MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis L2b/UCH-1/proctitis chromosome

Total Repeats: 19991

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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16002	NC_010280	AGA	2	6	833488	833493	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166155534
16003	NC_010280	CTT	2	6	833513	833518	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166155534
16004	NC_010280	ACA	2	6	833542	833547	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	166155534
16005	NC_010280	TAA	2	6	833582	833587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	166155534
16006	NC_010280	CTC	2	6	833588	833593	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	166155534
16007	NC_010280	AAG	2	6	833622	833627	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166155534
16008	NC_010280	GTA	2	6	833655	833660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166155534
16009	NC_010280	AG	3	6	833674	833679	50 %	0 %	50 %	0 %	166155534
16010	NC_010280	GAA	2	6	833680	833685	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166155534
16011	NC_010280	CT	3	6	833739	833744	0 %	50 %	0 %	50 %	166155534
16012	NC_010280	CTT	2	6	833923	833928	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166155534
16013	NC_010280	T	6	6	833927	833932	0 %	100 %	0 %	0 %	166155534
16014	NC_010280	A	6	6	833953	833958	100 %	0 %	0 %	0 %	166155534
16015	NC_010280	TTCT	2	8	833970	833977	0 %	75 %	0 %	25 %	166155534
16016	NC_010280	AGA	2	6	834006	834011	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166155534
16017	NC_010280	CCCA	2	8	834040	834047	25 %	0 %	0 %	75 %	166155534
16018	NC_010280	AGA	2	6	834060	834065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166155534
16019	NC_010280	ATC	2	6	834131	834136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	166155534
16020	NC_010280	ACGAC	2	10	834216	834225	40 %	0 %	20 %	40 %	166155534
16021	NC_010280	CTCTT	2	10	834299	834308	0 %	60 %	0 %	40 %	166155534
16022	NC_010280	TCC	2	6	834353	834358	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	166155534
16023	NC_010280	CCGC	2	8	834382	834389	0 %	0 %	25 %	75 %	166155534
16024	NC_010280	GAG	2	6	834406	834411	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	166155534
16025	NC_010280	T	6	6	834461	834466	0 %	100 %	0 %	0 %	166155534
16026	NC_010280	CTC	2	6	834508	834513	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	166155534
16027	NC_010280	CAC	2	6	834546	834551	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	166155534
16028	NC_010280	CTCTAT	2	12	835008	835019	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	166155535
16029	NC_010280	TC	3	6	835074	835079	0 %	50 %	0 %	50 %	166155535
16030	NC_010280	CTTC	2	8	835111	835118	0 %	50 %	0 %	50 %	166155535
16031	NC_010280	TCT	2	6	835222	835227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166155535
16032	NC_010280	AGT	2	6	835379	835384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166155535
16033	NC_010280	TCT	2	6	835402	835407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166155535
16034	NC_010280	ATAG	2	8	835421	835428	50 %	25 %	25 %	0 %	166155535
16035	NC_010280	TCT	2	6	835503	835508	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166155535
16036	NC_010280	TGC	2	6	835509	835514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	166155535
16037	NC_010280	TGAACT	2	12	835515	835526	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	166155535
16038	NC_010280	TTG	2	6	835550	835555	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	166155535
16039	NC_010280	CAA	2	6	836007	836012	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	166155536
16040	NC_010280	ATA	2	6	836041	836046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	166155536
16041	NC_010280	TC	3	6	836139	836144	0 %	50 %	0 %	50 %	166155536
16042	NC_010280	TAA	2	6	836181	836186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	166155536
16043	NC_010280	AGA	2	6	836219	836224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166155536
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16045	NC_010280	GA	3	6	836294	836299	50 %	0 %	50 %	0 %	166155536
16046	NC_010280	ATCC	2	8	836301	836308	25 %	25 %	0 %	50 %	166155536
16047	NC_010280	CAT	2	6	836336	836341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	166155536
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16050	NC_010280	TCT	2	6	836401	836406	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166155536
16051	NC_010280	A	6	6	836451	836456	100 %	0 %	0 %	0 %	166155536
16052	NC_010280	GAA	2	6	836471	836476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166155536
16053	NC_010280	TAA	2	6	836481	836486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	166155536
16054	NC_010280	AAT	2	6	836541	836546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	166155536
16055	NC_010280	AAT	2	6	836586	836591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	166155536
16056	NC_010280	CAG	2	6	836726	836731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	166155536
16057	NC_010280	TAATTC	2	12	836837	836848	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	166155536
16058	NC_010280	CGA	2	6	836859	836864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	166155536
16059	NC_010280	T	6	6	836902	836907	0 %	100 %	0 %	0 %	166155536
16060	NC_010280	TC	3	6	836966	836971	0 %	50 %	0 %	50 %	166155536
16061	NC_010280	A	6	6	837019	837024	100 %	0 %	0 %	0 %	166155536
16062	NC_010280	AAG	2	6	837050	837055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166155536
16063	NC_010280	CTG	2	6	837060	837065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	166155536
16064	NC_010280	TTC	2	6	837072	837077	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166155536
16065	NC_010280	ACTCCT	2	12	837106	837117	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	166155536
16066	NC_010280	TGCAA	2	10	837168	837177	40 %	20 %	20 %	20 %	166155536
16067	NC_010280	CTG	2	6	837260	837265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	166155536
16068	NC_010280	GCA	2	6	837308	837313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	166155536
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16071	NC_010280	TGT	2	6	837343	837348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	166155536
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16074	NC_010280	GAG	2	6	837544	837549	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	166155536
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16080	NC_010280	CAA	2	6	842552	842557	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	166155538
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16088	NC_010280	GCA	2	6	843563	843568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	166155539
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16090	NC_010280	ACA	2	6	843647	843652	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	166155539
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16092	NC_010280	ATTA	2	8	843709	843716	50 %	50 %	0 %	0 %	166155539
16093	NC_010280	A	7	7	843775	843781	100 %	0 %	0 %	0 %	166155539
16094	NC_010280	CAA	2	6	843991	843996	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	166155539
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16102	NC_010280	TTCT	2	8	844341	844348	0 %	75 %	0 %	25 %	166155540
16103	NC_010280	CTT	2	6	844349	844354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166155540
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16105	NC_010280	TCC	2	6	844465	844470	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	166155540
16106	NC_010280	TGG	2	6	844518	844523	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	166155540
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16108	NC_010280	CTT	2	6	844571	844576	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166155540
16109	NC_010280	A	6	6	844593	844598	100 %	0 %	0 %	0 %	166155540
16110	NC_010280	AGT	2	6	844631	844636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166155540
16111	NC_010280	ATCT	2	8	844661	844668	25 %	50 %	0 %	25 %	166155540
16112	NC_010280	CTT	2	6	844677	844682	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166155540
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16117	NC_010280	GAT	2	6	844939	844944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166155540
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16119	NC_010280	AAG	2	6	845082	845087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166155541
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16121	NC_010280	CCT	2	6	845114	845119	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	166155541
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16241	NC_010280	TGC	3	9	850495	850503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	166155545
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16484	NC_010280	AT	3	6	861736	861741	50 %	50 %	0 %	0 %	166155557
16485	NC_010280	GAAAA	2	10	861766	861775	80 %	0 %	20 %	0 %	166155557
16486	NC_010280	T	6	6	861783	861788	0 %	100 %	0 %	0 %	166155557
16487	NC_010280	CTA	2	6	861811	861816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	166155557
16488	NC_010280	TGC	2	6	861839	861844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	166155557
16489	NC_010280	GAA	2	6	861914	861919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166155557
16490	NC_010280	CCA	2	6	861941	861946	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	166155557
16491	NC_010280	ACAAGA	2	12	862016	862027	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	166155557
16492	NC_010280	GGA	2	6	862041	862046	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	166155557
16493	NC_010280	CCCT	2	8	862054	862061	0 %	25 %	0 %	75 %	166155557
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16495	NC_010280	TCCC	2	8	862171	862178	0 %	25 %	0 %	75 %	166155557
16496	NC_010280	AGA	2	6	862193	862198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166155557
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16500	NC_010280	CT	3	6	862326	862331	0 %	50 %	0 %	50 %	166155557

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