MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chloroherpeton thalassium ATCC 35110 chromosome

Total Repeats: 56949

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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55002	NC_011026	GCA	2	6	3180291	3180296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193216339
55003	NC_011026	TCA	2	6	3180310	3180315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193216339
55004	NC_011026	GC	3	6	3180433	3180438	0 %	0 %	50 %	50 %	193216339
55005	NC_011026	GAA	2	6	3180551	3180556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	193216339
55006	NC_011026	GC	3	6	3180742	3180747	0 %	0 %	50 %	50 %	193216339
55007	NC_011026	A	6	6	3180894	3180899	100 %	0 %	0 %	0 %	193216339
55008	NC_011026	T	6	6	3180919	3180924	0 %	100 %	0 %	0 %	193216340
55009	NC_011026	CGA	2	6	3180928	3180933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193216340
55010	NC_011026	CAACG	2	10	3180942	3180951	40 %	0 %	20 %	40 %	193216340
55011	NC_011026	A	7	7	3180987	3180993	100 %	0 %	0 %	0 %	193216340
55012	NC_011026	CTT	2	6	3181026	3181031	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193216340
55013	NC_011026	A	6	6	3181062	3181067	100 %	0 %	0 %	0 %	193216340
55014	NC_011026	TGC	2	6	3181148	3181153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193216340
55015	NC_011026	GCC	2	6	3181186	3181191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193216340
55016	NC_011026	CGC	2	6	3181200	3181205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193216340
55017	NC_011026	CGG	2	6	3181232	3181237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193216340
55018	NC_011026	CCA	2	6	3181253	3181258	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	193216340
55019	NC_011026	GCCA	2	8	3181293	3181300	25 %	0 %	25 %	50 %	193216340
55020	NC_011026	GCT	2	6	3181363	3181368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193216340
55021	NC_011026	CA	3	6	3181413	3181418	50 %	0 %	0 %	50 %	193216340
55022	NC_011026	GC	3	6	3181430	3181435	0 %	0 %	50 %	50 %	193216340
55023	NC_011026	CATCT	2	10	3181464	3181473	20 %	40 %	0 %	40 %	193216340
55024	NC_011026	GATG	2	8	3181536	3181543	25 %	25 %	50 %	0 %	193216340
55025	NC_011026	GCTT	2	8	3181557	3181564	0 %	50 %	25 %	25 %	193216340
55026	NC_011026	ATCG	2	8	3181642	3181649	25 %	25 %	25 %	25 %	193216340
55027	NC_011026	GAG	2	6	3181657	3181662	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	193216340
55028	NC_011026	TGC	2	6	3181764	3181769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193216340
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55030	NC_011026	TCG	2	6	3181834	3181839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193216341
55031	NC_011026	GTTTT	2	10	3181922	3181931	0 %	80 %	20 %	0 %	193216341
55032	NC_011026	T	8	8	3181938	3181945	0 %	100 %	0 %	0 %	193216341
55033	NC_011026	TGCAC	2	10	3182022	3182031	20 %	20 %	20 %	40 %	193216341
55034	NC_011026	CAG	2	6	3182082	3182087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193216341
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55036	NC_011026	TTTA	2	8	3182157	3182164	25 %	75 %	0 %	0 %	193216341
55037	NC_011026	GCC	2	6	3182172	3182177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193216341
55038	NC_011026	GCT	2	6	3182184	3182189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193216341
55039	NC_011026	TGC	2	6	3182311	3182316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193216342
55040	NC_011026	GCT	2	6	3182340	3182345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193216342
55041	NC_011026	GCA	3	9	3182424	3182432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193216342
55042	NC_011026	CGA	2	6	3182442	3182447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193216342
55043	NC_011026	TA	3	6	3182554	3182559	50 %	50 %	0 %	0 %	193216342
55044	NC_011026	A	6	6	3182559	3182564	100 %	0 %	0 %	0 %	193216342
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55046	NC_011026	GCAA	3	12	3182760	3182771	50 %	0 %	25 %	25 %	193216342
55047	NC_011026	A	6	6	3182784	3182789	100 %	0 %	0 %	0 %	193216342
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55050	NC_011026	CAT	2	6	3182885	3182890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193216342
55051	NC_011026	TCA	2	6	3182983	3182988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193216342
55052	NC_011026	TCG	2	6	3183030	3183035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193216342
55053	NC_011026	GC	3	6	3183040	3183045	0 %	0 %	50 %	50 %	193216342
55054	NC_011026	TCG	2	6	3183087	3183092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193216342
55055	NC_011026	GAA	2	6	3183199	3183204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	193216342
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55057	NC_011026	CTGA	2	8	3183359	3183366	25 %	25 %	25 %	25 %	193216343
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55064	NC_011026	T	7	7	3183745	3183751	0 %	100 %	0 %	0 %	193216343
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55067	NC_011026	A	6	6	3183863	3183868	100 %	0 %	0 %	0 %	193216343
55068	NC_011026	GGC	2	6	3183881	3183886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193216343
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55071	NC_011026	AATGGA	2	12	3184031	3184042	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	193216343
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55083	NC_011026	TTTTG	2	10	3184523	3184532	0 %	80 %	20 %	0 %	193216343
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55086	NC_011026	A	7	7	3184587	3184593	100 %	0 %	0 %	0 %	193216343
55087	NC_011026	ATA	2	6	3184605	3184610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	193216343
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55103	NC_011026	A	8	8	3185501	3185508	100 %	0 %	0 %	0 %	193216344
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55105	NC_011026	A	6	6	3185674	3185679	100 %	0 %	0 %	0 %	193216345
55106	NC_011026	CAAG	2	8	3185684	3185691	50 %	0 %	25 %	25 %	193216345
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55110	NC_011026	TTTC	2	8	3186035	3186042	0 %	75 %	0 %	25 %	193216345
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55354	NC_011026	ATT	2	6	3200438	3200443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	193216359
55355	NC_011026	GCG	2	6	3200493	3200498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193216359
55356	NC_011026	GCTT	2	8	3200518	3200525	0 %	50 %	25 %	25 %	193216359
55357	NC_011026	ATT	2	6	3200579	3200584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	193216359
55358	NC_011026	TGA	2	6	3200592	3200597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193216359
55359	NC_011026	GCA	2	6	3200605	3200610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193216359
55360	NC_011026	ATC	2	6	3200637	3200642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193216359
55361	NC_011026	GC	3	6	3200673	3200678	0 %	0 %	50 %	50 %	193216359
55362	NC_011026	TCT	2	6	3200738	3200743	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193216359
55363	NC_011026	CCG	2	6	3200849	3200854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193216359
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55365	NC_011026	ATC	2	6	3201044	3201049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193216359
55366	NC_011026	GAC	2	6	3201050	3201055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193216359
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55372	NC_011026	CG	3	6	3201210	3201215	0 %	0 %	50 %	50 %	193216359
55373	NC_011026	GAA	2	6	3201287	3201292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	193216359
55374	NC_011026	GCC	2	6	3201385	3201390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193216359
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55384	NC_011026	TGG	2	6	3202205	3202210	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	193216360
55385	NC_011026	CG	3	6	3202297	3202302	0 %	0 %	50 %	50 %	193216360
55386	NC_011026	TGG	2	6	3202306	3202311	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	193216360
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55390	NC_011026	CTTCAT	2	12	3202435	3202446	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	193216360
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55392	NC_011026	GTA	2	6	3202538	3202543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193216360
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55399	NC_011026	CGAG	2	8	3202891	3202898	25 %	0 %	50 %	25 %	193216361
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55402	NC_011026	CATC	2	8	3203117	3203124	25 %	25 %	0 %	50 %	193216361
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55405	NC_011026	CG	3	6	3203177	3203182	0 %	0 %	50 %	50 %	193216361
55406	NC_011026	GCA	2	6	3203200	3203205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193216361
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55411	NC_011026	TCTT	2	8	3203361	3203368	0 %	75 %	0 %	25 %	193216361
55412	NC_011026	AAT	2	6	3203430	3203435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	193216361
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55423	NC_011026	GCT	2	6	3203801	3203806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193216361
55424	NC_011026	AGCA	2	8	3203839	3203846	50 %	0 %	25 %	25 %	193216361
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55432	NC_011026	CGG	3	9	3204707	3204715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193216362
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55435	NC_011026	A	6	6	3204780	3204785	100 %	0 %	0 %	0 %	193216362
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55440	NC_011026	GAA	2	6	3204978	3204983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	193216362
55441	NC_011026	GC	3	6	3205039	3205044	0 %	0 %	50 %	50 %	193216362
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55450	NC_011026	TCGC	2	8	3205501	3205508	0 %	25 %	25 %	50 %	193216362
55451	NC_011026	A	6	6	3205558	3205563	100 %	0 %	0 %	0 %	193216362
55452	NC_011026	GATTC	2	10	3205578	3205587	20 %	40 %	20 %	20 %	193216362
55453	NC_011026	GC	3	6	3205604	3205609	0 %	0 %	50 %	50 %	193216362
55454	NC_011026	GAG	2	6	3205623	3205628	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	193216362
55455	NC_011026	GTG	2	6	3205638	3205643	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	193216362
55456	NC_011026	ACC	2	6	3205644	3205649	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	193216362
55457	NC_011026	AGA	2	6	3205733	3205738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	193216362
55458	NC_011026	GTT	2	6	3205848	3205853	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	193216362
55459	NC_011026	TGC	2	6	3205964	3205969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193216363
55460	NC_011026	GCTTT	2	10	3206095	3206104	0 %	60 %	20 %	20 %	193216363
55461	NC_011026	AAC	2	6	3206108	3206113	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	193216363
55462	NC_011026	A	6	6	3206145	3206150	100 %	0 %	0 %	0 %	193216363
55463	NC_011026	T	6	6	3206205	3206210	0 %	100 %	0 %	0 %	193216363
55464	NC_011026	ATC	2	6	3206231	3206236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193216363
55465	NC_011026	TTTCA	2	10	3206267	3206276	20 %	60 %	0 %	20 %	193216363
55466	NC_011026	GAAA	2	8	3206287	3206294	75 %	0 %	25 %	0 %	193216363
55467	NC_011026	GCC	2	6	3206320	3206325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193216363
55468	NC_011026	TGG	2	6	3206562	3206567	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	193216363
55469	NC_011026	AAC	2	6	3206636	3206641	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	193216363
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