MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis 434/Bu chromosome

Total Repeats: 20171

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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14002	NC_010287	TAA	2	6	727569	727574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	166154568
14003	NC_010287	CGT	2	6	727597	727602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	166154568
14004	NC_010287	GTA	2	6	728068	728073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166154569
14005	NC_010287	ACC	2	6	728141	728146	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	166154569
14006	NC_010287	TCT	2	6	728193	728198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166154569
14007	NC_010287	ATT	2	6	728209	728214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	166154569
14008	NC_010287	CTTG	2	8	728226	728233	0 %	50 %	25 %	25 %	166154569
14009	NC_010287	TAG	2	6	728261	728266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166154569
14010	NC_010287	TCA	2	6	728323	728328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	166154569
14011	NC_010287	ACT	2	6	728340	728345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	166154569
14012	NC_010287	ACA	2	6	728374	728379	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	166154569
14013	NC_010287	ACA	2	6	728385	728390	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	166154569
14014	NC_010287	CTT	2	6	728445	728450	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532524926
14015	NC_010287	TCA	2	6	728456	728461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532524926
14016	NC_010287	TCT	2	6	728465	728470	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532524926
14017	NC_010287	ACA	2	6	728520	728525	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532524926
14018	NC_010287	TAT	2	6	728593	728598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532524926
14019	NC_010287	TCTCT	2	10	728682	728691	0 %	60 %	0 %	40 %	532524926
14020	NC_010287	AGA	2	6	728791	728796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532524926
14021	NC_010287	AGA	2	6	728845	728850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532524926
14022	NC_010287	TC	3	6	728868	728873	0 %	50 %	0 %	50 %	532524926
14023	NC_010287	CAC	2	6	728874	728879	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532524926
14024	NC_010287	TC	3	6	728880	728885	0 %	50 %	0 %	50 %	532524926
14025	NC_010287	ATC	2	6	728905	728910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532524926
14026	NC_010287	ATAA	2	8	729024	729031	75 %	25 %	0 %	0 %	166154570
14027	NC_010287	AG	3	6	729129	729134	50 %	0 %	50 %	0 %	166154570
14028	NC_010287	ATC	2	6	729216	729221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	166154570
14029	NC_010287	CAG	2	6	729313	729318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	166154570
14030	NC_010287	CA	3	6	729343	729348	50 %	0 %	0 %	50 %	166154570
14031	NC_010287	GAA	2	6	729368	729373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154570
14032	NC_010287	ACT	2	6	729396	729401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	166154570
14033	NC_010287	CT	4	8	729865	729872	0 %	50 %	0 %	50 %	166154571
14034	NC_010287	AT	3	6	729887	729892	50 %	50 %	0 %	0 %	166154571
14035	NC_010287	TTCT	2	8	729913	729920	0 %	75 %	0 %	25 %	166154571
14036	NC_010287	TTC	2	6	729949	729954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166154571
14037	NC_010287	CT	3	6	729967	729972	0 %	50 %	0 %	50 %	166154571
14038	NC_010287	TC	3	6	729994	729999	0 %	50 %	0 %	50 %	166154571
14039	NC_010287	A	6	6	730001	730006	100 %	0 %	0 %	0 %	166154571
14040	NC_010287	CTT	3	9	730014	730022	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166154571
14041	NC_010287	CACT	2	8	730079	730086	25 %	25 %	0 %	50 %	166154571
14042	NC_010287	CT	3	6	730097	730102	0 %	50 %	0 %	50 %	166154571
14043	NC_010287	A	6	6	730181	730186	100 %	0 %	0 %	0 %	166154571
14044	NC_010287	T	8	8	730212	730219	0 %	100 %	0 %	0 %	166154571
14045	NC_010287	AAT	2	6	730220	730225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	166154571
14046	NC_010287	TTCT	3	12	730321	730332	0 %	75 %	0 %	25 %	166154571
14047	NC_010287	CT	3	6	730331	730336	0 %	50 %	0 %	50 %	166154571
14048	NC_010287	CTG	2	6	730365	730370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	166154571
14049	NC_010287	AATG	2	8	730372	730379	50 %	25 %	25 %	0 %	166154571
14050	NC_010287	AGCA	2	8	730436	730443	50 %	0 %	25 %	25 %	166154571
14051	NC_010287	TCTCT	2	10	730714	730723	0 %	60 %	0 %	40 %	166154572
14052	NC_010287	TTC	2	6	730840	730845	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166154572
14053	NC_010287	GAC	2	6	730859	730864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	166154572
14054	NC_010287	GTC	2	6	730962	730967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	166154572
14055	NC_010287	AATC	2	8	731246	731253	50 %	25 %	0 %	25 %	166154572
14056	NC_010287	AAAC	2	8	731324	731331	75 %	0 %	0 %	25 %	166154572
14057	NC_010287	AAATA	2	10	731388	731397	80 %	20 %	0 %	0 %	166154572
14058	NC_010287	CGAA	2	8	731421	731428	50 %	0 %	25 %	25 %	166154572
14059	NC_010287	CT	3	6	731434	731439	0 %	50 %	0 %	50 %	166154572
14060	NC_010287	AGC	2	6	731442	731447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	166154572
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14062	NC_010287	TTA	2	6	731566	731571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	166154573
14063	NC_010287	AATTA	2	10	731574	731583	60 %	40 %	0 %	0 %	166154573
14064	NC_010287	AGCT	2	8	731661	731668	25 %	25 %	25 %	25 %	166154573
14065	NC_010287	CTT	2	6	731972	731977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166154573
14066	NC_010287	CT	3	6	732180	732185	0 %	50 %	0 %	50 %	166154573
14067	NC_010287	AG	3	6	732208	732213	50 %	0 %	50 %	0 %	166154573
14068	NC_010287	C	6	6	732228	732233	0 %	0 %	0 %	100 %	166154573
14069	NC_010287	TCT	2	6	732301	732306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166154573
14070	NC_010287	CCGC	2	8	732356	732363	0 %	0 %	25 %	75 %	166154573
14071	NC_010287	CAG	2	6	732430	732435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	166154573
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14073	NC_010287	CT	3	6	732623	732628	0 %	50 %	0 %	50 %	166154573
14074	NC_010287	AAC	3	9	732687	732695	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	166154573
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14076	NC_010287	TCG	2	6	732732	732737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	166154573
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14078	NC_010287	T	6	6	732794	732799	0 %	100 %	0 %	0 %	166154573
14079	NC_010287	CT	3	6	732818	732823	0 %	50 %	0 %	50 %	166154574
14080	NC_010287	TGA	2	6	732824	732829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166154574
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14082	NC_010287	CTC	2	6	732885	732890	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	166154574
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14088	NC_010287	TCT	2	6	733212	733217	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166154574
14089	NC_010287	ACATGC	2	12	733313	733324	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	166154574
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14093	NC_010287	A	6	6	733406	733411	100 %	0 %	0 %	0 %	166154574
14094	NC_010287	TTC	2	6	733417	733422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166154574
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14098	NC_010287	ACA	2	6	733574	733579	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	166154574
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14103	NC_010287	TCT	2	6	733899	733904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166154575
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14105	NC_010287	GGCTCT	2	12	734048	734059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	166154575
14106	NC_010287	CT	3	6	734069	734074	0 %	50 %	0 %	50 %	166154575
14107	NC_010287	CAT	2	6	734166	734171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	166154575
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14110	NC_010287	GCT	2	6	734201	734206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	166154575
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14112	NC_010287	AAT	2	6	734326	734331	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	166154575
14113	NC_010287	AGC	2	6	734366	734371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	166154575
14114	NC_010287	AAC	2	6	734419	734424	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	166154575
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14491	NC_010287	TTA	2	6	752653	752658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	166154590
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