MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlorobaculum parvum NCIB 8327 chromosome

Total Repeats: 41667

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
25501	NC_011027	CTT	2	6	1408667	1408672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193212946
25502	NC_011027	TCC	2	6	1408794	1408799	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	193212946
25503	NC_011027	CGT	2	6	1408838	1408843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193212946
25504	NC_011027	ATG	2	6	1408857	1408862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193212946
25505	NC_011027	CGC	2	6	1408864	1408869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193212946
25506	NC_011027	TCG	2	6	1408893	1408898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193212946
25507	NC_011027	AGCC	2	8	1408956	1408963	25 %	0 %	25 %	50 %	193212946
25508	NC_011027	GGCGAT	2	12	1408976	1408987	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	193212946
25509	NC_011027	CTG	2	6	1409018	1409023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193212946
25510	NC_011027	GAT	2	6	1409033	1409038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193212946
25511	NC_011027	GCC	2	6	1409108	1409113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193212946
25512	NC_011027	CAC	2	6	1409114	1409119	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	193212946
25513	NC_011027	CCGA	2	8	1409334	1409341	25 %	0 %	25 %	50 %	193212946
25514	NC_011027	CTG	2	6	1409471	1409476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193212946
25515	NC_011027	TCA	2	6	1409485	1409490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193212946
25516	NC_011027	TGA	2	6	1409497	1409502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193212946
25517	NC_011027	TGCG	2	8	1409503	1409510	0 %	25 %	50 %	25 %	193212946
25518	NC_011027	CGT	2	6	1409573	1409578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193212946
25519	NC_011027	CGC	2	6	1409584	1409589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193212946
25520	NC_011027	CAA	3	9	1409752	1409760	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	193212946
25521	NC_011027	TTC	2	6	1409763	1409768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193212946
25522	NC_011027	CCG	2	6	1409832	1409837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193212947
25523	NC_011027	GCG	2	6	1409867	1409872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193212947
25524	NC_011027	CCA	2	6	1409883	1409888	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	193212947
25525	NC_011027	ACC	2	6	1410096	1410101	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	193212947
25526	NC_011027	TCG	2	6	1410119	1410124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193212947
25527	NC_011027	GAA	2	6	1410151	1410156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	193212947
25528	NC_011027	CGA	2	6	1410161	1410166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193212947
25529	NC_011027	TCA	2	6	1410270	1410275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193212947
25530	NC_011027	GGGC	2	8	1410286	1410293	0 %	0 %	75 %	25 %	193212947
25531	NC_011027	TGA	2	6	1410324	1410329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193212947
25532	NC_011027	GCT	2	6	1410416	1410421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193212947
25533	NC_011027	CAC	2	6	1410462	1410467	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	193212947
25534	NC_011027	ATG	2	6	1410470	1410475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193212947
25535	NC_011027	GCA	3	9	1410584	1410592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193212947
25536	NC_011027	TCA	2	6	1410602	1410607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193212947
25537	NC_011027	ATG	2	6	1410629	1410634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193212947
25538	NC_011027	GATGG	2	10	1410646	1410655	20 %	20 %	60 %	0 %	193212947
25539	NC_011027	ACA	2	6	1410679	1410684	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	193212947
25540	NC_011027	GAC	2	6	1410745	1410750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193212947
25541	NC_011027	GACG	2	8	1410784	1410791	25 %	0 %	50 %	25 %	193212947
25542	NC_011027	CCT	2	6	1410846	1410851	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	193212947
25543	NC_011027	TTG	2	6	1410865	1410870	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	193212947
25544	NC_011027	GTTCA	2	10	1411126	1411135	20 %	40 %	20 %	20 %	193212948
25545	NC_011027	AGT	2	6	1411160	1411165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193212948
25546	NC_011027	GAA	2	6	1411188	1411193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	193212948
25547	NC_011027	GTA	2	6	1411320	1411325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193212948
25548	NC_011027	AGCC	2	8	1411362	1411369	25 %	0 %	25 %	50 %	193212948
25549	NC_011027	ATC	2	6	1411408	1411413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193212948
25550	NC_011027	GACC	2	8	1411445	1411452	25 %	0 %	25 %	50 %	193212948
25551	NC_011027	GCT	2	6	1411477	1411482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193212948
25552	NC_011027	CCAG	2	8	1411483	1411490	25 %	0 %	25 %	50 %	193212948
25553	NC_011027	TCG	2	6	1411519	1411524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193212948
25554	NC_011027	TCA	2	6	1411583	1411588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193212948
25555	NC_011027	AGG	2	6	1411595	1411600	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	193212948
25556	NC_011027	TCAT	2	8	1411633	1411640	25 %	50 %	0 %	25 %	193212948
25557	NC_011027	ATG	2	6	1411645	1411650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193212948
25558	NC_011027	AGC	2	6	1411654	1411659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193212948
25559	NC_011027	AAGC	2	8	1411688	1411695	50 %	0 %	25 %	25 %	193212948
25560	NC_011027	TTC	2	6	1411708	1411713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193212948
25561	NC_011027	ACA	2	6	1411726	1411731	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	193212948
25562	NC_011027	ATC	2	6	1411741	1411746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193212948
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25564	NC_011027	ATG	2	6	1411978	1411983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193212948
25565	NC_011027	ACG	2	6	1411988	1411993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193212948
25566	NC_011027	CAT	2	6	1412034	1412039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193212948
25567	NC_011027	CGG	2	6	1412063	1412068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193212948
25568	NC_011027	CAG	2	6	1412097	1412102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193212948
25569	NC_011027	AGA	2	6	1412151	1412156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	193212948
25570	NC_011027	GTA	2	6	1412172	1412177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193212948
25571	NC_011027	CAG	2	6	1412232	1412237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193212948
25572	NC_011027	CAT	4	12	1412253	1412264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193212948
25573	NC_011027	T	6	6	1412319	1412324	0 %	100 %	0 %	0 %	193212948
25574	NC_011027	GTC	2	6	1412331	1412336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193212948
25575	NC_011027	TGG	2	6	1412342	1412347	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	193212948
25576	NC_011027	GAA	2	6	1412376	1412381	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	193212948
25577	NC_011027	GAA	2	6	1412388	1412393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	193212948
25578	NC_011027	AGA	2	6	1412426	1412431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	193212948
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25582	NC_011027	TTC	2	6	1412521	1412526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193212948
25583	NC_011027	GAT	2	6	1412622	1412627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193212948
25584	NC_011027	TTG	2	6	1412749	1412754	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	193212949
25585	NC_011027	TGC	2	6	1412756	1412761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193212949
25586	NC_011027	CGATAA	2	12	1412804	1412815	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	193212949
25587	NC_011027	GCTTGC	2	12	1412936	1412947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193212949
25588	NC_011027	AGC	2	6	1412982	1412987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193212949
25589	NC_011027	CGGG	2	8	1413024	1413031	0 %	0 %	75 %	25 %	193212949
25590	NC_011027	CGA	2	6	1413053	1413058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193212949
25591	NC_011027	AAGCG	2	10	1413102	1413111	40 %	0 %	40 %	20 %	193212949
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25593	NC_011027	GAAG	2	8	1413218	1413225	50 %	0 %	50 %	0 %	193212949
25594	NC_011027	AGC	2	6	1413307	1413312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193212949
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25597	NC_011027	CTG	2	6	1413363	1413368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193212949
25598	NC_011027	GAT	2	6	1413393	1413398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193212949
25599	NC_011027	AC	3	6	1413413	1413418	50 %	0 %	0 %	50 %	193212949
25600	NC_011027	TCA	2	6	1413473	1413478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193212949
25601	NC_011027	TCGGAG	2	12	1413527	1413538	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	193212949
25602	NC_011027	AT	3	6	1413625	1413630	50 %	50 %	0 %	0 %	193212949
25603	NC_011027	CTGG	2	8	1413681	1413688	0 %	25 %	50 %	25 %	193212949
25604	NC_011027	ACCGA	2	10	1413775	1413784	40 %	0 %	20 %	40 %	193212949
25605	NC_011027	GCA	2	6	1413811	1413816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193212949
25606	NC_011027	CT	3	6	1413819	1413824	0 %	50 %	0 %	50 %	193212949
25607	NC_011027	GAA	2	6	1413863	1413868	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	193212949
25608	NC_011027	GAA	2	6	1413897	1413902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	193212949
25609	NC_011027	AGC	2	6	1413917	1413922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193212949
25610	NC_011027	CAT	2	6	1413924	1413929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193212949
25611	NC_011027	GA	4	8	1414104	1414111	50 %	0 %	50 %	0 %	193212949
25612	NC_011027	ATC	2	6	1414129	1414134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193212949
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25614	NC_011027	GCG	2	6	1414165	1414170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193212949
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25728	NC_011027	TGA	2	6	1420297	1420302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193212955
25729	NC_011027	TGA	2	6	1420306	1420311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193212955
25730	NC_011027	CGG	2	6	1420320	1420325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193212955
25731	NC_011027	TCACC	2	10	1420501	1420510	20 %	20 %	0 %	60 %	193212955
25732	NC_011027	TGC	2	6	1420554	1420559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193212955
25733	NC_011027	GTC	2	6	1420619	1420624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193212955
25734	NC_011027	GAT	2	6	1420834	1420839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193212956
25735	NC_011027	CTTGAC	2	12	1420943	1420954	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	193212956
25736	NC_011027	AGGC	2	8	1421040	1421047	25 %	0 %	50 %	25 %	193212956
25737	NC_011027	AGA	2	6	1421064	1421069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	193212956
25738	NC_011027	CTG	2	6	1421106	1421111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193212956
25739	NC_011027	TGG	2	6	1421137	1421142	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	193212956
25740	NC_011027	ATA	2	6	1421187	1421192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	193212956
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25743	NC_011027	CGC	2	6	1421284	1421289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193212957
25744	NC_011027	CTG	2	6	1421311	1421316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193212957
25745	NC_011027	TCA	2	6	1421403	1421408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193212957
25746	NC_011027	CCG	2	6	1421411	1421416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193212957
25747	NC_011027	CCG	2	6	1421519	1421524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193212957
25748	NC_011027	AGC	2	6	1421532	1421537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193212957
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25751	NC_011027	GTTG	2	8	1421701	1421708	0 %	50 %	50 %	0 %	193212957
25752	NC_011027	CAT	2	6	1421710	1421715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193212957
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25755	NC_011027	TCA	2	6	1421778	1421783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193212957
25756	NC_011027	GCT	2	6	1422039	1422044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193212958
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25759	NC_011027	ACC	2	6	1422232	1422237	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	193212958
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25762	NC_011027	A	6	6	1422537	1422542	100 %	0 %	0 %	0 %	193212959
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25836	NC_011027	CG	3	6	1427121	1427126	0 %	0 %	50 %	50 %	193212964
25837	NC_011027	GGA	2	6	1427359	1427364	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	193212965
25838	NC_011027	GA	3	6	1427376	1427381	50 %	0 %	50 %	0 %	193212965
25839	NC_011027	CTG	2	6	1427652	1427657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193212965
25840	NC_011027	A	6	6	1427708	1427713	100 %	0 %	0 %	0 %	193212965
25841	NC_011027	GTC	2	6	1427778	1427783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193212965
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