MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Clostridium botulinum B1 str. Okra plasmid pCLD

Total Repeats: 3659

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_010379	CAT	2	6	122045	122050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169834600
3002	NC_010379	AT	3	6	122133	122138	50 %	50 %	0 %	0 %	169834600
3003	NC_010379	ATA	2	6	122178	122183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834600
3004	NC_010379	AT	3	6	122212	122217	50 %	50 %	0 %	0 %	169834600
3005	NC_010379	TCT	2	6	122278	122283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169834600
3006	NC_010379	A	7	7	122287	122293	100 %	0 %	0 %	0 %	169834600
3007	NC_010379	TAATC	2	10	122365	122374	40 %	40 %	0 %	20 %	169834600
3008	NC_010379	CATA	2	8	122375	122382	50 %	25 %	0 %	25 %	169834600
3009	NC_010379	TAT	2	6	122650	122655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834541
3010	NC_010379	GTTA	2	8	122687	122694	25 %	50 %	25 %	0 %	169834541
3011	NC_010379	TAG	2	6	122716	122721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169834541
3012	NC_010379	CCA	2	6	122907	122912	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169834541
3013	NC_010379	AAT	2	6	122929	122934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834541
3014	NC_010379	ACC	2	6	122960	122965	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169834541
3015	NC_010379	T	7	7	122996	123002	0 %	100 %	0 %	0 %	169834541
3016	NC_010379	TAG	2	6	123004	123009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169834541
3017	NC_010379	TA	4	8	123023	123030	50 %	50 %	0 %	0 %	169834541
3018	NC_010379	AT	3	6	123043	123048	50 %	50 %	0 %	0 %	169834541
3019	NC_010379	TATT	2	8	123118	123125	25 %	75 %	0 %	0 %	169834541
3020	NC_010379	GCT	3	9	123143	123151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169834541
3021	NC_010379	TGT	2	6	123191	123196	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169834541
3022	NC_010379	CTTT	2	8	123228	123235	0 %	75 %	0 %	25 %	169834541
3023	NC_010379	ACC	3	9	123317	123325	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169834541
3024	NC_010379	CAT	2	6	123352	123357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169834541
3025	NC_010379	AT	3	6	123382	123387	50 %	50 %	0 %	0 %	169834541
3026	NC_010379	CTT	2	6	123406	123411	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169834541
3027	NC_010379	ACTG	2	8	123479	123486	25 %	25 %	25 %	25 %	169834541
3028	NC_010379	TTC	2	6	123497	123502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169834541
3029	NC_010379	AGT	2	6	123521	123526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169834541
3030	NC_010379	TA	3	6	123560	123565	50 %	50 %	0 %	0 %	169834541
3031	NC_010379	GGT	2	6	123567	123572	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169834541
3032	NC_010379	TTA	2	6	123576	123581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834541
3033	NC_010379	ATT	2	6	123630	123635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834541
3034	NC_010379	ATA	2	6	123639	123644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834541
3035	NC_010379	TAA	2	6	123662	123667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834541
3036	NC_010379	T	7	7	123818	123824	0 %	100 %	0 %	0 %	169834622
3037	NC_010379	ATT	2	6	123988	123993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834622
3038	NC_010379	AAC	2	6	124003	124008	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169834622
3039	NC_010379	TAAA	2	8	124032	124039	75 %	25 %	0 %	0 %	169834622
3040	NC_010379	T	6	6	124060	124065	0 %	100 %	0 %	0 %	169834622
3041	NC_010379	AT	3	6	124079	124084	50 %	50 %	0 %	0 %	169834622
3042	NC_010379	TCT	2	6	124127	124132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169834622
3043	NC_010379	AT	3	6	124137	124142	50 %	50 %	0 %	0 %	169834622
3044	NC_010379	TAT	2	6	124161	124166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834622
3045	NC_010379	CCT	2	6	124217	124222	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169834622
3046	NC_010379	CTT	2	6	124305	124310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169834622
3047	NC_010379	TTA	2	6	124319	124324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834622
3048	NC_010379	T	7	7	124331	124337	0 %	100 %	0 %	0 %	169834622
3049	NC_010379	TA	3	6	124348	124353	50 %	50 %	0 %	0 %	169834622
3050	NC_010379	CTT	3	9	124396	124404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169834622
3051	NC_010379	GTC	2	6	124423	124428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169834622
3052	NC_010379	TAA	2	6	124446	124451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834622
3053	NC_010379	GAA	2	6	124463	124468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169834622
3054	NC_010379	TCTTAT	2	12	124488	124499	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	169834622
3055	NC_010379	TAA	2	6	124518	124523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834622
3056	NC_010379	TAA	2	6	124528	124533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834622
3057	NC_010379	TTTC	2	8	124558	124565	0 %	75 %	0 %	25 %	169834622
3058	NC_010379	ATA	2	6	124615	124620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834685
3059	NC_010379	T	6	6	124627	124632	0 %	100 %	0 %	0 %	169834685
3060	NC_010379	TCT	2	6	124653	124658	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169834685
3061	NC_010379	TTAA	2	8	124668	124675	50 %	50 %	0 %	0 %	169834685
3062	NC_010379	ATA	2	6	124688	124693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834685
3063	NC_010379	ATG	2	6	124708	124713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169834685
3064	NC_010379	CAT	2	6	124717	124722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169834685
3065	NC_010379	TGAT	2	8	124724	124731	25 %	50 %	25 %	0 %	169834685
3066	NC_010379	TC	3	6	124736	124741	0 %	50 %	0 %	50 %	169834685
3067	NC_010379	T	6	6	124769	124774	0 %	100 %	0 %	0 %	169834685
3068	NC_010379	A	7	7	124910	124916	100 %	0 %	0 %	0 %	169834685
3069	NC_010379	AT	3	6	125019	125024	50 %	50 %	0 %	0 %	169834685
3070	NC_010379	T	6	6	125038	125043	0 %	100 %	0 %	0 %	169834685
3071	NC_010379	T	6	6	125104	125109	0 %	100 %	0 %	0 %	169834685
3072	NC_010379	ATT	2	6	125111	125116	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834685
3073	NC_010379	TCT	2	6	125235	125240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169834685
3074	NC_010379	TTA	2	6	125283	125288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834685
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3076	NC_010379	AAT	2	6	125327	125332	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834685
3077	NC_010379	TCT	2	6	125344	125349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169834685
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3080	NC_010379	TAT	2	6	125608	125613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834646
3081	NC_010379	ATT	2	6	125614	125619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834646
3082	NC_010379	ATT	2	6	125634	125639	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834646
3083	NC_010379	T	6	6	125704	125709	0 %	100 %	0 %	0 %	169834646
3084	NC_010379	CTA	2	6	125718	125723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169834646
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3088	NC_010379	A	6	6	125760	125765	100 %	0 %	0 %	0 %	169834646
3089	NC_010379	AAT	2	6	126225	126230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834540
3090	NC_010379	ACA	2	6	126242	126247	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169834540
3091	NC_010379	ACA	2	6	126270	126275	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169834540
3092	NC_010379	TAT	2	6	126400	126405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834540
3093	NC_010379	GTG	3	9	126412	126420	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169834540
3094	NC_010379	ATG	2	6	126429	126434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169834540
3095	NC_010379	AAT	2	6	126458	126463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834540
3096	NC_010379	GAT	2	6	126547	126552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169834540
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3098	NC_010379	AAAGA	2	10	126653	126662	80 %	0 %	20 %	0 %	169834628
3099	NC_010379	TA	3	6	126685	126690	50 %	50 %	0 %	0 %	169834628
3100	NC_010379	ACTA	2	8	126700	126707	50 %	25 %	0 %	25 %	169834628
3101	NC_010379	TAT	2	6	126725	126730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834628
3102	NC_010379	ATGT	2	8	126774	126781	25 %	50 %	25 %	0 %	169834628
3103	NC_010379	AGA	2	6	126829	126834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169834628
3104	NC_010379	T	6	6	126913	126918	0 %	100 %	0 %	0 %	169834628
3105	NC_010379	ATT	2	6	126961	126966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834628
3106	NC_010379	GAT	2	6	126989	126994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169834628
3107	NC_010379	AT	4	8	127012	127019	50 %	50 %	0 %	0 %	169834628
3108	NC_010379	GAA	2	6	127055	127060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169834628
3109	NC_010379	A	7	7	127083	127089	100 %	0 %	0 %	0 %	169834628
3110	NC_010379	AAAG	2	8	127115	127122	75 %	0 %	25 %	0 %	169834628
3111	NC_010379	AAT	2	6	127123	127128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834628
3112	NC_010379	T	6	6	127190	127195	0 %	100 %	0 %	0 %	169834628
3113	NC_010379	GAA	2	6	127202	127207	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169834628
3114	NC_010379	ATA	2	6	127236	127241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834628
3115	NC_010379	CAA	2	6	127268	127273	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169834628
3116	NC_010379	CTT	2	6	127287	127292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169834628
3117	NC_010379	TAT	2	6	127298	127303	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834628
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3119	NC_010379	AAG	2	6	127336	127341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169834628
3120	NC_010379	ATT	2	6	127357	127362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834628
3121	NC_010379	AAG	2	6	127366	127371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169834628
3122	NC_010379	TTA	2	6	127379	127384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834628
3123	NC_010379	ATA	2	6	127392	127397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834628
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3499	NC_010379	AATAAA	2	12	141911	141922	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	169834660
3500	NC_010379	TAAA	2	8	141933	141940	75 %	25 %	0 %	0 %	169834660

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