295	GGT	2	6	584927	584932	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	206896466
10102	NC_011295	GAG	2	6	584956	584961	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	206896466
10103	NC_011295	AAGAA	2	10	584987	584996	80 %	0 %	20 %	0 %	206895789
10104	NC_011295	CGA	2	6	585023	585028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206895789
10105	NC_011295	AG	3	6	585051	585056	50 %	0 %	50 %	0 %	206895789
10106	NC_011295	TTCT	2	8	585060	585067	0 %	75 %	0 %	25 %	206895789
10107	NC_011295	GAA	2	6	585199	585204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206895789
10108	NC_011295	TGAG	2	8	585362	585369	25 %	25 %	50 %	0 %	206895789
10109	NC_011295	CT	3	6	585370	585375	0 %	50 %	0 %	50 %	206895789
10110	NC_011295	TAGC	2	8	585425	585432	25 %	25 %	25 %	25 %	206895789
10111	NC_011295	GGT	2	6	585580	585585	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	206895789
10112	NC_011295	TTGGT	2	10	585647	585656	0 %	60 %	40 %	0 %	206895789
10113	NC_011295	GCT	2	6	585687	585692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206895789
10114	NC_011295	CTG	2	6	585736	585741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206895789
10115	NC_011295	CTT	2	6	585757	585762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206895789
10116	NC_011295	GCTC	2	8	585837	585844	0 %	25 %	25 %	50 %	206895789
10117	NC_011295	AGC	2	6	585902	585907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206895789
10118	NC_011295	AGC	2	6	585918	585923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206895789
10119	NC_011295	GTT	2	6	585994	585999	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	206895789
10120	NC_011295	CTT	2	6	586050	586055	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206895789
10121	NC_011295	ACC	2	6	586071	586076	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	206895789
10122	NC_011295	TTC	2	6	586183	586188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206895789
10123	NC_011295	ACTG	2	8	586426	586433	25 %	25 %	25 %	25 %	206896278
10124	NC_011295	GAA	2	6	586535	586540	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206896278
10125	NC_011295	GATCA	2	10	586625	586634	40 %	20 %	20 %	20 %	206896278
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10128	NC_011295	TGGT	2	8	586710	586717	0 %	50 %	50 %	0 %	206896278
10129	NC_011295	GGT	2	6	586766	586771	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	206896278
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10135	NC_011295	ACC	2	6	587209	587214	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	206896278
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10158	NC_011295	GCG	2	6	588544	588549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	206895127
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10168	NC_011295	CA	3	6	589663	589668	50 %	0 %	0 %	50 %	206895998
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10215	NC_011295	AAAAC	2	10	593316	593325	80 %	0 %	0 %	20 %	206896201
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10223	NC_011295	CTTA	2	8	593662	593669	25 %	50 %	0 %	25 %	206896201
10224	NC_011295	TGC	2	6	593693	593698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206896201
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10230	NC_011295	GGT	2	6	594116	594121	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	206896201
10231	NC_011295	CAA	2	6	594152	594157	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	206896201
10232	NC_011295	ATC	2	6	594247	594252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206896201
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10241	NC_011295	TTTCTG	2	12	594914	594925	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	206896540
10242	NC_011295	GCT	2	6	595030	595035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206896540
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10355	NC_011295	AAC	2	6	601358	601363	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	206895268
10356	NC_011295	CTT	2	6	601405	601410	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206895268
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10480	NC_011295	CCT	2	6	609064	609069	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	206895925
10481	NC_011295	GCCA	2	8	609088	609095	25 %	0 %	25 %	50 %	206895925
10482	NC_011295	GT	3	6	609154	609159	0 %	50 %	50 %	0 %	206895925
10483	NC_011295	TTG	2	6	609182	609187	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	206895925
10484	NC_011295	TCG	2	6	609214	609219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206895925
10485	NC_011295	CGT	2	6	609269	609274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206895925
10486	NC_011295	TC	3	6	609305	609310	0 %	50 %	0 %	50 %	206895925
10487	NC_011295	TCA	2	6	609382	609387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206895925
10488	NC_011295	CGT	2	6	609467	609472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206895925
10489	NC_011295	AGA	2	6	609478	609483	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206895925
10490	NC_011295	TCCATG	2	12	609514	609525	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	206895925
10491	NC_011295	T	6	6	609791	609796	0 %	100 %	0 %	0 %	206895434
10492	NC_011295	CTG	2	6	609802	609807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206895434
10493	NC_011295	AGA	2	6	609892	609897	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206895434
10494	NC_011295	GTC	2	6	609926	609931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206895434
10495	NC_011295	CTC	2	6	609968	609973	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	206895434
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10498	NC_011295	AGG	2	6	610153	610158	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	206895434
10499	NC_011295	ACTA	2	8	610169	610176	50 %	25 %	0 %	25 %	206895434
10500	NC_011295	AAT	2	6	610387	610392	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	206896128

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