MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Cupriavidus taiwanensis LMG 19424 plasmid pRALTA

Total Repeats: 8961

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010529	GGC	2	6	58	63	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188591328
2	NC_010529	ACG	2	6	143	148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591328
3	NC_010529	AAG	2	6	253	258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188591328
4	NC_010529	GGA	2	6	312	317	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	188591328
5	NC_010529	CAG	2	6	333	338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591328
6	NC_010529	TAC	2	6	397	402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188591328
7	NC_010529	ACA	2	6	437	442	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188591328
8	NC_010529	ACT	2	6	470	475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188591328
9	NC_010529	GAA	2	6	520	525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188591328
10	NC_010529	AGCG	2	8	549	556	25 %	0 %	50 %	25 %	188591328
11	NC_010529	ATG	2	6	586	591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188591328
12	NC_010529	CTT	2	6	619	624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188591328
13	NC_010529	TCGA	2	8	649	656	25 %	25 %	25 %	25 %	188591328
14	NC_010529	CCA	2	6	722	727	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188591328
15	NC_010529	ACA	2	6	749	754	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188591328
16	NC_010529	GTTT	2	8	790	797	0 %	75 %	25 %	0 %	188591328
17	NC_010529	CCG	2	6	821	826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188591328
18	NC_010529	ATG	2	6	859	864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188591328
19	NC_010529	GAA	2	6	877	882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188591328
20	NC_010529	TCCAG	2	10	898	907	20 %	20 %	20 %	40 %	188591328
21	NC_010529	CCG	2	6	927	932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188591328
22	NC_010529	TCA	2	6	935	940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188591328
23	NC_010529	TCGC	2	8	955	962	0 %	25 %	25 %	50 %	188591328
24	NC_010529	TA	3	6	1001	1006	50 %	50 %	0 %	0 %	188591328
25	NC_010529	GAG	2	6	1117	1122	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	188591328
26	NC_010529	CAG	2	6	1141	1146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591328
27	NC_010529	AAG	2	6	1147	1152	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188591328
28	NC_010529	GAC	2	6	1165	1170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591328
29	NC_010529	GAG	2	6	1213	1218	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	188591328
30	NC_010529	CTG	2	6	1276	1281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591328
31	NC_010529	TTC	2	6	1375	1380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188591328
32	NC_010529	TCA	2	6	1448	1453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188591328
33	NC_010529	AGG	2	6	1499	1504	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	188591328
34	NC_010529	GCG	2	6	1569	1574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188591328
35	NC_010529	CTT	2	6	1622	1627	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188591328
36	NC_010529	CCG	2	6	1677	1682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188591328
37	NC_010529	AAC	2	6	1727	1732	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188591328
38	NC_010529	CTG	2	6	1795	1800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591328
39	NC_010529	GCG	2	6	1874	1879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188591328
40	NC_010529	CGC	2	6	1932	1937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188591328
41	NC_010529	CTT	2	6	1953	1958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188591328
42	NC_010529	CGG	2	6	1977	1982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188591328
43	NC_010529	CGC	2	6	2019	2024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188591328
44	NC_010529	GC	3	6	2023	2028	0 %	0 %	50 %	50 %	188591328
45	NC_010529	ACG	2	6	2128	2133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591329
46	NC_010529	CGGAA	2	10	2201	2210	40 %	0 %	40 %	20 %	188591329
47	NC_010529	CGG	2	6	2219	2224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188591329
48	NC_010529	CAA	2	6	2309	2314	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188591329
49	NC_010529	GAA	2	6	2340	2345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188591329
50	NC_010529	GGC	2	6	2346	2351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188591329
51	NC_010529	TTGAA	2	10	2428	2437	40 %	40 %	20 %	0 %	188591329
52	NC_010529	TCG	4	12	2461	2472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591329
53	NC_010529	TC	3	6	2508	2513	0 %	50 %	0 %	50 %	188591329
54	NC_010529	AAC	2	6	2616	2621	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188591329
55	NC_010529	ACC	2	6	2787	2792	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188591329
56	NC_010529	CTC	2	6	2829	2834	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	188591329
57	NC_010529	G	6	6	3221	3226	0 %	0 %	100 %	0 %	188591329
58	NC_010529	CGA	2	6	3233	3238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591329
59	NC_010529	GAA	2	6	3245	3250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188591329
60	NC_010529	AGA	2	6	3289	3294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188591329
61	NC_010529	TTC	2	6	3330	3335	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188591329
62	NC_010529	GAC	2	6	3366	3371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591329
63	NC_010529	TC	3	6	3397	3402	0 %	50 %	0 %	50 %	188591329
64	NC_010529	ACG	2	6	3484	3489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591329
65	NC_010529	GTC	2	6	3522	3527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591329
66	NC_010529	GCA	2	6	3547	3552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591329
67	NC_010529	GCT	2	6	3602	3607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591329
68	NC_010529	GGA	2	6	3614	3619	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	188591329
69	NC_010529	AAG	2	6	3655	3660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188591329
70	NC_010529	CGC	2	6	3723	3728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188591329
71	NC_010529	CAA	2	6	3761	3766	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188591329
72	NC_010529	CGGA	2	8	3880	3887	25 %	0 %	50 %	25 %	188591329
73	NC_010529	CTC	2	6	3925	3930	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	188591329
74	NC_010529	GGAA	2	8	3941	3948	50 %	0 %	50 %	0 %	188591329
75	NC_010529	GAG	2	6	3963	3968	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	188591329
76	NC_010529	CCG	2	6	4090	4095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188591329
77	NC_010529	AGTC	2	8	4174	4181	25 %	25 %	25 %	25 %	188591329
78	NC_010529	ACA	2	6	4186	4191	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188591329
79	NC_010529	CGA	2	6	4274	4279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591329
80	NC_010529	CGG	2	6	4385	4390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188591329
81	NC_010529	AGC	2	6	4429	4434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591329
82	NC_010529	CG	3	6	4480	4485	0 %	0 %	50 %	50 %	188591329
83	NC_010529	CGTA	2	8	4493	4500	25 %	25 %	25 %	25 %	188591329
84	NC_010529	CAACT	2	10	4518	4527	40 %	20 %	0 %	40 %	188591329
85	NC_010529	TTG	2	6	4600	4605	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	188591329
86	NC_010529	GAAA	2	8	4703	4710	75 %	0 %	25 %	0 %	188591329
87	NC_010529	TTTC	2	8	4765	4772	0 %	75 %	0 %	25 %	188591329
88	NC_010529	GGC	2	6	5039	5044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188591329
89	NC_010529	ACTG	2	8	5063	5070	25 %	25 %	25 %	25 %	188591329
90	NC_010529	CGT	2	6	5856	5861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591330
91	NC_010529	AAG	2	6	5880	5885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188591330
92	NC_010529	TC	3	6	5903	5908	0 %	50 %	0 %	50 %	188591330
93	NC_010529	CGC	2	6	5948	5953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188591330
94	NC_010529	GTT	2	6	5988	5993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	188591330
95	NC_010529	GGC	2	6	5997	6002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188591330
96	NC_010529	AT	3	6	6183	6188	50 %	50 %	0 %	0 %	188591330
97	NC_010529	TC	3	6	6223	6228	0 %	50 %	0 %	50 %	188591330
98	NC_010529	ATT	2	6	6238	6243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188591330
99	NC_010529	GA	3	6	6250	6255	50 %	0 %	50 %	0 %	188591330
100	NC_010529	T	6	6	6300	6305	0 %	100 %	0 %	0 %	188591330
101	NC_010529	TCA	2	6	6391	6396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188591330
102	NC_010529	CAC	2	6	6438	6443	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188591330
103	NC_010529	TATC	2	8	6540	6547	25 %	50 %	0 %	25 %	188591330
104	NC_010529	GGA	2	6	6584	6589	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	188591330
105	NC_010529	ATCC	2	8	6617	6624	25 %	25 %	0 %	50 %	188591330
106	NC_010529	GAC	2	6	6672	6677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591330
107	NC_010529	TAA	2	6	6740	6745	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188591330
108	NC_010529	TTG	2	6	6811	6816	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	188591330
109	NC_010529	AC	3	6	6850	6855	50 %	0 %	0 %	50 %	188591330
110	NC_010529	TG	3	6	6865	6870	0 %	50 %	50 %	0 %	188591330
111	NC_010529	TCG	2	6	6877	6882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591330
112	NC_010529	GC	3	6	6947	6952	0 %	0 %	50 %	50 %	188591330
113	NC_010529	ACG	2	6	7059	7064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591330
114	NC_010529	ATC	3	9	7065	7073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188591330
115	NC_010529	ATTT	2	8	7122	7129	25 %	75 %	0 %	0 %	188591330
116	NC_010529	CT	3	6	7211	7216	0 %	50 %	0 %	50 %	188591330
117	NC_010529	CGA	2	6	7271	7276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591330
118	NC_010529	GAAG	2	8	7397	7404	50 %	0 %	50 %	0 %	188591330
119	NC_010529	TTC	2	6	7441	7446	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188591330
120	NC_010529	C	7	7	7585	7591	0 %	0 %	0 %	100 %	188591330
121	NC_010529	CGC	2	6	7622	7627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188591330
122	NC_010529	TTG	2	6	7633	7638	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	188591330
123	NC_010529	AGC	2	6	7746	7751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591330
124	NC_010529	ACG	2	6	7780	7785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591330
125	NC_010529	TTC	2	6	7821	7826	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188591330
126	NC_010529	CGG	2	6	7851	7856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188591330
127	NC_010529	GGAA	2	8	7892	7899	50 %	0 %	50 %	0 %	188591330
128	NC_010529	AGA	2	6	7952	7957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188591330
129	NC_010529	GAA	2	6	8054	8059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188591330
130	NC_010529	GTT	2	6	8079	8084	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	188591330
131	NC_010529	ATG	2	6	8122	8127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188591330
132	NC_010529	GGC	2	6	8130	8135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188591330
133	NC_010529	C	8	8	8290	8297	0 %	0 %	0 %	100 %	188591330
134	NC_010529	TTCA	2	8	8345	8352	25 %	50 %	0 %	25 %	188591330
135	NC_010529	AAT	2	6	8361	8366	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188591330
136	NC_010529	CGC	2	6	8396	8401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188591330
137	NC_010529	GGT	2	6	8576	8581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188591330
138	NC_010529	CAGAA	2	10	8648	8657	60 %	0 %	20 %	20 %	188591330
139	NC_010529	CATT	2	8	8674	8681	25 %	50 %	0 %	25 %	188591330
140	NC_010529	CT	3	6	8814	8819	0 %	50 %	0 %	50 %	188591330
141	NC_010529	ATG	2	6	8878	8883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188591330
142	NC_010529	GA	3	6	8938	8943	50 %	0 %	50 %	0 %	188591330
143	NC_010529	A	8	8	9014	9021	100 %	0 %	0 %	0 %	188591330
144	NC_010529	GCC	2	6	9025	9030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188591330
145	NC_010529	CGGC	2	8	9633	9640	0 %	0 %	50 %	50 %	188591331
146	NC_010529	GGC	2	6	9652	9657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188591331
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148	NC_010529	GA	3	6	9740	9745	50 %	0 %	50 %	0 %	188591331
149	NC_010529	CAGC	2	8	9747	9754	25 %	0 %	25 %	50 %	188591331
150	NC_010529	GAA	3	9	10011	10019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188591331
151	NC_010529	AAG	2	6	10033	10038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188591331
152	NC_010529	TCG	2	6	10112	10117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591331
153	NC_010529	T	6	6	10122	10127	0 %	100 %	0 %	0 %	188591331
154	NC_010529	GGCA	2	8	10143	10150	25 %	0 %	50 %	25 %	188591331
155	NC_010529	CAT	2	6	10206	10211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188591331
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157	NC_010529	GAG	2	6	10260	10265	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	188591331
158	NC_010529	GGC	2	6	10314	10319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188591331
159	NC_010529	GGGGT	2	10	10477	10486	0 %	20 %	80 %	0 %	188591331
160	NC_010529	CCG	2	6	12410	12415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188591332
161	NC_010529	TCG	2	6	12442	12447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591332
162	NC_010529	TGCT	2	8	12475	12482	0 %	50 %	25 %	25 %	188591332
163	NC_010529	GAC	2	6	12528	12533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591332
164	NC_010529	TCT	2	6	12622	12627	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188591332
165	NC_010529	GA	3	6	12784	12789	50 %	0 %	50 %	0 %	188591332
166	NC_010529	CGG	2	6	12836	12841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188591332
167	NC_010529	CGG	2	6	12874	12879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188591332
168	NC_010529	AGG	2	6	12901	12906	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	188591332
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170	NC_010529	AAC	2	6	12963	12968	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188591332
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174	NC_010529	GCC	2	6	13077	13082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188591332
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231	NC_010529	CGG	2	6	17311	17316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188591334
232	NC_010529	GCT	2	6	17320	17325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591334
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236	NC_010529	ATCG	2	8	17507	17514	25 %	25 %	25 %	25 %	188591334
237	NC_010529	TG	3	6	17522	17527	0 %	50 %	50 %	0 %	188591334
238	NC_010529	GCC	2	6	17547	17552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188591334
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244	NC_010529	CA	3	6	17918	17923	50 %	0 %	0 %	50 %	188591334
245	NC_010529	GGC	2	6	18330	18335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188591335
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248	NC_010529	GACT	2	8	18429	18436	25 %	25 %	25 %	25 %	188591335
249	NC_010529	TCA	2	6	18445	18450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188591335
250	NC_010529	GCA	2	6	18522	18527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591335
251	NC_010529	CGGGC	2	10	18910	18919	0 %	0 %	60 %	40 %	188591335
252	NC_010529	CG	5	10	18958	18967	0 %	0 %	50 %	50 %	188591335
253	NC_010529	CTC	2	6	18968	18973	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	188591335
254	NC_010529	TCG	2	6	18981	18986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591335
255	NC_010529	GTCGT	2	10	18996	19005	0 %	40 %	40 %	20 %	188591335
256	NC_010529	TCG	3	9	19011	19019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591335
257	NC_010529	GAC	2	6	19029	19034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591335
258	NC_010529	GCC	2	6	19110	19115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188591335
259	NC_010529	GGA	2	6	19153	19158	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	188591335
260	NC_010529	TCG	2	6	19308	19313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591335
261	NC_010529	TTG	2	6	19329	19334	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	188591335
262	NC_010529	G	6	6	19491	19496	0 %	0 %	100 %	0 %	188591335
263	NC_010529	GCGCTC	2	12	19538	19549	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	188591335
264	NC_010529	GC	3	6	19565	19570	0 %	0 %	50 %	50 %	188591335
265	NC_010529	GAG	2	6	19615	19620	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	188591335
266	NC_010529	CGT	2	6	19642	19647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591336
267	NC_010529	GTT	2	6	19677	19682	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	188591336
268	NC_010529	CG	3	6	19847	19852	0 %	0 %	50 %	50 %	188591336
269	NC_010529	GTC	2	6	19855	19860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591336
270	NC_010529	ATC	2	6	19946	19951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188591336
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272	NC_010529	GTTCTC	2	12	20110	20121	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	188591336
273	NC_010529	GGA	2	6	20136	20141	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	188591336
274	NC_010529	TCT	2	6	20168	20173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188591336
275	NC_010529	T	6	6	20190	20195	0 %	100 %	0 %	0 %	188591336
276	NC_010529	GGA	3	9	20196	20204	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	188591336
277	NC_010529	CGG	2	6	20337	20342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188591336
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282	NC_010529	TGA	2	6	20592	20597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188591336
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284	NC_010529	GC	3	6	20662	20667	0 %	0 %	50 %	50 %	188591336
285	NC_010529	CTTG	2	8	20760	20767	0 %	50 %	25 %	25 %	188591336
286	NC_010529	GCC	2	6	20798	20803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188591336
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294	NC_010529	GCC	2	6	21234	21239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188591336
295	NC_010529	TGC	2	6	21251	21256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591336
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297	NC_010529	GCG	2	6	21355	21360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188591336
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299	NC_010529	GCC	2	6	21521	21526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188591336
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301	NC_010529	CCGC	2	8	21586	21593	0 %	0 %	25 %	75 %	188591336
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384	NC_010529	GC	3	6	25955	25960	0 %	0 %	50 %	50 %	188591338
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387	NC_010529	GCCA	2	8	26060	26067	25 %	0 %	25 %	50 %	188591338
388	NC_010529	GGC	3	9	26072	26080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188591338
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