MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Clavibacter michiganensis subsp. sepedonicus chromosome

Total Repeats: 89487

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_010407	CGA	2	6	419730	419735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170780830
11502	NC_010407	GCC	2	6	419741	419746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170780830
11503	NC_010407	CTT	2	6	419771	419776	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170780830
11504	NC_010407	TGCTTC	2	12	419822	419833	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	170780830
11505	NC_010407	TCC	2	6	419857	419862	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170780830
11506	NC_010407	GCG	2	6	419926	419931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170780830
11507	NC_010407	CCAGG	2	10	420146	420155	20 %	0 %	40 %	40 %	170780831
11508	NC_010407	GA	3	6	420205	420210	50 %	0 %	50 %	0 %	170780831
11509	NC_010407	ATC	2	6	420225	420230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170780831
11510	NC_010407	CTG	2	6	420272	420277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170780831
11511	NC_010407	GATG	2	8	420359	420366	25 %	25 %	50 %	0 %	170780831
11512	NC_010407	GCC	3	9	420384	420392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170780831
11513	NC_010407	CCT	2	6	420439	420444	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170780831
11514	NC_010407	CGA	2	6	420482	420487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170780831
11515	NC_010407	GCG	2	6	420558	420563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170780831
11516	NC_010407	GTT	2	6	420618	420623	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170780831
11517	NC_010407	GAA	2	6	420731	420736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170780831
11518	NC_010407	GA	3	6	420743	420748	50 %	0 %	50 %	0 %	170780831
11519	NC_010407	CGT	2	6	420752	420757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170780831
11520	NC_010407	GCT	2	6	420798	420803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170780831
11521	NC_010407	GAT	2	6	420915	420920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170780831
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11523	NC_010407	TCA	2	6	421030	421035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170780832
11524	NC_010407	GAC	2	6	421038	421043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170780832
11525	NC_010407	GC	3	6	421074	421079	0 %	0 %	50 %	50 %	170780832
11526	NC_010407	CCG	2	6	421080	421085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170780832
11527	NC_010407	CGG	2	6	421124	421129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170780832
11528	NC_010407	GGTG	2	8	421252	421259	0 %	25 %	75 %	0 %	170780832
11529	NC_010407	GAG	2	6	421399	421404	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170780832
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11531	NC_010407	AGAC	2	8	421492	421499	50 %	0 %	25 %	25 %	170780832
11532	NC_010407	CCGA	2	8	421526	421533	25 %	0 %	25 %	50 %	170780832
11533	NC_010407	TC	4	8	421539	421546	0 %	50 %	0 %	50 %	170780832
11534	NC_010407	GC	3	6	421611	421616	0 %	0 %	50 %	50 %	170780832
11535	NC_010407	TCT	2	6	421666	421671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170780832
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11540	NC_010407	C	6	6	422056	422061	0 %	0 %	0 %	100 %	170780833
11541	NC_010407	CG	3	6	422073	422078	0 %	0 %	50 %	50 %	170780833
11542	NC_010407	GCC	2	6	422092	422097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170780833
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11544	NC_010407	GAG	2	6	422165	422170	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170780833
11545	NC_010407	CTC	2	6	422207	422212	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170780833
11546	NC_010407	CGC	2	6	422263	422268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170780833
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11551	NC_010407	CGG	3	9	422392	422400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170780833
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11553	NC_010407	TCC	2	6	422463	422468	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170780833
11554	NC_010407	GAG	2	6	422471	422476	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170780833
11555	NC_010407	CGA	2	6	422480	422485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170780833
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11557	NC_010407	CCGG	2	8	422516	422523	0 %	0 %	50 %	50 %	170780833
11558	NC_010407	CCA	2	6	422543	422548	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170780833
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11560	NC_010407	CGC	2	6	422590	422595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170780833
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11979	NC_010407	GTC	2	6	437811	437816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170780850
11980	NC_010407	CGC	2	6	437826	437831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170780850
11981	NC_010407	CTCATG	2	12	437875	437886	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	170780850
11982	NC_010407	GTCGCG	2	12	437890	437901	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	170780850
11983	NC_010407	TCT	2	6	437915	437920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170780850
11984	NC_010407	GCC	2	6	437935	437940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170780850
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11999	NC_010407	CCCA	2	8	438490	438497	25 %	0 %	0 %	75 %	170780850
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