MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Clostridium botulinum B1 str. Okra plasmid pCLD

Total Repeats: 3659

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_010379	AAAG	2	8	40546	40553	75 %	0 %	25 %	0 %	169834569
1002	NC_010379	TAA	2	6	40581	40586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834569
1003	NC_010379	AT	3	6	40599	40604	50 %	50 %	0 %	0 %	169834569
1004	NC_010379	TCTTT	2	10	40621	40630	0 %	80 %	0 %	20 %	169834569
1005	NC_010379	TAT	2	6	42315	42320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834607
1006	NC_010379	AAT	2	6	42424	42429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834607
1007	NC_010379	CAAT	2	8	42478	42485	50 %	25 %	0 %	25 %	169834607
1008	NC_010379	TCA	2	6	42492	42497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169834607
1009	NC_010379	TTC	2	6	42503	42508	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169834607
1010	NC_010379	T	6	6	42512	42517	0 %	100 %	0 %	0 %	169834607
1011	NC_010379	TCA	2	6	42549	42554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169834607
1012	NC_010379	TCA	2	6	42585	42590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169834607
1013	NC_010379	TTC	2	6	42620	42625	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169834607
1014	NC_010379	TA	3	6	42649	42654	50 %	50 %	0 %	0 %	169834607
1015	NC_010379	A	7	7	42677	42683	100 %	0 %	0 %	0 %	169834607
1016	NC_010379	AT	4	8	42689	42696	50 %	50 %	0 %	0 %	169834607
1017	NC_010379	TCT	2	6	42699	42704	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169834607
1018	NC_010379	ATC	2	6	42716	42721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169834607
1019	NC_010379	TCT	2	6	42746	42751	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169834607
1020	NC_010379	TAA	2	6	42754	42759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834607
1021	NC_010379	AT	3	6	42771	42776	50 %	50 %	0 %	0 %	169834607
1022	NC_010379	TA	3	6	42791	42796	50 %	50 %	0 %	0 %	169834607
1023	NC_010379	TCTT	2	8	42849	42856	0 %	75 %	0 %	25 %	169834607
1024	NC_010379	AT	3	6	42864	42869	50 %	50 %	0 %	0 %	169834607
1025	NC_010379	ATA	2	6	42896	42901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834607
1026	NC_010379	TCTT	2	8	42971	42978	0 %	75 %	0 %	25 %	169834607
1027	NC_010379	TTGA	2	8	42985	42992	25 %	50 %	25 %	0 %	169834607
1028	NC_010379	AAAT	2	8	43030	43037	75 %	25 %	0 %	0 %	169834607
1029	NC_010379	TCTA	2	8	43043	43050	25 %	50 %	0 %	25 %	169834607
1030	NC_010379	ATT	2	6	43071	43076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834607
1031	NC_010379	ATT	2	6	43163	43168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834607
1032	NC_010379	A	6	6	43181	43186	100 %	0 %	0 %	0 %	169834607
1033	NC_010379	TA	3	6	43196	43201	50 %	50 %	0 %	0 %	169834607
1034	NC_010379	AT	3	6	43207	43212	50 %	50 %	0 %	0 %	169834607
1035	NC_010379	A	6	6	43232	43237	100 %	0 %	0 %	0 %	169834607
1036	NC_010379	ATT	2	6	43316	43321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834607
1037	NC_010379	AATT	2	8	43330	43337	50 %	50 %	0 %	0 %	169834607
1038	NC_010379	CAT	2	6	43372	43377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169834607
1039	NC_010379	AC	3	6	43426	43431	50 %	0 %	0 %	50 %	169834607
1040	NC_010379	CAT	2	6	43525	43530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169834607
1041	NC_010379	ATT	2	6	43571	43576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834607
1042	NC_010379	ATA	2	6	43599	43604	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834607
1043	NC_010379	TAT	2	6	43621	43626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834607
1044	NC_010379	TTA	2	6	43629	43634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834607
1045	NC_010379	TA	3	6	43663	43668	50 %	50 %	0 %	0 %	169834607
1046	NC_010379	TATT	2	8	43701	43708	25 %	75 %	0 %	0 %	169834607
1047	NC_010379	ATTT	2	8	43750	43757	25 %	75 %	0 %	0 %	169834607
1048	NC_010379	TA	3	6	43763	43768	50 %	50 %	0 %	0 %	169834607
1049	NC_010379	T	8	8	43779	43786	0 %	100 %	0 %	0 %	169834607
1050	NC_010379	TAT	2	6	43792	43797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834607
1051	NC_010379	T	7	7	43834	43840	0 %	100 %	0 %	0 %	169834607
1052	NC_010379	ATT	2	6	43874	43879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834607
1053	NC_010379	TAT	2	6	43882	43887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834607
1054	NC_010379	CTTTT	2	10	43955	43964	0 %	80 %	0 %	20 %	169834607
1055	NC_010379	AT	4	8	43970	43977	50 %	50 %	0 %	0 %	169834607
1056	NC_010379	TAT	2	6	43991	43996	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834607
1057	NC_010379	TTC	2	6	43997	44002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169834607
1058	NC_010379	TGCTTG	2	12	44006	44017	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	169834607
1059	NC_010379	CTA	2	6	44089	44094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169834607
1060	NC_010379	TAA	2	6	44155	44160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834607
1061	NC_010379	TTTTAT	2	12	44161	44172	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	169834607
1062	NC_010379	AT	3	6	44178	44183	50 %	50 %	0 %	0 %	169834607
1063	NC_010379	TAA	2	6	44189	44194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834607
1064	NC_010379	TAG	2	6	44237	44242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169834607
1065	NC_010379	TA	3	6	44321	44326	50 %	50 %	0 %	0 %	169834607
1066	NC_010379	AT	3	6	44341	44346	50 %	50 %	0 %	0 %	169834607
1067	NC_010379	TTA	2	6	44373	44378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834607
1068	NC_010379	AAT	2	6	44424	44429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834607
1069	NC_010379	TTA	2	6	44445	44450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834607
1070	NC_010379	A	7	7	44473	44479	100 %	0 %	0 %	0 %	169834607
1071	NC_010379	ATA	2	6	44500	44505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834607
1072	NC_010379	CAT	2	6	44509	44514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169834607
1073	NC_010379	T	8	8	44605	44612	0 %	100 %	0 %	0 %	169834607
1074	NC_010379	GTT	2	6	44620	44625	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169834607
1075	NC_010379	TTA	2	6	44698	44703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834607
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1077	NC_010379	TA	3	6	44747	44752	50 %	50 %	0 %	0 %	169834607
1078	NC_010379	TAT	2	6	44764	44769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834607
1079	NC_010379	ATTCT	2	10	44770	44779	20 %	60 %	0 %	20 %	169834607
1080	NC_010379	ATC	2	6	44795	44800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169834607
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1082	NC_010379	TTC	2	6	44924	44929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169834607
1083	NC_010379	TTTA	2	8	44939	44946	25 %	75 %	0 %	0 %	169834607
1084	NC_010379	AT	3	6	44992	44997	50 %	50 %	0 %	0 %	169834607
1085	NC_010379	TATAG	2	10	45011	45020	40 %	40 %	20 %	0 %	169834607
1086	NC_010379	TAA	2	6	45032	45037	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834607
1087	NC_010379	T	6	6	45039	45044	0 %	100 %	0 %	0 %	169834607
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1089	NC_010379	AAG	2	6	45076	45081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169834607
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1091	NC_010379	TA	3	6	45145	45150	50 %	50 %	0 %	0 %	169834607
1092	NC_010379	CTATA	2	10	45172	45181	40 %	40 %	0 %	20 %	169834607
1093	NC_010379	ATTTAT	2	12	45205	45216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834607
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1095	NC_010379	TA	4	8	45232	45239	50 %	50 %	0 %	0 %	169834607
1096	NC_010379	ATG	2	6	45354	45359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169834607
1097	NC_010379	TCC	2	6	45371	45376	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169834607
1098	NC_010379	TA	3	6	45382	45387	50 %	50 %	0 %	0 %	169834607
1099	NC_010379	TTC	2	6	45389	45394	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169834607
1100	NC_010379	A	6	6	45422	45427	100 %	0 %	0 %	0 %	169834607
1101	NC_010379	T	8	8	45428	45435	0 %	100 %	0 %	0 %	169834607
1102	NC_010379	ATC	2	6	45455	45460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169834607
1103	NC_010379	ATT	2	6	45578	45583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834607
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1105	NC_010379	ATT	2	6	45714	45719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834607
1106	NC_010379	T	7	7	45737	45743	0 %	100 %	0 %	0 %	169834607
1107	NC_010379	TTA	2	6	45774	45779	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834607
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1109	NC_010379	TAA	2	6	45866	45871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834607
1110	NC_010379	TGATT	2	10	45890	45899	20 %	60 %	20 %	0 %	169834607
1111	NC_010379	TTGT	2	8	45919	45926	0 %	75 %	25 %	0 %	169834607
1112	NC_010379	AT	3	6	45931	45936	50 %	50 %	0 %	0 %	169834607
1113	NC_010379	ATA	2	6	45971	45976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834607
1114	NC_010379	TTA	2	6	46011	46016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834607
1115	NC_010379	TAT	2	6	46055	46060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834607
1116	NC_010379	CAT	2	6	46127	46132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169834607
1117	NC_010379	AAT	2	6	46133	46138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834607
1118	NC_010379	ATT	3	9	46139	46147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834607
1119	NC_010379	ATT	2	6	46172	46177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834607
1120	NC_010379	ATT	3	9	46266	46274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834701
1121	NC_010379	ATC	2	6	46279	46284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169834701
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1124	NC_010379	AT	3	6	46361	46366	50 %	50 %	0 %	0 %	169834701
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1127	NC_010379	TAT	2	6	46421	46426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834701
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