MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Cupriavidus taiwanensis LMG 19424 chromosome 1

Total Repeats: 86632

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010528	GGC	2	6	724	729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188590796
2	NC_010528	CGC	2	6	756	761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188590796
3	NC_010528	GAA	2	6	809	814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188590796
4	NC_010528	TGC	2	6	832	837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188590796
5	NC_010528	CGC	2	6	949	954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188590796
6	NC_010528	GCCGC	2	10	960	969	0 %	0 %	40 %	60 %	188590796
7	NC_010528	GCGG	2	8	1004	1011	0 %	0 %	75 %	25 %	188590796
8	NC_010528	ATC	2	6	1026	1031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188590796
9	NC_010528	GGC	2	6	1055	1060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188590796
10	NC_010528	GGC	2	6	1091	1096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188590796
11	NC_010528	CGGC	2	8	1209	1216	0 %	0 %	50 %	50 %	188590796
12	NC_010528	CCGG	2	8	1238	1245	0 %	0 %	50 %	50 %	188590796
13	NC_010528	CG	3	6	1246	1251	0 %	0 %	50 %	50 %	188590796
14	NC_010528	CAC	2	6	1283	1288	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188590796
15	NC_010528	GCA	2	6	1291	1296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188590796
16	NC_010528	CCG	2	6	1338	1343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188590796
17	NC_010528	CG	3	6	1364	1369	0 %	0 %	50 %	50 %	188590796
18	NC_010528	GCA	2	6	1372	1377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188590796
19	NC_010528	CCA	2	6	1429	1434	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188590796
20	NC_010528	CCAA	2	8	1509	1516	50 %	0 %	0 %	50 %	188590796
21	NC_010528	GC	4	8	1520	1527	0 %	0 %	50 %	50 %	188590796
22	NC_010528	CGC	3	9	1525	1533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188590796
23	NC_010528	CAA	2	6	1546	1551	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188590796
24	NC_010528	CGG	2	6	1585	1590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188590796
25	NC_010528	CG	5	10	1653	1662	0 %	0 %	50 %	50 %	188590796
26	NC_010528	CGA	2	6	1729	1734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188590796
27	NC_010528	CTA	2	6	1744	1749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188590796
28	NC_010528	CTCG	2	8	1753	1760	0 %	25 %	25 %	50 %	188590796
29	NC_010528	CTG	3	9	1763	1771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188590796
30	NC_010528	CGA	2	6	1774	1779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188590796
31	NC_010528	TTC	2	6	1787	1792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188590796
32	NC_010528	CGCA	2	8	1805	1812	25 %	0 %	25 %	50 %	188590796
33	NC_010528	TTC	2	6	1820	1825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188590796
34	NC_010528	ATC	2	6	1865	1870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188590796
35	NC_010528	TACC	2	8	1879	1886	25 %	25 %	0 %	50 %	188590796
36	NC_010528	CGA	2	6	1906	1911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188590796
37	NC_010528	GCC	2	6	1957	1962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188590796
38	NC_010528	TGA	2	6	1989	1994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188590796
39	NC_010528	GCC	3	9	2000	2008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188590796
40	NC_010528	GAA	2	6	2027	2032	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188590796
41	NC_010528	CTT	2	6	2038	2043	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188590796
42	NC_010528	CG	3	6	2148	2153	0 %	0 %	50 %	50 %	188590796
43	NC_010528	CTG	2	6	2168	2173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188590796
44	NC_010528	AGA	2	6	2211	2216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188590796
45	NC_010528	ACA	2	6	2232	2237	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188590796
46	NC_010528	AGA	2	6	2328	2333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188590796
47	NC_010528	CGG	2	6	2359	2364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188590796
48	NC_010528	ACCAC	2	10	2370	2379	40 %	0 %	0 %	60 %	188590796
49	NC_010528	TGC	2	6	2382	2387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188590796
50	NC_010528	CGA	2	6	2407	2412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188590796
51	NC_010528	GCA	2	6	2415	2420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188590796
52	NC_010528	CTG	2	6	2931	2936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188590797
53	NC_010528	GCC	2	6	2971	2976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188590797
54	NC_010528	CTG	2	6	3000	3005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188590797
55	NC_010528	TCCT	2	8	3030	3037	0 %	50 %	0 %	50 %	188590797
56	NC_010528	CGAC	2	8	3040	3047	25 %	0 %	25 %	50 %	188590797
57	NC_010528	CAC	2	6	3062	3067	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188590797
58	NC_010528	GCG	2	6	3079	3084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188590797
59	NC_010528	CCA	2	6	3103	3108	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188590797
60	NC_010528	CG	3	6	3116	3121	0 %	0 %	50 %	50 %	188590797
61	NC_010528	GCT	2	6	3125	3130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188590797
62	NC_010528	GC	3	6	3140	3145	0 %	0 %	50 %	50 %	188590797
63	NC_010528	GCC	2	6	3234	3239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188590797
64	NC_010528	GAA	2	6	3240	3245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188590797
65	NC_010528	AGA	2	6	3298	3303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188590797
66	NC_010528	CTG	2	6	3315	3320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188590797
67	NC_010528	GCA	2	6	3344	3349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188590797
68	NC_010528	CTA	2	6	3359	3364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188590797
69	NC_010528	TGC	2	6	3376	3381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188590797
70	NC_010528	TGG	3	9	3382	3390	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188590797
71	NC_010528	AAG	2	6	3396	3401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188590797
72	NC_010528	GCG	2	6	3442	3447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188590797
73	NC_010528	TCA	2	6	3493	3498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188590797
74	NC_010528	CTG	2	6	3531	3536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188590797
75	NC_010528	ACG	2	6	3544	3549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188590797
76	NC_010528	GCC	2	6	3570	3575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188590797
77	NC_010528	TGCAGC	2	12	3697	3708	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	188590797
78	NC_010528	ACC	2	6	3735	3740	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188590797
79	NC_010528	CCA	2	6	3796	3801	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188590797
80	NC_010528	ACCT	2	8	3879	3886	25 %	25 %	0 %	50 %	188590797
81	NC_010528	GCAGGT	2	12	3917	3928	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	188590797
82	NC_010528	GC	3	6	3952	3957	0 %	0 %	50 %	50 %	188590797
83	NC_010528	GAC	3	9	3972	3980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188590797
84	NC_010528	CGT	2	6	3992	3997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188590797
85	NC_010528	TGA	2	6	4014	4019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188590797
86	NC_010528	CAG	2	6	4279	4284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188590798
87	NC_010528	CCT	2	6	4313	4318	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	188590798
88	NC_010528	CAC	2	6	4402	4407	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188590798
89	NC_010528	CGA	2	6	4437	4442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188590798
90	NC_010528	TCG	2	6	4505	4510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188590798
91	NC_010528	CGA	2	6	4545	4550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188590798
92	NC_010528	AGCGC	2	10	4565	4574	20 %	0 %	40 %	40 %	188590798
93	NC_010528	CGG	2	6	4605	4610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188590798
94	NC_010528	CGG	2	6	4641	4646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188590798
95	NC_010528	CGTG	2	8	4667	4674	0 %	25 %	50 %	25 %	188590798
96	NC_010528	CAT	2	6	4764	4769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188590798
97	NC_010528	CGA	2	6	4869	4874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188590798
98	NC_010528	AAC	2	6	4945	4950	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188590798
99	NC_010528	GACC	2	8	4968	4975	25 %	0 %	25 %	50 %	188590798
100	NC_010528	GAA	2	6	4990	4995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188590798
101	NC_010528	CGG	2	6	5010	5015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188590798
102	NC_010528	ACC	2	6	5053	5058	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188590798
103	NC_010528	TCT	2	6	5072	5077	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188590798
104	NC_010528	ACG	2	6	5129	5134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188590798
105	NC_010528	CAA	2	6	5163	5168	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188590798
106	NC_010528	GGC	2	6	5185	5190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188590798
107	NC_010528	GC	3	6	5208	5213	0 %	0 %	50 %	50 %	188590798
108	NC_010528	CG	3	6	5222	5227	0 %	0 %	50 %	50 %	188590798
109	NC_010528	TCA	2	6	5228	5233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188590798
110	NC_010528	GAA	2	6	5245	5250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188590798
111	NC_010528	AAG	2	6	5263	5268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188590798
112	NC_010528	GCG	2	6	5285	5290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188590798
113	NC_010528	GGCCT	2	10	5305	5314	0 %	20 %	40 %	40 %	188590798
114	NC_010528	GAA	2	6	5401	5406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188590798
115	NC_010528	CTG	2	6	5434	5439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188590798
116	NC_010528	CGCC	2	8	5444	5451	0 %	0 %	25 %	75 %	188590798
117	NC_010528	TCG	2	6	5477	5482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188590798
118	NC_010528	CGC	2	6	5484	5489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188590798
119	NC_010528	GCC	2	6	5503	5508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188590798
120	NC_010528	CGC	2	6	5530	5535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188590798
121	NC_010528	GGC	2	6	5638	5643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188590798
122	NC_010528	GC	3	6	5715	5720	0 %	0 %	50 %	50 %	188590798
123	NC_010528	CCAG	2	8	5741	5748	25 %	0 %	25 %	50 %	188590798
124	NC_010528	GAC	2	6	5794	5799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188590798
125	NC_010528	ACC	2	6	5822	5827	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188590798
126	NC_010528	CAT	4	12	5829	5840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188590798
127	NC_010528	GCT	3	9	5877	5885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188590798
128	NC_010528	TTC	2	6	5890	5895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188590798
129	NC_010528	CAT	2	6	5913	5918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188590798
130	NC_010528	GCC	2	6	5946	5951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188590798
131	NC_010528	GAAG	2	8	5973	5980	50 %	0 %	50 %	0 %	188590798
132	NC_010528	GAT	2	6	5995	6000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188590798
133	NC_010528	CTG	2	6	6019	6024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188590798
134	NC_010528	CTGGAT	2	12	6193	6204	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	188590798
135	NC_010528	GCG	4	12	6208	6219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188590798
136	NC_010528	ATGC	2	8	6259	6266	25 %	25 %	25 %	25 %	188590798
137	NC_010528	ATG	3	9	6293	6301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188590798
138	NC_010528	TGA	2	6	6327	6332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188590798
139	NC_010528	TGA	2	6	6353	6358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188590798
140	NC_010528	GCG	2	6	6363	6368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188590798
141	NC_010528	TCA	2	6	6369	6374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188590798
142	NC_010528	TGC	2	6	6444	6449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188590798
143	NC_010528	GCT	2	6	6555	6560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188590798
144	NC_010528	GCCGAA	2	12	6562	6573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188590798
145	NC_010528	GT	3	6	6578	6583	0 %	50 %	50 %	0 %	188590798
146	NC_010528	AGC	2	6	6623	6628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188590798
147	NC_010528	GAC	2	6	6636	6641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188590798
148	NC_010528	CGG	2	6	6695	6700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188590798
149	NC_010528	ACC	2	6	6712	6717	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188590798
150	NC_010528	TGA	2	6	6726	6731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188590798
151	NC_010528	TGG	2	6	6770	6775	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188590798
152	NC_010528	CAGAA	2	10	7052	7061	60 %	0 %	20 %	20 %	188590799
153	NC_010528	GCT	2	6	7083	7088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188590799
154	NC_010528	AAGC	2	8	7090	7097	50 %	0 %	25 %	25 %	188590799
155	NC_010528	CGG	2	6	7184	7189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188590799
156	NC_010528	GAAG	2	8	7239	7246	50 %	0 %	50 %	0 %	188590799
157	NC_010528	GCT	2	6	7294	7299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188590799
158	NC_010528	AAC	2	6	7318	7323	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188590799
159	NC_010528	GCCCTT	2	12	7329	7340	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	188590799
160	NC_010528	CAT	2	6	7359	7364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188590799
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162	NC_010528	AAG	2	6	7551	7556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188590800
163	NC_010528	CAT	2	6	7593	7598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188590800
164	NC_010528	CG	3	6	7708	7713	0 %	0 %	50 %	50 %	188590800
165	NC_010528	CGATC	2	10	7730	7739	20 %	20 %	20 %	40 %	188590800
166	NC_010528	GCG	2	6	7757	7762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188590800
167	NC_010528	CGA	2	6	7775	7780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188590800
168	NC_010528	ATC	2	6	7785	7790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188590800
169	NC_010528	TCA	2	6	7873	7878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188590800
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171	NC_010528	GCCC	2	8	7923	7930	0 %	0 %	25 %	75 %	188590800
172	NC_010528	GGT	2	6	7949	7954	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188590800
173	NC_010528	TTC	2	6	7956	7961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188590800
174	NC_010528	TGCGC	2	10	7964	7973	0 %	20 %	40 %	40 %	188590800
175	NC_010528	GGT	2	6	7994	7999	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188590800
176	NC_010528	CAA	2	6	8003	8008	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188590800
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182	NC_010528	ATC	2	6	8460	8465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188590800
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184	NC_010528	ATC	2	6	8511	8516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188590800
185	NC_010528	TGA	2	6	8540	8545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188590800
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218	NC_010528	GTA	2	6	9552	9557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188590802
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240	NC_010528	GCGCC	2	10	10092	10101	0 %	0 %	40 %	60 %	188590803
241	NC_010528	CG	3	6	10199	10204	0 %	0 %	50 %	50 %	188590803
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243	NC_010528	CCAT	2	8	10400	10407	25 %	25 %	0 %	50 %	188590803
244	NC_010528	GCA	2	6	10595	10600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188590803
245	NC_010528	GC	3	6	10638	10643	0 %	0 %	50 %	50 %	188590803
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249	NC_010528	GC	3	6	10878	10883	0 %	0 %	50 %	50 %	188590803
250	NC_010528	TGC	2	6	10906	10911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188590803
251	NC_010528	CGG	2	6	10946	10951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188590803
252	NC_010528	CCT	2	6	10967	10972	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	188590803
253	NC_010528	AGA	2	6	11009	11014	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188590803
254	NC_010528	CG	3	6	11033	11038	0 %	0 %	50 %	50 %	188590803
255	NC_010528	TGGAAG	2	12	11062	11073	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	188590803
256	NC_010528	CG	3	6	11090	11095	0 %	0 %	50 %	50 %	188590803
257	NC_010528	GCG	2	6	11103	11108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188590803
258	NC_010528	CAG	2	6	11133	11138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188590804
259	NC_010528	CAG	2	6	11147	11152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188590804
260	NC_010528	GGA	2	6	11153	11158	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	188590804
261	NC_010528	GTC	2	6	11177	11182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188590804
262	NC_010528	CAG	2	6	11183	11188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188590804
263	NC_010528	GCG	2	6	11211	11216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188590804
264	NC_010528	GCG	2	6	11254	11259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188590804
265	NC_010528	CCA	2	6	11261	11266	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188590804
266	NC_010528	CCA	2	6	11314	11319	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188590804
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270	NC_010528	CG	4	8	11415	11422	0 %	0 %	50 %	50 %	188590804
271	NC_010528	GCC	2	6	11461	11466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188590804
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284	NC_010528	CCGG	2	8	11752	11759	0 %	0 %	50 %	50 %	188590804
285	NC_010528	CGC	2	6	11771	11776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188590804
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289	NC_010528	CTG	2	6	11927	11932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188590804
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299	NC_010528	GGCCA	2	10	12450	12459	20 %	0 %	40 %	40 %	188590804
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500	NC_010528	GTGA	2	8	20109	20116	25 %	25 %	50 %	0 %	188590815

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