MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlorobaculum parvum NCIB 8327 chromosome

Total Repeats: 41667

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
40001	NC_011027	CCT	2	6	2200616	2200621	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	193213636
40002	NC_011027	AGA	2	6	2200627	2200632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	193213636
40003	NC_011027	ACG	2	6	2200660	2200665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213636
40004	NC_011027	CCT	2	6	2200688	2200693	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	193213636
40005	NC_011027	AG	3	6	2200712	2200717	50 %	0 %	50 %	0 %	193213636
40006	NC_011027	CAG	2	6	2200755	2200760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213636
40007	NC_011027	CGG	2	6	2200883	2200888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193213636
40008	NC_011027	CTGG	2	8	2200900	2200907	0 %	25 %	50 %	25 %	193213636
40009	NC_011027	GCA	2	6	2201005	2201010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213636
40010	NC_011027	CAG	2	6	2201058	2201063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213636
40011	NC_011027	GCC	2	6	2201139	2201144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213637
40012	NC_011027	GGTG	2	8	2201196	2201203	0 %	25 %	75 %	0 %	193213637
40013	NC_011027	ATG	2	6	2201207	2201212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193213637
40014	NC_011027	GCC	2	6	2201227	2201232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213637
40015	NC_011027	GGT	2	6	2201244	2201249	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	193213637
40016	NC_011027	GCC	2	6	2201357	2201362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213637
40017	NC_011027	CCGA	2	8	2201372	2201379	25 %	0 %	25 %	50 %	193213637
40018	NC_011027	CGG	3	9	2201463	2201471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193213637
40019	NC_011027	C	6	6	2201486	2201491	0 %	0 %	0 %	100 %	193213637
40020	NC_011027	TCC	2	6	2201704	2201709	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	193213637
40021	NC_011027	GAT	2	6	2201764	2201769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193213637
40022	NC_011027	TGA	2	6	2201805	2201810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193213637
40023	NC_011027	GAC	2	6	2201881	2201886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213638
40024	NC_011027	CT	3	6	2201911	2201916	0 %	50 %	0 %	50 %	193213638
40025	NC_011027	ATG	2	6	2201933	2201938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193213638
40026	NC_011027	CGA	2	6	2201958	2201963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213638
40027	NC_011027	TCA	2	6	2201964	2201969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193213638
40028	NC_011027	AGGCCG	2	12	2201972	2201983	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	193213638
40029	NC_011027	GCG	2	6	2201995	2202000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193213638
40030	NC_011027	CCT	2	6	2202024	2202029	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	193213638
40031	NC_011027	GAC	2	6	2202065	2202070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213638
40032	NC_011027	CCG	2	6	2202131	2202136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213638
40033	NC_011027	AGC	2	6	2202173	2202178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213638
40034	NC_011027	CAG	2	6	2202214	2202219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213638
40035	NC_011027	CTC	2	6	2202220	2202225	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	193213638
40036	NC_011027	ATC	2	6	2202332	2202337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193213638
40037	NC_011027	TGA	2	6	2202366	2202371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193213638
40038	NC_011027	TCC	2	6	2202419	2202424	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	193213638
40039	NC_011027	CGT	2	6	2202426	2202431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213638
40040	NC_011027	AC	3	6	2202432	2202437	50 %	0 %	0 %	50 %	193213638
40041	NC_011027	CAC	2	6	2202456	2202461	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	193213638
40042	NC_011027	GCG	2	6	2202470	2202475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193213638
40043	NC_011027	GAC	2	6	2202508	2202513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213638
40044	NC_011027	GCG	2	6	2202518	2202523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193213638
40045	NC_011027	TAG	2	6	2202551	2202556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193213638
40046	NC_011027	CG	3	6	2202575	2202580	0 %	0 %	50 %	50 %	193213638
40047	NC_011027	TGC	2	6	2202687	2202692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213638
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40049	NC_011027	TGA	2	6	2202801	2202806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193213638
40050	NC_011027	CTC	2	6	2202817	2202822	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	193213638
40051	NC_011027	CCGG	2	8	2203060	2203067	0 %	0 %	50 %	50 %	193213639
40052	NC_011027	CGG	2	6	2203094	2203099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193213639
40053	NC_011027	GCAGT	2	10	2203110	2203119	20 %	20 %	40 %	20 %	193213639
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40055	NC_011027	ACCA	2	8	2203266	2203273	50 %	0 %	0 %	50 %	193213639
40056	NC_011027	CGAG	2	8	2203313	2203320	25 %	0 %	50 %	25 %	193213639
40057	NC_011027	TGA	2	6	2203331	2203336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193213639
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40087	NC_011027	A	6	6	2204747	2204752	100 %	0 %	0 %	0 %	193213640
40088	NC_011027	CTCCG	2	10	2204766	2204775	0 %	20 %	20 %	60 %	193213640
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40099	NC_011027	CCGA	2	8	2205580	2205587	25 %	0 %	25 %	50 %	193213641
40100	NC_011027	TCA	2	6	2205646	2205651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193213641
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40103	NC_011027	TGC	2	6	2205754	2205759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213641
40104	NC_011027	GGA	2	6	2205767	2205772	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	193213641
40105	NC_011027	CGGCAC	2	12	2205806	2205817	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	193213641
40106	NC_011027	GCAACC	2	12	2205850	2205861	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	193213641
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40114	NC_011027	A	6	6	2206202	2206207	100 %	0 %	0 %	0 %	193213641
40115	NC_011027	CTT	2	6	2206323	2206328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193213642
40116	NC_011027	AGC	2	6	2206417	2206422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213642
40117	NC_011027	CGA	2	6	2206487	2206492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213642
40118	NC_011027	GCA	2	6	2206542	2206547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213642
40119	NC_011027	GAC	2	6	2206554	2206559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213642
40120	NC_011027	ATC	2	6	2206560	2206565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193213642
40121	NC_011027	GCG	2	6	2206566	2206571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193213642
40122	NC_011027	AGG	2	6	2206618	2206623	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	193213642
40123	NC_011027	CTT	2	6	2206634	2206639	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193213642
40124	NC_011027	CGG	2	6	2206694	2206699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193213642
40125	NC_011027	GCA	2	6	2206702	2206707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213642
40126	NC_011027	ATC	2	6	2206713	2206718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193213642
40127	NC_011027	TCGGT	2	10	2206762	2206771	0 %	40 %	40 %	20 %	193213642
40128	NC_011027	GGA	2	6	2206814	2206819	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	193213642
40129	NC_011027	GGC	2	6	2206826	2206831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193213642
40130	NC_011027	CGC	2	6	2206856	2206861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213642
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40133	NC_011027	ATG	2	6	2206993	2206998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193213642
40134	NC_011027	GCT	2	6	2207009	2207014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213642
40135	NC_011027	CGA	2	6	2207039	2207044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213642
40136	NC_011027	GCA	2	6	2207180	2207185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213642
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40138	NC_011027	CATA	2	8	2208600	2208607	50 %	25 %	0 %	25 %	193213643
40139	NC_011027	T	6	6	2208703	2208708	0 %	100 %	0 %	0 %	193213643
40140	NC_011027	AAG	2	6	2208717	2208722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	193213643
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40142	NC_011027	CAT	2	6	2208921	2208926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193213643
40143	NC_011027	GTC	2	6	2209070	2209075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213643
40144	NC_011027	TCC	2	6	2209121	2209126	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	193213643
40145	NC_011027	CGG	2	6	2209152	2209157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193213644
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40148	NC_011027	CAC	2	6	2209289	2209294	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	193213644
40149	NC_011027	CCT	2	6	2209378	2209383	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	193213644
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40177	NC_011027	TGA	2	6	2210961	2210966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193213645
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40184	NC_011027	GGC	2	6	2211322	2211327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193213645
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40186	NC_011027	TCG	2	6	2211440	2211445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213645
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40192	NC_011027	GCT	2	6	2211660	2211665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213645
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40199	NC_011027	CGA	2	6	2212027	2212032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213645
40200	NC_011027	ATC	2	6	2212070	2212075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193213645
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40202	NC_011027	GGT	2	6	2212143	2212148	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	193213645
40203	NC_011027	ATCCAT	2	12	2212159	2212170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193213645
40204	NC_011027	TGA	2	6	2212326	2212331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193213646
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40206	NC_011027	GGC	3	9	2212417	2212425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193213646
40207	NC_011027	TCG	2	6	2212457	2212462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213646
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40209	NC_011027	ACACC	2	10	2212482	2212491	40 %	0 %	0 %	60 %	193213646
40210	NC_011027	CGAG	2	8	2212524	2212531	25 %	0 %	50 %	25 %	193213646
40211	NC_011027	AGC	2	6	2212532	2212537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213646
40212	NC_011027	TGC	2	6	2212548	2212553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213646
40213	NC_011027	GAG	2	6	2212562	2212567	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	193213646
40214	NC_011027	AGC	2	6	2212616	2212621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213646
40215	NC_011027	AGC	2	6	2212640	2212645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213646
40216	NC_011027	CCG	2	6	2212646	2212651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213646
40217	NC_011027	CTTC	2	8	2212730	2212737	0 %	50 %	0 %	50 %	193213646
40218	NC_011027	GCG	2	6	2212755	2212760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193213646
40219	NC_011027	TGC	2	6	2212791	2212796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213646
40220	NC_011027	CCT	2	6	2212809	2212814	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	193213646
40221	NC_011027	ATG	2	6	2212829	2212834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193213646
40222	NC_011027	CGA	2	6	2212835	2212840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213646
40223	NC_011027	TCC	2	6	2212853	2212858	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	193213646
40224	NC_011027	GC	3	6	2212927	2212932	0 %	0 %	50 %	50 %	193213646
40225	NC_011027	AGC	2	6	2212945	2212950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213646
40226	NC_011027	GCC	2	6	2212975	2212980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213646
40227	NC_011027	AGC	2	6	2213021	2213026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213647
40228	NC_011027	ACG	2	6	2213050	2213055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213647
40229	NC_011027	ACG	2	6	2213072	2213077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213647
40230	NC_011027	TGCG	2	8	2213107	2213114	0 %	25 %	50 %	25 %	193213647
40231	NC_011027	TCG	2	6	2213206	2213211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213647
40232	NC_011027	ACC	2	6	2213221	2213226	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	193213647
40233	NC_011027	CGCC	2	8	2213237	2213244	0 %	0 %	25 %	75 %	193213647
40234	NC_011027	GCG	2	6	2213296	2213301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193213647
40235	NC_011027	GCT	2	6	2213459	2213464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213647
40236	NC_011027	TCCG	3	12	2213485	2213496	0 %	25 %	25 %	50 %	193213647
40237	NC_011027	CCG	2	6	2213570	2213575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213647
40238	NC_011027	AGC	2	6	2213576	2213581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213647
40239	NC_011027	CCCCG	2	10	2213607	2213616	0 %	0 %	20 %	80 %	193213647
40240	NC_011027	AGG	2	6	2213726	2213731	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	193213647
40241	NC_011027	GCT	2	6	2213762	2213767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213647
40242	NC_011027	CGA	2	6	2213848	2213853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213648
40243	NC_011027	GCC	2	6	2213915	2213920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213648
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40245	NC_011027	GGA	2	6	2213969	2213974	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	193213648
40246	NC_011027	CGA	2	6	2214043	2214048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213648
40247	NC_011027	TCA	2	6	2214067	2214072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193213648
40248	NC_011027	CG	3	6	2214160	2214165	0 %	0 %	50 %	50 %	193213648
40249	NC_011027	GCC	3	9	2214222	2214230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213648
40250	NC_011027	CAG	2	6	2214251	2214256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213648
40251	NC_011027	CCCG	2	8	2214340	2214347	0 %	0 %	25 %	75 %	193213648
40252	NC_011027	GGCCGA	2	12	2214356	2214367	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	193213648
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40256	NC_011027	GGCG	2	8	2214540	2214547	0 %	0 %	75 %	25 %	193213649
40257	NC_011027	CGG	2	6	2214565	2214570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193213649
40258	NC_011027	CG	3	6	2214628	2214633	0 %	0 %	50 %	50 %	193213649
40259	NC_011027	CAC	2	6	2214646	2214651	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	193213649
40260	NC_011027	GC	3	6	2214712	2214717	0 %	0 %	50 %	50 %	193213649
40261	NC_011027	GCTCAC	2	12	2214735	2214746	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	193213649
40262	NC_011027	CAT	2	6	2214793	2214798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193213649
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40264	NC_011027	GGT	2	6	2214811	2214816	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	193213649
40265	NC_011027	GACGCC	2	12	2214982	2214993	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	193213649
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40270	NC_011027	GAT	2	6	2215210	2215215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193213649
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40299	NC_011027	TGA	2	6	2216694	2216699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193213651
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40302	NC_011027	GCG	2	6	2216779	2216784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193213651
40303	NC_011027	GCAG	2	8	2216871	2216878	25 %	0 %	50 %	25 %	193213651
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40305	NC_011027	TCG	2	6	2216898	2216903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213651
40306	NC_011027	CAGC	2	8	2216944	2216951	25 %	0 %	25 %	50 %	193213651
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40308	NC_011027	ACC	2	6	2217057	2217062	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	193213651
40309	NC_011027	TGA	2	6	2217151	2217156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193213651
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40312	NC_011027	GCA	2	6	2217256	2217261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213651
40313	NC_011027	CGG	2	6	2217287	2217292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193213651
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40315	NC_011027	CCA	3	9	2217343	2217351	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	193213651
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40324	NC_011027	CGGA	2	8	2218024	2218031	25 %	0 %	50 %	25 %	193213652
40325	NC_011027	TGC	2	6	2218201	2218206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213652
40326	NC_011027	ATG	2	6	2218209	2218214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193213652
40327	NC_011027	TCG	2	6	2218221	2218226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213652
40328	NC_011027	TCC	2	6	2218257	2218262	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	193213652
40329	NC_011027	TGA	2	6	2218267	2218272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193213652
40330	NC_011027	TGA	2	6	2218393	2218398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193213652
40331	NC_011027	CCG	2	6	2218407	2218412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213652
40332	NC_011027	GTC	2	6	2218457	2218462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213652
40333	NC_011027	CAC	2	6	2218538	2218543	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	193213652
40334	NC_011027	GCC	2	6	2218589	2218594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213652
40335	NC_011027	CAC	2	6	2218610	2218615	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	193213652
40336	NC_011027	GC	3	6	2218652	2218657	0 %	0 %	50 %	50 %	193213652
40337	NC_011027	ATG	2	6	2218713	2218718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193213652
40338	NC_011027	ATT	2	6	2218733	2218738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	193213652
40339	NC_011027	GAT	2	6	2218758	2218763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193213652
40340	NC_011027	ACG	2	6	2218945	2218950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213652
40341	NC_011027	GTAT	2	8	2219071	2219078	25 %	50 %	25 %	0 %	193213652
40342	NC_011027	GAC	2	6	2219082	2219087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213652
40343	NC_011027	TTG	2	6	2219094	2219099	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	193213652
40344	NC_011027	CGGG	2	8	2219121	2219128	0 %	0 %	75 %	25 %	193213652
40345	NC_011027	TTG	2	6	2219187	2219192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	193213652
40346	NC_011027	GCC	2	6	2219331	2219336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193213652
40347	NC_011027	CAC	2	6	2219345	2219350	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	193213652
40348	NC_011027	TGC	2	6	2219374	2219379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213652
40349	NC_011027	TCG	2	6	2219403	2219408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193213652
40350	NC_011027	CATG	2	8	2219545	2219552	25 %	25 %	25 %	25 %	193213652
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40352	NC_011027	TCGG	2	8	2220174	2220181	0 %	25 %	50 %	25 %	193213653
40353	NC_011027	A	6	6	2220201	2220206	100 %	0 %	0 %	0 %	193213653
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40356	NC_011027	A	6	6	2220390	2220395	100 %	0 %	0 %	0 %	193213653
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40403	NC_011027	GAGTA	2	10	2222639	2222648	40 %	20 %	40 %	0 %	193213654
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40457	NC_011027	CTCA	2	8	2225357	2225364	25 %	25 %	0 %	50 %	193213656
40458	NC_011027	CGA	2	6	2225366	2225371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193213656
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40461	NC_011027	CCT	2	6	2225670	2225675	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	193213657
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