MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis L2b/UCH-1/proctitis chromosome

Total Repeats: 19991

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_010280	CAT	2	6	602494	602499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	166155338
11502	NC_010280	T	9	9	602499	602507	0 %	100 %	0 %	0 %	166155338
11503	NC_010280	TTC	2	6	602583	602588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166155338
11504	NC_010280	GT	3	6	602607	602612	0 %	50 %	50 %	0 %	166155338
11505	NC_010280	CTG	2	6	602663	602668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	166155338
11506	NC_010280	CCA	2	6	602788	602793	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	166155338
11507	NC_010280	A	6	6	602798	602803	100 %	0 %	0 %	0 %	166155338
11508	NC_010280	CAC	2	6	602979	602984	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	166155338
11509	NC_010280	CCT	2	6	603013	603018	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	166155338
11510	NC_010280	CTCC	2	8	603061	603068	0 %	25 %	0 %	75 %	166155338
11511	NC_010280	AAGC	2	8	603083	603090	50 %	0 %	25 %	25 %	166155338
11512	NC_010280	ATG	2	6	603100	603105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166155338
11513	NC_010280	T	6	6	603156	603161	0 %	100 %	0 %	0 %	166155338
11514	NC_010280	CTC	2	6	603162	603167	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	166155338
11515	NC_010280	GAT	2	6	603211	603216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166155338
11516	NC_010280	A	7	7	603217	603223	100 %	0 %	0 %	0 %	166155338
11517	NC_010280	AG	3	6	603284	603289	50 %	0 %	50 %	0 %	166155338
11518	NC_010280	CTT	2	6	603587	603592	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166155339
11519	NC_010280	ACT	2	6	603616	603621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	166155339
11520	NC_010280	GCTGT	2	10	603629	603638	0 %	40 %	40 %	20 %	166155339
11521	NC_010280	GTC	2	6	603697	603702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	166155339
11522	NC_010280	T	6	6	603716	603721	0 %	100 %	0 %	0 %	166155339
11523	NC_010280	ACT	2	6	603744	603749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	166155339
11524	NC_010280	ACT	2	6	603813	603818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	166155339
11525	NC_010280	TGC	2	6	603849	603854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	166155339
11526	NC_010280	T	7	7	603859	603865	0 %	100 %	0 %	0 %	166155339
11527	NC_010280	CTCCTA	2	12	603866	603877	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	166155339
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11530	NC_010280	ATC	2	6	604091	604096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	166155339
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11533	NC_010280	AG	3	6	604162	604167	50 %	0 %	50 %	0 %	166155339
11534	NC_010280	TTG	2	6	604169	604174	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	166155339
11535	NC_010280	ACT	2	6	604202	604207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	166155339
11536	NC_010280	AT	3	6	604212	604217	50 %	50 %	0 %	0 %	166155339
11537	NC_010280	TTG	2	6	604244	604249	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	166155340
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11539	NC_010280	CTTT	2	8	604434	604441	0 %	75 %	0 %	25 %	166155340
11540	NC_010280	T	7	7	604439	604445	0 %	100 %	0 %	0 %	166155340
11541	NC_010280	GAA	2	6	604493	604498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166155340
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11543	NC_010280	ATT	2	6	604587	604592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	166155340
11544	NC_010280	AAC	2	6	604622	604627	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	166155340
11545	NC_010280	GAA	2	6	604651	604656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166155340
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11552	NC_010280	TCTTT	2	10	604877	604886	0 %	80 %	0 %	20 %	166155340
11553	NC_010280	TTTA	2	8	604897	604904	25 %	75 %	0 %	0 %	166155340
11554	NC_010280	CGC	2	6	604923	604928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	166155340
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11557	NC_010280	T	6	6	605202	605207	0 %	100 %	0 %	0 %	166155341
11558	NC_010280	TTC	2	6	605233	605238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166155341
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11564	NC_010280	TA	3	6	605467	605472	50 %	50 %	0 %	0 %	166155341
11565	NC_010280	TTC	2	6	605569	605574	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166155341
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11570	NC_010280	TCT	2	6	605956	605961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166155342
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11574	NC_010280	GTC	2	6	606313	606318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	166155342
11575	NC_010280	CTAT	2	8	606329	606336	25 %	50 %	0 %	25 %	166155342
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11586	NC_010280	GATT	2	8	606685	606692	25 %	50 %	25 %	0 %	166155342
11587	NC_010280	TGA	2	6	606722	606727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166155342
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11591	NC_010280	CTA	2	6	606844	606849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	166155342
11592	NC_010280	TG	3	6	606969	606974	0 %	50 %	50 %	0 %	166155342
11593	NC_010280	TA	3	6	606984	606989	50 %	50 %	0 %	0 %	166155342
11594	NC_010280	AACT	2	8	607005	607012	50 %	25 %	0 %	25 %	166155342
11595	NC_010280	CCT	2	6	607038	607043	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	166155343
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11603	NC_010280	AATT	2	8	607322	607329	50 %	50 %	0 %	0 %	166155343
11604	NC_010280	TC	3	6	607340	607345	0 %	50 %	0 %	50 %	166155343
11605	NC_010280	A	6	6	607358	607363	100 %	0 %	0 %	0 %	166155343
11606	NC_010280	TCA	2	6	607530	607535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	166155343
11607	NC_010280	TCGT	2	8	607670	607677	0 %	50 %	25 %	25 %	166155343
11608	NC_010280	A	6	6	607746	607751	100 %	0 %	0 %	0 %	166155343
11609	NC_010280	TGT	2	6	607779	607784	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	166155343
11610	NC_010280	TCAT	2	8	607829	607836	25 %	50 %	0 %	25 %	166155343
11611	NC_010280	ATA	2	6	607886	607891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	166155343
11612	NC_010280	CTT	2	6	607982	607987	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166155343
11613	NC_010280	GAAC	2	8	607993	608000	50 %	0 %	25 %	25 %	166155343
11614	NC_010280	AC	3	6	608012	608017	50 %	0 %	0 %	50 %	166155343
11615	NC_010280	ATT	2	6	608047	608052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	166155343
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11984	NC_010280	GAA	2	6	626727	626732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166155362
11985	NC_010280	TG	3	6	626835	626840	0 %	50 %	50 %	0 %	166155362
11986	NC_010280	TG	3	6	626857	626862	0 %	50 %	50 %	0 %	166155362
11987	NC_010280	TTC	2	6	626950	626955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166155363
11988	NC_010280	AGAA	2	8	626983	626990	75 %	0 %	25 %	0 %	166155363
11989	NC_010280	CTG	2	6	627003	627008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	166155363
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11991	NC_010280	TC	3	6	627091	627096	0 %	50 %	0 %	50 %	166155363
11992	NC_010280	GAA	2	6	627107	627112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166155363
11993	NC_010280	AGC	2	6	627160	627165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	166155363
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11995	NC_010280	TAC	2	6	627360	627365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	166155363
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