MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Clostridium botulinum E3 str. Alaska E43 chromosome

Total Repeats: 85603

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010723	GATG	2	8	126	133	25 %	25 %	50 %	0 %	188589439
2	NC_010723	TAAA	2	8	140	147	75 %	25 %	0 %	0 %	188589439
3	NC_010723	A	6	6	155	160	100 %	0 %	0 %	0 %	188589439
4	NC_010723	TGTT	2	8	333	340	0 %	75 %	25 %	0 %	188589439
5	NC_010723	ATA	2	6	364	369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188589439
6	NC_010723	TAA	2	6	381	386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188589439
7	NC_010723	TAG	2	6	402	407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188589439
8	NC_010723	A	6	6	444	449	100 %	0 %	0 %	0 %	188589439
9	NC_010723	ATG	2	6	461	466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188589439
10	NC_010723	TTTA	2	8	588	595	25 %	75 %	0 %	0 %	188589439
11	NC_010723	TA	3	6	594	599	50 %	50 %	0 %	0 %	188589439
12	NC_010723	ATGC	2	8	631	638	25 %	25 %	25 %	25 %	188589439
13	NC_010723	ATA	2	6	662	667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188589439
14	NC_010723	CTAAAG	2	12	668	679	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	188589439
15	NC_010723	TTC	2	6	690	695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188589439
16	NC_010723	TAA	2	6	716	721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188589439
17	NC_010723	GAT	2	6	733	738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188589439
18	NC_010723	GAA	2	6	745	750	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188589439
19	NC_010723	A	7	7	756	762	100 %	0 %	0 %	0 %	188589439
20	NC_010723	GAT	2	6	790	795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188589439
21	NC_010723	ATTCA	2	10	796	805	40 %	40 %	0 %	20 %	188589439
22	NC_010723	AAG	2	6	827	832	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188589439
23	NC_010723	TTC	2	6	835	840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188589439
24	NC_010723	AAT	2	6	876	881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188589439
25	NC_010723	ATC	2	6	885	890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188589439
26	NC_010723	CCA	2	6	898	903	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188589439
27	NC_010723	AGA	2	6	921	926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188589439
28	NC_010723	A	6	6	1009	1014	100 %	0 %	0 %	0 %	188589439
29	NC_010723	TAA	2	6	1106	1111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188589439
30	NC_010723	AAT	2	6	1113	1118	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188589439
31	NC_010723	A	6	6	1192	1197	100 %	0 %	0 %	0 %	188589439
32	NC_010723	TAG	2	6	1235	1240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188589439
33	NC_010723	TTTAA	2	10	1249	1258	40 %	60 %	0 %	0 %	188589439
34	NC_010723	GAT	2	6	1264	1269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188589439
35	NC_010723	AGA	2	6	1282	1287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188589439
36	NC_010723	GAA	2	6	1369	1374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188589439
37	NC_010723	TGG	2	6	1377	1382	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188589439
38	NC_010723	TAC	2	6	1392	1397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188589439
39	NC_010723	A	6	6	1415	1420	100 %	0 %	0 %	0 %	188589439
40	NC_010723	TGA	2	6	1440	1445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188589439
41	NC_010723	ACA	2	6	1452	1457	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188589439
42	NC_010723	AAG	2	6	1477	1482	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188589439
43	NC_010723	ATTA	2	8	1493	1500	50 %	50 %	0 %	0 %	188589439
44	NC_010723	ATT	2	6	1784	1789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188587627
45	NC_010723	CAA	2	6	1831	1836	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188587627
46	NC_010723	CTA	2	6	1867	1872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188587627
47	NC_010723	ATG	2	6	1873	1878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188587627
48	NC_010723	GA	3	6	1981	1986	50 %	0 %	50 %	0 %	188587627
49	NC_010723	TTA	2	6	1987	1992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188587627
50	NC_010723	AGA	2	6	2033	2038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188587627
51	NC_010723	TGT	2	6	2075	2080	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	188587627
52	NC_010723	CAT	2	6	2104	2109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188587627
53	NC_010723	A	6	6	2159	2164	100 %	0 %	0 %	0 %	188587627
54	NC_010723	ATT	2	6	2228	2233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188587627
55	NC_010723	AAG	2	6	2291	2296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188587627
56	NC_010723	AGA	2	6	2372	2377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188587627
57	NC_010723	TAA	2	6	2408	2413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188587627
58	NC_010723	AT	3	6	2416	2421	50 %	50 %	0 %	0 %	188587627
59	NC_010723	CAT	2	6	2485	2490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188587627
60	NC_010723	TAC	2	6	2491	2496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188587627
61	NC_010723	ATT	2	6	2510	2515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188587627
62	NC_010723	A	6	6	2526	2531	100 %	0 %	0 %	0 %	188587627
63	NC_010723	GAA	2	6	2532	2537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188587627
64	NC_010723	CTT	2	6	2560	2565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188587627
65	NC_010723	ATA	2	6	2584	2589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188587627
66	NC_010723	AGA	2	6	2612	2617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188587627
67	NC_010723	TAA	3	9	2623	2631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188587627
68	NC_010723	GAA	2	6	2661	2666	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188587627
69	NC_010723	GAA	2	6	2688	2693	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188587627
70	NC_010723	TTA	2	6	2721	2726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188587627
71	NC_010723	TGA	2	6	2750	2755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188587627
72	NC_010723	AAAAGA	2	12	2798	2809	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	188587627
73	NC_010723	AGG	2	6	2858	2863	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	188587627
74	NC_010723	TA	3	6	2990	2995	50 %	50 %	0 %	0 %	188588344
75	NC_010723	AAG	2	6	2997	3002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188588344
76	NC_010723	TAA	2	6	3006	3011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188588344
77	NC_010723	GAAA	2	8	3042	3049	75 %	0 %	25 %	0 %	188588344
78	NC_010723	TAT	2	6	3064	3069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188588344
79	NC_010723	TA	3	6	3178	3183	50 %	50 %	0 %	0 %	188590699
80	NC_010723	AAT	2	6	3217	3222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188590699
81	NC_010723	GAAA	2	8	3363	3370	75 %	0 %	25 %	0 %	188590699
82	NC_010723	AT	3	6	3378	3383	50 %	50 %	0 %	0 %	188590699
83	NC_010723	A	8	8	3399	3406	100 %	0 %	0 %	0 %	188590699
84	NC_010723	A	7	7	3447	3453	100 %	0 %	0 %	0 %	188590699
85	NC_010723	ATAA	2	8	3478	3485	75 %	25 %	0 %	0 %	188590699
86	NC_010723	AGA	2	6	3531	3536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188590699
87	NC_010723	ATA	2	6	3544	3549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188590699
88	NC_010723	AAG	2	6	3567	3572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188590699
89	NC_010723	A	6	6	3607	3612	100 %	0 %	0 %	0 %	188590699
90	NC_010723	TAT	2	6	3613	3618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188590699
91	NC_010723	TAA	2	6	3636	3641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188590699
92	NC_010723	TGAA	2	8	3647	3654	50 %	25 %	25 %	0 %	188590699
93	NC_010723	TAA	2	6	3684	3689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188590699
94	NC_010723	TAG	2	6	3719	3724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188590699
95	NC_010723	AAAG	2	8	3745	3752	75 %	0 %	25 %	0 %	188590699
96	NC_010723	AT	3	6	3759	3764	50 %	50 %	0 %	0 %	188590699
97	NC_010723	AGATA	2	10	3765	3774	60 %	20 %	20 %	0 %	188590699
98	NC_010723	ATT	2	6	3776	3781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188590699
99	NC_010723	AGA	2	6	3819	3824	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188590699
100	NC_010723	T	6	6	3879	3884	0 %	100 %	0 %	0 %	188590699
101	NC_010723	AAT	2	6	3898	3903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188590699
102	NC_010723	TTA	2	6	3904	3909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188590699
103	NC_010723	TAA	2	6	3968	3973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188590699
104	NC_010723	ATA	2	6	3974	3979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188590699
105	NC_010723	A	6	6	3988	3993	100 %	0 %	0 %	0 %	188590699
106	NC_010723	CAA	2	6	4009	4014	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188590699
107	NC_010723	TTC	2	6	4041	4046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188590699
108	NC_010723	ATT	2	6	4054	4059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188590699
109	NC_010723	TTA	2	6	4087	4092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188590699
110	NC_010723	ACAA	2	8	4161	4168	75 %	0 %	0 %	25 %	188590699
111	NC_010723	AGA	2	6	4197	4202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188590699
112	NC_010723	GAT	2	6	4210	4215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188590699
113	NC_010723	TGT	2	6	4298	4303	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	188589365
114	NC_010723	ATT	2	6	4320	4325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188589365
115	NC_010723	ATA	2	6	4342	4347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188589365
116	NC_010723	GAA	2	6	4389	4394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188589365
117	NC_010723	AGAA	2	8	4406	4413	75 %	0 %	25 %	0 %	188589365
118	NC_010723	TAA	2	6	4454	4459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188589365
119	NC_010723	AT	3	6	4470	4475	50 %	50 %	0 %	0 %	188589365
120	NC_010723	TCT	2	6	4488	4493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188589365
121	NC_010723	AAT	2	6	4580	4585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188588443
122	NC_010723	ATG	2	6	4593	4598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188588443
123	NC_010723	GTA	2	6	4662	4667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188588443
124	NC_010723	ATA	2	6	4710	4715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188588443
125	NC_010723	TGA	2	6	4792	4797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188588443
126	NC_010723	CAG	2	6	4842	4847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188588443
127	NC_010723	TAA	2	6	4854	4859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188588443
128	NC_010723	CGG	2	6	4876	4881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188588443
129	NC_010723	TGG	3	9	4888	4896	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188588443
130	NC_010723	TGG	2	6	4912	4917	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188588443
131	NC_010723	TGT	2	6	4939	4944	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	188588443
132	NC_010723	AT	3	6	4992	4997	50 %	50 %	0 %	0 %	188588443
133	NC_010723	CAA	2	6	5000	5005	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188588443
134	NC_010723	GTAAAG	2	12	5013	5024	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	188588443
135	NC_010723	GAA	2	6	5057	5062	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188588443
136	NC_010723	ACA	2	6	5069	5074	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188588443
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