MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Clavibacter michiganensis subsp. sepedonicus plasmid pCSL1

Total Repeats: 1926

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_010408	CTC	2	6	71515	71520	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189016783
1502	NC_010408	GCC	2	6	71537	71542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189016783
1503	NC_010408	GGC	2	6	71544	71549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189016783
1504	NC_010408	GAC	2	6	71557	71562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189016783
1505	NC_010408	CTG	2	6	71727	71732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189016784
1506	NC_010408	CCG	3	9	71768	71776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189016784
1507	NC_010408	CCT	2	6	71798	71803	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189016784
1508	NC_010408	CGA	2	6	71924	71929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189016784
1509	NC_010408	GC	3	6	71932	71937	0 %	0 %	50 %	50 %	189016784
1510	NC_010408	TCG	2	6	71944	71949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189016784
1511	NC_010408	GAC	2	6	72009	72014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189016784
1512	NC_010408	CGGT	2	8	72254	72261	0 %	25 %	50 %	25 %	189016784
1513	NC_010408	GCGT	2	8	72263	72270	0 %	25 %	50 %	25 %	189016784
1514	NC_010408	ACG	2	6	72379	72384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189016784
1515	NC_010408	CGA	2	6	72407	72412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189016784
1516	NC_010408	GAC	2	6	72444	72449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189016784
1517	NC_010408	GGCAAG	2	12	72477	72488	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	189016784
1518	NC_010408	CTG	2	6	72498	72503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189016784
1519	NC_010408	CGC	2	6	72521	72526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189016784
1520	NC_010408	CTC	2	6	72570	72575	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189016784
1521	NC_010408	GCTCC	2	10	72578	72587	0 %	20 %	20 %	60 %	189016784
1522	NC_010408	ACT	2	6	72602	72607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189016784
1523	NC_010408	GCCG	2	8	72609	72616	0 %	0 %	50 %	50 %	189016784
1524	NC_010408	ACC	2	6	72622	72627	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189016784
1525	NC_010408	GAT	2	6	72656	72661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189016784
1526	NC_010408	CGA	2	6	72734	72739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189016784
1527	NC_010408	CAACTT	2	12	72926	72937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189016784
1528	NC_010408	GCC	2	6	72952	72957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189016784
1529	NC_010408	CGC	2	6	72968	72973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189016784
1530	NC_010408	GAT	2	6	72977	72982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189016784
1531	NC_010408	GACC	2	8	73103	73110	25 %	0 %	25 %	50 %	189016784
1532	NC_010408	ATC	2	6	73152	73157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189016784
1533	NC_010408	AGC	2	6	73159	73164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189016784
1534	NC_010408	ATC	2	6	73200	73205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189016784
1535	NC_010408	GAC	2	6	73248	73253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189016784
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1537	NC_010408	CAC	2	6	73295	73300	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189016784
1538	NC_010408	GGA	2	6	73330	73335	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189016784
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1540	NC_010408	CGAC	2	8	73387	73394	25 %	0 %	25 %	50 %	189016784
1541	NC_010408	GAG	2	6	73398	73403	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189016784
1542	NC_010408	CGA	2	6	73466	73471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189016784
1543	NC_010408	CCT	2	6	73472	73477	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189016784
1544	NC_010408	CGA	2	6	73481	73486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189016784
1545	NC_010408	GC	3	6	73507	73512	0 %	0 %	50 %	50 %	189016784
1546	NC_010408	TCG	2	6	73519	73524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189016784
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1549	NC_010408	CCG	2	6	73778	73783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189016785
1550	NC_010408	GC	3	6	73809	73814	0 %	0 %	50 %	50 %	189016785
1551	NC_010408	TCC	2	6	73836	73841	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189016785
1552	NC_010408	ATC	2	6	73867	73872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189016785
1553	NC_010408	CGA	2	6	73925	73930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189016785
1554	NC_010408	GTG	2	6	73946	73951	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189016785
1555	NC_010408	CGA	2	6	73966	73971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189016785
1556	NC_010408	GCC	2	6	74334	74339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189016786
1557	NC_010408	GGC	2	6	74358	74363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189016786
1558	NC_010408	GAC	2	6	74371	74376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189016786
1559	NC_010408	GC	3	6	74382	74387	0 %	0 %	50 %	50 %	189016786
1560	NC_010408	CCT	2	6	74410	74415	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189016786
1561	NC_010408	CGT	2	6	74438	74443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189016786
1562	NC_010408	TGG	2	6	74488	74493	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189016786
1563	NC_010408	CTGGCT	2	12	74509	74520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189016786
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1565	NC_010408	CG	3	6	74557	74562	0 %	0 %	50 %	50 %	189016786
1566	NC_010408	TCC	2	6	74609	74614	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189016786
1567	NC_010408	GTC	2	6	74752	74757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189016786
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1569	NC_010408	CCTA	2	8	74892	74899	25 %	25 %	0 %	50 %	189016786
1570	NC_010408	CTT	3	9	74909	74917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189016786
1571	NC_010408	GC	3	6	74949	74954	0 %	0 %	50 %	50 %	189016786
1572	NC_010408	GC	3	6	74959	74964	0 %	0 %	50 %	50 %	189016786
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1580	NC_010408	CCG	3	9	75188	75196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189016786
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1585	NC_010408	GCAG	2	8	75399	75406	25 %	0 %	50 %	25 %	189016786
1586	NC_010408	GCCGCG	2	12	75418	75429	0 %	0 %	50 %	50 %	189016786
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1604	NC_010408	GAT	2	6	76975	76980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189016788
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1607	NC_010408	CTC	2	6	77065	77070	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189016788
1608	NC_010408	GCTC	2	8	77079	77086	0 %	25 %	25 %	50 %	189016788
1609	NC_010408	GTG	2	6	77096	77101	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189016788
1610	NC_010408	CTG	2	6	77134	77139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189016788
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1619	NC_010408	AGGT	2	8	77772	77779	25 %	25 %	50 %	0 %	189016789
1620	NC_010408	GCCG	2	8	77791	77798	0 %	0 %	50 %	50 %	189016789
1621	NC_010408	GCCC	2	8	77821	77828	0 %	0 %	25 %	75 %	189016789
1622	NC_010408	CGT	2	6	77921	77926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189016789
1623	NC_010408	CG	3	6	77927	77932	0 %	0 %	50 %	50 %	189016789
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1748	NC_010408	CCG	2	6	83253	83258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189016797
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1751	NC_010408	CGA	2	6	83319	83324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189016797
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1753	NC_010408	CGAC	2	8	83590	83597	25 %	0 %	25 %	50 %	189016798
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