MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chloroflexus aurantiacus J-10-fl chromosome

Total Repeats: 83160

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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19002	NC_010175	CCAT	2	8	1246827	1246834	25 %	25 %	0 %	50 %	163846474
19003	NC_010175	TCA	2	6	1246837	1246842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163846474
19004	NC_010175	CGCGG	2	10	1246947	1246956	0 %	0 %	60 %	40 %	163846474
19005	NC_010175	GCA	2	6	1246961	1246966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163846474
19006	NC_010175	GTG	2	6	1247029	1247034	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163846474
19007	NC_010175	TCA	2	6	1247038	1247043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163846474
19008	NC_010175	GGT	2	6	1247049	1247054	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163846474
19009	NC_010175	CTC	2	6	1247058	1247063	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	163846474
19010	NC_010175	ACC	2	6	1247065	1247070	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163846474
19011	NC_010175	CGG	2	6	1247087	1247092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163846474
19012	NC_010175	AGCA	2	8	1247094	1247101	50 %	0 %	25 %	25 %	163846474
19013	NC_010175	AGC	2	6	1247128	1247133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163846474
19014	NC_010175	CTG	2	6	1247163	1247168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163846474
19015	NC_010175	CAGC	2	8	1247189	1247196	25 %	0 %	25 %	50 %	163846474
19016	NC_010175	CGC	2	6	1247295	1247300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163846474
19017	NC_010175	GAT	2	6	1247355	1247360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163846474
19018	NC_010175	CTGA	2	8	1247469	1247476	25 %	25 %	25 %	25 %	163846474
19019	NC_010175	CTG	2	6	1247493	1247498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163846474
19020	NC_010175	TGC	2	6	1247506	1247511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163846474
19021	NC_010175	TCA	2	6	1247567	1247572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163846474
19022	NC_010175	GAG	2	6	1247613	1247618	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	163846474
19023	NC_010175	AGC	2	6	1247683	1247688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163846474
19024	NC_010175	CAG	2	6	1247700	1247705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163846474
19025	NC_010175	TCG	2	6	1247714	1247719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163846474
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19027	NC_010175	GC	3	6	1247817	1247822	0 %	0 %	50 %	50 %	163846474
19028	NC_010175	CGCC	2	8	1247917	1247924	0 %	0 %	25 %	75 %	163846474
19029	NC_010175	CG	3	6	1248006	1248011	0 %	0 %	50 %	50 %	163846474
19030	NC_010175	ATC	2	6	1248018	1248023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163846474
19031	NC_010175	CGT	2	6	1248065	1248070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163846474
19032	NC_010175	TCT	2	6	1248071	1248076	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163846474
19033	NC_010175	CCAG	2	8	1248134	1248141	25 %	0 %	25 %	50 %	163846474
19034	NC_010175	GCG	2	6	1248158	1248163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163846474
19035	NC_010175	GCG	2	6	1248188	1248193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163846474
19036	NC_010175	TGG	2	6	1248210	1248215	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163846474
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19042	NC_010175	CGC	2	6	1248469	1248474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163846474
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19045	NC_010175	CTG	2	6	1248544	1248549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163846474
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19050	NC_010175	CGA	2	6	1248635	1248640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163846474
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19053	NC_010175	CTT	2	6	1248807	1248812	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163846474
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19055	NC_010175	GAA	2	6	1248882	1248887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163846474
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19057	NC_010175	GCG	2	6	1248922	1248927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163846474
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19093	NC_010175	GGCCC	2	10	1252260	1252269	0 %	0 %	40 %	60 %	163846476
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19105	NC_010175	GCTCA	2	10	1252914	1252923	20 %	20 %	20 %	40 %	163846477
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19230	NC_010175	CCA	2	6	1262810	1262815	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163846484
19231	NC_010175	GGCT	2	8	1262956	1262963	0 %	25 %	50 %	25 %	163846484
19232	NC_010175	GCG	2	6	1263011	1263016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163846484
19233	NC_010175	CCA	2	6	1263031	1263036	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163846484
19234	NC_010175	ACCGTC	2	12	1263042	1263053	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	163846484
19235	NC_010175	GCA	2	6	1263175	1263180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163846484
19236	NC_010175	GAC	2	6	1263220	1263225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163846484
19237	NC_010175	GAG	2	6	1263238	1263243	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	163846484
19238	NC_010175	CGATC	2	10	1263347	1263356	20 %	20 %	20 %	40 %	163846484
19239	NC_010175	GATC	2	8	1263361	1263368	25 %	25 %	25 %	25 %	163846484
19240	NC_010175	CTG	2	6	1263380	1263385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163846484
19241	NC_010175	AC	3	6	1263583	1263588	50 %	0 %	0 %	50 %	163846484
19242	NC_010175	ACC	2	6	1263611	1263616	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163846484
19243	NC_010175	CGC	2	6	1263620	1263625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163846484
19244	NC_010175	CGT	2	6	1263666	1263671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163846484
19245	NC_010175	GCC	2	6	1263741	1263746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163846484
19246	NC_010175	GCC	2	6	1263762	1263767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163846484
19247	NC_010175	GCCGG	2	10	1263771	1263780	0 %	0 %	60 %	40 %	163846484
19248	NC_010175	CACC	2	8	1263802	1263809	25 %	0 %	0 %	75 %	163846484
19249	NC_010175	TGC	2	6	1263810	1263815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163846484
19250	NC_010175	ATC	2	6	1263863	1263868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163846484
19251	NC_010175	GGCG	2	8	1263885	1263892	0 %	0 %	75 %	25 %	163846484
19252	NC_010175	GAT	2	6	1263998	1264003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163846484
19253	NC_010175	CTG	2	6	1264146	1264151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163846485
19254	NC_010175	CCT	2	6	1264222	1264227	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	163846485
19255	NC_010175	ACC	2	6	1264236	1264241	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163846485
19256	NC_010175	GCC	2	6	1264329	1264334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163846485
19257	NC_010175	GGCC	2	8	1264336	1264343	0 %	0 %	50 %	50 %	163846485
19258	NC_010175	GCG	2	6	1264413	1264418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163846485
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19262	NC_010175	ACC	2	6	1264550	1264555	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163846485
19263	NC_010175	CGG	2	6	1264562	1264567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163846485
19264	NC_010175	CGC	2	6	1264606	1264611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163846485
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19292	NC_010175	TGC	2	6	1268107	1268112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163846486
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19301	NC_010175	CGC	2	6	1268435	1268440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163846487
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19317	NC_010175	ACTTCA	2	12	1270125	1270136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163846489
19318	NC_010175	ACC	2	6	1270152	1270157	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163846489
19319	NC_010175	TCA	2	6	1270191	1270196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163846489
19320	NC_010175	GATC	2	8	1270228	1270235	25 %	25 %	25 %	25 %	163846489
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19329	NC_010175	CGA	2	6	1270717	1270722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163846489
19330	NC_010175	TGG	2	6	1270726	1270731	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163846489
19331	NC_010175	AGC	2	6	1270740	1270745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163846489
19332	NC_010175	ACA	2	6	1270764	1270769	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163846489
19333	NC_010175	CAA	2	6	1270804	1270809	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163846489
19334	NC_010175	GGT	2	6	1270820	1270825	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163846489
19335	NC_010175	TACA	2	8	1270877	1270884	50 %	25 %	0 %	25 %	163846489
19336	NC_010175	CAC	2	6	1270900	1270905	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163846489
19337	NC_010175	CTG	3	9	1270952	1270960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163846489
19338	NC_010175	CGGT	2	8	1270966	1270973	0 %	25 %	50 %	25 %	163846489
19339	NC_010175	GCT	2	6	1270992	1270997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163846489
19340	NC_010175	GGCG	2	8	1271023	1271030	0 %	0 %	75 %	25 %	163846489
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19342	NC_010175	CCG	2	6	1271086	1271091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163846489
19343	NC_010175	CGT	2	6	1271183	1271188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163846489
19344	NC_010175	GGC	2	6	1271222	1271227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163846489
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19346	NC_010175	TGA	2	6	1271254	1271259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163846489
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19462	NC_010175	CGG	2	6	1278579	1278584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163846492
19463	NC_010175	AGAGGC	2	12	1278659	1278670	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	163846493
19464	NC_010175	CCAAC	2	10	1278672	1278681	40 %	0 %	0 %	60 %	163846493
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19466	NC_010175	GTC	2	6	1278738	1278743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163846493
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19468	NC_010175	CTGA	2	8	1279011	1279018	25 %	25 %	25 %	25 %	163846493
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19481	NC_010175	AGC	2	6	1279821	1279826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163846494
19482	NC_010175	GCA	2	6	1279840	1279845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163846494
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19484	NC_010175	C	6	6	1279943	1279948	0 %	0 %	0 %	100 %	163846494
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19488	NC_010175	CTGG	2	8	1280118	1280125	0 %	25 %	50 %	25 %	163846494
19489	NC_010175	CTG	2	6	1280129	1280134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163846494
19490	NC_010175	GAC	2	6	1280155	1280160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163846494
19491	NC_010175	CTG	2	6	1280188	1280193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163846494
19492	NC_010175	CGGA	2	8	1280226	1280233	25 %	0 %	50 %	25 %	163846494
19493	NC_010175	GCCA	2	8	1280266	1280273	25 %	0 %	25 %	50 %	163846494
19494	NC_010175	GTGGC	2	10	1280309	1280318	0 %	20 %	60 %	20 %	163846494
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19500	NC_010175	ACA	2	6	1280530	1280535	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163846495

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