MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Cyanothece sp. ATCC 51142 chromosome linear

Total Repeats: 7564

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010547	GAA	2	6	246	251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172054854
2	NC_010547	TAA	2	6	329	334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172054854
3	NC_010547	GAC	2	6	406	411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172054854
4	NC_010547	A	6	6	417	422	100 %	0 %	0 %	0 %	172054854
5	NC_010547	GAAA	2	8	470	477	75 %	0 %	25 %	0 %	172054854
6	NC_010547	ATA	2	6	643	648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172054854
7	NC_010547	G	7	7	678	684	0 %	0 %	100 %	0 %	172054854
8	NC_010547	ACC	2	6	708	713	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	172054854
9	NC_010547	ACC	2	6	752	757	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	172054854
10	NC_010547	TTGC	2	8	931	938	0 %	50 %	25 %	25 %	172054854
11	NC_010547	AAG	2	6	943	948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172054854
12	NC_010547	CAA	2	6	1240	1245	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	172054855
13	NC_010547	CAA	2	6	1248	1253	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	172054855
14	NC_010547	GCT	2	6	1302	1307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172054855
15	NC_010547	AGA	2	6	1319	1324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172054855
16	NC_010547	AGA	2	6	1388	1393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172054855
17	NC_010547	AGA	2	6	1400	1405	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172054855
18	NC_010547	CAA	2	6	1422	1427	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	172054855
19	NC_010547	AGA	2	6	1466	1471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172054855
20	NC_010547	ACA	2	6	1579	1584	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	172054856
21	NC_010547	AAC	2	6	1593	1598	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	172054856
22	NC_010547	TAA	2	6	1622	1627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172054856
23	NC_010547	GAA	2	6	1653	1658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172054856
24	NC_010547	T	6	6	1701	1706	0 %	100 %	0 %	0 %	172054856
25	NC_010547	TGC	2	6	1757	1762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172054856
26	NC_010547	TGG	2	6	1821	1826	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	172054856
27	NC_010547	TTAA	2	8	1863	1870	50 %	50 %	0 %	0 %	172054856
28	NC_010547	CAC	2	6	2078	2083	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	172054857
29	NC_010547	ATTAA	2	10	2101	2110	60 %	40 %	0 %	0 %	172054857
30	NC_010547	TGAT	2	8	2195	2202	25 %	50 %	25 %	0 %	172054857
31	NC_010547	CCGTTA	2	12	2298	2309	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	172054857
32	NC_010547	TAT	2	6	2392	2397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172054857
33	NC_010547	TAA	2	6	2416	2421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172054857
34	NC_010547	TAT	2	6	2560	2565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172054858
35	NC_010547	ATA	2	6	2744	2749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172054858
36	NC_010547	ACT	2	6	2795	2800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172054858
37	NC_010547	CTA	2	6	2854	2859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172054859
38	NC_010547	CAA	2	6	2907	2912	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	172054859
39	NC_010547	TGGA	2	8	2929	2936	25 %	25 %	50 %	0 %	172054859
40	NC_010547	ATT	2	6	2949	2954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172054859
41	NC_010547	TGA	2	6	2993	2998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172054859
42	NC_010547	TTA	2	6	3009	3014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172054859
43	NC_010547	ATCA	2	8	3018	3025	50 %	25 %	0 %	25 %	172054859
44	NC_010547	TTC	2	6	3032	3037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172054859
45	NC_010547	ATT	2	6	3059	3064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172054859
46	NC_010547	A	6	6	3070	3075	100 %	0 %	0 %	0 %	172054859
47	NC_010547	CT	4	8	3199	3206	0 %	50 %	0 %	50 %	172054859
48	NC_010547	CAT	2	6	3236	3241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172054859
49	NC_010547	ATT	2	6	3299	3304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172054860
50	NC_010547	GGT	2	6	3382	3387	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	172054860
51	NC_010547	TAA	2	6	3429	3434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172054860
52	NC_010547	ATA	2	6	3443	3448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172054860
53	NC_010547	ATC	2	6	3494	3499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172054860
54	NC_010547	ACA	3	9	3504	3512	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	172054860
55	NC_010547	TTG	2	6	3554	3559	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172054860
56	NC_010547	TTA	2	6	3680	3685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172054861
57	NC_010547	T	6	6	3796	3801	0 %	100 %	0 %	0 %	172054861
58	NC_010547	ATG	2	6	3823	3828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172054861
59	NC_010547	TAA	2	6	3832	3837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172054861
60	NC_010547	AACC	2	8	3900	3907	50 %	0 %	0 %	50 %	172054861
61	NC_010547	TGGAAT	2	12	4075	4086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172054861
62	NC_010547	CTTT	2	8	4128	4135	0 %	75 %	0 %	25 %	172054861
63	NC_010547	CCA	2	6	4223	4228	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	172054862
64	NC_010547	ATA	2	6	4266	4271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172054862
65	NC_010547	TAT	2	6	4292	4297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172054862
66	NC_010547	TAG	2	6	4339	4344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172054862
67	NC_010547	A	6	6	4345	4350	100 %	0 %	0 %	0 %	172054862
68	NC_010547	CCT	2	6	4365	4370	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	172054862
69	NC_010547	GTT	2	6	4371	4376	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172054862
70	NC_010547	CAA	2	6	4394	4399	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	172054862
71	NC_010547	CTG	2	6	4423	4428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172054862
72	NC_010547	TCC	3	9	4430	4438	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	172054862
73	NC_010547	AAT	2	6	4442	4447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172054862
74	NC_010547	GGTA	2	8	4482	4489	25 %	25 %	50 %	0 %	172054862
75	NC_010547	ATA	2	6	4568	4573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172054862
76	NC_010547	ATA	2	6	4611	4616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172054862
77	NC_010547	GGTAA	2	10	4650	4659	40 %	20 %	40 %	0 %	172054862
78	NC_010547	ATT	2	6	4686	4691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172054862
79	NC_010547	A	7	7	4743	4749	100 %	0 %	0 %	0 %	172054862
80	NC_010547	ACTA	2	8	4751	4758	50 %	25 %	0 %	25 %	172054862
81	NC_010547	TAA	2	6	4882	4887	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172054863
82	NC_010547	TTC	2	6	4888	4893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172054863
83	NC_010547	CAT	2	6	4897	4902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172054863
84	NC_010547	TCT	3	9	4913	4921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172054863
85	NC_010547	T	8	8	5065	5072	0 %	100 %	0 %	0 %	172054863
86	NC_010547	TCT	2	6	5113	5118	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172054863
87	NC_010547	ATC	2	6	5120	5125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172054863
88	NC_010547	T	7	7	5134	5140	0 %	100 %	0 %	0 %	172054863
89	NC_010547	TTG	2	6	5239	5244	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172054863
90	NC_010547	ATG	2	6	5248	5253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172054863
91	NC_010547	TAG	2	6	5269	5274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172054863
92	NC_010547	CTT	2	6	5310	5315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172054863
93	NC_010547	TTA	2	6	5327	5332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172054863
94	NC_010547	TA	3	6	5331	5336	50 %	50 %	0 %	0 %	172054863
95	NC_010547	AG	3	6	5375	5380	50 %	0 %	50 %	0 %	172054863
96	NC_010547	T	6	6	5416	5421	0 %	100 %	0 %	0 %	172054863
97	NC_010547	GTT	2	6	5482	5487	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172054863
98	NC_010547	CTTT	2	8	5493	5500	0 %	75 %	0 %	25 %	172054863
99	NC_010547	TCA	3	9	5558	5566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172054863
100	NC_010547	TCT	2	6	5567	5572	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172054863
101	NC_010547	TTA	2	6	5595	5600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172054863
102	NC_010547	CAT	2	6	5605	5610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172054863
103	NC_010547	CT	3	6	5641	5646	0 %	50 %	0 %	50 %	172054863
104	NC_010547	T	7	7	5649	5655	0 %	100 %	0 %	0 %	172054863
105	NC_010547	TTG	2	6	5667	5672	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172054863
106	NC_010547	TGT	2	6	5723	5728	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172054863
107	NC_010547	A	6	6	5783	5788	100 %	0 %	0 %	0 %	172054863
108	NC_010547	TTTG	2	8	5817	5824	0 %	75 %	25 %	0 %	172054863
109	NC_010547	ACG	2	6	5854	5859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172054863
110	NC_010547	GAT	2	6	5873	5878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172054863
111	NC_010547	GA	3	6	6101	6106	50 %	0 %	50 %	0 %	172054864
112	NC_010547	CTT	2	6	6123	6128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172054864
113	NC_010547	CAA	2	6	6148	6153	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	172054864
114	NC_010547	TAG	2	6	6199	6204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172054864
115	NC_010547	TAA	2	6	6282	6287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172054864
116	NC_010547	TGA	2	6	6298	6303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172054864
117	NC_010547	CTCTGT	2	12	6319	6330	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	172054864
118	NC_010547	GAC	2	6	6362	6367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172054864
119	NC_010547	CTTTCT	2	12	6419	6430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172054864
120	NC_010547	ATT	2	6	6457	6462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172054864
121	NC_010547	CTG	2	6	6466	6471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172054864
122	NC_010547	TCT	2	6	6503	6508	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172054864
123	NC_010547	TTA	2	6	6539	6544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172054864
124	NC_010547	CATCA	2	10	6547	6556	40 %	20 %	0 %	40 %	172054864
125	NC_010547	GTT	2	6	6590	6595	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172054864
126	NC_010547	TTCTCA	2	12	6596	6607	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	172054864
127	NC_010547	CA	3	6	6619	6624	50 %	0 %	0 %	50 %	172054864
128	NC_010547	ATT	2	6	6628	6633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172054864
129	NC_010547	TGAT	2	8	6640	6647	25 %	50 %	25 %	0 %	172054864
130	NC_010547	TTCCGG	2	12	6770	6781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172054864
131	NC_010547	AGTTG	2	10	6801	6810	20 %	40 %	40 %	0 %	172054864
132	NC_010547	CTC	2	6	6918	6923	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	172054864
133	NC_010547	GAT	2	6	6991	6996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172054864
134	NC_010547	GTT	2	6	7024	7029	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172054864
135	NC_010547	AC	3	6	7066	7071	50 %	0 %	0 %	50 %	172054864
136	NC_010547	C	6	6	7333	7338	0 %	0 %	0 %	100 %	172054865
137	NC_010547	TGC	2	6	7345	7350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172054865
138	NC_010547	TTTTC	2	10	7352	7361	0 %	80 %	0 %	20 %	172054865
139	NC_010547	GTAAG	2	10	7362	7371	40 %	20 %	40 %	0 %	172054865
140	NC_010547	GTG	2	6	7399	7404	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	172054865
141	NC_010547	GGT	2	6	7500	7505	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	172054865
142	NC_010547	CTA	2	6	7526	7531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172054865
143	NC_010547	TCC	2	6	7569	7574	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	172054865
144	NC_010547	ACC	2	6	7621	7626	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	172054865
145	NC_010547	CAT	2	6	7674	7679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172054865
146	NC_010547	AAGTA	2	10	7745	7754	60 %	20 %	20 %	0 %	172054865
147	NC_010547	TGG	2	6	7757	7762	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	172054865
148	NC_010547	TC	3	6	7780	7785	0 %	50 %	0 %	50 %	172054865
149	NC_010547	ATG	2	6	7948	7953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172054865
150	NC_010547	T	6	6	7956	7961	0 %	100 %	0 %	0 %	172054865
151	NC_010547	CTTT	2	8	7981	7988	0 %	75 %	0 %	25 %	172054865
152	NC_010547	CTT	2	6	8108	8113	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172054865
153	NC_010547	TA	3	6	8123	8128	50 %	50 %	0 %	0 %	172054865
154	NC_010547	CAT	2	6	8318	8323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172054865
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156	NC_010547	GCT	2	6	8407	8412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172054865
157	NC_010547	GCT	2	6	8566	8571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172054865
158	NC_010547	AAT	2	6	8584	8589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172054865
159	NC_010547	T	6	6	8598	8603	0 %	100 %	0 %	0 %	172054865
160	NC_010547	AAT	2	6	8659	8664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172054865
161	NC_010547	TTCT	2	8	8729	8736	0 %	75 %	0 %	25 %	172054865
162	NC_010547	TAA	2	6	8748	8753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172054865
163	NC_010547	CTT	2	6	8760	8765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172054865
164	NC_010547	G	6	6	8826	8831	0 %	0 %	100 %	0 %	172054865
165	NC_010547	TCT	2	6	8905	8910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172054865
166	NC_010547	TCT	2	6	8950	8955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172054865
167	NC_010547	TGT	2	6	8981	8986	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172054865
168	NC_010547	CATT	2	8	9068	9075	25 %	50 %	0 %	25 %	172054865
169	NC_010547	CTA	2	6	9077	9082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172054865
170	NC_010547	TGG	2	6	9471	9476	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	172054866
171	NC_010547	TAA	3	9	9499	9507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172054866
172	NC_010547	TTC	2	6	10032	10037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172054867
173	NC_010547	TAA	2	6	10056	10061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172054867
174	NC_010547	GAC	2	6	10118	10123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172054867
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179	NC_010547	A	8	8	10463	10470	100 %	0 %	0 %	0 %	172054868
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213	NC_010547	T	6	6	13333	13338	0 %	100 %	0 %	0 %	172054873
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248	NC_010547	GAT	2	6	15665	15670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172054876
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250	NC_010547	TAAT	2	8	15764	15771	50 %	50 %	0 %	0 %	172054876
251	NC_010547	AGA	2	6	15899	15904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172054877
252	NC_010547	GAT	2	6	15954	15959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172054877
253	NC_010547	ATC	2	6	16032	16037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172054877
254	NC_010547	TCT	2	6	16050	16055	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172054877
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256	NC_010547	CCT	2	6	16364	16369	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	172054878
257	NC_010547	GA	3	6	16410	16415	50 %	0 %	50 %	0 %	172054878
258	NC_010547	GTC	2	6	16512	16517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172054878
259	NC_010547	AAC	2	6	16551	16556	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	172054878
260	NC_010547	CAACT	2	10	16588	16597	40 %	20 %	0 %	40 %	172054878
261	NC_010547	AGA	2	6	16603	16608	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172054878
262	NC_010547	CAA	2	6	16727	16732	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	172054878
263	NC_010547	AAT	2	6	16778	16783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172054879
264	NC_010547	AGA	2	6	16799	16804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172054879
265	NC_010547	AGA	2	6	16835	16840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172054879
266	NC_010547	AAC	2	6	16912	16917	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	172054879
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269	NC_010547	ATC	2	6	17014	17019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172054879
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388	NC_010547	AGT	2	6	23349	23354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172054882
389	NC_010547	GTTACT	2	12	23357	23368	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	172054882
390	NC_010547	CAC	2	6	23536	23541	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	172054882
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