MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis 434/Bu chromosome

Total Repeats: 20171

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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19002	NC_010287	GCA	2	6	980196	980201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	166154801
19003	NC_010287	A	7	7	980201	980207	100 %	0 %	0 %	0 %	166154801
19004	NC_010287	CTC	2	6	980211	980216	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	166154801
19005	NC_010287	GAA	3	9	980229	980237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154801
19006	NC_010287	GTC	2	6	980420	980425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	166154802
19007	NC_010287	GA	3	6	980443	980448	50 %	0 %	50 %	0 %	166154802
19008	NC_010287	TCA	2	6	980490	980495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	166154802
19009	NC_010287	GCGT	2	8	980519	980526	0 %	25 %	50 %	25 %	166154802
19010	NC_010287	TGAT	2	8	980697	980704	25 %	50 %	25 %	0 %	166154802
19011	NC_010287	GCT	2	6	980777	980782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	166154802
19012	NC_010287	TGG	2	6	980818	980823	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	166154802
19013	NC_010287	ATG	2	6	980852	980857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166154802
19014	NC_010287	TCA	2	6	980862	980867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	166154802
19015	NC_010287	ATGC	2	8	980876	980883	25 %	25 %	25 %	25 %	166154802
19016	NC_010287	A	8	8	980983	980990	100 %	0 %	0 %	0 %	166154802
19017	NC_010287	TGA	2	6	981025	981030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166154802
19018	NC_010287	AGA	2	6	981118	981123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154802
19019	NC_010287	GCT	2	6	981146	981151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	166154802
19020	NC_010287	TCT	2	6	981152	981157	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166154802
19021	NC_010287	ATG	2	6	981183	981188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166154802
19022	NC_010287	GAA	2	6	981272	981277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154802
19023	NC_010287	GAC	2	6	981338	981343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	166154802
19024	NC_010287	ATTG	2	8	981364	981371	25 %	50 %	25 %	0 %	166154802
19025	NC_010287	TCA	2	6	981408	981413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	166154802
19026	NC_010287	AACCA	2	10	981414	981423	60 %	0 %	0 %	40 %	166154802
19027	NC_010287	GCTAC	2	10	981477	981486	20 %	20 %	20 %	40 %	166154802
19028	NC_010287	AGA	2	6	981514	981519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154802
19029	NC_010287	TAC	2	6	981520	981525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	166154802
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19031	NC_010287	AATA	2	8	981834	981841	75 %	25 %	0 %	0 %	166154803
19032	NC_010287	CACG	2	8	981859	981866	25 %	0 %	25 %	50 %	166154803
19033	NC_010287	TG	3	6	981891	981896	0 %	50 %	50 %	0 %	166154803
19034	NC_010287	TAT	2	6	981902	981907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	166154803
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19036	NC_010287	TTTA	2	8	981998	982005	25 %	75 %	0 %	0 %	166154803
19037	NC_010287	ACA	2	6	982019	982024	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	166154803
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19039	NC_010287	CTG	2	6	982093	982098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	166154803
19040	NC_010287	A	7	7	982169	982175	100 %	0 %	0 %	0 %	166154803
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19043	NC_010287	TATT	2	8	982395	982402	25 %	75 %	0 %	0 %	166154803
19044	NC_010287	CT	3	6	982429	982434	0 %	50 %	0 %	50 %	166154803
19045	NC_010287	TC	3	6	982451	982456	0 %	50 %	0 %	50 %	166154803
19046	NC_010287	CAT	2	6	982466	982471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	166154803
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19049	NC_010287	TAC	2	6	982582	982587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	166154803
19050	NC_010287	C	6	6	982589	982594	0 %	0 %	0 %	100 %	166154803
19051	NC_010287	AT	3	6	982667	982672	50 %	50 %	0 %	0 %	166154803
19052	NC_010287	CT	3	6	982676	982681	0 %	50 %	0 %	50 %	166154803
19053	NC_010287	GAA	2	6	982713	982718	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154803
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19055	NC_010287	CGA	2	6	982746	982751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	166154803
19056	NC_010287	TTG	2	6	982775	982780	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	166154803
19057	NC_010287	T	6	6	982805	982810	0 %	100 %	0 %	0 %	166154803
19058	NC_010287	ATG	2	6	982857	982862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166154803
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19061	NC_010287	ATC	2	6	982921	982926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	166154803
19062	NC_010287	A	7	7	982984	982990	100 %	0 %	0 %	0 %	166154803
19063	NC_010287	GAA	2	6	983034	983039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154803
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19073	NC_010287	ACAG	2	8	983321	983328	50 %	0 %	25 %	25 %	166154803
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19090	NC_010287	AACA	2	8	984463	984470	75 %	0 %	0 %	25 %	166154804
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19093	NC_010287	CT	4	8	984581	984588	0 %	50 %	0 %	50 %	166154804
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19103	NC_010287	TC	3	6	985099	985104	0 %	50 %	0 %	50 %	166154804
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19487	NC_010287	CTT	2	6	1004322	1004327	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166154820
19488	NC_010287	ATC	2	6	1004355	1004360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	166154820
19489	NC_010287	A	6	6	1004363	1004368	100 %	0 %	0 %	0 %	166154820
19490	NC_010287	CTT	2	6	1004369	1004374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166154820
19491	NC_010287	ATCG	3	12	1004402	1004413	25 %	25 %	25 %	25 %	166154820
19492	NC_010287	TGC	2	6	1004426	1004431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	166154820
19493	NC_010287	TTTG	2	8	1004536	1004543	0 %	75 %	25 %	0 %	166154820
19494	NC_010287	AG	3	6	1004680	1004685	50 %	0 %	50 %	0 %	166154820
19495	NC_010287	CT	3	6	1004697	1004702	0 %	50 %	0 %	50 %	166154821
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19497	NC_010287	T	6	6	1004926	1004931	0 %	100 %	0 %	0 %	166154822
19498	NC_010287	TAAT	2	8	1004939	1004946	50 %	50 %	0 %	0 %	166154822
19499	NC_010287	GCAA	2	8	1005007	1005014	50 %	0 %	25 %	25 %	166154822
19500	NC_010287	GCA	2	6	1005065	1005070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	166154822

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