MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis 434/Bu chromosome

Total Repeats: 20171

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_010287	CAATC	2	10	418778	418787	40 %	20 %	0 %	40 %	166154305
8002	NC_010287	AGC	2	6	418789	418794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	166154305
8003	NC_010287	T	8	8	418798	418805	0 %	100 %	0 %	0 %	166154305
8004	NC_010287	AGG	2	6	418810	418815	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	166154305
8005	NC_010287	TCTTTT	2	12	418835	418846	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	166154305
8006	NC_010287	CT	3	6	418879	418884	0 %	50 %	0 %	50 %	166154305
8007	NC_010287	TTTGC	2	10	418912	418921	0 %	60 %	20 %	20 %	166154305
8008	NC_010287	TCT	2	6	418955	418960	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166154305
8009	NC_010287	TAA	2	6	418965	418970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	166154305
8010	NC_010287	ATG	2	6	419038	419043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166154305
8011	NC_010287	AG	3	6	419074	419079	50 %	0 %	50 %	0 %	166154305
8012	NC_010287	ATTCA	2	10	419176	419185	40 %	40 %	0 %	20 %	166154305
8013	NC_010287	AAT	2	6	419188	419193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	166154305
8014	NC_010287	TGGA	2	8	419225	419232	25 %	25 %	50 %	0 %	166154305
8015	NC_010287	GAA	2	6	419256	419261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154305
8016	NC_010287	AGC	2	6	419272	419277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	166154305
8017	NC_010287	CTCC	2	8	419282	419289	0 %	25 %	0 %	75 %	166154305
8018	NC_010287	TAA	2	6	419322	419327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	166154305
8019	NC_010287	TAA	2	6	419352	419357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	166154305
8020	NC_010287	ATT	2	6	419387	419392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	166154305
8021	NC_010287	TCT	2	6	419403	419408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166154305
8022	NC_010287	GATCC	2	10	419435	419444	20 %	20 %	20 %	40 %	166154305
8023	NC_010287	T	6	6	419472	419477	0 %	100 %	0 %	0 %	166154305
8024	NC_010287	GGA	2	6	419501	419506	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	166154305
8025	NC_010287	GA	3	6	419535	419540	50 %	0 %	50 %	0 %	166154305
8026	NC_010287	ATAC	2	8	419573	419580	50 %	25 %	0 %	25 %	166154305
8027	NC_010287	T	6	6	419602	419607	0 %	100 %	0 %	0 %	166154305
8028	NC_010287	T	7	7	419662	419668	0 %	100 %	0 %	0 %	166154305
8029	NC_010287	CAG	2	6	419769	419774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	166154305
8030	NC_010287	GGGGCT	2	12	419783	419794	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	166154305
8031	NC_010287	TCC	2	6	419806	419811	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	166154305
8032	NC_010287	ATT	2	6	419837	419842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	166154305
8033	NC_010287	GTTTT	2	10	419856	419865	0 %	80 %	20 %	0 %	166154305
8034	NC_010287	T	7	7	419862	419868	0 %	100 %	0 %	0 %	166154305
8035	NC_010287	TTA	2	6	420039	420044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	166154306
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8037	NC_010287	TCA	2	6	420091	420096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	166154306
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8039	NC_010287	G	8	8	420147	420154	0 %	0 %	100 %	0 %	166154306
8040	NC_010287	AG	4	8	420255	420262	50 %	0 %	50 %	0 %	166154306
8041	NC_010287	GCT	2	6	420341	420346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	166154306
8042	NC_010287	AAC	2	6	420368	420373	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	166154306
8043	NC_010287	A	7	7	420463	420469	100 %	0 %	0 %	0 %	166154306
8044	NC_010287	AAG	2	6	420540	420545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154306
8045	NC_010287	CTTC	2	8	420689	420696	0 %	50 %	0 %	50 %	166154306
8046	NC_010287	AG	3	6	420791	420796	50 %	0 %	50 %	0 %	166154306
8047	NC_010287	AGT	2	6	420802	420807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166154306
8048	NC_010287	A	6	6	420829	420834	100 %	0 %	0 %	0 %	166154306
8049	NC_010287	TCT	2	6	420835	420840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166154306
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8051	NC_010287	GATA	2	8	420869	420876	50 %	25 %	25 %	0 %	166154306
8052	NC_010287	TCTT	2	8	420880	420887	0 %	75 %	0 %	25 %	166154306
8053	NC_010287	GAC	2	6	420971	420976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	166154306
8054	NC_010287	GAAT	2	8	421004	421011	50 %	25 %	25 %	0 %	166154306
8055	NC_010287	AAGCT	2	10	421060	421069	40 %	20 %	20 %	20 %	166154306
8056	NC_010287	A	6	6	421081	421086	100 %	0 %	0 %	0 %	166154306
8057	NC_010287	A	6	6	421144	421149	100 %	0 %	0 %	0 %	166154306
8058	NC_010287	T	8	8	421188	421195	0 %	100 %	0 %	0 %	166154306
8059	NC_010287	CCA	2	6	421219	421224	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	166154306
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8061	NC_010287	TCT	2	6	421357	421362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166154306
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8063	NC_010287	GAG	2	6	421423	421428	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	166154306
8064	NC_010287	AG	3	6	421477	421482	50 %	0 %	50 %	0 %	166154306
8065	NC_010287	AGA	2	6	421497	421502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154306
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8069	NC_010287	TGA	2	6	421636	421641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166154306
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8083	NC_010287	ATAGC	2	10	422112	422121	40 %	20 %	20 %	20 %	166154307
8084	NC_010287	CGA	2	6	422130	422135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	166154307
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8114	NC_010287	GA	3	6	423542	423547	50 %	0 %	50 %	0 %	166154308
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8119	NC_010287	GA	3	6	423789	423794	50 %	0 %	50 %	0 %	166154308
8120	NC_010287	TATC	2	8	423830	423837	25 %	50 %	0 %	25 %	166154308
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8494	NC_010287	GAA	2	6	442953	442958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154326
8495	NC_010287	CGC	2	6	442982	442987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	166154326
8496	NC_010287	TGC	2	6	443000	443005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	166154326
8497	NC_010287	CTG	2	6	443008	443013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	166154326
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8500	NC_010287	GTA	2	6	443238	443243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166154326

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