MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Candidatus Korarchaeum cryptofilum OPF8 chromosome

Total Repeats: 30380

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_010482	GAG	2	6	211479	211484	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170289838
4002	NC_010482	A	6	6	211541	211546	100 %	0 %	0 %	0 %	170289838
4003	NC_010482	T	6	6	211573	211578	0 %	100 %	0 %	0 %	170289838
4004	NC_010482	GCTC	2	8	211626	211633	0 %	25 %	25 %	50 %	170289838
4005	NC_010482	GGA	2	6	211635	211640	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170289838
4006	NC_010482	G	6	6	211739	211744	0 %	0 %	100 %	0 %	170289838
4007	NC_010482	CGA	2	6	211775	211780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170289838
4008	NC_010482	AT	3	6	211840	211845	50 %	50 %	0 %	0 %	170289838
4009	NC_010482	GAG	2	6	211926	211931	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170289838
4010	NC_010482	GGA	2	6	211953	211958	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170289838
4011	NC_010482	CTGAG	2	10	212000	212009	20 %	20 %	40 %	20 %	170289838
4012	NC_010482	GAT	2	6	212070	212075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170289838
4013	NC_010482	AG	3	6	212076	212081	50 %	0 %	50 %	0 %	170289838
4014	NC_010482	CGC	2	6	212159	212164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170289838
4015	NC_010482	GA	4	8	212274	212281	50 %	0 %	50 %	0 %	170289839
4016	NC_010482	TCCT	2	8	212312	212319	0 %	50 %	0 %	50 %	170289839
4017	NC_010482	GCC	2	6	212384	212389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170289839
4018	NC_010482	AGC	2	6	212399	212404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170289839
4019	NC_010482	CTA	2	6	212449	212454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170289839
4020	NC_010482	ACCTC	2	10	212662	212671	20 %	20 %	0 %	60 %	170289839
4021	NC_010482	CTC	2	6	212684	212689	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170289839
4022	NC_010482	CAG	2	6	212746	212751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170289839
4023	NC_010482	CTCA	2	8	212771	212778	25 %	25 %	0 %	50 %	170289839
4024	NC_010482	GAA	2	6	212852	212857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170289839
4025	NC_010482	CT	3	6	212872	212877	0 %	50 %	0 %	50 %	170289839
4026	NC_010482	CCT	2	6	212883	212888	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170289839
4027	NC_010482	TCC	2	6	212889	212894	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170289839
4028	NC_010482	CCA	2	6	212948	212953	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170289839
4029	NC_010482	CATT	2	8	212988	212995	25 %	50 %	0 %	25 %	170289839
4030	NC_010482	AGC	2	6	213008	213013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170289839
4031	NC_010482	TAT	2	6	213038	213043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170289839
4032	NC_010482	GGT	2	6	213050	213055	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170289839
4033	NC_010482	GAT	2	6	213185	213190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170289840
4034	NC_010482	GA	3	6	213369	213374	50 %	0 %	50 %	0 %	170289840
4035	NC_010482	GCT	2	6	213375	213380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170289840
4036	NC_010482	CTC	2	6	213422	213427	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170289840
4037	NC_010482	ACTTGA	2	12	213451	213462	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	170289840
4038	NC_010482	TTC	2	6	213480	213485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170289840
4039	NC_010482	AT	3	6	213490	213495	50 %	50 %	0 %	0 %	170289840
4040	NC_010482	CGAG	2	8	213508	213515	25 %	0 %	50 %	25 %	170289840
4041	NC_010482	GGA	2	6	213604	213609	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170289840
4042	NC_010482	GAG	2	6	213665	213670	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170289840
4043	NC_010482	GCT	2	6	213714	213719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170289840
4044	NC_010482	AT	3	6	213780	213785	50 %	50 %	0 %	0 %	170289840
4045	NC_010482	GGA	2	6	213814	213819	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170289840
4046	NC_010482	GGAGT	2	10	213854	213863	20 %	20 %	60 %	0 %	170289840
4047	NC_010482	GGA	2	6	213883	213888	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170289840
4048	NC_010482	GAG	2	6	213924	213929	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170289840
4049	NC_010482	CTC	2	6	213942	213947	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170289840
4050	NC_010482	AGGA	2	8	213960	213967	50 %	0 %	50 %	0 %	170289840
4051	NC_010482	ATGGG	2	10	214085	214094	20 %	20 %	60 %	0 %	170289840
4052	NC_010482	AG	3	6	214143	214148	50 %	0 %	50 %	0 %	170289840
4053	NC_010482	GAT	2	6	214227	214232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170289840
4054	NC_010482	AGGGA	2	10	214248	214257	40 %	0 %	60 %	0 %	170289840
4055	NC_010482	GAG	2	6	214517	214522	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170289840
4056	NC_010482	AGG	2	6	214566	214571	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170289840
4057	NC_010482	AT	3	6	214599	214604	50 %	50 %	0 %	0 %	170289840
4058	NC_010482	GAG	2	6	214608	214613	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170289840
4059	NC_010482	GA	3	6	214695	214700	50 %	0 %	50 %	0 %	170289840
4060	NC_010482	GGA	2	6	214790	214795	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170289840
4061	NC_010482	AG	3	6	214862	214867	50 %	0 %	50 %	0 %	170289840
4062	NC_010482	ATA	2	6	214902	214907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170289840
4063	NC_010482	GAG	2	6	214986	214991	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170289840
4064	NC_010482	GA	3	6	215073	215078	50 %	0 %	50 %	0 %	170289840
4065	NC_010482	TTCCC	2	10	215145	215154	0 %	40 %	0 %	60 %	170289841
4066	NC_010482	TTA	2	6	215159	215164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170289841
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4068	NC_010482	TAG	2	6	215222	215227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170289841
4069	NC_010482	TGA	2	6	215259	215264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170289841
4070	NC_010482	TCCC	2	8	215299	215306	0 %	25 %	0 %	75 %	170289841
4071	NC_010482	GAG	2	6	215316	215321	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170289841
4072	NC_010482	GAG	2	6	215358	215363	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170289841
4073	NC_010482	TCC	2	6	215401	215406	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170289841
4074	NC_010482	CTC	2	6	215411	215416	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170289841
4075	NC_010482	TTA	2	6	215480	215485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170289841
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4082	NC_010482	CTTCA	2	10	215718	215727	20 %	40 %	0 %	40 %	170289841
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4085	NC_010482	TCC	2	6	215839	215844	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170289842
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4087	NC_010482	CAT	2	6	215987	215992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170289842
4088	NC_010482	ATC	2	6	215997	216002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170289842
4089	NC_010482	CTC	2	6	216050	216055	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170289842
4090	NC_010482	CTC	2	6	216193	216198	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170289843
4091	NC_010482	GGGA	2	8	216211	216218	25 %	0 %	75 %	0 %	170289843
4092	NC_010482	TAGC	2	8	216227	216234	25 %	25 %	25 %	25 %	170289843
4093	NC_010482	AGA	2	6	216298	216303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170289843
4094	NC_010482	GA	3	6	216302	216307	50 %	0 %	50 %	0 %	170289843
4095	NC_010482	CGC	2	6	216336	216341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170289843
4096	NC_010482	CCT	3	9	216395	216403	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170289843
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4098	NC_010482	GGGA	2	8	216696	216703	25 %	0 %	75 %	0 %	170289843
4099	NC_010482	GAGC	2	8	216741	216748	25 %	0 %	50 %	25 %	170289843
4100	NC_010482	TCA	2	6	216839	216844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170289843
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4102	NC_010482	CTC	2	6	216910	216915	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170289843
4103	NC_010482	GGA	2	6	217233	217238	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170289844
4104	NC_010482	AG	3	6	217286	217291	50 %	0 %	50 %	0 %	170289844
4105	NC_010482	AGA	2	6	217353	217358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170289844
4106	NC_010482	ATG	2	6	217362	217367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170289844
4107	NC_010482	C	6	6	217473	217478	0 %	0 %	0 %	100 %	170289844
4108	NC_010482	TGG	2	6	217556	217561	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170289844
4109	NC_010482	AGT	2	6	217593	217598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170289844
4110	NC_010482	GTAGA	2	10	217605	217614	40 %	20 %	40 %	0 %	170289844
4111	NC_010482	AGG	2	6	217671	217676	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170289844
4112	NC_010482	AAT	2	6	217681	217686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170289844
4113	NC_010482	GGT	2	6	218190	218195	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170289845
4114	NC_010482	AGC	2	6	218200	218205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170289845
4115	NC_010482	GA	3	6	218240	218245	50 %	0 %	50 %	0 %	170289845
4116	NC_010482	GCTT	2	8	218261	218268	0 %	50 %	25 %	25 %	170289845
4117	NC_010482	ACT	2	6	218305	218310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170289845
4118	NC_010482	TTA	2	6	218354	218359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170289845
4119	NC_010482	TAT	2	6	218423	218428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170289845
4120	NC_010482	GAG	2	6	218519	218524	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170289845
4121	NC_010482	AGG	2	6	218563	218568	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170289845
4122	NC_010482	AGG	2	6	218578	218583	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170289845
4123	NC_010482	GAG	2	6	218721	218726	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170289846
4124	NC_010482	ATC	2	6	218753	218758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170289846
4125	NC_010482	GGAA	2	8	218812	218819	50 %	0 %	50 %	0 %	170289846
4126	NC_010482	GAG	2	6	218844	218849	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170289846
4127	NC_010482	GAT	2	6	218866	218871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170289846
4128	NC_010482	ATAG	2	8	218971	218978	50 %	25 %	25 %	0 %	170289847
4129	NC_010482	AG	3	6	218996	219001	50 %	0 %	50 %	0 %	170289847
4130	NC_010482	CT	3	6	219003	219008	0 %	50 %	0 %	50 %	170289847
4131	NC_010482	ATT	2	6	219037	219042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170289847
4132	NC_010482	TCCT	2	8	219058	219065	0 %	50 %	0 %	50 %	170289847
4133	NC_010482	CAT	2	6	219080	219085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170289847
4134	NC_010482	TCT	2	6	219101	219106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170289847
4135	NC_010482	TGA	3	9	219140	219148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170289847
4136	NC_010482	GCT	2	6	219171	219176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170289847
4137	NC_010482	CTC	2	6	219180	219185	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170289847
4138	NC_010482	ATC	2	6	219214	219219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170289847
4139	NC_010482	GCTA	2	8	219255	219262	25 %	25 %	25 %	25 %	170289847
4140	NC_010482	AT	3	6	219272	219277	50 %	50 %	0 %	0 %	170289847
4141	NC_010482	TCC	2	6	219290	219295	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170289847
4142	NC_010482	CTC	2	6	219331	219336	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170289847
4143	NC_010482	CT	3	6	219340	219345	0 %	50 %	0 %	50 %	170289847
4144	NC_010482	CTGCT	2	10	219513	219522	0 %	40 %	20 %	40 %	170289847
4145	NC_010482	AGGA	2	8	219571	219578	50 %	0 %	50 %	0 %	170289847
4146	NC_010482	CAT	2	6	219587	219592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170289847
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4148	NC_010482	TTA	2	6	219664	219669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170289847
4149	NC_010482	CAG	2	6	219747	219752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170289847
4150	NC_010482	CGT	2	6	219807	219812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170289847
4151	NC_010482	GGGAT	2	10	220015	220024	20 %	20 %	60 %	0 %	170289848
4152	NC_010482	CGG	2	6	220046	220051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170289848
4153	NC_010482	CAG	2	6	220076	220081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170289848
4154	NC_010482	ATA	2	6	220110	220115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170289848
4155	NC_010482	GAG	2	6	220145	220150	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170289848
4156	NC_010482	GATAG	2	10	220167	220176	40 %	20 %	40 %	0 %	170289848
4157	NC_010482	GGATGA	2	12	220244	220255	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	170289848
4158	NC_010482	GAG	2	6	220274	220279	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170289848
4159	NC_010482	TAC	2	6	220299	220304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170289848
4160	NC_010482	GTC	2	6	220347	220352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170289848
4161	NC_010482	TCC	2	6	220354	220359	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170289848
4162	NC_010482	AATG	2	8	220376	220383	50 %	25 %	25 %	0 %	170289848
4163	NC_010482	CTC	2	6	220392	220397	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170289848
4164	NC_010482	AT	3	6	220403	220408	50 %	50 %	0 %	0 %	170289848
4165	NC_010482	TGC	2	6	220421	220426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170289848
4166	NC_010482	TCCA	2	8	220457	220464	25 %	25 %	0 %	50 %	170289848
4167	NC_010482	G	6	6	220472	220477	0 %	0 %	100 %	0 %	170289848
4168	NC_010482	AAGG	2	8	220578	220585	50 %	0 %	50 %	0 %	170289848
4169	NC_010482	GAT	2	6	220604	220609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170289848
4170	NC_010482	GAT	2	6	220631	220636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170289848
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4172	NC_010482	TGAA	2	8	220693	220700	50 %	25 %	25 %	0 %	170289848
4173	NC_010482	GTT	2	6	220770	220775	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170289848
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4176	NC_010482	GAT	2	6	220956	220961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170289848
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4180	NC_010482	GAAT	2	8	221231	221238	50 %	25 %	25 %	0 %	170289848
4181	NC_010482	ATA	2	6	221292	221297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170289848
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4184	NC_010482	GAG	2	6	221634	221639	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170289849
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4190	NC_010482	AG	4	8	221937	221944	50 %	0 %	50 %	0 %	170289849
4191	NC_010482	GAG	2	6	222016	222021	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170289849
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4200	NC_010482	GA	3	6	222337	222342	50 %	0 %	50 %	0 %	170289849
4201	NC_010482	GGA	2	6	222378	222383	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170289849
4202	NC_010482	GGA	2	6	222414	222419	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170289849
4203	NC_010482	GAG	2	6	222438	222443	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170289849
4204	NC_010482	GAG	2	6	222463	222468	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170289849
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4215	NC_010482	ATC	2	6	222935	222940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170289850
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4219	NC_010482	CCCTT	2	10	223044	223053	0 %	40 %	0 %	60 %	170289850
4220	NC_010482	TCCC	2	8	223073	223080	0 %	25 %	0 %	75 %	170289850
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4223	NC_010482	AG	3	6	223147	223152	50 %	0 %	50 %	0 %	170289850
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4228	NC_010482	GTTA	2	8	223408	223415	25 %	50 %	25 %	0 %	170289850
4229	NC_010482	CTT	2	6	223572	223577	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170289851
4230	NC_010482	TCT	2	6	223664	223669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170289851
4231	NC_010482	CTT	2	6	223671	223676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170289851
4232	NC_010482	TC	4	8	223791	223798	0 %	50 %	0 %	50 %	170289851
4233	NC_010482	CCG	2	6	223996	224001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170289851
4234	NC_010482	CGA	2	6	224009	224014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170289851
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4236	NC_010482	TCA	2	6	224221	224226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170289851
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4238	NC_010482	CATC	2	8	224354	224361	25 %	25 %	0 %	50 %	170289852
4239	NC_010482	TCCT	2	8	224392	224399	0 %	50 %	0 %	50 %	170289852
4240	NC_010482	CCCT	2	8	224458	224465	0 %	25 %	0 %	75 %	170289852
4241	NC_010482	TCA	2	6	224485	224490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170289852
4242	NC_010482	AAGC	2	8	224514	224521	50 %	0 %	25 %	25 %	170289852
4243	NC_010482	TTA	2	6	224531	224536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170289852
4244	NC_010482	CT	3	6	224583	224588	0 %	50 %	0 %	50 %	170289852
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4246	NC_010482	CCCT	2	8	224664	224671	0 %	25 %	0 %	75 %	170289852
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4362	NC_010482	AGTAA	2	10	230020	230029	60 %	20 %	20 %	0 %	170289857
4363	NC_010482	GAA	2	6	230059	230064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170289857
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4365	NC_010482	GTC	2	6	230170	230175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170289857
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4368	NC_010482	TA	3	6	230292	230297	50 %	50 %	0 %	0 %	170289858
4369	NC_010482	CTT	2	6	230330	230335	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170289858
4370	NC_010482	CT	3	6	230391	230396	0 %	50 %	0 %	50 %	170289858
4371	NC_010482	TTC	2	6	230403	230408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170289858
4372	NC_010482	TTC	2	6	230523	230528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170289858
4373	NC_010482	TCC	2	6	230587	230592	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170289858
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4377	NC_010482	CTC	2	6	230774	230779	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170289858
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4380	NC_010482	TTCGC	2	10	230874	230883	0 %	40 %	20 %	40 %	170289858
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4401	NC_010482	TAT	2	6	231710	231715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170289858
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4462	NC_010482	TCCC	2	8	235876	235883	0 %	25 %	0 %	75 %	170289862
4463	NC_010482	GA	3	6	235892	235897	50 %	0 %	50 %	0 %	170289862
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4472	NC_010482	TA	3	6	236227	236232	50 %	50 %	0 %	0 %	170289862
4473	NC_010482	GAG	2	6	236355	236360	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170289862
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4478	NC_010482	CT	4	8	236554	236561	0 %	50 %	0 %	50 %	170289862
4479	NC_010482	TCC	2	6	236625	236630	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170289862
4480	NC_010482	C	6	6	236664	236669	0 %	0 %	0 %	100 %	170289862
4481	NC_010482	CTC	2	6	236687	236692	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170289862
4482	NC_010482	TCC	2	6	236756	236761	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170289862
4483	NC_010482	GAG	2	6	236771	236776	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170289862
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4485	NC_010482	CTA	2	6	236868	236873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170289862
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4488	NC_010482	CCCT	2	8	237083	237090	0 %	25 %	0 %	75 %	170289862
4489	NC_010482	TC	3	6	237328	237333	0 %	50 %	0 %	50 %	170289863
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