MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C chromosome

Total Repeats: 43795

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010424	AAT	2	6	117	122	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169830220
2	NC_010424	GCA	2	6	132	137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169830220
3	NC_010424	ACT	2	6	182	187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169830220
4	NC_010424	CAA	2	6	219	224	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169830220
5	NC_010424	CTT	2	6	289	294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169830220
6	NC_010424	A	7	7	369	375	100 %	0 %	0 %	0 %	169830220
7	NC_010424	TC	3	6	411	416	0 %	50 %	0 %	50 %	169830220
8	NC_010424	TCGCGG	2	12	491	502	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	169830220
9	NC_010424	CATG	2	8	570	577	25 %	25 %	25 %	25 %	169830220
10	NC_010424	CAT	2	6	586	591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169830220
11	NC_010424	CGA	2	6	729	734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169830220
12	NC_010424	GAA	2	6	769	774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169830220
13	NC_010424	TTC	2	6	775	780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169830220
14	NC_010424	GCC	2	6	837	842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169830220
15	NC_010424	GGA	2	6	861	866	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169830220
16	NC_010424	GATT	2	8	893	900	25 %	50 %	25 %	0 %	169830220
17	NC_010424	GAA	2	6	964	969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169830220
18	NC_010424	TC	3	6	1091	1096	0 %	50 %	0 %	50 %	169830220
19	NC_010424	GCC	2	6	1131	1136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169830220
20	NC_010424	GTG	2	6	1177	1182	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169830220
21	NC_010424	AAG	2	6	1222	1227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169830220
22	NC_010424	TC	5	10	1290	1299	0 %	50 %	0 %	50 %	169830220
23	NC_010424	ACC	2	6	1336	1341	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169830220
24	NC_010424	AAT	2	6	1401	1406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169830220
25	NC_010424	ACC	2	6	1591	1596	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169830221
26	NC_010424	CCT	2	6	1605	1610	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169830221
27	NC_010424	GGCA	2	8	1611	1618	25 %	0 %	50 %	25 %	169830221
28	NC_010424	CAC	2	6	1620	1625	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169830221
29	NC_010424	GC	3	6	1632	1637	0 %	0 %	50 %	50 %	169830221
30	NC_010424	A	6	6	1646	1651	100 %	0 %	0 %	0 %	169830221
31	NC_010424	GCC	2	6	1660	1665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169830221
32	NC_010424	GCA	2	6	1730	1735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169830221
33	NC_010424	AAT	2	6	1758	1763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169830221
34	NC_010424	CCGG	2	8	1765	1772	0 %	0 %	50 %	50 %	169830221
35	NC_010424	CGGCA	2	10	1802	1811	20 %	0 %	40 %	40 %	169830221
36	NC_010424	CGC	2	6	1828	1833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169830221
37	NC_010424	ACC	2	6	1865	1870	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169830221
38	NC_010424	GC	4	8	1903	1910	0 %	0 %	50 %	50 %	169830221
39	NC_010424	GCC	2	6	1930	1935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169830221
40	NC_010424	GCCG	2	8	1947	1954	0 %	0 %	50 %	50 %	169830221
41	NC_010424	C	6	6	2000	2005	0 %	0 %	0 %	100 %	169830221
42	NC_010424	CGGC	2	8	2066	2073	0 %	0 %	50 %	50 %	169830221
43	NC_010424	CGA	2	6	2118	2123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169830221
44	NC_010424	TGC	2	6	2429	2434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169830221
45	NC_010424	GAA	2	6	2614	2619	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169830221
46	NC_010424	ATAC	2	8	2708	2715	50 %	25 %	0 %	25 %	169830221
47	NC_010424	AGG	2	6	2747	2752	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169830221
48	NC_010424	T	6	6	2757	2762	0 %	100 %	0 %	0 %	169830222
49	NC_010424	CGG	2	6	2822	2827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169830222
50	NC_010424	GGAA	2	8	2848	2855	50 %	0 %	50 %	0 %	169830222
51	NC_010424	CGTTC	2	10	2912	2921	0 %	40 %	20 %	40 %	169830222
52	NC_010424	GGAA	2	8	2982	2989	50 %	0 %	50 %	0 %	169830222
53	NC_010424	GC	3	6	3009	3014	0 %	0 %	50 %	50 %	169830222
54	NC_010424	CGG	2	6	3026	3031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169830222
55	NC_010424	GAC	2	6	3112	3117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169830222
56	NC_010424	TCA	2	6	3125	3130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169830222
57	NC_010424	GCC	2	6	3149	3154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169830222
58	NC_010424	CGG	2	6	3217	3222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169830222
59	NC_010424	GTG	2	6	3257	3262	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169830222
60	NC_010424	GTATG	2	10	3312	3321	20 %	40 %	40 %	0 %	169830222
61	NC_010424	TGC	2	6	3323	3328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169830222
62	NC_010424	GAA	2	6	3400	3405	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169830222
63	NC_010424	GCC	2	6	3487	3492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169830222
64	NC_010424	GAC	2	6	3544	3549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169830222
65	NC_010424	GGCC	2	8	3577	3584	0 %	0 %	50 %	50 %	169830222
66	NC_010424	CAG	2	6	3601	3606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169830222
67	NC_010424	CGA	2	6	3687	3692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169830222
68	NC_010424	TGT	2	6	3695	3700	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169830222
69	NC_010424	ACG	2	6	3749	3754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169830222
70	NC_010424	ACC	2	6	3769	3774	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169830222
71	NC_010424	T	6	6	3803	3808	0 %	100 %	0 %	0 %	169830222
72	NC_010424	AGG	2	6	3830	3835	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169830222
73	NC_010424	TGA	2	6	3872	3877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169830223
74	NC_010424	CAT	2	6	3891	3896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169830223
75	NC_010424	TGG	2	6	3923	3928	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169830223
76	NC_010424	TGG	2	6	3971	3976	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169830223
77	NC_010424	GAG	2	6	3988	3993	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169830223
78	NC_010424	CAC	2	6	4017	4022	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169830223
79	NC_010424	CAC	2	6	4309	4314	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169830224
80	NC_010424	GGT	2	6	4326	4331	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169830224
81	NC_010424	ACA	2	6	4334	4339	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169830224
82	NC_010424	CGA	2	6	4344	4349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169830224
83	NC_010424	GGT	2	6	4380	4385	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169830224
84	NC_010424	GCCG	2	8	4460	4467	0 %	0 %	50 %	50 %	169830224
85	NC_010424	CGG	2	6	4500	4505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169830224
86	NC_010424	CGG	2	6	4512	4517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169830224
87	NC_010424	CGG	2	6	4536	4541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169830224
88	NC_010424	CGGCGT	2	12	4548	4559	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	169830224
89	NC_010424	GTG	2	6	4564	4569	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169830224
90	NC_010424	CT	3	6	4576	4581	0 %	50 %	0 %	50 %	169830224
91	NC_010424	TGGAGG	2	12	4589	4600	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	169830224
92	NC_010424	TACCGC	2	12	4615	4626	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	169830224
93	NC_010424	GAA	2	6	4729	4734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169830224
94	NC_010424	ACG	2	6	4748	4753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169830224
95	NC_010424	CTTT	2	8	4777	4784	0 %	75 %	0 %	25 %	169830224
96	NC_010424	CGA	2	6	4815	4820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169830224
97	NC_010424	TTC	2	6	4901	4906	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169830224
98	NC_010424	CGG	2	6	5031	5036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169830224
99	NC_010424	GCG	2	6	5126	5131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169830224
100	NC_010424	TGG	2	6	5237	5242	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169830224
101	NC_010424	GTG	2	6	5248	5253	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169830224
102	NC_010424	GCC	2	6	5266	5271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169830224
103	NC_010424	GAA	2	6	5278	5283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169830224
104	NC_010424	CAGA	2	8	5298	5305	50 %	0 %	25 %	25 %	169830224
105	NC_010424	GCGG	2	8	5313	5320	0 %	0 %	75 %	25 %	169830224
106	NC_010424	CCCGGG	2	12	5330	5341	0 %	0 %	50 %	50 %	169830224
107	NC_010424	GGC	2	6	5343	5348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169830224
108	NC_010424	CGG	2	6	5350	5355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169830224
109	NC_010424	TGG	2	6	5459	5464	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169830224
110	NC_010424	CGGC	2	8	5474	5481	0 %	0 %	50 %	50 %	169830224
111	NC_010424	CCGGGA	2	12	5499	5510	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	169830224
112	NC_010424	CCG	2	6	5562	5567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169830224
113	NC_010424	ACC	2	6	5660	5665	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169830224
114	NC_010424	CCGACG	2	12	5681	5692	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	169830224
115	NC_010424	CA	3	6	5702	5707	50 %	0 %	0 %	50 %	169830224
116	NC_010424	ACC	2	6	5784	5789	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169830224
117	NC_010424	A	6	6	5817	5822	100 %	0 %	0 %	0 %	169830224
118	NC_010424	CAG	2	6	5845	5850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169830224
119	NC_010424	TTC	2	6	5860	5865	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169830224
120	NC_010424	GGC	2	6	5876	5881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169830224
121	NC_010424	ACC	2	6	5944	5949	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169830224
122	NC_010424	GGA	2	6	5988	5993	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169830224
123	NC_010424	GGC	2	6	6000	6005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169830224
124	NC_010424	AGC	2	6	6008	6013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169830224
125	NC_010424	TTCA	2	8	6058	6065	25 %	50 %	0 %	25 %	169830224
126	NC_010424	GCA	2	6	6066	6071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169830224
127	NC_010424	GGGA	2	8	6113	6120	25 %	0 %	75 %	0 %	169830225
128	NC_010424	TCC	2	6	6215	6220	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169830225
129	NC_010424	GAA	2	6	6223	6228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169830225
130	NC_010424	ACT	3	9	6234	6242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169830225
131	NC_010424	G	6	6	6273	6278	0 %	0 %	100 %	0 %	169830225
132	NC_010424	TGG	2	6	6366	6371	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169830225
133	NC_010424	GA	3	6	6489	6494	50 %	0 %	50 %	0 %	169830225
134	NC_010424	CAC	2	6	6520	6525	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169830225
135	NC_010424	CGG	2	6	6526	6531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169830225
136	NC_010424	CCG	2	6	6543	6548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169830225
137	NC_010424	CGG	2	6	6568	6573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169830225
138	NC_010424	GGT	2	6	6577	6582	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169830225
139	NC_010424	TCCTGG	2	12	7058	7069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169830226
140	NC_010424	GCTG	2	8	7097	7104	0 %	25 %	50 %	25 %	169830226
141	NC_010424	GGT	2	6	7128	7133	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169830226
142	NC_010424	GCTG	2	8	7188	7195	0 %	25 %	50 %	25 %	169830226
143	NC_010424	G	6	6	7201	7206	0 %	0 %	100 %	0 %	169830226
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149	NC_010424	CGTG	2	8	7559	7566	0 %	25 %	50 %	25 %	169830227
150	NC_010424	CGG	2	6	7587	7592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169830227
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153	NC_010424	ACG	2	6	7897	7902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169830227
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156	NC_010424	TCCCG	2	10	7927	7936	0 %	20 %	20 %	60 %	169830227
157	NC_010424	CCT	2	6	7946	7951	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169830227
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159	NC_010424	ACC	2	6	8047	8052	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169830227
160	NC_010424	G	6	6	8109	8114	0 %	0 %	100 %	0 %	169830227
161	NC_010424	ACCGG	2	10	8149	8158	20 %	0 %	40 %	40 %	169830227
162	NC_010424	GA	3	6	8196	8201	50 %	0 %	50 %	0 %	169830227
163	NC_010424	GC	3	6	8256	8261	0 %	0 %	50 %	50 %	169830227
164	NC_010424	TGG	2	6	8263	8268	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169830227
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167	NC_010424	GCG	2	6	8366	8371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169830227
168	NC_010424	CTG	2	6	8445	8450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169830227
169	NC_010424	TGG	2	6	8455	8460	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169830227
170	NC_010424	TCA	2	6	8527	8532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169830227
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177	NC_010424	CGA	2	6	8822	8827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169830227
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179	NC_010424	CCG	2	6	8891	8896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169830227
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251	NC_010424	CCCG	2	8	12481	12488	0 %	0 %	25 %	75 %	169830230
252	NC_010424	TCAGCC	2	12	12501	12512	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	169830230
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255	NC_010424	TAC	2	6	12554	12559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169830230
256	NC_010424	A	7	7	12577	12583	100 %	0 %	0 %	0 %	169830230
257	NC_010424	GCCG	2	8	12613	12620	0 %	0 %	50 %	50 %	169830230
258	NC_010424	TTC	2	6	12629	12634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169830230
259	NC_010424	CGC	2	6	12643	12648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169830230
260	NC_010424	CGCC	2	8	12688	12695	0 %	0 %	25 %	75 %	169830230
261	NC_010424	CGG	2	6	12711	12716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169830230
262	NC_010424	GGC	2	6	12766	12771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169830230
263	NC_010424	CGC	2	6	12774	12779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169830230
264	NC_010424	CGG	2	6	12786	12791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169830230
265	NC_010424	CGA	2	6	12817	12822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169830230
266	NC_010424	CTG	3	9	12833	12841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169830230
267	NC_010424	GGC	2	6	12866	12871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169830230
268	NC_010424	GCG	2	6	12999	13004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169830230
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271	NC_010424	GGA	2	6	13140	13145	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169830231
272	NC_010424	ATC	2	6	13180	13185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169830231
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275	NC_010424	GGGT	2	8	13259	13266	0 %	25 %	75 %	0 %	169830231
276	NC_010424	ATC	2	6	13306	13311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169830231
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279	NC_010424	TCG	2	6	13442	13447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169830231
280	NC_010424	GCG	2	6	13502	13507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169830231
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283	NC_010424	GGA	2	6	13608	13613	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169830231
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379	NC_010424	ATC	2	6	19794	19799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169830234
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387	NC_010424	AAT	2	6	20692	20697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169830235
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389	NC_010424	CAT	2	6	20766	20771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169830235
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391	NC_010424	TGCA	2	8	20797	20804	25 %	25 %	25 %	25 %	169830235
392	NC_010424	CA	4	8	20803	20810	50 %	0 %	0 %	50 %	169830235
393	NC_010424	GGA	2	6	20814	20819	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169830235
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400	NC_010424	GCGG	2	8	21015	21022	0 %	0 %	75 %	25 %	169830235
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