MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Clostridium botulinum B1 str. Okra plasmid pCLD

Total Repeats: 3659

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_010379	TTTTA	2	10	61382	61391	20 %	80 %	0 %	0 %	169834674
1502	NC_010379	CTTCAT	2	12	61453	61464	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	169834674
1503	NC_010379	CAC	2	6	61512	61517	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169834565
1504	NC_010379	TAT	2	6	61586	61591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834565
1505	NC_010379	TAA	2	6	61599	61604	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834565
1506	NC_010379	TAT	3	9	61655	61663	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834565
1507	NC_010379	TAA	2	6	61665	61670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834565
1508	NC_010379	A	6	6	61679	61684	100 %	0 %	0 %	0 %	169834565
1509	NC_010379	AT	3	6	61705	61710	50 %	50 %	0 %	0 %	169834565
1510	NC_010379	TTC	2	6	61755	61760	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169834565
1511	NC_010379	AT	3	6	61775	61780	50 %	50 %	0 %	0 %	169834565
1512	NC_010379	TGT	2	6	61789	61794	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169834565
1513	NC_010379	TAA	2	6	61855	61860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834565
1514	NC_010379	T	7	7	61865	61871	0 %	100 %	0 %	0 %	169834565
1515	NC_010379	TAAT	2	8	61886	61893	50 %	50 %	0 %	0 %	169834565
1516	NC_010379	TTA	2	6	61906	61911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834565
1517	NC_010379	CTTT	2	8	62105	62112	0 %	75 %	0 %	25 %	169834565
1518	NC_010379	T	6	6	62178	62183	0 %	100 %	0 %	0 %	169834565
1519	NC_010379	ATAGAT	2	12	62219	62230	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	169834565
1520	NC_010379	CTA	2	6	62258	62263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169834565
1521	NC_010379	ATGC	2	8	62344	62351	25 %	25 %	25 %	25 %	169834565
1522	NC_010379	AAATA	2	10	62360	62369	80 %	20 %	0 %	0 %	169834565
1523	NC_010379	TTA	2	6	62384	62389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834565
1524	NC_010379	TCA	2	6	62398	62403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169834565
1525	NC_010379	CTT	2	6	62438	62443	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169834565
1526	NC_010379	TAT	2	6	62453	62458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834565
1527	NC_010379	T	7	7	62949	62955	0 %	100 %	0 %	0 %	169834713
1528	NC_010379	TAA	2	6	62957	62962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834713
1529	NC_010379	TAT	2	6	62979	62984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834713
1530	NC_010379	AAT	2	6	62985	62990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834713
1531	NC_010379	TTA	2	6	63070	63075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834713
1532	NC_010379	TTA	2	6	63079	63084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834713
1533	NC_010379	ACT	2	6	63088	63093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169834713
1534	NC_010379	TAT	2	6	63107	63112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834713
1535	NC_010379	CTG	2	6	63148	63153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169834713
1536	NC_010379	TTA	2	6	63175	63180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834713
1537	NC_010379	ATTT	2	8	63242	63249	25 %	75 %	0 %	0 %	169834713
1538	NC_010379	GAA	2	6	63265	63270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169834713
1539	NC_010379	TTA	2	6	63292	63297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834713
1540	NC_010379	GAA	2	6	63340	63345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169834713
1541	NC_010379	GAA	2	6	63388	63393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169834713
1542	NC_010379	TAG	2	6	63443	63448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169834713
1543	NC_010379	CTA	2	6	63508	63513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169834713
1544	NC_010379	ACT	2	6	63516	63521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169834713
1545	NC_010379	GAA	2	6	63532	63537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169834713
1546	NC_010379	GAA	2	6	63547	63552	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169834713
1547	NC_010379	AGA	2	6	63558	63563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169834713
1548	NC_010379	ACT	3	9	63582	63590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169834713
1549	NC_010379	TCC	2	6	63597	63602	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169834713
1550	NC_010379	A	6	6	63629	63634	100 %	0 %	0 %	0 %	169834713
1551	NC_010379	TA	3	6	63663	63668	50 %	50 %	0 %	0 %	169834713
1552	NC_010379	ATT	2	6	63678	63683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834713
1553	NC_010379	T	8	8	63682	63689	0 %	100 %	0 %	0 %	169834713
1554	NC_010379	AT	3	6	63715	63720	50 %	50 %	0 %	0 %	169834713
1555	NC_010379	TA	3	6	63725	63730	50 %	50 %	0 %	0 %	169834713
1556	NC_010379	GAATA	2	10	64198	64207	60 %	20 %	20 %	0 %	169834595
1557	NC_010379	TTG	2	6	64268	64273	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169834595
1558	NC_010379	AT	3	6	64327	64332	50 %	50 %	0 %	0 %	169834595
1559	NC_010379	TCT	2	6	64384	64389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169834595
1560	NC_010379	ATT	2	6	64414	64419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834595
1561	NC_010379	ATC	2	6	64422	64427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169834595
1562	NC_010379	TTC	2	6	64551	64556	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169834595
1563	NC_010379	T	6	6	64570	64575	0 %	100 %	0 %	0 %	169834595
1564	NC_010379	TTC	2	6	64602	64607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169834595
1565	NC_010379	AAT	2	6	64639	64644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834595
1566	NC_010379	TCT	2	6	64741	64746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169834595
1567	NC_010379	AT	3	6	64781	64786	50 %	50 %	0 %	0 %	169834595
1568	NC_010379	TAG	2	6	64820	64825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169834595
1569	NC_010379	ATA	2	6	65112	65117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834640
1570	NC_010379	GCA	2	6	65161	65166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169834640
1571	NC_010379	TAA	2	6	65178	65183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834640
1572	NC_010379	ACC	2	6	65205	65210	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169834640
1573	NC_010379	TA	3	6	65213	65218	50 %	50 %	0 %	0 %	169834640
1574	NC_010379	ATA	2	6	65246	65251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834640
1575	NC_010379	TAT	2	6	65292	65297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834640
1576	NC_010379	T	7	7	65312	65318	0 %	100 %	0 %	0 %	169834640
1577	NC_010379	AT	3	6	65463	65468	50 %	50 %	0 %	0 %	169834640
1578	NC_010379	GTA	2	6	65506	65511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169834640
1579	NC_010379	TAAT	2	8	65543	65550	50 %	50 %	0 %	0 %	169834640
1580	NC_010379	ATC	2	6	65571	65576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169834640
1581	NC_010379	TTGT	2	8	65582	65589	0 %	75 %	25 %	0 %	169834640
1582	NC_010379	CTAT	2	8	65596	65603	25 %	50 %	0 %	25 %	169834640
1583	NC_010379	TAGT	2	8	65630	65637	25 %	50 %	25 %	0 %	169834640
1584	NC_010379	AAT	2	6	65644	65649	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834640
1585	NC_010379	TAT	2	6	65660	65665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834640
1586	NC_010379	AAG	2	6	65731	65736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169834640
1587	NC_010379	TCT	2	6	65918	65923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169834553
1588	NC_010379	CTG	2	6	65928	65933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169834553
1589	NC_010379	GTT	2	6	65936	65941	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169834553
1590	NC_010379	T	6	6	65944	65949	0 %	100 %	0 %	0 %	169834553
1591	NC_010379	ATC	2	6	65968	65973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169834553
1592	NC_010379	TGA	2	6	65989	65994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169834553
1593	NC_010379	CAG	2	6	66033	66038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169834553
1594	NC_010379	T	8	8	66131	66138	0 %	100 %	0 %	0 %	169834553
1595	NC_010379	TTTTC	2	10	66189	66198	0 %	80 %	0 %	20 %	169834553
1596	NC_010379	T	6	6	66205	66210	0 %	100 %	0 %	0 %	169834553
1597	NC_010379	TTC	2	6	66217	66222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169834553
1598	NC_010379	T	7	7	66241	66247	0 %	100 %	0 %	0 %	169834553
1599	NC_010379	T	8	8	66289	66296	0 %	100 %	0 %	0 %	169834553
1600	NC_010379	A	6	6	66302	66307	100 %	0 %	0 %	0 %	169834553
1601	NC_010379	CAG	3	9	66327	66335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169834553
1602	NC_010379	T	6	6	66375	66380	0 %	100 %	0 %	0 %	169834553
1603	NC_010379	ATT	2	6	66421	66426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834553
1604	NC_010379	TGCTTT	2	12	66427	66438	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	169834553
1605	NC_010379	TTA	2	6	66446	66451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834553
1606	NC_010379	TAA	2	6	66615	66620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834588
1607	NC_010379	ATT	2	6	66652	66657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834588
1608	NC_010379	TAT	2	6	66665	66670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834588
1609	NC_010379	TTC	2	6	66682	66687	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169834588
1610	NC_010379	TTAATT	2	12	66709	66720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834588
1611	NC_010379	AAC	2	6	66865	66870	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169834588
1612	NC_010379	TCA	2	6	66892	66897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169834588
1613	NC_010379	TA	3	6	66921	66926	50 %	50 %	0 %	0 %	169834588
1614	NC_010379	T	6	6	66927	66932	0 %	100 %	0 %	0 %	169834588
1615	NC_010379	TAA	2	6	66938	66943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834588
1616	NC_010379	AAAT	2	8	66953	66960	75 %	25 %	0 %	0 %	169834588
1617	NC_010379	TCA	2	6	66976	66981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169834588
1618	NC_010379	TCA	2	6	66991	66996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169834588
1619	NC_010379	ATTA	2	8	67011	67018	50 %	50 %	0 %	0 %	169834588
1620	NC_010379	AAT	3	9	67070	67078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834588
1621	NC_010379	CTT	2	6	67100	67105	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169834588
1622	NC_010379	AAT	2	6	67134	67139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834588
1623	NC_010379	ATA	2	6	67147	67152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834588
1624	NC_010379	GTT	2	6	67172	67177	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169834588
1625	NC_010379	T	7	7	67191	67197	0 %	100 %	0 %	0 %	169834588
1626	NC_010379	ATT	2	6	67249	67254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834588
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