MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Cyanothece sp. ATCC 51142 chromosome circular

Total Repeats: 92402

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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24004	NC_010546	TGGT	2	8	1279432	1279439	0 %	50 %	50 %	0 %	172036188
24005	NC_010546	GAATT	2	10	1279447	1279456	40 %	40 %	20 %	0 %	172036188
24006	NC_010546	ATT	2	6	1279478	1279483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172036188
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24117	NC_010546	TCT	2	6	1286704	1286709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172036197
24118	NC_010546	CTT	2	6	1286783	1286788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172036197
24119	NC_010546	TAA	2	6	1286876	1286881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172036197
24120	NC_010546	GGC	2	6	1286889	1286894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	172036197
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24124	NC_010546	AAT	2	6	1287184	1287189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172036197
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24143	NC_010546	TCT	2	6	1288265	1288270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172036198
24144	NC_010546	TTC	2	6	1288288	1288293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172036198
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24220	NC_010546	GTTT	2	8	1292396	1292403	0 %	75 %	25 %	0 %	172036202
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24226	NC_010546	TAAA	2	8	1292795	1292802	75 %	25 %	0 %	0 %	172036203
24227	NC_010546	CTT	2	6	1292818	1292823	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172036203
24228	NC_010546	T	6	6	1292822	1292827	0 %	100 %	0 %	0 %	172036203
24229	NC_010546	TTG	2	6	1292897	1292902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172036203
24230	NC_010546	T	6	6	1293037	1293042	0 %	100 %	0 %	0 %	172036203
24231	NC_010546	TTC	3	9	1293047	1293055	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172036203
24232	NC_010546	AGAGA	2	10	1293072	1293081	60 %	0 %	40 %	0 %	172036203
24233	NC_010546	CAG	2	6	1293148	1293153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172036203
24234	NC_010546	GTG	2	6	1293162	1293167	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	172036203
24235	NC_010546	ATC	2	6	1293203	1293208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172036203
24236	NC_010546	ATT	2	6	1293212	1293217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172036203
24237	NC_010546	GTA	2	6	1293253	1293258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172036203
24238	NC_010546	AATT	2	8	1293287	1293294	50 %	50 %	0 %	0 %	172036203
24239	NC_010546	CAT	2	6	1293364	1293369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172036203
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24241	NC_010546	CAT	2	6	1293406	1293411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172036203
24242	NC_010546	TAA	3	9	1293417	1293425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172036203
24243	NC_010546	TAGG	2	8	1293427	1293434	25 %	25 %	50 %	0 %	172036203
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24245	NC_010546	T	6	6	1293473	1293478	0 %	100 %	0 %	0 %	172036203
24246	NC_010546	TAAC	2	8	1293511	1293518	50 %	25 %	0 %	25 %	172036203
24247	NC_010546	TAA	2	6	1293542	1293547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172036203
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24250	NC_010546	A	6	6	1293647	1293652	100 %	0 %	0 %	0 %	172036203
24251	NC_010546	TACT	2	8	1293706	1293713	25 %	50 %	0 %	25 %	172036203
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24262	NC_010546	TA	3	6	1294015	1294020	50 %	50 %	0 %	0 %	172036203
24263	NC_010546	TAC	2	6	1294102	1294107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172036203
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24265	NC_010546	TCA	2	6	1294138	1294143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172036203
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24341	NC_010546	TTACC	2	10	1299836	1299845	20 %	40 %	0 %	40 %	172036211
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24343	NC_010546	CGT	2	6	1299952	1299957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172036211
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24348	NC_010546	AAG	2	6	1300214	1300219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172036211
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24351	NC_010546	TTC	2	6	1300287	1300292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172036212
24352	NC_010546	GTC	2	6	1300337	1300342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172036212
24353	NC_010546	ATA	2	6	1300383	1300388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172036212
24354	NC_010546	TTC	2	6	1300389	1300394	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172036212
24355	NC_010546	TTG	2	6	1300443	1300448	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172036212
24356	NC_010546	CTT	2	6	1300454	1300459	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172036212
24357	NC_010546	CTT	2	6	1300472	1300477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172036212
24358	NC_010546	AAT	2	6	1300490	1300495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172036212
24359	NC_010546	ATT	2	6	1300512	1300517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172036212
24360	NC_010546	CA	3	6	1300524	1300529	50 %	0 %	0 %	50 %	172036212
24361	NC_010546	CTC	2	6	1300538	1300543	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	172036212
24362	NC_010546	TTGCT	2	10	1300587	1300596	0 %	60 %	20 %	20 %	172036212
24363	NC_010546	AAT	2	6	1300669	1300674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172036212
24364	NC_010546	AAT	2	6	1300693	1300698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172036212
24365	NC_010546	GAC	2	6	1300718	1300723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172036212
24366	NC_010546	ATTA	2	8	1300782	1300789	50 %	50 %	0 %	0 %	172036212
24367	NC_010546	T	6	6	1300934	1300939	0 %	100 %	0 %	0 %	172036212
24368	NC_010546	ATA	2	6	1300976	1300981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172036212
24369	NC_010546	A	6	6	1301014	1301019	100 %	0 %	0 %	0 %	172036212
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24371	NC_010546	CTC	2	6	1301141	1301146	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	172036212
24372	NC_010546	TTC	2	6	1301166	1301171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172036212
24373	NC_010546	TTC	2	6	1301212	1301217	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172036212
24374	NC_010546	ATA	2	6	1301237	1301242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172036212
24375	NC_010546	ATA	2	6	1301332	1301337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172036212
24376	NC_010546	GAC	2	6	1301422	1301427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172036213
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24378	NC_010546	ATC	2	6	1301456	1301461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172036213
24379	NC_010546	AAG	2	6	1301543	1301548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172036213
24380	NC_010546	TAATTT	2	12	1301570	1301581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172036213
24381	NC_010546	CGAA	2	8	1301586	1301593	50 %	0 %	25 %	25 %	172036213
24382	NC_010546	TTC	2	6	1301746	1301751	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172036214
24383	NC_010546	GAT	2	6	1301793	1301798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172036214
24384	NC_010546	CAT	2	6	1301811	1301816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172036214
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24386	NC_010546	CAT	2	6	1302093	1302098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172036214
24387	NC_010546	TTC	2	6	1302175	1302180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172036214
24388	NC_010546	ACG	2	6	1302256	1302261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172036214
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24399	NC_010546	A	7	7	1303322	1303328	100 %	0 %	0 %	0 %	172036215
24400	NC_010546	TAG	2	6	1303437	1303442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172036215
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24410	NC_010546	ATCCTA	2	12	1304019	1304030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172036216
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24414	NC_010546	TCTT	2	8	1304950	1304957	0 %	75 %	0 %	25 %	172036217
24415	NC_010546	G	6	6	1304983	1304988	0 %	0 %	100 %	0 %	172036217
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24417	NC_010546	TAA	2	6	1305079	1305084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172036217
24418	NC_010546	ATA	2	6	1305116	1305121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172036217
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24424	NC_010546	T	6	6	1305489	1305494	0 %	100 %	0 %	0 %	172036217
24425	NC_010546	GAA	2	6	1305564	1305569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172036217
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24428	NC_010546	GCG	2	6	1306066	1306071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	172036220
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24432	NC_010546	AAT	2	6	1306252	1306257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172036221
24433	NC_010546	TCA	2	6	1306289	1306294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172036221
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24435	NC_010546	GCCA	2	8	1306711	1306718	25 %	0 %	25 %	50 %	172036223
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24439	NC_010546	CCT	2	6	1306862	1306867	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	172036223
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24443	NC_010546	GCT	2	6	1307342	1307347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172036223
24444	NC_010546	CTA	2	6	1307355	1307360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172036223
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24447	NC_010546	T	7	7	1307682	1307688	0 %	100 %	0 %	0 %	172036224
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24452	NC_010546	CTG	2	6	1308466	1308471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172036225
24453	NC_010546	TTC	2	6	1308539	1308544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172036225
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24455	NC_010546	ATTG	2	8	1308583	1308590	25 %	50 %	25 %	0 %	172036225
24456	NC_010546	TCT	2	6	1308603	1308608	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172036225
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24460	NC_010546	TCT	2	6	1308789	1308794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172036225
24461	NC_010546	CCT	2	6	1308795	1308800	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	172036225
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24464	NC_010546	ACT	2	6	1308899	1308904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172036225
24465	NC_010546	CGT	2	6	1309027	1309032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172036225
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