MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis 434/Bu chromosome

Total Repeats: 20171

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_010287	ATC	2	6	598428	598433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	166154461
11502	NC_010287	TTC	2	6	598434	598439	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166154461
11503	NC_010287	GAA	2	6	598465	598470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154461
11504	NC_010287	GA	3	6	598490	598495	50 %	0 %	50 %	0 %	166154461
11505	NC_010287	AAAG	2	8	598522	598529	75 %	0 %	25 %	0 %	166154461
11506	NC_010287	ATA	2	6	598620	598625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	166154461
11507	NC_010287	CAT	2	6	598688	598693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	166154461
11508	NC_010287	TAA	2	6	598695	598700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	166154461
11509	NC_010287	GTT	2	6	598768	598773	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	166154461
11510	NC_010287	GAT	2	6	598801	598806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166154461
11511	NC_010287	TTC	2	6	598865	598870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166154461
11512	NC_010287	A	6	6	598876	598881	100 %	0 %	0 %	0 %	166154461
11513	NC_010287	TAAT	2	8	598943	598950	50 %	50 %	0 %	0 %	166154461
11514	NC_010287	TTC	2	6	598953	598958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166154461
11515	NC_010287	AGA	2	6	598989	598994	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154461
11516	NC_010287	TG	3	6	599034	599039	0 %	50 %	50 %	0 %	166154461
11517	NC_010287	GAA	2	6	599040	599045	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154461
11518	NC_010287	CTT	2	6	599048	599053	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166154461
11519	NC_010287	TCC	2	6	599223	599228	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	166154461
11520	NC_010287	CAG	2	6	599231	599236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	166154461
11521	NC_010287	GAA	2	6	599336	599341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154461
11522	NC_010287	CACGCG	2	12	599490	599501	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	166154461
11523	NC_010287	ATT	3	9	599514	599522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	166154461
11524	NC_010287	TTTCTT	2	12	599669	599680	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	166154461
11525	NC_010287	TCT	2	6	599793	599798	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166154462
11526	NC_010287	TGC	2	6	599816	599821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	166154462
11527	NC_010287	TGT	2	6	599825	599830	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	166154462
11528	NC_010287	TGTT	2	8	599844	599851	0 %	75 %	25 %	0 %	166154462
11529	NC_010287	TTG	2	6	599857	599862	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	166154462
11530	NC_010287	AGA	2	6	599881	599886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154462
11531	NC_010287	AAC	2	6	599939	599944	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	166154462
11532	NC_010287	CAT	2	6	599947	599952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	166154462
11533	NC_010287	CTT	2	6	599964	599969	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166154462
11534	NC_010287	GTT	2	6	599976	599981	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	166154462
11535	NC_010287	CAG	2	6	600009	600014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	166154462
11536	NC_010287	CTG	2	6	600022	600027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	166154462
11537	NC_010287	GAA	2	6	600057	600062	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154462
11538	NC_010287	TATC	2	8	600132	600139	25 %	50 %	0 %	25 %	166154462
11539	NC_010287	AGCT	2	8	600153	600160	25 %	25 %	25 %	25 %	166154462
11540	NC_010287	CTG	2	6	600319	600324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	166154462
11541	NC_010287	ACG	2	6	600358	600363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	166154462
11542	NC_010287	TAA	2	6	600421	600426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	166154462
11543	NC_010287	ATA	2	6	600428	600433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	166154462
11544	NC_010287	ATA	2	6	600483	600488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	166154462
11545	NC_010287	TGC	2	6	600490	600495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	166154462
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11548	NC_010287	GAG	2	6	600846	600851	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	166154462
11549	NC_010287	GTT	2	6	600856	600861	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	166154462
11550	NC_010287	TTC	2	6	600923	600928	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166154462
11551	NC_010287	TCT	2	6	601007	601012	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166154462
11552	NC_010287	AGT	2	6	601021	601026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166154462
11553	NC_010287	GCT	2	6	601053	601058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	166154462
11554	NC_010287	CCA	2	6	601085	601090	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	166154462
11555	NC_010287	CT	3	6	601097	601102	0 %	50 %	0 %	50 %	166154462
11556	NC_010287	TAT	2	6	601116	601121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	166154462
11557	NC_010287	ACA	2	6	601130	601135	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	166154462
11558	NC_010287	CT	3	6	601209	601214	0 %	50 %	0 %	50 %	166154462
11559	NC_010287	ATA	2	6	601252	601257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	166154462
11560	NC_010287	CT	3	6	601348	601353	0 %	50 %	0 %	50 %	166154462
11561	NC_010287	TCT	2	6	601388	601393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166154462
11562	NC_010287	GTA	2	6	601480	601485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166154462
11563	NC_010287	AC	3	6	601559	601564	50 %	0 %	0 %	50 %	166154462
11564	NC_010287	TCT	2	6	601565	601570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166154462
11565	NC_010287	ATTC	2	8	601599	601606	25 %	50 %	0 %	25 %	166154462
11566	NC_010287	ATG	2	6	601626	601631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166154462
11567	NC_010287	CTA	2	6	601722	601727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	166154462
11568	NC_010287	CTT	2	6	601785	601790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166154462
11569	NC_010287	AAG	2	6	601857	601862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154462
11570	NC_010287	CAG	2	6	601903	601908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	166154462
11571	NC_010287	CTC	2	6	601957	601962	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	166154462
11572	NC_010287	TAC	2	6	601981	601986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	166154462
11573	NC_010287	GCT	2	6	602031	602036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	166154462
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11575	NC_010287	ATA	2	6	602124	602129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	166154462
11576	NC_010287	CGTT	2	8	602131	602138	0 %	50 %	25 %	25 %	166154462
11577	NC_010287	ATTC	2	8	602140	602147	25 %	50 %	0 %	25 %	166154462
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11587	NC_010287	CTCC	2	8	603026	603033	0 %	25 %	0 %	75 %	166154463
11588	NC_010287	AAGC	2	8	603048	603055	50 %	0 %	25 %	25 %	166154463
11589	NC_010287	ATG	2	6	603065	603070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166154463
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11591	NC_010287	CTC	2	6	603127	603132	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	166154463
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11594	NC_010287	AG	3	6	603249	603254	50 %	0 %	50 %	0 %	166154463
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11604	NC_010287	CTCCTA	2	12	603831	603842	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	166154464
11605	NC_010287	AAC	2	6	603916	603921	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	166154464
11606	NC_010287	TC	3	6	604031	604036	0 %	50 %	0 %	50 %	166154464
11607	NC_010287	ATC	2	6	604056	604061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	166154464
11608	NC_010287	TGGC	2	8	604066	604073	0 %	25 %	50 %	25 %	166154464
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11612	NC_010287	TTG	2	6	604134	604139	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	166154464
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11614	NC_010287	AT	3	6	604177	604182	50 %	50 %	0 %	0 %	166154464
11615	NC_010287	TTG	2	6	604209	604214	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	166154465
11616	NC_010287	T	6	6	604241	604246	0 %	100 %	0 %	0 %	166154465
11617	NC_010287	CTTT	2	8	604399	604406	0 %	75 %	0 %	25 %	166154465
11618	NC_010287	T	7	7	604404	604410	0 %	100 %	0 %	0 %	166154465
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11983	NC_010287	ATC	2	6	622625	622630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	166154483
11984	NC_010287	CCA	2	6	622662	622667	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	166154483
11985	NC_010287	TTTC	2	8	622772	622779	0 %	75 %	0 %	25 %	166154483
11986	NC_010287	AGGA	2	8	622789	622796	50 %	0 %	50 %	0 %	166154483
11987	NC_010287	TCTTTT	2	12	622840	622851	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	166154483
11988	NC_010287	T	6	6	622848	622853	0 %	100 %	0 %	0 %	166154483
11989	NC_010287	GCA	2	6	622875	622880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	166154483
11990	NC_010287	CTC	2	6	622881	622886	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	166154483
11991	NC_010287	TCT	2	6	622929	622934	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166154483
11992	NC_010287	CACTT	2	10	622952	622961	20 %	40 %	0 %	40 %	166154483
11993	NC_010287	GAT	2	6	623002	623007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166154483
11994	NC_010287	GTT	2	6	623039	623044	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	166154483
11995	NC_010287	AGCA	2	8	623072	623079	50 %	0 %	25 %	25 %	166154483
11996	NC_010287	CAT	2	6	623083	623088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	166154483
11997	NC_010287	CTT	2	6	623116	623121	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166154483
11998	NC_010287	AAG	2	6	623125	623130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154483
11999	NC_010287	CAGA	2	8	623191	623198	50 %	0 %	25 %	25 %	166154483
12000	NC_010287	A	6	6	623244	623249	100 %	0 %	0 %	0 %	166154483

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