MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Cyanothece sp. ATCC 51142 chromosome linear

Total Repeats: 7564

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_010547	CAA	2	6	178201	178206	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	172055030
3002	NC_010547	ACC	2	6	178229	178234	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	172055030
3003	NC_010547	GAG	2	6	178261	178266	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	172055030
3004	NC_010547	AAGA	2	8	178337	178344	75 %	0 %	25 %	0 %	172055030
3005	NC_010547	TGA	2	6	178357	178362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172055030
3006	NC_010547	G	6	6	178397	178402	0 %	0 %	100 %	0 %	172055030
3007	NC_010547	CGATT	2	10	178408	178417	20 %	40 %	20 %	20 %	172055030
3008	NC_010547	AAG	2	6	178446	178451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172055030
3009	NC_010547	CGG	2	6	178530	178535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	172055030
3010	NC_010547	CAA	2	6	178603	178608	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	172055030
3011	NC_010547	GTT	2	6	178621	178626	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172055030
3012	NC_010547	GGAC	2	8	178635	178642	25 %	0 %	50 %	25 %	172055030
3013	NC_010547	TCAG	2	8	178722	178729	25 %	25 %	25 %	25 %	172055030
3014	NC_010547	AGT	2	6	178808	178813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172055030
3015	NC_010547	GCTG	2	8	178815	178822	0 %	25 %	50 %	25 %	172055030
3016	NC_010547	GTGA	2	8	178854	178861	25 %	25 %	50 %	0 %	172055030
3017	NC_010547	GAC	2	6	178884	178889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172055031
3018	NC_010547	GCA	2	6	178914	178919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172055031
3019	NC_010547	ATC	2	6	178920	178925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172055031
3020	NC_010547	AAG	2	6	178927	178932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172055031
3021	NC_010547	AAAG	2	8	179006	179013	75 %	0 %	25 %	0 %	172055031
3022	NC_010547	TGT	2	6	179069	179074	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172055031
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3024	NC_010547	GT	3	6	179156	179161	0 %	50 %	50 %	0 %	172055031
3025	NC_010547	AAG	2	6	179191	179196	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172055031
3026	NC_010547	GCGAT	2	10	179217	179226	20 %	20 %	40 %	20 %	172055031
3027	NC_010547	TATT	2	8	179268	179275	25 %	75 %	0 %	0 %	172055031
3028	NC_010547	GAA	2	6	179299	179304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172055031
3029	NC_010547	TGC	2	6	179587	179592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172055031
3030	NC_010547	AAT	2	6	179601	179606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172055031
3031	NC_010547	TC	3	6	179642	179647	0 %	50 %	0 %	50 %	172055031
3032	NC_010547	AGCAA	2	10	179648	179657	60 %	0 %	20 %	20 %	172055031
3033	NC_010547	TTG	2	6	179671	179676	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172055031
3034	NC_010547	GA	3	6	179721	179726	50 %	0 %	50 %	0 %	172055031
3035	NC_010547	AGA	2	6	180543	180548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172055032
3036	NC_010547	AGA	2	6	180551	180556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172055032
3037	NC_010547	GAA	2	6	180559	180564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172055032
3038	NC_010547	GAA	2	6	180610	180615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172055032
3039	NC_010547	TAA	2	6	180621	180626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172055032
3040	NC_010547	T	6	6	180676	180681	0 %	100 %	0 %	0 %	172055032
3041	NC_010547	AAG	2	6	180799	180804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172055032
3042	NC_010547	GAA	2	6	181048	181053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172055032
3043	NC_010547	AAT	2	6	181138	181143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172055032
3044	NC_010547	CGA	2	6	181257	181262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172055032
3045	NC_010547	GTCT	2	8	182281	182288	0 %	50 %	25 %	25 %	172055033
3046	NC_010547	TGT	2	6	182292	182297	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172055033
3047	NC_010547	CAT	2	6	182316	182321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172055033
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3049	NC_010547	GAAAG	2	10	182356	182365	60 %	0 %	40 %	0 %	172055033
3050	NC_010547	TAT	2	6	182368	182373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172055033
3051	NC_010547	GAA	2	6	182407	182412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172055033
3052	NC_010547	CAA	2	6	182772	182777	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	172055034
3053	NC_010547	AGA	2	6	182828	182833	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172055034
3054	NC_010547	TTG	2	6	182864	182869	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172055034
3055	NC_010547	CCA	2	6	182902	182907	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	172055034
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3057	NC_010547	GAT	2	6	182967	182972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172055034
3058	NC_010547	GAA	3	9	183018	183026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172055034
3059	NC_010547	CAG	2	6	183442	183447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172055035
3060	NC_010547	T	7	7	183454	183460	0 %	100 %	0 %	0 %	172055035
3061	NC_010547	T	8	8	183470	183477	0 %	100 %	0 %	0 %	172055035
3062	NC_010547	TCT	2	6	183589	183594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172055035
3063	NC_010547	CTG	2	6	183726	183731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172055036
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3065	NC_010547	GCT	2	6	183841	183846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172055036
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3105	NC_010547	AAC	2	6	186846	186851	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	172055040
3106	NC_010547	CAA	2	6	186987	186992	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	172055040
3107	NC_010547	GAT	2	6	187123	187128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172055040
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3112	NC_010547	AT	3	6	187508	187513	50 %	50 %	0 %	0 %	172055041
3113	NC_010547	AGA	2	6	187569	187574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172055041
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3120	NC_010547	TGT	2	6	188774	188779	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172055042
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3122	NC_010547	TTG	2	6	188826	188831	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172055042
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3240	NC_010547	AAGACA	2	12	197009	197020	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	172055054
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3244	NC_010547	CAT	2	6	197824	197829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172055055
3245	NC_010547	TGA	2	6	197907	197912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172055055
3246	NC_010547	GGTCA	2	10	197928	197937	20 %	20 %	40 %	20 %	172055055
3247	NC_010547	AAG	3	9	197943	197951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172055055
3248	NC_010547	TGA	2	6	198034	198039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172055055
3249	NC_010547	TCGATG	2	12	198099	198110	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	172055055
3250	NC_010547	AAAG	2	8	198181	198188	75 %	0 %	25 %	0 %	172055055
3251	NC_010547	AGC	2	6	198196	198201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172055055
3252	NC_010547	TCC	2	6	198315	198320	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	172055055
3253	NC_010547	CAA	2	6	198406	198411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	172055056
3254	NC_010547	ATC	2	6	198436	198441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172055056
3255	NC_010547	ATC	2	6	198613	198618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172055056
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3257	NC_010547	GTA	2	6	198646	198651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172055056
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3259	NC_010547	ATT	2	6	198795	198800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172055057
3260	NC_010547	AGA	2	6	198813	198818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172055057
3261	NC_010547	ACTA	2	8	199062	199069	50 %	25 %	0 %	25 %	172055058
3262	NC_010547	ATGA	2	8	199143	199150	50 %	25 %	25 %	0 %	172055058
3263	NC_010547	TA	3	6	199187	199192	50 %	50 %	0 %	0 %	172055058
3264	NC_010547	ACG	2	6	199228	199233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172055058
3265	NC_010547	CCA	2	6	199263	199268	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	172055058
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3267	NC_010547	TAG	2	6	199402	199407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172055058
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3269	NC_010547	TG	3	6	199494	199499	0 %	50 %	50 %	0 %	172055058
3270	NC_010547	GCACA	2	10	199506	199515	40 %	0 %	20 %	40 %	172055058
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3273	NC_010547	AAG	2	6	200107	200112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172055059
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3275	NC_010547	AGA	2	6	200172	200177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172055059
3276	NC_010547	AAAAG	2	10	200265	200274	80 %	0 %	20 %	0 %	172055059
3277	NC_010547	CTTT	2	8	200312	200319	0 %	75 %	0 %	25 %	172055060
3278	NC_010547	T	7	7	200317	200323	0 %	100 %	0 %	0 %	172055060
3279	NC_010547	TGT	3	9	200329	200337	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172055060
3280	NC_010547	CAT	2	6	200459	200464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172055060
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3284	NC_010547	TTG	2	6	201057	201062	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172055060
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3323	NC_010547	GATC	2	8	203722	203729	25 %	25 %	25 %	25 %	172055060
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3347	NC_010547	GA	4	8	205022	205029	50 %	0 %	50 %	0 %	172055062
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3349	NC_010547	T	7	7	205080	205086	0 %	100 %	0 %	0 %	172055062
3350	NC_010547	TAAT	2	8	205109	205116	50 %	50 %	0 %	0 %	172055062
3351	NC_010547	TCT	2	6	205156	205161	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172055063
3352	NC_010547	TCG	2	6	205162	205167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172055063
3353	NC_010547	CTG	2	6	205214	205219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172055063
3354	NC_010547	AG	3	6	205250	205255	50 %	0 %	50 %	0 %	172055063
3355	NC_010547	GGA	2	6	205261	205266	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	172055063
3356	NC_010547	AGT	2	6	205312	205317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172055063
3357	NC_010547	GATGT	2	10	205320	205329	20 %	40 %	40 %	0 %	172055063
3358	NC_010547	GAG	2	6	205332	205337	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	172055063
3359	NC_010547	CTT	2	6	205367	205372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172055063
3360	NC_010547	GAA	2	6	205375	205380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172055063
3361	NC_010547	CCT	2	6	205381	205386	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	172055063
3362	NC_010547	TTGCT	2	10	205464	205473	0 %	60 %	20 %	20 %	172055063
3363	NC_010547	TTG	2	6	205474	205479	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172055063
3364	NC_010547	TAG	2	6	205480	205485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172055063
3365	NC_010547	TCT	2	6	205510	205515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172055063
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3367	NC_010547	CTT	2	6	205585	205590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172055064
3368	NC_010547	AGT	2	6	205592	205597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172055064
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3375	NC_010547	ATC	2	6	206111	206116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172055064
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3380	NC_010547	ACG	2	6	206582	206587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172055064
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3384	NC_010547	AAGA	2	8	207013	207020	75 %	0 %	25 %	0 %	172055065
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3386	NC_010547	A	6	6	207073	207078	100 %	0 %	0 %	0 %	172055065
3387	NC_010547	TATACC	2	12	207119	207130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172055065
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3407	NC_010547	ATC	2	6	208167	208172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172055066
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3476	NC_010547	CTTA	2	8	211566	211573	25 %	50 %	0 %	25 %	172055071
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3482	NC_010547	GTG	2	6	211791	211796	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	172055071
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3486	NC_010547	GCGG	2	8	212130	212137	0 %	0 %	75 %	25 %	172055071
3487	NC_010547	A	6	6	212158	212163	100 %	0 %	0 %	0 %	172055071
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3490	NC_010547	AAC	2	6	212256	212261	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	172055071
3491	NC_010547	GTC	2	6	212326	212331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172055071
3492	NC_010547	AGA	2	6	212387	212392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172055071
3493	NC_010547	CTA	2	6	212490	212495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172055071
3494	NC_010547	CCT	2	6	212524	212529	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	172055071
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