MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Clavibacter michiganensis subsp. sepedonicus chromosome

Total Repeats: 89487

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_010407	GCC	2	6	19285	19290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170780480
502	NC_010407	TGC	2	6	19320	19325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170780480
503	NC_010407	TCGT	2	8	19337	19344	0 %	50 %	25 %	25 %	170780480
504	NC_010407	TCG	2	6	19425	19430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170780480
505	NC_010407	TGC	2	6	19437	19442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170780480
506	NC_010407	CGG	2	6	19512	19517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170780480
507	NC_010407	GC	3	6	19559	19564	0 %	0 %	50 %	50 %	170780480
508	NC_010407	CGTC	2	8	19566	19573	0 %	25 %	25 %	50 %	170780480
509	NC_010407	GGC	2	6	19616	19621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170780480
510	NC_010407	CCT	2	6	19692	19697	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170780480
511	NC_010407	CGGCG	2	10	19708	19717	0 %	0 %	60 %	40 %	170780480
512	NC_010407	GAC	2	6	19726	19731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170780480
513	NC_010407	TCT	2	6	19773	19778	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170780480
514	NC_010407	GTC	2	6	19795	19800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170780480
515	NC_010407	GGGGGT	2	12	19834	19845	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	170780480
516	NC_010407	GCTCGG	2	12	19861	19872	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	170780480
517	NC_010407	GCGTCG	2	12	19907	19918	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	170780480
518	NC_010407	GGCC	2	8	19941	19948	0 %	0 %	50 %	50 %	170780480
519	NC_010407	GGC	2	6	19954	19959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170780480
520	NC_010407	CGA	4	12	19974	19985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170780480
521	NC_010407	GC	3	6	19997	20002	0 %	0 %	50 %	50 %	170780480
522	NC_010407	CTC	2	6	20017	20022	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170780480
523	NC_010407	CTC	2	6	20026	20031	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170780480
524	NC_010407	GTC	2	6	20032	20037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170780480
525	NC_010407	GTC	2	6	20041	20046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170780480
526	NC_010407	GAG	2	6	20047	20052	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170780480
527	NC_010407	CCG	2	6	20061	20066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170780480
528	NC_010407	GC	3	6	20072	20077	0 %	0 %	50 %	50 %	170780480
529	NC_010407	GGA	2	6	20083	20088	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170780480
530	NC_010407	CGG	2	6	20115	20120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170780480
531	NC_010407	CGG	2	6	20123	20128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170780480
532	NC_010407	AGC	2	6	20179	20184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170780480
533	NC_010407	CCGCGA	2	12	20199	20210	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	170780480
534	NC_010407	TGG	2	6	20211	20216	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170780480
535	NC_010407	CGC	2	6	20229	20234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170780480
536	NC_010407	GCG	2	6	20249	20254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170780480
537	NC_010407	CG	4	8	20253	20260	0 %	0 %	50 %	50 %	170780480
538	NC_010407	GCG	2	6	20267	20272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170780480
539	NC_010407	GCGG	2	8	20277	20284	0 %	0 %	75 %	25 %	170780480
540	NC_010407	CGGC	2	8	20286	20293	0 %	0 %	50 %	50 %	170780480
541	NC_010407	GCT	2	6	20361	20366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170780480
542	NC_010407	ATGGCG	2	12	20381	20392	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	170780480
543	NC_010407	GCG	2	6	20416	20421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170780480
544	NC_010407	CGA	2	6	20442	20447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170780480
545	NC_010407	GC	3	6	20569	20574	0 %	0 %	50 %	50 %	170780480
546	NC_010407	TGA	2	6	20613	20618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170780480
547	NC_010407	GCG	2	6	20666	20671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170780480
548	NC_010407	GAT	2	6	20695	20700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170780480
549	NC_010407	CGCTCG	2	12	20729	20740	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	170780480
550	NC_010407	TGG	2	6	20745	20750	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170780480
551	NC_010407	TCC	2	6	20798	20803	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170780480
552	NC_010407	GCG	2	6	20849	20854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170780480
553	NC_010407	GCC	2	6	20977	20982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170780480
554	NC_010407	GCGAT	2	10	20987	20996	20 %	20 %	40 %	20 %	170780480
555	NC_010407	TTC	2	6	21070	21075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170780481
556	NC_010407	GCG	2	6	21085	21090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170780481
557	NC_010407	TCGTCC	2	12	21111	21122	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	170780481
558	NC_010407	GCC	2	6	21123	21128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170780481
559	NC_010407	GACCGC	2	12	21141	21152	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	170780481
560	NC_010407	CCG	2	6	21167	21172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170780481
561	NC_010407	GTC	2	6	21204	21209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170780481
562	NC_010407	CGACG	2	10	21270	21279	20 %	0 %	40 %	40 %	170780481
563	NC_010407	CGT	2	6	21290	21295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170780481
564	NC_010407	ATC	3	9	21298	21306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170780481
565	NC_010407	TGG	2	6	21314	21319	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170780481
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567	NC_010407	GCTC	2	8	21374	21381	0 %	25 %	25 %	50 %	170780481
568	NC_010407	CGA	2	6	21404	21409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170780481
569	NC_010407	CGC	2	6	21428	21433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170780481
570	NC_010407	CG	3	6	21477	21482	0 %	0 %	50 %	50 %	170780481
571	NC_010407	CGT	2	6	21521	21526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170780481
572	NC_010407	TCGA	2	8	21571	21578	25 %	25 %	25 %	25 %	170780481
573	NC_010407	CGC	2	6	21606	21611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170780481
574	NC_010407	TCT	2	6	21614	21619	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170780481
575	NC_010407	CCTCGG	2	12	21692	21703	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	170780481
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577	NC_010407	GTGCCG	2	12	21739	21750	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	170780481
578	NC_010407	CGG	2	6	21765	21770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170780481
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580	NC_010407	GGC	3	9	21813	21821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170780481
581	NC_010407	TGA	2	6	21827	21832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170780481
582	NC_010407	CGGG	2	8	21848	21855	0 %	0 %	75 %	25 %	170780481
583	NC_010407	TGA	2	6	21878	21883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170780481
584	NC_010407	CGA	2	6	21909	21914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170780481
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589	NC_010407	CTG	2	6	22062	22067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170780481
590	NC_010407	CGAC	2	8	22091	22098	25 %	0 %	25 %	50 %	170780481
591	NC_010407	GAA	2	6	22143	22148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170780481
592	NC_010407	CGT	2	6	22175	22180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170780481
593	NC_010407	GTA	2	6	22221	22226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170780481
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595	NC_010407	GTC	2	6	22284	22289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170780481
596	NC_010407	GACG	2	8	22296	22303	25 %	0 %	50 %	25 %	170780481
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598	NC_010407	GAC	2	6	22407	22412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170780481
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601	NC_010407	GGA	2	6	22540	22545	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170780482
602	NC_010407	GAT	2	6	22556	22561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170780482
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605	NC_010407	GTG	2	6	22605	22610	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170780482
606	NC_010407	CGC	2	6	22639	22644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170780482
607	NC_010407	CGATGA	2	12	22645	22656	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	170780482
608	NC_010407	ACGA	2	8	22674	22681	50 %	0 %	25 %	25 %	170780482
609	NC_010407	AGC	2	6	22695	22700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170780482
610	NC_010407	GTC	2	6	22709	22714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170780482
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612	NC_010407	CTC	2	6	22799	22804	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170780482
613	NC_010407	GCG	2	6	22840	22845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170780482
614	NC_010407	GCC	2	6	22931	22936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170780482
615	NC_010407	CGT	2	6	22942	22947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170780482
616	NC_010407	CGG	2	6	22951	22956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170780482
617	NC_010407	GCC	2	6	22988	22993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170780482
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621	NC_010407	AGG	2	6	23172	23177	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170780482
622	NC_010407	CG	3	6	23197	23202	0 %	0 %	50 %	50 %	170780482
623	NC_010407	CG	4	8	23248	23255	0 %	0 %	50 %	50 %	170780482
624	NC_010407	GAA	2	6	23273	23278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170780482
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626	NC_010407	GCA	4	12	23386	23397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170780482
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