MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Coprothermobacter proteolyticus DSM 5265 chromosome

Total Repeats: 24215

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_011295	ATG	2	6	28434	28439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206896405
502	NC_011295	GTT	2	6	28511	28516	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	206896405
503	NC_011295	GAAT	2	8	28765	28772	50 %	25 %	25 %	0 %	206896405
504	NC_011295	TTGT	2	8	28796	28803	0 %	75 %	25 %	0 %	206895579
505	NC_011295	GAT	2	6	28817	28822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206895579
506	NC_011295	ATG	2	6	28860	28865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206895579
507	NC_011295	TTTC	2	8	28866	28873	0 %	75 %	0 %	25 %	206895579
508	NC_011295	ATT	2	6	28931	28936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	206895579
509	NC_011295	TAC	2	6	28963	28968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206895579
510	NC_011295	CCG	2	6	29049	29054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	206895579
511	NC_011295	TGT	2	6	29119	29124	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	206895579
512	NC_011295	CGC	2	6	29153	29158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	206895579
513	NC_011295	AAGA	2	8	29175	29182	75 %	0 %	25 %	0 %	206895579
514	NC_011295	GAA	2	6	29195	29200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206895579
515	NC_011295	CCT	2	6	29209	29214	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	206895579
516	NC_011295	GAAG	2	8	29255	29262	50 %	0 %	50 %	0 %	206895579
517	NC_011295	GAAG	2	8	29314	29321	50 %	0 %	50 %	0 %	206895579
518	NC_011295	GAAAA	2	10	29525	29534	80 %	0 %	20 %	0 %	206895579
519	NC_011295	A	7	7	29531	29537	100 %	0 %	0 %	0 %	206895579
520	NC_011295	AGA	2	6	29539	29544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206895579
521	NC_011295	A	7	7	29663	29669	100 %	0 %	0 %	0 %	206895579
522	NC_011295	TGG	2	6	29707	29712	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	206895579
523	NC_011295	CTT	2	6	29753	29758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206895579
524	NC_011295	GGA	2	6	29779	29784	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	206895579
525	NC_011295	AG	3	6	29814	29819	50 %	0 %	50 %	0 %	206895579
526	NC_011295	TCA	2	6	29875	29880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206895579
527	NC_011295	TGC	2	6	29968	29973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206895579
528	NC_011295	TGC	2	6	30087	30092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206895579
529	NC_011295	AGG	2	6	30292	30297	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	206895234
530	NC_011295	AAG	2	6	30350	30355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206895234
531	NC_011295	A	6	6	30835	30840	100 %	0 %	0 %	0 %	206896272
532	NC_011295	TGA	2	6	30841	30846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206896272
533	NC_011295	GAA	2	6	30857	30862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206896272
534	NC_011295	TTAC	2	8	30871	30878	25 %	50 %	0 %	25 %	206896272
535	NC_011295	ATG	2	6	30885	30890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206896272
536	NC_011295	CCACT	2	10	30897	30906	20 %	20 %	0 %	60 %	206896272
537	NC_011295	CAA	2	6	30997	31002	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	206896272
538	NC_011295	GAAA	2	8	31038	31045	75 %	0 %	25 %	0 %	206896272
539	NC_011295	CAT	2	6	31048	31053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206896272
540	NC_011295	GCA	2	6	31100	31105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206896272
541	NC_011295	AGA	2	6	31141	31146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206896272
542	NC_011295	CTT	2	6	31184	31189	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206896272
543	NC_011295	CAG	2	6	31302	31307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206896272
544	NC_011295	GAA	2	6	31361	31366	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206896272
545	NC_011295	AAG	2	6	31389	31394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206896272
546	NC_011295	GCA	2	6	31502	31507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206896272
547	NC_011295	TCAT	2	8	31566	31573	25 %	50 %	0 %	25 %	206896272
548	NC_011295	CTAT	2	8	31585	31592	25 %	50 %	0 %	25 %	206896272
549	NC_011295	GCA	2	6	31634	31639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206896272
550	NC_011295	CGA	2	6	31717	31722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206896272
551	NC_011295	CAT	2	6	31765	31770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206896272
552	NC_011295	AGATC	2	10	31834	31843	40 %	20 %	20 %	20 %	206896272
553	NC_011295	GCA	2	6	31882	31887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206896272
554	NC_011295	GAA	2	6	31910	31915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206896272
555	NC_011295	AAAACA	2	12	31951	31962	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	206895910
556	NC_011295	AGA	2	6	32001	32006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206895910
557	NC_011295	TGG	2	6	32084	32089	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	206895910
558	NC_011295	AGT	2	6	32144	32149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206895910
559	NC_011295	A	7	7	32162	32168	100 %	0 %	0 %	0 %	206895910
560	NC_011295	T	6	6	32199	32204	0 %	100 %	0 %	0 %	206895910
561	NC_011295	AGA	2	6	32225	32230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206895910
562	NC_011295	ACT	2	6	32232	32237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206895910
563	NC_011295	CTA	2	6	32258	32263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206895910
564	NC_011295	AAGC	2	8	32314	32321	50 %	0 %	25 %	25 %	206895910
565	NC_011295	GAA	2	6	32355	32360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206895910
566	NC_011295	AG	3	6	32432	32437	50 %	0 %	50 %	0 %	206895910
567	NC_011295	GCG	2	6	32458	32463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	206895910
568	NC_011295	ATG	2	6	32481	32486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206895910
569	NC_011295	CAG	2	6	32491	32496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206895910
570	NC_011295	GA	3	6	32588	32593	50 %	0 %	50 %	0 %	206895910
571	NC_011295	AAG	2	6	32607	32612	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206895910
572	NC_011295	ACA	2	6	32629	32634	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	206895910
573	NC_011295	TTG	2	6	32731	32736	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	206895910
574	NC_011295	CCTC	2	8	32749	32756	0 %	25 %	0 %	75 %	206895910
575	NC_011295	AAG	2	6	32762	32767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206895910
576	NC_011295	ATG	2	6	32897	32902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206895272
577	NC_011295	CT	3	6	32926	32931	0 %	50 %	0 %	50 %	206895272
578	NC_011295	GCA	2	6	33032	33037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206895272
579	NC_011295	ATGA	2	8	33085	33092	50 %	25 %	25 %	0 %	206895272
580	NC_011295	TGA	3	9	33090	33098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206895272
581	NC_011295	ACTCC	2	10	33149	33158	20 %	20 %	0 %	60 %	206895272
582	NC_011295	AGC	2	6	33177	33182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206895272
583	NC_011295	GGT	2	6	33193	33198	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	206895272
584	NC_011295	ACT	2	6	33215	33220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206895272
585	NC_011295	AAG	2	6	33233	33238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206895272
586	NC_011295	TGC	2	6	33359	33364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206895272
587	NC_011295	TAG	2	6	33416	33421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206895272
588	NC_011295	ATG	2	6	33425	33430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206895272
589	NC_011295	ACC	2	6	33711	33716	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	206896053
590	NC_011295	GGC	2	6	33792	33797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	206896053
591	NC_011295	TGGT	2	8	33822	33829	0 %	50 %	50 %	0 %	206896053
592	NC_011295	GTA	2	6	33888	33893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206896053
593	NC_011295	ACC	2	6	33928	33933	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	206896053
594	NC_011295	ATT	2	6	33951	33956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	206896053
595	NC_011295	GCT	3	9	34042	34050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206896053
596	NC_011295	CTTT	2	8	34058	34065	0 %	75 %	0 %	25 %	206896053
597	NC_011295	TAA	2	6	34222	34227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	206896053
598	NC_011295	ATG	2	6	34318	34323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206896053
599	NC_011295	TCA	2	6	34375	34380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206896053
600	NC_011295	ATC	2	6	34392	34397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206896053
601	NC_011295	TTA	2	6	34402	34407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	206896053
602	NC_011295	AT	3	6	34534	34539	50 %	50 %	0 %	0 %	206895395
603	NC_011295	CTA	2	6	34552	34557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206895395
604	NC_011295	GCC	2	6	34597	34602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	206895395
605	NC_011295	CAG	2	6	34603	34608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206895395
606	NC_011295	CAA	2	6	34687	34692	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	206895395
607	NC_011295	CGA	2	6	34721	34726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206895395
608	NC_011295	TGT	2	6	34732	34737	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	206895395
609	NC_011295	AAG	2	6	34770	34775	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206895395
610	NC_011295	CAG	2	6	34831	34836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206895395
611	NC_011295	AAT	2	6	34838	34843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	206895395
612	NC_011295	GTT	2	6	34847	34852	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	206895395
613	NC_011295	CAAA	2	8	34855	34862	75 %	0 %	0 %	25 %	206895395
614	NC_011295	GCA	3	9	34863	34871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206895395
615	NC_011295	AGT	2	6	34919	34924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206895395
616	NC_011295	AGC	2	6	34961	34966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206895395
617	NC_011295	TGC	2	6	35045	35050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206895395
618	NC_011295	CA	3	6	35082	35087	50 %	0 %	0 %	50 %	206895395
619	NC_011295	TGC	2	6	35123	35128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206895395
620	NC_011295	GCG	2	6	35160	35165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	206895395
621	NC_011295	AGCA	2	8	35189	35196	50 %	0 %	25 %	25 %	206895395
622	NC_011295	GCCAT	2	10	35199	35208	20 %	20 %	20 %	40 %	206895395
623	NC_011295	TGA	2	6	35296	35301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206895395
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625	NC_011295	AGC	2	6	35348	35353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206895395
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1000	NC_011295	CCT	2	6	57686	57691	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	206895387

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