MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis L2b/UCH-1/proctitis chromosome

Total Repeats: 19991

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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14002	NC_010280	ACATGC	2	12	733345	733356	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	166155449
14003	NC_010280	ACA	2	6	733367	733372	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	166155449
14004	NC_010280	ACA	2	6	733407	733412	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	166155449
14005	NC_010280	TAA	2	6	733424	733429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	166155449
14006	NC_010280	A	6	6	733438	733443	100 %	0 %	0 %	0 %	166155449
14007	NC_010280	TTC	2	6	733449	733454	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166155449
14008	NC_010280	AGT	2	6	733563	733568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166155449
14009	NC_010280	CTG	2	6	733571	733576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	166155449
14010	NC_010280	GAAG	2	8	733591	733598	50 %	0 %	50 %	0 %	166155449
14011	NC_010280	ACA	2	6	733606	733611	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	166155449
14012	NC_010280	AACGC	2	10	733709	733718	40 %	0 %	20 %	40 %	166155449
14013	NC_010280	AGA	2	6	733728	733733	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166155449
14014	NC_010280	CAA	2	6	733796	733801	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	166155449
14015	NC_010280	AAAC	2	8	733869	733876	75 %	0 %	0 %	25 %	166155450
14016	NC_010280	TCT	2	6	733931	733936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166155450
14017	NC_010280	A	6	6	733961	733966	100 %	0 %	0 %	0 %	166155450
14018	NC_010280	GGCTCT	2	12	734080	734091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	166155450
14019	NC_010280	CT	3	6	734101	734106	0 %	50 %	0 %	50 %	166155450
14020	NC_010280	CAT	2	6	734198	734203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	166155450
14021	NC_010280	AAG	2	6	734204	734209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166155450
14022	NC_010280	GCA	2	6	734224	734229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	166155450
14023	NC_010280	GCT	2	6	734233	734238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	166155450
14024	NC_010280	ACA	3	9	734281	734289	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	166155450
14025	NC_010280	AAT	2	6	734358	734363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	166155450
14026	NC_010280	AGC	2	6	734398	734403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	166155450
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14028	NC_010280	TCT	2	6	734478	734483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166155450
14029	NC_010280	A	6	6	734500	734505	100 %	0 %	0 %	0 %	166155450
14030	NC_010280	GAC	2	6	734513	734518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	166155450
14031	NC_010280	T	7	7	734579	734585	0 %	100 %	0 %	0 %	166155450
14032	NC_010280	ATA	2	6	734587	734592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	166155450
14033	NC_010280	CAA	2	6	734830	734835	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	166155451
14034	NC_010280	ATG	2	6	734844	734849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166155451
14035	NC_010280	TCT	2	6	734850	734855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166155451
14036	NC_010280	CTC	2	6	734995	735000	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	166155451
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14038	NC_010280	TCTT	2	8	735110	735117	0 %	75 %	0 %	25 %	166155451
14039	NC_010280	AACT	2	8	735182	735189	50 %	25 %	0 %	25 %	166155451
14040	NC_010280	CTT	2	6	735209	735214	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166155451
14041	NC_010280	AAGC	2	8	735218	735225	50 %	0 %	25 %	25 %	166155451
14042	NC_010280	TAT	2	6	735250	735255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	166155451
14043	NC_010280	GC	3	6	735272	735277	0 %	0 %	50 %	50 %	166155451
14044	NC_010280	CTTCT	2	10	735289	735298	0 %	60 %	0 %	40 %	166155451
14045	NC_010280	TGA	2	6	735333	735338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166155451
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14048	NC_010280	CAG	2	6	735424	735429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	166155451
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14052	NC_010280	TGC	2	6	735530	735535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	166155451
14053	NC_010280	GAAG	2	8	735567	735574	50 %	0 %	50 %	0 %	166155451
14054	NC_010280	CT	3	6	735581	735586	0 %	50 %	0 %	50 %	166155451
14055	NC_010280	ACC	2	6	735597	735602	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	166155451
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14057	NC_010280	CAA	2	6	735664	735669	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	166155451
14058	NC_010280	ATCTTG	2	12	735674	735685	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	166155451
14059	NC_010280	TG	3	6	735722	735727	0 %	50 %	50 %	0 %	166155451
14060	NC_010280	AGG	2	6	735770	735775	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	166155451
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14062	NC_010280	TCT	2	6	735924	735929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166155451
14063	NC_010280	T	7	7	735956	735962	0 %	100 %	0 %	0 %	166155451
14064	NC_010280	CTC	2	6	736012	736017	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	166155451
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14073	NC_010280	CG	3	6	736770	736775	0 %	0 %	50 %	50 %	166155452
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14085	NC_010280	TCTT	2	8	737313	737320	0 %	75 %	0 %	25 %	166155452
14086	NC_010280	GGA	2	6	737349	737354	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	166155452
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14089	NC_010280	CT	3	6	737430	737435	0 %	50 %	0 %	50 %	166155452
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14092	NC_010280	CTTCT	2	10	737496	737505	0 %	60 %	0 %	40 %	166155452
14093	NC_010280	TTA	2	6	737508	737513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	166155452
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14100	NC_010280	A	6	6	737731	737736	100 %	0 %	0 %	0 %	166155452
14101	NC_010280	GGT	2	6	737739	737744	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	166155452
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14106	NC_010280	ATAA	2	8	737901	737908	75 %	25 %	0 %	0 %	166155452
14107	NC_010280	CTTC	2	8	737989	737996	0 %	50 %	0 %	50 %	166155452
14108	NC_010280	T	7	7	738048	738054	0 %	100 %	0 %	0 %	166155453
14109	NC_010280	CTT	2	6	738067	738072	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166155453
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14114	NC_010280	ACA	2	6	738303	738308	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	166155453
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14118	NC_010280	GA	3	6	738441	738446	50 %	0 %	50 %	0 %	166155453
14119	NC_010280	T	6	6	738468	738473	0 %	100 %	0 %	0 %	166155453
14120	NC_010280	AG	3	6	738483	738488	50 %	0 %	50 %	0 %	166155453
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14122	NC_010280	CGT	2	6	738562	738567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	166155454
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14247	NC_010280	ATTT	2	8	744187	744194	25 %	75 %	0 %	0 %	166155458
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14487	NC_010280	CCT	2	6	756877	756882	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	166155470
14488	NC_010280	GAT	2	6	756920	756925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166155470
14489	NC_010280	AAT	2	6	756934	756939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	166155470
14490	NC_010280	TTC	2	6	756951	756956	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166155470
14491	NC_010280	CTTCT	2	10	757067	757076	0 %	60 %	0 %	40 %	166155470
14492	NC_010280	GCA	2	6	757153	757158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	166155470
14493	NC_010280	AGA	2	6	757185	757190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166155470
14494	NC_010280	GC	3	6	757216	757221	0 %	0 %	50 %	50 %	166155470
14495	NC_010280	CATA	2	8	757238	757245	50 %	25 %	0 %	25 %	166155470
14496	NC_010280	ATC	2	6	757284	757289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	166155470
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14498	NC_010280	GAA	2	6	757375	757380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166155470
14499	NC_010280	T	7	7	757390	757396	0 %	100 %	0 %	0 %	166155470
14500	NC_010280	AGA	2	6	757399	757404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166155470

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