MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chloroflexus aurantiacus J-10-fl chromosome

Total Repeats: 83160

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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21002	NC_010175	GCA	2	6	1370936	1370941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163846563
21003	NC_010175	TCGGC	2	10	1371005	1371014	0 %	20 %	40 %	40 %	163846563
21004	NC_010175	CTC	2	6	1371024	1371029	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	163846563
21005	NC_010175	GTT	2	6	1371103	1371108	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163846563
21006	NC_010175	AGT	2	6	1371200	1371205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163846563
21007	NC_010175	GTC	2	6	1371267	1371272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163846563
21008	NC_010175	GTA	2	6	1371354	1371359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163846563
21009	NC_010175	GGC	2	6	1371381	1371386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163846563
21010	NC_010175	ATC	2	6	1371441	1371446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163846563
21011	NC_010175	AAC	2	6	1371535	1371540	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163846563
21012	NC_010175	CCG	2	6	1371551	1371556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163846563
21013	NC_010175	TAT	2	6	1371887	1371892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	163846564
21014	NC_010175	GTC	2	6	1371934	1371939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163846564
21015	NC_010175	TTG	2	6	1371943	1371948	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163846564
21016	NC_010175	GACC	2	8	1371968	1371975	25 %	0 %	25 %	50 %	163846564
21017	NC_010175	CTGGCC	2	12	1371978	1371989	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	163846564
21018	NC_010175	GCG	2	6	1371995	1372000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163846564
21019	NC_010175	CGA	2	6	1372001	1372006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163846564
21020	NC_010175	TGT	2	6	1372022	1372027	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163846564
21021	NC_010175	GTC	2	6	1372033	1372038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163846564
21022	NC_010175	AGA	2	6	1372064	1372069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163846564
21023	NC_010175	GAT	2	6	1372235	1372240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163846564
21024	NC_010175	CGG	2	6	1372246	1372251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163846564
21025	NC_010175	TCA	2	6	1372259	1372264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163846564
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21028	NC_010175	CGA	2	6	1372370	1372375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163846564
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21031	NC_010175	TGA	2	6	1372489	1372494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163846565
21032	NC_010175	CGC	2	6	1372568	1372573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163846565
21033	NC_010175	TCTG	2	8	1372577	1372584	0 %	50 %	25 %	25 %	163846565
21034	NC_010175	CCG	2	6	1372608	1372613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163846565
21035	NC_010175	CTG	2	6	1372638	1372643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163846565
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21037	NC_010175	CTG	2	6	1372671	1372676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163846565
21038	NC_010175	TGA	2	6	1372777	1372782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163846565
21039	NC_010175	GCTG	2	8	1372876	1372883	0 %	25 %	50 %	25 %	163846565
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21049	NC_010175	GCTGGT	2	12	1373745	1373756	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	163846566
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21052	NC_010175	CAT	2	6	1374012	1374017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163846566
21053	NC_010175	CGA	2	6	1374045	1374050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163846566
21054	NC_010175	CAA	2	6	1374213	1374218	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163846566
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21063	NC_010175	GCA	2	6	1374734	1374739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163846566
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21069	NC_010175	TGA	3	9	1375109	1375117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163846567
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21115	NC_010175	GGCA	2	8	1378021	1378028	25 %	0 %	50 %	25 %	163846570
21116	NC_010175	GCC	2	6	1378066	1378071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163846570
21117	NC_010175	ACA	2	6	1378080	1378085	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163846570
21118	NC_010175	ACCCAG	2	12	1378099	1378110	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	163846570
21119	NC_010175	ATTG	2	8	1378141	1378148	25 %	50 %	25 %	0 %	163846570
21120	NC_010175	TGC	2	6	1378161	1378166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163846570
21121	NC_010175	GGC	2	6	1378244	1378249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163846570
21122	NC_010175	GCCGG	2	10	1378256	1378265	0 %	0 %	60 %	40 %	163846570
21123	NC_010175	ATG	2	6	1378283	1378288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163846570
21124	NC_010175	CGG	3	9	1378388	1378396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163846571
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21126	NC_010175	CGG	2	6	1378552	1378557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163846571
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21128	NC_010175	TGA	2	6	1378769	1378774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163846571
21129	NC_010175	CTG	2	6	1378776	1378781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163846571
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21131	NC_010175	GAT	2	6	1378838	1378843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163846571
21132	NC_010175	CTT	2	6	1378850	1378855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163846571
21133	NC_010175	CTT	2	6	1378862	1378867	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163846571
21134	NC_010175	CGG	2	6	1378868	1378873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163846571
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21143	NC_010175	CGA	2	6	1379255	1379260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163846571
21144	NC_010175	CGC	2	6	1379336	1379341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163846571
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21200	NC_010175	GACC	2	8	1382377	1382384	25 %	0 %	25 %	50 %	163846574
21201	NC_010175	GC	4	8	1382397	1382404	0 %	0 %	50 %	50 %	163846574
21202	NC_010175	CG	4	8	1382419	1382426	0 %	0 %	50 %	50 %	163846574
21203	NC_010175	CCGAC	2	10	1382427	1382436	20 %	0 %	20 %	60 %	163846574
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21212	NC_010175	TGC	2	6	1383007	1383012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163846575
21213	NC_010175	GGC	2	6	1383017	1383022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163846575
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21215	NC_010175	GTG	2	6	1383036	1383041	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163846575
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21217	NC_010175	CGGA	2	8	1383067	1383074	25 %	0 %	50 %	25 %	163846575
21218	NC_010175	CGG	2	6	1383118	1383123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163846575
21219	NC_010175	CAC	2	6	1383140	1383145	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163846575
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21222	NC_010175	ATCA	2	8	1383263	1383270	50 %	25 %	0 %	25 %	163846575
21223	NC_010175	CCG	2	6	1383304	1383309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163846575
21224	NC_010175	CCA	2	6	1383325	1383330	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163846575
21225	NC_010175	GC	3	6	1383345	1383350	0 %	0 %	50 %	50 %	163846575
21226	NC_010175	CTG	2	6	1383494	1383499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163846575
21227	NC_010175	GCA	2	6	1383501	1383506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163846575
21228	NC_010175	TGCCG	2	10	1383516	1383525	0 %	20 %	40 %	40 %	163846575
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21230	NC_010175	GCC	2	6	1383576	1383581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163846575
21231	NC_010175	GGCC	2	8	1383601	1383608	0 %	0 %	50 %	50 %	163846575
21232	NC_010175	GCC	3	9	1383654	1383662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163846575
21233	NC_010175	CCG	2	6	1383685	1383690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163846575
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21235	NC_010175	CG	3	6	1383761	1383766	0 %	0 %	50 %	50 %	163846575
21236	NC_010175	GCT	2	6	1383778	1383783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163846575
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21340	NC_010175	TCG	2	6	1391669	1391674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163846581
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21347	NC_010175	CGG	2	6	1392037	1392042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163846582
21348	NC_010175	TGC	2	6	1392094	1392099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163846582
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21460	NC_010175	GATC	2	8	1399005	1399012	25 %	25 %	25 %	25 %	163846588
21461	NC_010175	CAC	2	6	1399201	1399206	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163846588
21462	NC_010175	GGT	2	6	1399341	1399346	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163846588
21463	NC_010175	GTC	2	6	1399484	1399489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163846588
21464	NC_010175	ATTG	2	8	1399736	1399743	25 %	50 %	25 %	0 %	163846589
21465	NC_010175	CAC	2	6	1399856	1399861	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163846589
21466	NC_010175	GC	3	6	1399876	1399881	0 %	0 %	50 %	50 %	163846589
21467	NC_010175	ATG	2	6	1400035	1400040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163846589
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21471	NC_010175	ATC	2	6	1400285	1400290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163846590
21472	NC_010175	CGA	2	6	1400329	1400334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163846590
21473	NC_010175	GCC	2	6	1400337	1400342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163846590
21474	NC_010175	GTG	2	6	1400360	1400365	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163846590
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21478	NC_010175	ATGT	2	8	1400604	1400611	25 %	50 %	25 %	0 %	163846590
21479	NC_010175	TGA	2	6	1400653	1400658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163846590
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21482	NC_010175	CCA	3	9	1400845	1400853	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163846590
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21489	NC_010175	CGC	2	6	1401065	1401070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163846590
21490	NC_010175	TTCA	2	8	1401203	1401210	25 %	50 %	0 %	25 %	163846590
21491	NC_010175	AACG	2	8	1401335	1401342	50 %	0 %	25 %	25 %	163846590
21492	NC_010175	ACCGC	2	10	1401354	1401363	20 %	0 %	20 %	60 %	163846590
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