MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chloroherpeton thalassium ATCC 35110 chromosome

Total Repeats: 56949

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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55503	NC_011026	T	7	7	3208150	3208156	0 %	100 %	0 %	0 %	193216364
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55505	NC_011026	A	6	6	3208240	3208245	100 %	0 %	0 %	0 %	193216365
55506	NC_011026	T	6	6	3208256	3208261	0 %	100 %	0 %	0 %	193216365
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55543	NC_011026	AAGC	2	8	3210242	3210249	50 %	0 %	25 %	25 %	193216366
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55619	NC_011026	TGC	3	9	3213925	3213933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193216370
55620	NC_011026	GCT	2	6	3214021	3214026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193216370
55621	NC_011026	A	6	6	3214060	3214065	100 %	0 %	0 %	0 %	193216370
55622	NC_011026	CAA	2	6	3214089	3214094	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	193216370
55623	NC_011026	TCA	2	6	3214113	3214118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193216370
55624	NC_011026	ATT	2	6	3214148	3214153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	193216370
55625	NC_011026	TGG	2	6	3214183	3214188	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	193216370
55626	NC_011026	CTAAC	2	10	3214305	3214314	40 %	20 %	0 %	40 %	193216370
55627	NC_011026	CAAA	2	8	3214390	3214397	75 %	0 %	0 %	25 %	193216370
55628	NC_011026	GCG	2	6	3214441	3214446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193216370
55629	NC_011026	GCA	2	6	3214471	3214476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193216370
55630	NC_011026	AG	3	6	3214477	3214482	50 %	0 %	50 %	0 %	193216370
55631	NC_011026	CAA	2	6	3214489	3214494	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	193216370
55632	NC_011026	CGG	2	6	3214543	3214548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193216370
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55634	NC_011026	A	6	6	3214599	3214604	100 %	0 %	0 %	0 %	193216370
55635	NC_011026	CAG	2	6	3214734	3214739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193216370
55636	NC_011026	T	6	6	3214788	3214793	0 %	100 %	0 %	0 %	193216370
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55639	NC_011026	TGA	2	6	3214866	3214871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193216370
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55643	NC_011026	TGCAT	2	10	3215026	3215035	20 %	40 %	20 %	20 %	193216371
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55647	NC_011026	CCA	2	6	3215167	3215172	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	193216371
55648	NC_011026	CGG	2	6	3215175	3215180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193216371
55649	NC_011026	TTTG	2	8	3215189	3215196	0 %	75 %	25 %	0 %	193216371
55650	NC_011026	TCAAA	2	10	3215257	3215266	60 %	20 %	0 %	20 %	193216371
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55654	NC_011026	GAC	2	6	3215463	3215468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193216371
55655	NC_011026	CGT	2	6	3215524	3215529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193216371
55656	NC_011026	AGCGGA	2	12	3215618	3215629	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	193216371
55657	NC_011026	TGG	2	6	3215740	3215745	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	193216371
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55663	NC_011026	AAGT	2	8	3215941	3215948	50 %	25 %	25 %	0 %	193216371
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55681	NC_011026	GTT	2	6	3217218	3217223	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	193216372
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55703	NC_011026	GAA	2	6	3218704	3218709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	193216372
55704	NC_011026	GGA	2	6	3218765	3218770	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	193216372
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55720	NC_011026	TCT	2	6	3220235	3220240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193216373
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55724	NC_011026	T	7	7	3220373	3220379	0 %	100 %	0 %	0 %	193216373
55725	NC_011026	CTGC	3	12	3220442	3220453	0 %	25 %	25 %	50 %	193216373
55726	NC_011026	TCT	2	6	3220475	3220480	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193216373
55727	NC_011026	CGA	2	6	3220488	3220493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193216373
55728	NC_011026	CAT	2	6	3220531	3220536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193216373
55729	NC_011026	CAAA	2	8	3220596	3220603	75 %	0 %	0 %	25 %	193216374
55730	NC_011026	ATGA	2	8	3220630	3220637	50 %	25 %	25 %	0 %	193216374
55731	NC_011026	T	6	6	3220656	3220661	0 %	100 %	0 %	0 %	193216374
55732	NC_011026	TTTA	2	8	3220720	3220727	25 %	75 %	0 %	0 %	193216374
55733	NC_011026	AATGGA	2	12	3220968	3220979	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	193216375
55734	NC_011026	TCC	2	6	3221043	3221048	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	193216375
55735	NC_011026	GCT	2	6	3221120	3221125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193216375
55736	NC_011026	AAT	2	6	3221221	3221226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	193216375
55737	NC_011026	GCT	2	6	3221362	3221367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193216375
55738	NC_011026	TCA	2	6	3221401	3221406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193216375
55739	NC_011026	CA	3	6	3221405	3221410	50 %	0 %	0 %	50 %	193216376
55740	NC_011026	ATT	2	6	3221428	3221433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	193216376
55741	NC_011026	ATCG	2	8	3221479	3221486	25 %	25 %	25 %	25 %	193216376
55742	NC_011026	GATATT	2	12	3221659	3221670	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	193216376
55743	NC_011026	ACC	2	6	3221682	3221687	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	193216376
55744	NC_011026	TCA	2	6	3221693	3221698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193216376
55745	NC_011026	TTC	2	6	3221719	3221724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193216376
55746	NC_011026	CACGC	2	10	3221740	3221749	20 %	0 %	20 %	60 %	193216376
55747	NC_011026	TCA	2	6	3221822	3221827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193216376
55748	NC_011026	CTT	2	6	3221871	3221876	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193216376
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55750	NC_011026	ACG	2	6	3222333	3222338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193216377
55751	NC_011026	GGTGC	2	10	3222346	3222355	0 %	20 %	60 %	20 %	193216377
55752	NC_011026	T	6	6	3222381	3222386	0 %	100 %	0 %	0 %	193216377
55753	NC_011026	CGG	2	6	3222407	3222412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193216377
55754	NC_011026	CTT	3	9	3222413	3222421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193216377
55755	NC_011026	CCA	2	6	3222430	3222435	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	193216377
55756	NC_011026	CTT	2	6	3222604	3222609	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193216377
55757	NC_011026	ATA	2	6	3222652	3222657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	193216377
55758	NC_011026	TTTC	2	8	3222722	3222729	0 %	75 %	0 %	25 %	193216377
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55760	NC_011026	AAT	2	6	3222783	3222788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	193216377
55761	NC_011026	GCT	2	6	3222808	3222813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193216377
55762	NC_011026	ATCGC	2	10	3222820	3222829	20 %	20 %	20 %	40 %	193216377
55763	NC_011026	CGC	2	6	3222837	3222842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193216377
55764	NC_011026	T	6	6	3222876	3222881	0 %	100 %	0 %	0 %	193216377
55765	NC_011026	CGA	2	6	3222983	3222988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193216377
55766	NC_011026	CAG	2	6	3223247	3223252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193216378
55767	NC_011026	CGG	2	6	3223353	3223358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193216378
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55773	NC_011026	GTA	2	6	3223647	3223652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193216378
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55797	NC_011026	TGC	2	6	3225409	3225414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193216379
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55836	NC_011026	A	6	6	3227262	3227267	100 %	0 %	0 %	0 %	193216380
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55842	NC_011026	TGA	2	6	3227722	3227727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193216380
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55847	NC_011026	TTC	2	6	3228000	3228005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193216380
55848	NC_011026	TCT	2	6	3228098	3228103	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193216380
55849	NC_011026	ACG	2	6	3228129	3228134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193216380
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55851	NC_011026	CTATGG	2	12	3228379	3228390	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	193216380
55852	NC_011026	AATT	2	8	3228494	3228501	50 %	50 %	0 %	0 %	193216381
55853	NC_011026	CAAC	2	8	3228505	3228512	50 %	0 %	0 %	50 %	193216381
55854	NC_011026	ATAG	2	8	3228618	3228625	50 %	25 %	25 %	0 %	193216381
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55858	NC_011026	CCTG	2	8	3228921	3228928	0 %	25 %	25 %	50 %	193216381
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55860	NC_011026	ATGCG	2	10	3229110	3229119	20 %	20 %	40 %	20 %	193216381
55861	NC_011026	T	6	6	3229202	3229207	0 %	100 %	0 %	0 %	193216381
55862	NC_011026	CTT	2	6	3229407	3229412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193216382
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55864	NC_011026	CTT	2	6	3229458	3229463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193216382
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55871	NC_011026	CAT	2	6	3229825	3229830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193216382
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55910	NC_011026	ATC	2	6	3232183	3232188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193216385
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55953	NC_011026	GTT	2	6	3235978	3235983	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	193216389
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55962	NC_011026	TGA	2	6	3236544	3236549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193216389
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