MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlorobaculum parvum NCIB 8327 chromosome

Total Repeats: 41667

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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25002	NC_011027	CGG	2	6	1378310	1378315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193212913
25003	NC_011027	TCG	2	6	1378381	1378386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193212913
25004	NC_011027	GAC	2	6	1378461	1378466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193212913
25005	NC_011027	ATC	2	6	1378512	1378517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193212913
25006	NC_011027	CAA	2	6	1378571	1378576	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	193212913
25007	NC_011027	CAT	2	6	1378600	1378605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193212913
25008	NC_011027	CGG	2	6	1378669	1378674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193212913
25009	NC_011027	CGAC	2	8	1378700	1378707	25 %	0 %	25 %	50 %	193212913
25010	NC_011027	CTG	2	6	1378751	1378756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193212913
25011	NC_011027	GGC	2	6	1378784	1378789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193212913
25012	NC_011027	CAT	2	6	1378911	1378916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193212913
25013	NC_011027	CGGA	2	8	1378927	1378934	25 %	0 %	50 %	25 %	193212913
25014	NC_011027	CAT	2	6	1378976	1378981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193212913
25015	NC_011027	GCT	2	6	1378988	1378993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193212913
25016	NC_011027	GCG	2	6	1379004	1379009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193212913
25017	NC_011027	TAC	2	6	1379145	1379150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193212913
25018	NC_011027	ACC	2	6	1379239	1379244	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	193212913
25019	NC_011027	GTCG	2	8	1379275	1379282	0 %	25 %	50 %	25 %	193212913
25020	NC_011027	A	6	6	1379312	1379317	100 %	0 %	0 %	0 %	193212914
25021	NC_011027	ATT	2	6	1379347	1379352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	193212914
25022	NC_011027	A	6	6	1379377	1379382	100 %	0 %	0 %	0 %	193212914
25023	NC_011027	TAA	2	6	1379424	1379429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	193212914
25024	NC_011027	GCG	2	6	1379441	1379446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193212914
25025	NC_011027	A	6	6	1379471	1379476	100 %	0 %	0 %	0 %	193212914
25026	NC_011027	GAT	2	6	1379487	1379492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193212914
25027	NC_011027	TCG	2	6	1379609	1379614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193212914
25028	NC_011027	CGT	2	6	1379628	1379633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193212914
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25030	NC_011027	A	8	8	1379677	1379684	100 %	0 %	0 %	0 %	193212914
25031	NC_011027	CGG	2	6	1379708	1379713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193212914
25032	NC_011027	CGG	2	6	1379732	1379737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193212914
25033	NC_011027	GCG	2	6	1379931	1379936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193212914
25034	NC_011027	AAC	2	6	1379983	1379988	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	193212914
25035	NC_011027	TCA	2	6	1379993	1379998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193212914
25036	NC_011027	CGA	2	6	1380003	1380008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193212914
25037	NC_011027	AGCA	2	8	1380025	1380032	50 %	0 %	25 %	25 %	193212914
25038	NC_011027	ATC	2	6	1380076	1380081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193212914
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25040	NC_011027	CGT	2	6	1380198	1380203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193212914
25041	NC_011027	ATC	2	6	1380226	1380231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193212914
25042	NC_011027	GCA	2	6	1380475	1380480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193212915
25043	NC_011027	TG	3	6	1380559	1380564	0 %	50 %	50 %	0 %	193212915
25044	NC_011027	AGC	2	6	1380627	1380632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193212915
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25047	NC_011027	CT	4	8	1381224	1381231	0 %	50 %	0 %	50 %	193212917
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25049	NC_011027	CAC	2	6	1381325	1381330	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	193212917
25050	NC_011027	TGA	2	6	1381423	1381428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193212917
25051	NC_011027	CCT	2	6	1381462	1381467	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	193212917
25052	NC_011027	CT	3	6	1381466	1381471	0 %	50 %	0 %	50 %	193212917
25053	NC_011027	GCC	2	6	1381474	1381479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193212917
25054	NC_011027	GACT	2	8	1381608	1381615	25 %	25 %	25 %	25 %	193212918
25055	NC_011027	CTG	2	6	1381652	1381657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193212918
25056	NC_011027	TCT	2	6	1381671	1381676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193212918
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25058	NC_011027	ACC	2	6	1381776	1381781	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	193212918
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25060	NC_011027	CTT	2	6	1381817	1381822	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193212918
25061	NC_011027	ACA	2	6	1381830	1381835	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	193212918
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25064	NC_011027	TTC	2	6	1381920	1381925	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193212918
25065	NC_011027	AGT	2	6	1381946	1381951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193212918
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25069	NC_011027	TTG	2	6	1382208	1382213	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	193212918
25070	NC_011027	TCA	2	6	1382248	1382253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193212918
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25072	NC_011027	CATT	2	8	1382353	1382360	25 %	50 %	0 %	25 %	193212918
25073	NC_011027	GCC	2	6	1382384	1382389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193212918
25074	NC_011027	CAT	2	6	1382416	1382421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193212918
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25078	NC_011027	TTTG	2	8	1382701	1382708	0 %	75 %	25 %	0 %	193212918
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25082	NC_011027	AAT	2	6	1383223	1383228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	193212919
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25084	NC_011027	GCA	2	6	1383369	1383374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193212919
25085	NC_011027	CAA	2	6	1383411	1383416	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	193212919
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25087	NC_011027	GGC	2	6	1383523	1383528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193212919
25088	NC_011027	CTGCC	2	10	1383597	1383606	0 %	20 %	20 %	60 %	193212920
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25095	NC_011027	T	7	7	1383776	1383782	0 %	100 %	0 %	0 %	193212920
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25099	NC_011027	GCA	2	6	1383989	1383994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193212920
25100	NC_011027	CCAAC	2	10	1384214	1384223	40 %	0 %	0 %	60 %	193212921
25101	NC_011027	CAA	2	6	1384238	1384243	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	193212921
25102	NC_011027	ACA	2	6	1384252	1384257	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	193212921
25103	NC_011027	CG	3	6	1384281	1384286	0 %	0 %	50 %	50 %	193212921
25104	NC_011027	TCC	2	6	1384287	1384292	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	193212921
25105	NC_011027	GTC	2	6	1384398	1384403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193212921
25106	NC_011027	GCG	2	6	1384432	1384437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193212921
25107	NC_011027	CGCT	2	8	1384498	1384505	0 %	25 %	25 %	50 %	193212921
25108	NC_011027	ACT	2	6	1384531	1384536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193212921
25109	NC_011027	CGA	2	6	1384550	1384555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193212921
25110	NC_011027	CGG	2	6	1384583	1384588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193212921
25111	NC_011027	GTC	3	9	1384644	1384652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193212921
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25113	NC_011027	CGT	3	9	1384685	1384693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193212921
25114	NC_011027	CAT	2	6	1384697	1384702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193212921
25115	NC_011027	GGGC	2	8	1384753	1384760	0 %	0 %	75 %	25 %	193212921
25116	NC_011027	CAT	2	6	1384763	1384768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193212921
25117	NC_011027	TCA	2	6	1384786	1384791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193212921
25118	NC_011027	GTGG	2	8	1384796	1384803	0 %	25 %	75 %	0 %	193212921
25119	NC_011027	CGG	2	6	1384960	1384965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193212921
25120	NC_011027	CGAA	2	8	1384973	1384980	50 %	0 %	25 %	25 %	193212921
25121	NC_011027	AGC	2	6	1384982	1384987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193212921
25122	NC_011027	TCG	2	6	1385086	1385091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193212921
25123	NC_011027	TCG	2	6	1385176	1385181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193212921
25124	NC_011027	ATG	2	6	1385187	1385192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193212921
25125	NC_011027	TCG	2	6	1385274	1385279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193212922
25126	NC_011027	CAT	2	6	1385302	1385307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193212922
25127	NC_011027	ACG	2	6	1385372	1385377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193212922
25128	NC_011027	CAG	2	6	1385423	1385428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193212922
25129	NC_011027	GCC	2	6	1385451	1385456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193212922
25130	NC_011027	CGA	2	6	1385473	1385478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193212922
25131	NC_011027	GCG	3	9	1385538	1385546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193212922
25132	NC_011027	GCA	2	6	1385566	1385571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193212922
25133	NC_011027	ATC	2	6	1385703	1385708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193212923
25134	NC_011027	TCG	2	6	1385739	1385744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193212923
25135	NC_011027	CGA	2	6	1385798	1385803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193212923
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25137	NC_011027	CGA	2	6	1385957	1385962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193212923
25138	NC_011027	TG	3	6	1386044	1386049	0 %	50 %	50 %	0 %	193212923
25139	NC_011027	ACG	2	6	1386079	1386084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193212923
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25141	NC_011027	GCG	2	6	1386137	1386142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193212923
25142	NC_011027	CGC	2	6	1386212	1386217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193212923
25143	NC_011027	CGA	2	6	1386242	1386247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193212923
25144	NC_011027	ACCT	2	8	1386255	1386262	25 %	25 %	0 %	50 %	193212923
25145	NC_011027	TCCGT	2	10	1386318	1386327	0 %	40 %	20 %	40 %	193212924
25146	NC_011027	GGC	2	6	1386485	1386490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193212924
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25148	NC_011027	TGC	2	6	1386591	1386596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193212924
25149	NC_011027	CGA	2	6	1386649	1386654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193212924
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25156	NC_011027	GGCATC	2	12	1386985	1386996	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	193212925
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25183	NC_011027	GAT	2	6	1388769	1388774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193212926
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25188	NC_011027	GCACC	2	10	1388898	1388907	20 %	0 %	20 %	60 %	193212927
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25200	NC_011027	GGC	2	6	1389581	1389586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193212927
25201	NC_011027	CGC	2	6	1389614	1389619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193212927
25202	NC_011027	CGA	2	6	1389623	1389628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193212927
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25218	NC_011027	TC	3	6	1390658	1390663	0 %	50 %	0 %	50 %	193212929
25219	NC_011027	ATG	2	6	1390677	1390682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193212929
25220	NC_011027	TCC	2	6	1390685	1390690	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	193212929
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25222	NC_011027	TCG	2	6	1390848	1390853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193212929
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25224	NC_011027	GATA	2	8	1391079	1391086	50 %	25 %	25 %	0 %	193212930
25225	NC_011027	CGG	2	6	1391139	1391144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193212930
25226	NC_011027	CAC	2	6	1391176	1391181	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	193212930
25227	NC_011027	GATC	2	8	1391205	1391212	25 %	25 %	25 %	25 %	193212930
25228	NC_011027	CTG	2	6	1391233	1391238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193212930
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25230	NC_011027	GAA	2	6	1391323	1391328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	193212930
25231	NC_011027	GAC	2	6	1391353	1391358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193212930
25232	NC_011027	TCT	2	6	1391484	1391489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193212930
25233	NC_011027	GGT	2	6	1391542	1391547	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	193212930
25234	NC_011027	TTC	2	6	1391682	1391687	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193212930
25235	NC_011027	TTG	2	6	1391828	1391833	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	193212930
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25347	NC_011027	CG	3	6	1398539	1398544	0 %	0 %	50 %	50 %	193212936
25348	NC_011027	ACC	2	6	1398555	1398560	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	193212936
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25353	NC_011027	CCG	2	6	1398868	1398873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193212936
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25373	NC_011027	GCA	2	6	1399972	1399977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193212936
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25457	NC_011027	TTGACC	2	12	1405180	1405191	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	193212941
25458	NC_011027	GCT	2	6	1405223	1405228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193212941
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