MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Clavibacter michiganensis subsp. sepedonicus chromosome

Total Repeats: 89487

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4002	NC_010407	CAT	2	6	150030	150035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170780583
4003	NC_010407	ACG	2	6	150044	150049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170780583
4004	NC_010407	AGCCG	2	10	150072	150081	20 %	0 %	40 %	40 %	170780583
4005	NC_010407	CGT	2	6	150084	150089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170780583
4006	NC_010407	CCT	2	6	150126	150131	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170780583
4007	NC_010407	GC	4	8	150150	150157	0 %	0 %	50 %	50 %	170780583
4008	NC_010407	CCG	2	6	150251	150256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170780583
4009	NC_010407	CGG	2	6	150276	150281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170780583
4010	NC_010407	CCT	2	6	150312	150317	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170780583
4011	NC_010407	ACCT	2	8	150319	150326	25 %	25 %	0 %	50 %	170780583
4012	NC_010407	CG	3	6	150413	150418	0 %	0 %	50 %	50 %	170780584
4013	NC_010407	CAC	2	6	150445	150450	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170780584
4014	NC_010407	CGC	2	6	150465	150470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170780584
4015	NC_010407	CGG	2	6	150505	150510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170780584
4016	NC_010407	AGC	2	6	150570	150575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170780584
4017	NC_010407	CGC	2	6	150625	150630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170780584
4018	NC_010407	CTG	2	6	150641	150646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170780584
4019	NC_010407	CGA	2	6	150685	150690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170780584
4020	NC_010407	CGG	2	6	150697	150702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170780584
4021	NC_010407	CCT	2	6	150712	150717	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170780584
4022	NC_010407	CG	3	6	150720	150725	0 %	0 %	50 %	50 %	170780584
4023	NC_010407	TCG	3	9	150744	150752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170780584
4024	NC_010407	CGC	2	6	150775	150780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170780584
4025	NC_010407	TGA	2	6	150846	150851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170780584
4026	NC_010407	CG	3	6	150866	150871	0 %	0 %	50 %	50 %	170780584
4027	NC_010407	CGGC	2	8	150891	150898	0 %	0 %	50 %	50 %	170780584
4028	NC_010407	GTC	2	6	150905	150910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170780584
4029	NC_010407	ACA	2	6	150915	150920	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170780584
4030	NC_010407	TCGCC	2	10	150924	150933	0 %	20 %	20 %	60 %	170780584
4031	NC_010407	GCA	2	6	150940	150945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170780584
4032	NC_010407	CCA	3	9	150981	150989	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170780584
4033	NC_010407	GGC	2	6	150998	151003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170780584
4034	NC_010407	CGA	3	9	151036	151044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170780584
4035	NC_010407	TCC	2	6	151068	151073	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170780584
4036	NC_010407	CAC	2	6	151117	151122	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170780584
4037	NC_010407	GAG	2	6	151175	151180	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170780584
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4039	NC_010407	GCA	3	9	151195	151203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170780584
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4041	NC_010407	CGG	2	6	151285	151290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170780584
4042	NC_010407	CG	3	6	151327	151332	0 %	0 %	50 %	50 %	170780584
4043	NC_010407	CG	3	6	151350	151355	0 %	0 %	50 %	50 %	170780584
4044	NC_010407	GCG	2	6	151380	151385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170780584
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4047	NC_010407	CGC	2	6	151440	151445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170780584
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4050	NC_010407	GC	4	8	151519	151526	0 %	0 %	50 %	50 %	170780584
4051	NC_010407	GCG	2	6	151558	151563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170780584
4052	NC_010407	GCA	2	6	151604	151609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170780585
4053	NC_010407	TCG	2	6	151624	151629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170780585
4054	NC_010407	CG	4	8	151646	151653	0 %	0 %	50 %	50 %	170780585
4055	NC_010407	TCG	2	6	151732	151737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170780585
4056	NC_010407	GTCGAA	2	12	151743	151754	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	170780585
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4058	NC_010407	CGC	2	6	151794	151799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170780585
4059	NC_010407	CCG	2	6	151814	151819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170780585
4060	NC_010407	CG	3	6	151818	151823	0 %	0 %	50 %	50 %	170780585
4061	NC_010407	CGG	2	6	151841	151846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170780585
4062	NC_010407	CGTCG	2	10	151854	151863	0 %	20 %	40 %	40 %	170780585
4063	NC_010407	GCCC	2	8	151893	151900	0 %	0 %	25 %	75 %	170780585
4064	NC_010407	GC	4	8	151951	151958	0 %	0 %	50 %	50 %	170780585
4065	NC_010407	GTC	2	6	151962	151967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170780585
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4070	NC_010407	GTC	3	9	152175	152183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170780585
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4087	NC_010407	GC	3	6	153048	153053	0 %	0 %	50 %	50 %	170780586
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4093	NC_010407	TCG	2	6	153355	153360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170780586
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4100	NC_010407	GCCCA	2	10	153757	153766	20 %	0 %	20 %	60 %	170780587
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4104	NC_010407	GC	3	6	153917	153922	0 %	0 %	50 %	50 %	170780587
4105	NC_010407	GCC	2	6	153927	153932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170780587
4106	NC_010407	CGC	2	6	153990	153995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170780587
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4108	NC_010407	CATCGG	2	12	154029	154040	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	170780587
4109	NC_010407	CAC	2	6	154150	154155	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170780587
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4111	NC_010407	TGGC	2	8	154213	154220	0 %	25 %	50 %	25 %	170780587
4112	NC_010407	GC	3	6	154219	154224	0 %	0 %	50 %	50 %	170780587
4113	NC_010407	CGG	2	6	154227	154232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170780587
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4119	NC_010407	TCC	2	6	154397	154402	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170780587
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4245	NC_010407	ATC	2	6	158554	158559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170780590
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4362	NC_010407	CG	3	6	163914	163919	0 %	0 %	50 %	50 %	170780595
4363	NC_010407	GC	3	6	163923	163928	0 %	0 %	50 %	50 %	170780595
4364	NC_010407	GCCGGG	2	12	163938	163949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170780595
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4483	NC_010407	GGT	2	6	168750	168755	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170780599
4484	NC_010407	GC	3	6	168763	168768	0 %	0 %	50 %	50 %	170780599
4485	NC_010407	GAG	2	6	168828	168833	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170780600
4486	NC_010407	GC	3	6	168855	168860	0 %	0 %	50 %	50 %	170780600
4487	NC_010407	GAC	2	6	168891	168896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170780600
4488	NC_010407	TCG	2	6	168898	168903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170780600
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4490	NC_010407	CCGCGC	2	12	168943	168954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170780600
4491	NC_010407	GAG	2	6	168969	168974	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170780600
4492	NC_010407	GCG	2	6	168975	168980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170780600
4493	NC_010407	TCG	2	6	168982	168987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170780600
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4495	NC_010407	GCG	2	6	169040	169045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170780600
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4499	NC_010407	GAG	2	6	169230	169235	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170780600
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