MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Candidatus Phytoplasma mali chromosome

Total Repeats: 16698

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011047	CAAACA	2	12	1246	1257	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194246404
2	NC_011047	TAA	2	6	1260	1265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194246404
3	NC_011047	ATT	2	6	1311	1316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194246404
4	NC_011047	A	6	6	1317	1322	100 %	0 %	0 %	0 %	194246404
5	NC_011047	A	7	7	1337	1343	100 %	0 %	0 %	0 %	194246404
6	NC_011047	TAA	2	6	1350	1355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194246404
7	NC_011047	ATC	2	6	1359	1364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194246404
8	NC_011047	ACA	2	6	1377	1382	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194246404
9	NC_011047	CAA	3	9	1406	1414	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194246404
10	NC_011047	TAA	3	9	1423	1431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194246404
11	NC_011047	ATT	2	6	1693	1698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194246405
12	NC_011047	T	6	6	1697	1702	0 %	100 %	0 %	0 %	194246405
13	NC_011047	AAT	2	6	1708	1713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194246405
14	NC_011047	TAAAA	3	15	1723	1737	80 %	20 %	0 %	0 %	194246405
15	NC_011047	AAAC	2	8	1743	1750	75 %	0 %	0 %	25 %	194246405
16	NC_011047	TAA	2	6	1751	1756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194246405
17	NC_011047	TAG	2	6	1768	1773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194246405
18	NC_011047	AAAT	2	8	1784	1791	75 %	25 %	0 %	0 %	194246405
19	NC_011047	AAC	2	6	1794	1799	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194246405
20	NC_011047	ATA	2	6	1800	1805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194246405
21	NC_011047	A	7	7	1809	1815	100 %	0 %	0 %	0 %	194246405
22	NC_011047	ATTT	2	8	1822	1829	25 %	75 %	0 %	0 %	194246405
23	NC_011047	AATTT	2	10	1834	1843	40 %	60 %	0 %	0 %	194246405
24	NC_011047	ATAA	2	8	1864	1871	75 %	25 %	0 %	0 %	194246405
25	NC_011047	TAA	3	9	1913	1921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194246405
26	NC_011047	ATT	2	6	1952	1957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194246405
27	NC_011047	TAT	2	6	1966	1971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194246405
28	NC_011047	ATAA	2	8	1987	1994	75 %	25 %	0 %	0 %	194246405
29	NC_011047	A	7	7	2009	2015	100 %	0 %	0 %	0 %	194246405
30	NC_011047	AAT	2	6	2082	2087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194246405
31	NC_011047	A	7	7	2114	2120	100 %	0 %	0 %	0 %	194246405
32	NC_011047	AATA	2	8	2131	2138	75 %	25 %	0 %	0 %	194246405
33	NC_011047	A	6	6	2148	2153	100 %	0 %	0 %	0 %	194246405
34	NC_011047	AAT	2	6	2171	2176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194246405
35	NC_011047	A	6	6	2210	2215	100 %	0 %	0 %	0 %	194246405
36	NC_011047	A	6	6	2225	2230	100 %	0 %	0 %	0 %	194246405
37	NC_011047	ATTA	2	8	2411	2418	50 %	50 %	0 %	0 %	194246406
38	NC_011047	TAA	2	6	2420	2425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194246406
39	NC_011047	TTC	2	6	2433	2438	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194246406
40	NC_011047	TA	3	6	2447	2452	50 %	50 %	0 %	0 %	194246406
41	NC_011047	AT	3	6	2480	2485	50 %	50 %	0 %	0 %	194246406
42	NC_011047	AT	3	6	2503	2508	50 %	50 %	0 %	0 %	194246406
43	NC_011047	T	8	8	2508	2515	0 %	100 %	0 %	0 %	194246406
44	NC_011047	A	6	6	2521	2526	100 %	0 %	0 %	0 %	194246406
45	NC_011047	T	6	6	2535	2540	0 %	100 %	0 %	0 %	194246406
46	NC_011047	ATT	2	6	2575	2580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194246406
47	NC_011047	T	9	9	2591	2599	0 %	100 %	0 %	0 %	194246406
48	NC_011047	T	6	6	2601	2606	0 %	100 %	0 %	0 %	194246406
49	NC_011047	TAA	2	6	2628	2633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194246406
50	NC_011047	A	9	9	2642	2650	100 %	0 %	0 %	0 %	194246406
51	NC_011047	T	7	7	2653	2659	0 %	100 %	0 %	0 %	194246406
52	NC_011047	AAT	2	6	2685	2690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194246406
53	NC_011047	GTT	2	6	2694	2699	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194246406
54	NC_011047	A	8	8	2706	2713	100 %	0 %	0 %	0 %	194246406
55	NC_011047	TAA	2	6	2718	2723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194246406
56	NC_011047	A	6	6	2809	2814	100 %	0 %	0 %	0 %	194246406
57	NC_011047	TAA	2	6	2817	2822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194246406
58	NC_011047	ATA	2	6	2828	2833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194246406
59	NC_011047	AAAT	2	8	2844	2851	75 %	25 %	0 %	0 %	194246406
60	NC_011047	GTT	2	6	2938	2943	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194246406
61	NC_011047	TAAT	2	8	2968	2975	50 %	50 %	0 %	0 %	194246406
62	NC_011047	AGA	2	6	2997	3002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194246406
63	NC_011047	A	6	6	3044	3049	100 %	0 %	0 %	0 %	194246406
64	NC_011047	ATA	2	6	3061	3066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194246406
65	NC_011047	ACT	2	6	3079	3084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194246406
66	NC_011047	CTT	2	6	3158	3163	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194246406
67	NC_011047	ATA	3	9	3187	3195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194246406
68	NC_011047	A	6	6	3211	3216	100 %	0 %	0 %	0 %	194246406
69	NC_011047	T	6	6	3252	3257	0 %	100 %	0 %	0 %	194246406
70	NC_011047	TAC	2	6	3260	3265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194246406
71	NC_011047	ATAA	2	8	3278	3285	75 %	25 %	0 %	0 %	194246406
72	NC_011047	TAA	2	6	3317	3322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194246406
73	NC_011047	TA	3	6	3347	3352	50 %	50 %	0 %	0 %	194246406
74	NC_011047	CAA	2	6	3362	3367	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194246406
75	NC_011047	T	9	9	3411	3419	0 %	100 %	0 %	0 %	194246406
76	NC_011047	A	6	6	3427	3432	100 %	0 %	0 %	0 %	194246406
77	NC_011047	AT	3	6	3483	3488	50 %	50 %	0 %	0 %	194246406
78	NC_011047	TAT	2	6	3492	3497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194246406
79	NC_011047	T	7	7	3508	3514	0 %	100 %	0 %	0 %	194246407
80	NC_011047	T	7	7	3546	3552	0 %	100 %	0 %	0 %	194246407
81	NC_011047	A	6	6	3606	3611	100 %	0 %	0 %	0 %	194246407
82	NC_011047	T	6	6	3623	3628	0 %	100 %	0 %	0 %	194246407
83	NC_011047	ATT	2	6	3639	3644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194246407
84	NC_011047	AATT	2	8	3672	3679	50 %	50 %	0 %	0 %	194246407
85	NC_011047	T	6	6	3678	3683	0 %	100 %	0 %	0 %	194246407
86	NC_011047	ATA	2	6	3688	3693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194246407
87	NC_011047	TCT	2	6	3695	3700	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194246407
88	NC_011047	TAA	2	6	3731	3736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194246407
89	NC_011047	GAG	2	6	3746	3751	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194246407
90	NC_011047	A	7	7	3766	3772	100 %	0 %	0 %	0 %	194246407
91	NC_011047	AAT	2	6	3867	3872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194246407
92	NC_011047	A	6	6	3892	3897	100 %	0 %	0 %	0 %	194246407
93	NC_011047	AAT	2	6	3945	3950	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194246407
94	NC_011047	AAT	2	6	3990	3995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194246407
95	NC_011047	TAC	2	6	3996	4001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194246407
96	NC_011047	ATT	2	6	4033	4038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194246407
97	NC_011047	TAT	2	6	4053	4058	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194246407
98	NC_011047	TTC	2	6	4068	4073	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194246407
99	NC_011047	ATAA	2	8	4081	4088	75 %	25 %	0 %	0 %	194246407
100	NC_011047	A	6	6	4103	4108	100 %	0 %	0 %	0 %	194246407
101	NC_011047	TAA	3	9	4112	4120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194246407
102	NC_011047	A	6	6	4119	4124	100 %	0 %	0 %	0 %	194246407
103	NC_011047	TAC	2	6	4125	4130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194246407
104	NC_011047	ATAATT	2	12	4138	4149	50 %	50 %	0 %	0 %	194246407
105	NC_011047	GTT	2	6	4157	4162	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194246407
106	NC_011047	GCT	2	6	4177	4182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194246407
107	NC_011047	A	8	8	4189	4196	100 %	0 %	0 %	0 %	194246407
108	NC_011047	TACCT	2	10	4254	4263	20 %	40 %	0 %	40 %	194246407
109	NC_011047	A	7	7	4269	4275	100 %	0 %	0 %	0 %	194246407
110	NC_011047	AAAGT	2	10	4283	4292	60 %	20 %	20 %	0 %	194246407
111	NC_011047	T	7	7	4313	4319	0 %	100 %	0 %	0 %	194246407
112	NC_011047	ATT	2	6	4333	4338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194246407
113	NC_011047	A	6	6	4357	4362	100 %	0 %	0 %	0 %	194246407
114	NC_011047	AAAT	2	8	4383	4390	75 %	25 %	0 %	0 %	194246407
115	NC_011047	ATC	2	6	4395	4400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194246407
116	NC_011047	TAAA	2	8	4416	4423	75 %	25 %	0 %	0 %	194246407
117	NC_011047	GCTT	2	8	4474	4481	0 %	50 %	25 %	25 %	194246407
118	NC_011047	T	6	6	4480	4485	0 %	100 %	0 %	0 %	194246407
119	NC_011047	A	6	6	4504	4509	100 %	0 %	0 %	0 %	194246407
120	NC_011047	CAG	2	6	4511	4516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194246407
121	NC_011047	AAG	2	6	4529	4534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194246407
122	NC_011047	AT	5	10	4553	4562	50 %	50 %	0 %	0 %	194246407
123	NC_011047	CCAT	2	8	4563	4570	25 %	25 %	0 %	50 %	194246407
124	NC_011047	TTCAT	2	10	4582	4591	20 %	60 %	0 %	20 %	194246407
125	NC_011047	TAT	2	6	4623	4628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194246408
126	NC_011047	T	7	7	4638	4644	0 %	100 %	0 %	0 %	194246408
127	NC_011047	TTC	2	6	4651	4656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194246408
128	NC_011047	T	6	6	4689	4694	0 %	100 %	0 %	0 %	194246408
129	NC_011047	ATTA	2	8	4699	4706	50 %	50 %	0 %	0 %	194246408
130	NC_011047	ATG	2	6	4747	4752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194246408
131	NC_011047	AAT	2	6	4801	4806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194246408
132	NC_011047	TAAA	2	8	4852	4859	75 %	25 %	0 %	0 %	194246408
133	NC_011047	CTT	2	6	4866	4871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194246408
134	NC_011047	ACC	2	6	4909	4914	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194246408
135	NC_011047	AGT	2	6	4945	4950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194246408
136	NC_011047	T	6	6	4993	4998	0 %	100 %	0 %	0 %	194246408
137	NC_011047	ACC	2	6	5013	5018	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194246408
138	NC_011047	ACA	2	6	5045	5050	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194246408
139	NC_011047	T	7	7	5109	5115	0 %	100 %	0 %	0 %	194246408
140	NC_011047	AAT	2	6	5144	5149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194246408
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