MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlorobaculum parvum NCIB 8327 chromosome

Total Repeats: 41667

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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24002	NC_011027	CAC	3	9	1322082	1322090	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	193212860
24003	NC_011027	CCG	2	6	1322152	1322157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193212861
24004	NC_011027	CGAA	2	8	1322183	1322190	50 %	0 %	25 %	25 %	193212861
24005	NC_011027	CTC	2	6	1322223	1322228	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	193212861
24006	NC_011027	CGG	2	6	1322264	1322269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193212861
24007	NC_011027	ACG	2	6	1322311	1322316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193212861
24008	NC_011027	CCG	2	6	1322327	1322332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193212861
24009	NC_011027	GC	3	6	1322343	1322348	0 %	0 %	50 %	50 %	193212861
24010	NC_011027	TGC	2	6	1322440	1322445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193212861
24011	NC_011027	CTGC	2	8	1322463	1322470	0 %	25 %	25 %	50 %	193212861
24012	NC_011027	AGCA	2	8	1322487	1322494	50 %	0 %	25 %	25 %	193212861
24013	NC_011027	CAT	2	6	1322606	1322611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193212861
24014	NC_011027	CAAGCC	2	12	1322618	1322629	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	193212861
24015	NC_011027	CGG	2	6	1322668	1322673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193212861
24016	NC_011027	GATC	2	8	1322684	1322691	25 %	25 %	25 %	25 %	193212861
24017	NC_011027	CCA	2	6	1322714	1322719	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	193212861
24018	NC_011027	ATG	2	6	1322734	1322739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193212861
24019	NC_011027	TG	3	6	1322842	1322847	0 %	50 %	50 %	0 %	193212862
24020	NC_011027	TGA	2	6	1322972	1322977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193212862
24021	NC_011027	GCC	2	6	1322988	1322993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193212862
24022	NC_011027	CATC	2	8	1323089	1323096	25 %	25 %	0 %	50 %	193212862
24023	NC_011027	AGA	2	6	1323118	1323123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	193212862
24024	NC_011027	ACG	2	6	1323154	1323159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193212862
24025	NC_011027	TCA	2	6	1323248	1323253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193212862
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24027	NC_011027	CGTG	2	8	1323312	1323319	0 %	25 %	50 %	25 %	193212862
24028	NC_011027	AGG	2	6	1323325	1323330	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	193212862
24029	NC_011027	GAC	2	6	1323354	1323359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193212862
24030	NC_011027	A	6	6	1323396	1323401	100 %	0 %	0 %	0 %	193212862
24031	NC_011027	GCA	2	6	1323433	1323438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193212862
24032	NC_011027	CCG	2	6	1323512	1323517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193212862
24033	NC_011027	CAT	2	6	1323549	1323554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193212862
24034	NC_011027	ACGA	2	8	1323571	1323578	50 %	0 %	25 %	25 %	193212862
24035	NC_011027	AGC	2	6	1323595	1323600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193212862
24036	NC_011027	CGC	2	6	1323624	1323629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193212862
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24038	NC_011027	CA	3	6	1323673	1323678	50 %	0 %	0 %	50 %	193212862
24039	NC_011027	TCA	2	6	1324029	1324034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193212863
24040	NC_011027	AATC	2	8	1324072	1324079	50 %	25 %	0 %	25 %	193212863
24041	NC_011027	TGT	2	6	1324102	1324107	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	193212863
24042	NC_011027	CAA	2	6	1324141	1324146	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	193212863
24043	NC_011027	AC	3	6	1324160	1324165	50 %	0 %	0 %	50 %	193212863
24044	NC_011027	TCG	2	6	1324206	1324211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193212863
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24047	NC_011027	T	6	6	1324608	1324613	0 %	100 %	0 %	0 %	193212864
24048	NC_011027	GCC	2	6	1324638	1324643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193212864
24049	NC_011027	AAG	2	6	1324695	1324700	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	193212864
24050	NC_011027	CGC	2	6	1324759	1324764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193212864
24051	NC_011027	GA	3	6	1324816	1324821	50 %	0 %	50 %	0 %	193212864
24052	NC_011027	AGC	2	6	1324843	1324848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193212864
24053	NC_011027	CGG	2	6	1324856	1324861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193212864
24054	NC_011027	GGC	2	6	1324874	1324879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193212864
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24056	NC_011027	ACC	2	6	1325134	1325139	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	193212864
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24058	NC_011027	AGC	2	6	1325218	1325223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193212864
24059	NC_011027	TCACCG	2	12	1325228	1325239	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	193212864
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24066	NC_011027	CGGCA	2	10	1325457	1325466	20 %	0 %	40 %	40 %	193212864
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24069	NC_011027	TGA	2	6	1325713	1325718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193212864
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24075	NC_011027	GTA	2	6	1325913	1325918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193212864
24076	NC_011027	GAG	2	6	1325947	1325952	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	193212864
24077	NC_011027	GTC	2	6	1325998	1326003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193212864
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24082	NC_011027	CA	3	6	1326153	1326158	50 %	0 %	0 %	50 %	193212865
24083	NC_011027	GAT	2	6	1326164	1326169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193212865
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24087	NC_011027	CTC	2	6	1326365	1326370	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	193212865
24088	NC_011027	ACA	2	6	1326423	1326428	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	193212865
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24098	NC_011027	GC	3	6	1326751	1326756	0 %	0 %	50 %	50 %	193212866
24099	NC_011027	TCG	2	6	1326861	1326866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193212866
24100	NC_011027	GCT	3	9	1326868	1326876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193212866
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24102	NC_011027	ACC	2	6	1326990	1326995	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	193212866
24103	NC_011027	ACG	2	6	1326999	1327004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193212866
24104	NC_011027	CA	3	6	1327006	1327011	50 %	0 %	0 %	50 %	193212866
24105	NC_011027	GAT	2	6	1327016	1327021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193212866
24106	NC_011027	T	6	6	1327035	1327040	0 %	100 %	0 %	0 %	193212866
24107	NC_011027	AAC	2	6	1327085	1327090	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	193212866
24108	NC_011027	CGA	2	6	1327096	1327101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193212866
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24110	NC_011027	A	6	6	1327154	1327159	100 %	0 %	0 %	0 %	193212866
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24113	NC_011027	TCC	2	6	1327444	1327449	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	193212867
24114	NC_011027	CCG	2	6	1327454	1327459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193212867
24115	NC_011027	GAT	2	6	1327469	1327474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193212867
24116	NC_011027	AGC	2	6	1327587	1327592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193212867
24117	NC_011027	TTG	2	6	1327674	1327679	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	193212867
24118	NC_011027	CCCAGG	2	12	1327726	1327737	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	193212867
24119	NC_011027	GAG	2	6	1327745	1327750	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	193212867
24120	NC_011027	GAT	2	6	1327757	1327762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193212867
24121	NC_011027	AC	3	6	1327780	1327785	50 %	0 %	0 %	50 %	193212867
24122	NC_011027	C	6	6	1327792	1327797	0 %	0 %	0 %	100 %	193212867
24123	NC_011027	AGTG	2	8	1327825	1327832	25 %	25 %	50 %	0 %	193212867
24124	NC_011027	AGT	2	6	1327893	1327898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193212867
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24126	NC_011027	ATCG	2	8	1328056	1328063	25 %	25 %	25 %	25 %	193212868
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24131	NC_011027	TGC	2	6	1328283	1328288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193212868
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24136	NC_011027	TTTCA	2	10	1328465	1328474	20 %	60 %	0 %	20 %	193212868
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24142	NC_011027	GCG	2	6	1328832	1328837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193212869
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24219	NC_011027	CGC	2	6	1333545	1333550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193212872
24220	NC_011027	GGT	2	6	1333565	1333570	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	193212872
24221	NC_011027	TGA	2	6	1333579	1333584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193212872
24222	NC_011027	TCA	2	6	1333612	1333617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193212872
24223	NC_011027	GCA	2	6	1333630	1333635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193212872
24224	NC_011027	GC	3	6	1333686	1333691	0 %	0 %	50 %	50 %	193212872
24225	NC_011027	GCC	2	6	1333732	1333737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193212872
24226	NC_011027	GCA	2	6	1333744	1333749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193212872
24227	NC_011027	CTT	2	6	1333766	1333771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193212872
24228	NC_011027	CTC	2	6	1333856	1333861	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	193212872
24229	NC_011027	CCA	2	6	1333885	1333890	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	193212872
24230	NC_011027	CGG	2	6	1334032	1334037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193212872
24231	NC_011027	TGG	2	6	1334071	1334076	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	193212872
24232	NC_011027	GAA	2	6	1334102	1334107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	193212872
24233	NC_011027	AAAGC	2	10	1334166	1334175	60 %	0 %	20 %	20 %	193212873
24234	NC_011027	ACG	2	6	1334176	1334181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193212873
24235	NC_011027	TCA	2	6	1334269	1334274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193212873
24236	NC_011027	CGACAT	2	12	1334291	1334302	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	193212873
24237	NC_011027	AGC	2	6	1334347	1334352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193212873
24238	NC_011027	GGC	2	6	1334355	1334360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193212873
24239	NC_011027	TCG	2	6	1334443	1334448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193212873
24240	NC_011027	GGA	2	6	1334510	1334515	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	193212873
24241	NC_011027	CGC	2	6	1334526	1334531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193212873
24242	NC_011027	CGCCCT	2	12	1334546	1334557	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	193212873
24243	NC_011027	TCG	2	6	1334587	1334592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193212873
24244	NC_011027	ACG	2	6	1334599	1334604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193212873
24245	NC_011027	ATG	2	6	1334682	1334687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193212873
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24247	NC_011027	AGC	2	6	1334760	1334765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193212873
24248	NC_011027	CG	3	6	1334782	1334787	0 %	0 %	50 %	50 %	193212873
24249	NC_011027	GGC	2	6	1334819	1334824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193212873
24250	NC_011027	ATCG	2	8	1334834	1334841	25 %	25 %	25 %	25 %	193212873
24251	NC_011027	ATC	2	6	1334880	1334885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193212873
24252	NC_011027	GGT	2	6	1334963	1334968	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	193212873
24253	NC_011027	CT	3	6	1335016	1335021	0 %	50 %	0 %	50 %	193212873
24254	NC_011027	ACG	2	6	1335113	1335118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193212873
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24257	NC_011027	CGG	2	6	1335226	1335231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193212873
24258	NC_011027	GCC	2	6	1335235	1335240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193212873
24259	NC_011027	GAC	2	6	1335267	1335272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193212873
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24264	NC_011027	TCC	2	6	1335404	1335409	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	193212873
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24330	NC_011027	GCT	2	6	1339046	1339051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193212876
24331	NC_011027	GTA	2	6	1339218	1339223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193212876
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24338	NC_011027	GCG	2	6	1339806	1339811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193212877
24339	NC_011027	CTT	2	6	1339813	1339818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193212877
24340	NC_011027	ACT	2	6	1339841	1339846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193212877
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24342	NC_011027	GGC	2	6	1340039	1340044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193212877
24343	NC_011027	CGG	2	6	1340101	1340106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193212877
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24345	NC_011027	TTC	2	6	1340226	1340231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193212877
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24461	NC_011027	GA	3	6	1345873	1345878	50 %	0 %	50 %	0 %	193212883
24462	NC_011027	ATG	2	6	1345910	1345915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193212883
24463	NC_011027	CTG	2	6	1345935	1345940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193212883
24464	NC_011027	GCT	2	6	1345955	1345960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193212883
24465	NC_011027	ATT	2	6	1346449	1346454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	193212884
24466	NC_011027	CTGA	2	8	1346467	1346474	25 %	25 %	25 %	25 %	193212884
24467	NC_011027	CCTG	2	8	1346517	1346524	0 %	25 %	25 %	50 %	193212884
24468	NC_011027	GCG	2	6	1346548	1346553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193212884
24469	NC_011027	TGAC	2	8	1346558	1346565	25 %	25 %	25 %	25 %	193212884
24470	NC_011027	CCT	2	6	1346568	1346573	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	193212884
24471	NC_011027	TGC	2	6	1346586	1346591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193212884
24472	NC_011027	GC	3	6	1346590	1346595	0 %	0 %	50 %	50 %	193212884
24473	NC_011027	CCA	2	6	1346622	1346627	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	193212884
24474	NC_011027	GGCC	2	8	1346733	1346740	0 %	0 %	50 %	50 %	193212884
24475	NC_011027	TCC	2	6	1346768	1346773	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	193212884
24476	NC_011027	GCT	2	6	1346799	1346804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193212884
24477	NC_011027	TCA	2	6	1346898	1346903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193212884
24478	NC_011027	ACCGGC	2	12	1347019	1347030	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	193212884
24479	NC_011027	TGC	2	6	1347037	1347042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193212884
24480	NC_011027	TGG	2	6	1347114	1347119	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	193212884
24481	NC_011027	ACG	2	6	1347141	1347146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193212884
24482	NC_011027	GGA	2	6	1347269	1347274	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	193212884
24483	NC_011027	AAC	2	6	1347302	1347307	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	193212884
24484	NC_011027	CAC	2	6	1347498	1347503	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	193212884
24485	NC_011027	GGT	2	6	1347547	1347552	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	193212884
24486	NC_011027	AGAAA	2	10	1347666	1347675	80 %	0 %	20 %	0 %	193212884
24487	NC_011027	A	6	6	1347673	1347678	100 %	0 %	0 %	0 %	193212884
24488	NC_011027	TTC	2	6	1347695	1347700	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193212884
24489	NC_011027	CTC	2	6	1347934	1347939	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	193212885
24490	NC_011027	GCC	2	6	1347948	1347953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193212885
24491	NC_011027	ATC	2	6	1347968	1347973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193212885
24492	NC_011027	TGC	2	6	1347996	1348001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193212885
24493	NC_011027	GC	3	6	1348057	1348062	0 %	0 %	50 %	50 %	193212885
24494	NC_011027	CTG	2	6	1348087	1348092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193212885
24495	NC_011027	CGC	2	6	1348144	1348149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193212885
24496	NC_011027	TCA	2	6	1348158	1348163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193212885
24497	NC_011027	GC	3	6	1348267	1348272	0 %	0 %	50 %	50 %	193212885
24498	NC_011027	TCG	2	6	1348314	1348319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193212885
24499	NC_011027	CAT	2	6	1348345	1348350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193212885
24500	NC_011027	CG	4	8	1348398	1348405	0 %	0 %	50 %	50 %	193212885

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