MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlorobaculum parvum NCIB 8327 chromosome

Total Repeats: 41667

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_011027	GGC	2	6	555973	555978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193212186
10002	NC_011027	ACT	2	6	556010	556015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193212186
10003	NC_011027	GAG	2	6	556069	556074	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	193212186
10004	NC_011027	TCA	2	6	556133	556138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193212186
10005	NC_011027	ACCG	2	8	556219	556226	25 %	0 %	25 %	50 %	193212186
10006	NC_011027	ATC	2	6	556261	556266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193212186
10007	NC_011027	CGG	2	6	556287	556292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193212186
10008	NC_011027	TCA	2	6	556337	556342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193212186
10009	NC_011027	CG	3	6	556355	556360	0 %	0 %	50 %	50 %	193212186
10010	NC_011027	CGA	2	6	556446	556451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193212186
10011	NC_011027	ACC	2	6	556474	556479	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	193212186
10012	NC_011027	TCGA	2	8	556498	556505	25 %	25 %	25 %	25 %	193212186
10013	NC_011027	CGT	2	6	556512	556517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193212186
10014	NC_011027	GTCG	2	8	556584	556591	0 %	25 %	50 %	25 %	193212186
10015	NC_011027	TGA	2	6	556694	556699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193212186
10016	NC_011027	CAG	3	9	556717	556725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193212186
10017	NC_011027	AGG	2	6	556739	556744	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	193212186
10018	NC_011027	AAGATC	2	12	556756	556767	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	193212186
10019	NC_011027	GAG	2	6	556825	556830	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	193212186
10020	NC_011027	ACA	2	6	556868	556873	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	193212186
10021	NC_011027	CGC	2	6	557004	557009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193212187
10022	NC_011027	GCG	2	6	557023	557028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193212187
10023	NC_011027	CG	3	6	557041	557046	0 %	0 %	50 %	50 %	193212187
10024	NC_011027	TTCG	2	8	557050	557057	0 %	50 %	25 %	25 %	193212187
10025	NC_011027	A	6	6	557102	557107	100 %	0 %	0 %	0 %	193212187
10026	NC_011027	CG	3	6	557119	557124	0 %	0 %	50 %	50 %	193212187
10027	NC_011027	CCGC	2	8	557144	557151	0 %	0 %	25 %	75 %	193212187
10028	NC_011027	TCA	2	6	557290	557295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193212187
10029	NC_011027	CGA	2	6	557297	557302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193212187
10030	NC_011027	GCG	2	6	557340	557345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193212187
10031	NC_011027	GGC	2	6	557357	557362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193212187
10032	NC_011027	TTG	2	6	557482	557487	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	193212187
10033	NC_011027	AAC	2	6	557493	557498	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	193212187
10034	NC_011027	TGA	2	6	557527	557532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193212187
10035	NC_011027	GAT	2	6	557615	557620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193212187
10036	NC_011027	AGG	2	6	557623	557628	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	193212187
10037	NC_011027	GCT	2	6	557842	557847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193212188
10038	NC_011027	GAA	2	6	557868	557873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	193212188
10039	NC_011027	ACC	2	6	557911	557916	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	193212188
10040	NC_011027	GCG	2	6	557920	557925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193212188
10041	NC_011027	GCC	2	6	557940	557945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193212188
10042	NC_011027	CAG	2	6	558063	558068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193212188
10043	NC_011027	AGC	2	6	558100	558105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193212188
10044	NC_011027	TGA	2	6	558158	558163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193212188
10045	NC_011027	GGTGC	2	10	558171	558180	0 %	20 %	60 %	20 %	193212188
10046	NC_011027	ATC	2	6	558265	558270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193212188
10047	NC_011027	CCAT	2	8	558355	558362	25 %	25 %	0 %	50 %	193212188
10048	NC_011027	GA	3	6	558439	558444	50 %	0 %	50 %	0 %	193212188
10049	NC_011027	CGAGC	2	10	558642	558651	20 %	0 %	40 %	40 %	193212189
10050	NC_011027	CAGC	2	8	558888	558895	25 %	0 %	25 %	50 %	193212189
10051	NC_011027	GCC	2	6	558912	558917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193212189
10052	NC_011027	GTC	2	6	558945	558950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193212189
10053	NC_011027	GCC	2	6	559149	559154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193212189
10054	NC_011027	T	6	6	559191	559196	0 %	100 %	0 %	0 %	193212189
10055	NC_011027	CGT	2	6	559208	559213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193212189
10056	NC_011027	AGT	2	6	559223	559228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193212189
10057	NC_011027	GAA	2	6	559395	559400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	193212189
10058	NC_011027	T	6	6	559420	559425	0 %	100 %	0 %	0 %	193212189
10059	NC_011027	TGGC	2	8	559428	559435	0 %	25 %	50 %	25 %	193212189
10060	NC_011027	TGA	2	6	559451	559456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193212189
10061	NC_011027	CTCC	2	8	559458	559465	0 %	25 %	0 %	75 %	193212189
10062	NC_011027	AGT	2	6	559517	559522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193212189
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10065	NC_011027	GAG	2	6	559852	559857	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	193212189
10066	NC_011027	CTGG	2	8	559905	559912	0 %	25 %	50 %	25 %	193212189
10067	NC_011027	T	7	7	560026	560032	0 %	100 %	0 %	0 %	193212189
10068	NC_011027	TGG	2	6	560060	560065	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	193212189
10069	NC_011027	CGTTC	2	10	560075	560084	0 %	40 %	20 %	40 %	193212189
10070	NC_011027	CGAG	2	8	560192	560199	25 %	0 %	50 %	25 %	193212189
10071	NC_011027	GGC	2	6	560252	560257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193212189
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10077	NC_011027	GA	3	6	560569	560574	50 %	0 %	50 %	0 %	193212189
10078	NC_011027	GCGAG	2	10	560615	560624	20 %	0 %	60 %	20 %	193212189
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10082	NC_011027	CTGC	2	8	560654	560661	0 %	25 %	25 %	50 %	193212189
10083	NC_011027	TTC	2	6	560778	560783	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193212190
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10086	NC_011027	CTGTT	2	10	560903	560912	0 %	60 %	20 %	20 %	193212190
10087	NC_011027	AT	3	6	560962	560967	50 %	50 %	0 %	0 %	193212190
10088	NC_011027	CAAGAT	2	12	560972	560983	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	193212190
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10090	NC_011027	GGGA	2	8	561066	561073	25 %	0 %	75 %	0 %	193212191
10091	NC_011027	ATG	3	9	561084	561092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193212191
10092	NC_011027	CCAG	2	8	561266	561273	25 %	0 %	25 %	50 %	193212192
10093	NC_011027	T	6	6	561274	561279	0 %	100 %	0 %	0 %	193212192
10094	NC_011027	CTC	2	6	561444	561449	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	193212192
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10100	NC_011027	CCT	2	6	561776	561781	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	193212192
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10102	NC_011027	TCG	2	6	561811	561816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193212192
10103	NC_011027	TGC	2	6	561840	561845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193212192
10104	NC_011027	CGG	2	6	561902	561907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193212192
10105	NC_011027	CCG	2	6	561935	561940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193212192
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10109	NC_011027	AGG	2	6	562076	562081	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	193212192
10110	NC_011027	AGC	2	6	562108	562113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193212192
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10112	NC_011027	CAG	2	6	562191	562196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193212192
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10114	NC_011027	T	6	6	562248	562253	0 %	100 %	0 %	0 %	193212192
10115	NC_011027	GCCG	2	8	562323	562330	0 %	0 %	50 %	50 %	193212192
10116	NC_011027	CTC	2	6	562362	562367	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	193212192
10117	NC_011027	CAGC	2	8	562433	562440	25 %	0 %	25 %	50 %	193212192
10118	NC_011027	CGC	2	6	562517	562522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193212192
10119	NC_011027	GGC	2	6	562643	562648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193212192
10120	NC_011027	TTC	2	6	562756	562761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193212192
10121	NC_011027	AGC	2	6	562819	562824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193212192
10122	NC_011027	AAG	2	6	562882	562887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	193212192
10123	NC_011027	AGC	2	6	562999	563004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193212192
10124	NC_011027	CCT	2	6	563015	563020	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	193212192
10125	NC_011027	CGCC	2	8	563051	563058	0 %	0 %	25 %	75 %	193212192
10126	NC_011027	GGA	2	6	563131	563136	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	193212192
10127	NC_011027	GCG	2	6	563149	563154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193212192
10128	NC_011027	GCG	2	6	563164	563169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193212192
10129	NC_011027	GCA	2	6	563192	563197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193212192
10130	NC_011027	GTC	2	6	563238	563243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193212192
10131	NC_011027	GC	4	8	563331	563338	0 %	0 %	50 %	50 %	193212192
10132	NC_011027	GTC	2	6	563349	563354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193212192
10133	NC_011027	TGT	2	6	563369	563374	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	193212192
10134	NC_011027	CGAG	2	8	563375	563382	25 %	0 %	50 %	25 %	193212192
10135	NC_011027	TGT	2	6	563441	563446	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	193212192
10136	NC_011027	CGT	2	6	563579	563584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193212192
10137	NC_011027	GTC	2	6	563634	563639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193212192
10138	NC_011027	TGC	2	6	563652	563657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193212192
10139	NC_011027	GTC	2	6	563670	563675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193212192
10140	NC_011027	ATG	2	6	563692	563697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193212192
10141	NC_011027	TG	3	6	563746	563751	0 %	50 %	50 %	0 %	193212192
10142	NC_011027	GTC	2	6	563757	563762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193212192
10143	NC_011027	CGG	2	6	563763	563768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193212192
10144	NC_011027	CTC	2	6	563862	563867	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	193212192
10145	NC_011027	GAT	2	6	563868	563873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193212192
10146	NC_011027	CTG	2	6	563943	563948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193212192
10147	NC_011027	TGCCA	2	10	563976	563985	20 %	20 %	20 %	40 %	193212192
10148	NC_011027	TTTTC	2	10	564008	564017	0 %	80 %	0 %	20 %	193212192
10149	NC_011027	TC	5	10	564023	564032	0 %	50 %	0 %	50 %	193212192
10150	NC_011027	T	8	8	564036	564043	0 %	100 %	0 %	0 %	193212192
10151	NC_011027	GCCGGA	2	12	564055	564066	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	193212192
10152	NC_011027	GATC	2	8	564083	564090	25 %	25 %	25 %	25 %	193212192
10153	NC_011027	CAT	2	6	564102	564107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193212192
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10155	NC_011027	GC	4	8	564172	564179	0 %	0 %	50 %	50 %	193212193
10156	NC_011027	TCG	2	6	564192	564197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193212193
10157	NC_011027	TGG	2	6	564198	564203	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	193212193
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10159	NC_011027	T	6	6	564240	564245	0 %	100 %	0 %	0 %	193212193
10160	NC_011027	AGA	2	6	564427	564432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	193212193
10161	NC_011027	CTC	2	6	564449	564454	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	193212193
10162	NC_011027	CGG	2	6	564565	564570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193212193
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10176	NC_011027	AAG	2	6	565346	565351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	193212194
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10194	NC_011027	CGTG	2	8	566331	566338	0 %	25 %	50 %	25 %	193212195
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10198	NC_011027	CTG	2	6	566780	566785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193212196
10199	NC_011027	CTA	2	6	566800	566805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193212196
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10203	NC_011027	CAC	2	6	567079	567084	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	193212196
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10207	NC_011027	ACGT	2	8	567762	567769	25 %	25 %	25 %	25 %	193212197
10208	NC_011027	GCG	2	6	567798	567803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193212197
10209	NC_011027	GAA	2	6	567885	567890	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	193212197
10210	NC_011027	ACC	2	6	567892	567897	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	193212197
10211	NC_011027	CAT	2	6	567927	567932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193212197
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10215	NC_011027	TCG	2	6	568054	568059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193212197
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10220	NC_011027	GCT	2	6	568208	568213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193212197
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10223	NC_011027	GCT	2	6	568442	568447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193212197
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10227	NC_011027	TCG	2	6	568708	568713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193212197
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10229	NC_011027	GGC	2	6	568860	568865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193212197
10230	NC_011027	GGT	2	6	568878	568883	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	193212197
10231	NC_011027	GT	3	6	568882	568887	0 %	50 %	50 %	0 %	193212197
10232	NC_011027	GCCGAT	2	12	568899	568910	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	193212197
10233	NC_011027	GGT	2	6	568911	568916	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	193212197
10234	NC_011027	CGA	2	6	568931	568936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193212197
10235	NC_011027	GATC	2	8	568940	568947	25 %	25 %	25 %	25 %	193212197
10236	NC_011027	ATC	2	6	568968	568973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193212197
10237	NC_011027	CCGG	2	8	569040	569047	0 %	0 %	50 %	50 %	193212197
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10358	NC_011027	GGT	2	6	576447	576452	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	193212208
10359	NC_011027	CGG	2	6	576620	576625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193212208
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10475	NC_011027	GAC	2	6	581782	581787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193212211
10476	NC_011027	CTC	2	6	581860	581865	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	193212211
10477	NC_011027	CGA	2	6	581889	581894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193212211
10478	NC_011027	AGGT	2	8	581912	581919	25 %	25 %	50 %	0 %	193212211
10479	NC_011027	CGGTG	2	10	581948	581957	0 %	20 %	60 %	20 %	193212211
10480	NC_011027	CAC	2	6	581968	581973	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	193212211
10481	NC_011027	GCG	2	6	581987	581992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193212211
10482	NC_011027	CTT	2	6	582019	582024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193212211
10483	NC_011027	GCT	2	6	582052	582057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193212211
10484	NC_011027	GCC	2	6	582083	582088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193212211
10485	NC_011027	TCG	2	6	582218	582223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193212211
10486	NC_011027	CTG	2	6	582238	582243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193212211
10487	NC_011027	CCGC	2	8	582246	582253	0 %	0 %	25 %	75 %	193212211
10488	NC_011027	AGC	2	6	582278	582283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193212211
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10490	NC_011027	GCG	2	6	582325	582330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193212211
10491	NC_011027	GT	3	6	582366	582371	0 %	50 %	50 %	0 %	193212211
10492	NC_011027	GTC	2	6	582391	582396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193212211
10493	NC_011027	GTGGC	2	10	582408	582417	0 %	20 %	60 %	20 %	193212211
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10495	NC_011027	GCA	2	6	582658	582663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193212212
10496	NC_011027	TGG	2	6	582727	582732	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	193212212
10497	NC_011027	ACC	2	6	582753	582758	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	193212212
10498	NC_011027	TCT	2	6	582811	582816	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193212212
10499	NC_011027	CAA	2	6	582842	582847	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	193212212
10500	NC_011027	GAT	2	6	582878	582883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193212212

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