MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Clavibacter michiganensis subsp. sepedonicus chromosome

Total Repeats: 89487

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_010407	ACGA	2	8	117261	117268	50 %	0 %	25 %	25 %	170780552
3002	NC_010407	TTG	2	6	117324	117329	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170780552
3003	NC_010407	CGA	3	9	117349	117357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170780552
3004	NC_010407	CGT	2	6	117358	117363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170780552
3005	NC_010407	CCG	2	6	117456	117461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170780553
3006	NC_010407	GGCG	2	8	117474	117481	0 %	0 %	75 %	25 %	170780553
3007	NC_010407	GCCG	2	8	117514	117521	0 %	0 %	50 %	50 %	170780553
3008	NC_010407	TCG	2	6	117531	117536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170780553
3009	NC_010407	CGG	2	6	117544	117549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170780553
3010	NC_010407	CTCG	2	8	117556	117563	0 %	25 %	25 %	50 %	170780553
3011	NC_010407	CGG	2	6	117573	117578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170780553
3012	NC_010407	CG	4	8	117594	117601	0 %	0 %	50 %	50 %	170780553
3013	NC_010407	CGT	3	9	117619	117627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170780553
3014	NC_010407	CCG	2	6	117651	117656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170780553
3015	NC_010407	CGC	2	6	117661	117666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170780553
3016	NC_010407	CGC	2	6	117670	117675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170780553
3017	NC_010407	CG	4	8	117682	117689	0 %	0 %	50 %	50 %	170780553
3018	NC_010407	GTC	2	6	117707	117712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170780553
3019	NC_010407	CG	3	6	117717	117722	0 %	0 %	50 %	50 %	170780553
3020	NC_010407	GCC	3	9	117755	117763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170780553
3021	NC_010407	CGC	2	6	117766	117771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170780553
3022	NC_010407	CGC	2	6	117778	117783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170780553
3023	NC_010407	CGA	2	6	117787	117792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170780553
3024	NC_010407	CG	3	6	117815	117820	0 %	0 %	50 %	50 %	170780553
3025	NC_010407	CTC	2	6	117824	117829	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170780553
3026	NC_010407	CGA	2	6	117841	117846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170780553
3027	NC_010407	TGC	2	6	117861	117866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170780553
3028	NC_010407	GCC	2	6	117890	117895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170780553
3029	NC_010407	CG	3	6	117925	117930	0 %	0 %	50 %	50 %	170780553
3030	NC_010407	CGGC	2	8	117933	117940	0 %	0 %	50 %	50 %	170780553
3031	NC_010407	GCT	2	6	117958	117963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170780553
3032	NC_010407	CG	3	6	117971	117976	0 %	0 %	50 %	50 %	170780553
3033	NC_010407	CG	4	8	117984	117991	0 %	0 %	50 %	50 %	170780553
3034	NC_010407	CCT	2	6	118044	118049	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170780553
3035	NC_010407	CGCGTC	2	12	118055	118066	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	170780553
3036	NC_010407	ACG	2	6	118071	118076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170780553
3037	NC_010407	TGC	2	6	118077	118082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170780553
3038	NC_010407	GAC	3	9	118154	118162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170780553
3039	NC_010407	CGC	2	6	118177	118182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170780553
3040	NC_010407	GAG	2	6	118193	118198	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170780553
3041	NC_010407	CTC	2	6	118244	118249	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170780553
3042	NC_010407	GCCGC	2	10	118250	118259	0 %	0 %	40 %	60 %	170780553
3043	NC_010407	CGC	2	6	118288	118293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170780553
3044	NC_010407	GC	3	6	118292	118297	0 %	0 %	50 %	50 %	170780553
3045	NC_010407	GAG	2	6	118298	118303	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170780553
3046	NC_010407	CG	3	6	118342	118347	0 %	0 %	50 %	50 %	170780553
3047	NC_010407	GAC	2	6	118438	118443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170780553
3048	NC_010407	CGA	2	6	118475	118480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170780554
3049	NC_010407	TCC	2	6	118492	118497	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170780554
3050	NC_010407	AGG	2	6	118504	118509	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170780554
3051	NC_010407	GGA	2	6	118565	118570	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170780554
3052	NC_010407	CTC	2	6	118575	118580	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170780554
3053	NC_010407	GGTCAT	2	12	118601	118612	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	170780554
3054	NC_010407	CG	4	8	118622	118629	0 %	0 %	50 %	50 %	170780554
3055	NC_010407	GCG	2	6	118696	118701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170780554
3056	NC_010407	GCC	2	6	118741	118746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170780554
3057	NC_010407	TCG	2	6	118756	118761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170780554
3058	NC_010407	CAT	2	6	118766	118771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170780554
3059	NC_010407	GCT	2	6	118796	118801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170780554
3060	NC_010407	CTG	2	6	118848	118853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170780554
3061	NC_010407	GAC	2	6	118914	118919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170780554
3062	NC_010407	CGC	2	6	118987	118992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170780554
3063	NC_010407	CTC	2	6	119179	119184	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170780555
3064	NC_010407	TCG	2	6	119201	119206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170780555
3065	NC_010407	TCG	2	6	119216	119221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170780555
3066	NC_010407	TCA	2	6	119243	119248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170780555
3067	NC_010407	CAC	2	6	119271	119276	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170780555
3068	NC_010407	GCA	2	6	119277	119282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170780555
3069	NC_010407	ATC	2	6	119326	119331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170780555
3070	NC_010407	AGC	2	6	119339	119344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170780555
3071	NC_010407	GCG	3	9	119417	119425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170780555
3072	NC_010407	CCG	2	6	119456	119461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170780555
3073	NC_010407	CGA	2	6	119469	119474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170780555
3074	NC_010407	CTG	2	6	119518	119523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170780555
3075	NC_010407	GCT	3	9	119526	119534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170780555
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3079	NC_010407	GAG	2	6	119692	119697	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170780555
3080	NC_010407	TGC	2	6	119762	119767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170780555
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3083	NC_010407	GGCG	2	8	119823	119830	0 %	0 %	75 %	25 %	170780555
3084	NC_010407	TCG	2	6	119861	119866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170780555
3085	NC_010407	CAT	2	6	119937	119942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170780555
3086	NC_010407	TCG	2	6	119945	119950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170780555
3087	NC_010407	GCC	2	6	119969	119974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170780555
3088	NC_010407	CGG	3	9	119991	119999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170780555
3089	NC_010407	ACG	2	6	120002	120007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170780555
3090	NC_010407	TGG	2	6	120035	120040	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170780555
3091	NC_010407	CCA	2	6	120086	120091	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170780555
3092	NC_010407	CGC	2	6	120219	120224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170780555
3093	NC_010407	CG	3	6	120246	120251	0 %	0 %	50 %	50 %	170780555
3094	NC_010407	CTC	2	6	120307	120312	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170780555
3095	NC_010407	GC	3	6	120316	120321	0 %	0 %	50 %	50 %	170780555
3096	NC_010407	CGA	2	6	120339	120344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170780555
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3099	NC_010407	GCCGCA	2	12	120392	120403	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	170780555
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3102	NC_010407	CGG	3	9	120461	120469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170780555
3103	NC_010407	AAC	2	6	120475	120480	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170780555
3104	NC_010407	CG	3	6	120512	120517	0 %	0 %	50 %	50 %	170780555
3105	NC_010407	TGC	2	6	120542	120547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170780555
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3108	NC_010407	GGC	2	6	120610	120615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170780555
3109	NC_010407	GGA	2	6	120624	120629	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170780555
3110	NC_010407	CAC	2	6	120648	120653	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170780555
3111	NC_010407	CG	3	6	120690	120695	0 %	0 %	50 %	50 %	170780555
3112	NC_010407	CGG	2	6	120786	120791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170780555
3113	NC_010407	ACT	2	6	120800	120805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170780555
3114	NC_010407	GGA	2	6	120807	120812	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170780555
3115	NC_010407	GC	4	8	120840	120847	0 %	0 %	50 %	50 %	170780555
3116	NC_010407	GC	3	6	120857	120862	0 %	0 %	50 %	50 %	170780555
3117	NC_010407	ACG	2	6	120863	120868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170780555
3118	NC_010407	TCA	2	6	120881	120886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170780555
3119	NC_010407	GCT	2	6	120924	120929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170780555
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3121	NC_010407	GAA	2	6	120981	120986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170780555
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3123	NC_010407	CGT	2	6	121083	121088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170780555
3124	NC_010407	GCC	2	6	121110	121115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170780555
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3240	NC_010407	CGGCCG	2	12	124159	124170	0 %	0 %	50 %	50 %	170780559
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3243	NC_010407	GCC	3	9	124217	124225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170780559
3244	NC_010407	CGC	2	6	124234	124239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170780559
3245	NC_010407	CCG	2	6	124242	124247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170780559
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3353	NC_010407	ACCCC	2	10	127053	127062	20 %	0 %	0 %	80 %	170780562
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3363	NC_010407	TGC	2	6	127298	127303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170780563
3364	NC_010407	GAGCG	2	10	127339	127348	20 %	0 %	60 %	20 %	170780563
3365	NC_010407	TCG	2	6	127391	127396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170780563
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3367	NC_010407	TCG	2	6	127436	127441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170780563
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3481	NC_010407	GAA	2	6	131235	131240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170780568
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3483	NC_010407	CGC	2	6	131340	131345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170780568
3484	NC_010407	CAG	2	6	131389	131394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170780568
3485	NC_010407	AGG	2	6	131426	131431	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170780568
3486	NC_010407	CGG	2	6	131442	131447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170780568
3487	NC_010407	GCA	2	6	131454	131459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170780568
3488	NC_010407	CAG	2	6	131464	131469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170780568
3489	NC_010407	GGC	2	6	131514	131519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170780568
3490	NC_010407	GC	3	6	131518	131523	0 %	0 %	50 %	50 %	170780568
3491	NC_010407	CGC	2	6	131590	131595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170780568
3492	NC_010407	AAC	2	6	131602	131607	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170780568
3493	NC_010407	CCG	2	6	131642	131647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170780568
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3496	NC_010407	GCTC	2	8	131732	131739	0 %	25 %	25 %	50 %	170780568
3497	NC_010407	GAG	2	6	131770	131775	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170780568
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3499	NC_010407	CG	3	6	131807	131812	0 %	0 %	50 %	50 %	170780568
3500	NC_010407	CAT	2	6	131817	131822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170780568

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