MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chloroflexus aurantiacus J-10-fl chromosome

Total Repeats: 83160

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18502	NC_010175	ACC	2	6	1217492	1217497	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163846457
18503	NC_010175	TGT	2	6	1217551	1217556	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163846457
18504	NC_010175	CCGAA	2	10	1217605	1217614	40 %	0 %	20 %	40 %	163846457
18505	NC_010175	TGC	2	6	1217644	1217649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163846457
18506	NC_010175	CTG	2	6	1217686	1217691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163846457
18507	NC_010175	TCA	2	6	1217728	1217733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163846457
18508	NC_010175	CAT	2	6	1217804	1217809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163846457
18509	NC_010175	ACG	2	6	1217839	1217844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163846457
18510	NC_010175	TAG	3	9	1217877	1217885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163846457
18511	NC_010175	ATC	2	6	1217915	1217920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163846457
18512	NC_010175	GGC	2	6	1217930	1217935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163846457
18513	NC_010175	CATC	2	8	1217953	1217960	25 %	25 %	0 %	50 %	163846457
18514	NC_010175	GCC	2	6	1218123	1218128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163846457
18515	NC_010175	CGGT	2	8	1218147	1218154	0 %	25 %	50 %	25 %	163846457
18516	NC_010175	TGG	2	6	1218172	1218177	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163846457
18517	NC_010175	CAG	2	6	1218190	1218195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163846457
18518	NC_010175	AG	3	6	1218290	1218295	50 %	0 %	50 %	0 %	163846457
18519	NC_010175	TCG	2	6	1218483	1218488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163846457
18520	NC_010175	CAT	2	6	1218511	1218516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163846457
18521	NC_010175	GGC	3	9	1218518	1218526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163846457
18522	NC_010175	GA	3	6	1218537	1218542	50 %	0 %	50 %	0 %	163846457
18523	NC_010175	TCG	2	6	1218670	1218675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163846457
18524	NC_010175	GTC	3	9	1218705	1218713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163846457
18525	NC_010175	CGG	2	6	1218729	1218734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163846457
18526	NC_010175	GGC	2	6	1218824	1218829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163846457
18527	NC_010175	ATC	2	6	1218836	1218841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163846457
18528	NC_010175	GGC	2	6	1218899	1218904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163846457
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18532	NC_010175	CAG	2	6	1218959	1218964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163846457
18533	NC_010175	GGGT	2	8	1219051	1219058	0 %	25 %	75 %	0 %	163846457
18534	NC_010175	CGT	2	6	1219070	1219075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163846457
18535	NC_010175	CGT	2	6	1219085	1219090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163846457
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18541	NC_010175	CGT	2	6	1219331	1219336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163846457
18542	NC_010175	GAAC	2	8	1219367	1219374	50 %	0 %	25 %	25 %	163846457
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18544	NC_010175	GTC	2	6	1219473	1219478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163846457
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18547	NC_010175	AC	3	6	1219606	1219611	50 %	0 %	0 %	50 %	163846457
18548	NC_010175	TCA	2	6	1219644	1219649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163846457
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18551	NC_010175	ACT	2	6	1219763	1219768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163846457
18552	NC_010175	TTA	2	6	1219770	1219775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	163846457
18553	NC_010175	TTAC	2	8	1219782	1219789	25 %	50 %	0 %	25 %	163846457
18554	NC_010175	GAC	2	6	1219815	1219820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163846457
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18615	NC_010175	TCACGG	2	12	1222927	1222938	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	163846459
18616	NC_010175	GTTG	2	8	1223026	1223033	0 %	50 %	50 %	0 %	163846459
18617	NC_010175	CAA	2	6	1223066	1223071	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163846459
18618	NC_010175	GCCC	2	8	1223206	1223213	0 %	0 %	25 %	75 %	163846459
18619	NC_010175	GTG	2	6	1223261	1223266	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163846459
18620	NC_010175	GGC	2	6	1223277	1223282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163846459
18621	NC_010175	CAA	2	6	1223300	1223305	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163846459
18622	NC_010175	AG	3	6	1223307	1223312	50 %	0 %	50 %	0 %	163846459
18623	NC_010175	ACT	2	6	1223350	1223355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163846459
18624	NC_010175	AAT	2	6	1223363	1223368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	163846459
18625	NC_010175	CAAAAT	2	12	1223403	1223414	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	163846459
18626	NC_010175	CTCA	2	8	1223427	1223434	25 %	25 %	0 %	50 %	163846459
18627	NC_010175	TCA	2	6	1223471	1223476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163846459
18628	NC_010175	GGC	2	6	1223489	1223494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163846459
18629	NC_010175	CACC	2	8	1223511	1223518	25 %	0 %	0 %	75 %	163846459
18630	NC_010175	CAC	2	6	1223628	1223633	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163846459
18631	NC_010175	CGAA	2	8	1223697	1223704	50 %	0 %	25 %	25 %	163846459
18632	NC_010175	CCA	2	6	1223720	1223725	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163846459
18633	NC_010175	GGC	2	6	1223810	1223815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163846459
18634	NC_010175	GT	3	6	1224252	1224257	0 %	50 %	50 %	0 %	163846460
18635	NC_010175	CCAG	2	8	1224535	1224542	25 %	0 %	25 %	50 %	163846460
18636	NC_010175	AGA	2	6	1224755	1224760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163846460
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18638	NC_010175	ACA	2	6	1224900	1224905	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163846460
18639	NC_010175	ACC	2	6	1224923	1224928	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163846460
18640	NC_010175	GCT	2	6	1225368	1225373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163846461
18641	NC_010175	CGG	2	6	1225407	1225412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163846461
18642	NC_010175	GCCAGC	2	12	1225419	1225430	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	163846461
18643	NC_010175	CAGC	2	8	1225453	1225460	25 %	0 %	25 %	50 %	163846461
18644	NC_010175	CTT	2	6	1225510	1225515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163846461
18645	NC_010175	GCTC	2	8	1225546	1225553	0 %	25 %	25 %	50 %	163846461
18646	NC_010175	TCA	2	6	1225554	1225559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163846461
18647	NC_010175	GCA	2	6	1225569	1225574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163846461
18648	NC_010175	CACG	2	8	1225606	1225613	25 %	0 %	25 %	50 %	163846461
18649	NC_010175	GCC	2	6	1225624	1225629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163846461
18650	NC_010175	CGT	2	6	1225654	1225659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163846461
18651	NC_010175	GCC	2	6	1225767	1225772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163846461
18652	NC_010175	GCG	2	6	1225826	1225831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163846461
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18654	NC_010175	TAAT	2	8	1225846	1225853	50 %	50 %	0 %	0 %	163846461
18655	NC_010175	GCT	2	6	1226620	1226625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163846462
18656	NC_010175	CGT	2	6	1226635	1226640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163846462
18657	NC_010175	AGT	2	6	1226714	1226719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163846462
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18660	NC_010175	GCTG	2	8	1226745	1226752	0 %	25 %	50 %	25 %	163846462
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18662	NC_010175	CGCTA	2	10	1226831	1226840	20 %	20 %	20 %	40 %	163846462
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18664	NC_010175	TCG	2	6	1226953	1226958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163846462
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18667	NC_010175	CTG	2	6	1227807	1227812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163846463
18668	NC_010175	TTC	2	6	1227843	1227848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163846463
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18671	NC_010175	GC	3	6	1227935	1227940	0 %	0 %	50 %	50 %	163846463
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18674	NC_010175	CACG	2	8	1228118	1228125	25 %	0 %	25 %	50 %	163846463
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18676	NC_010175	TCACGC	2	12	1228208	1228219	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	163846463
18677	NC_010175	TGA	2	6	1228268	1228273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163846463
18678	NC_010175	GGC	2	6	1228304	1228309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163846463
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18680	NC_010175	TCC	2	6	1228340	1228345	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	163846463
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18684	NC_010175	GTC	2	6	1228530	1228535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163846463
18685	NC_010175	ACT	2	6	1228561	1228566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163846463
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18702	NC_010175	CGA	2	6	1229666	1229671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163846464
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18714	NC_010175	GGC	2	6	1230360	1230365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163846464
18715	NC_010175	TGG	2	6	1230473	1230478	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163846464
18716	NC_010175	GTC	2	6	1230542	1230547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163846464
18717	NC_010175	GCTCA	2	10	1230558	1230567	20 %	20 %	20 %	40 %	163846464
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18719	NC_010175	CGGTGA	2	12	1230702	1230713	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	163846464
18720	NC_010175	GCGA	2	8	1230723	1230730	25 %	0 %	50 %	25 %	163846464
18721	NC_010175	GC	3	6	1230799	1230804	0 %	0 %	50 %	50 %	163846464
18722	NC_010175	ACT	2	6	1230809	1230814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163846464
18723	NC_010175	GCCT	2	8	1230887	1230894	0 %	25 %	25 %	50 %	163846464
18724	NC_010175	CCG	2	6	1230955	1230960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163846464
18725	NC_010175	AGC	2	6	1230972	1230977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163846464
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18727	NC_010175	GGC	2	6	1231062	1231067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163846464
18728	NC_010175	CTT	2	6	1231122	1231127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163846465
18729	NC_010175	TGGGC	2	10	1231165	1231174	0 %	20 %	60 %	20 %	163846465
18730	NC_010175	TGG	2	6	1231180	1231185	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163846465
18731	NC_010175	CAG	2	6	1231304	1231309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163846465
18732	NC_010175	CCG	2	6	1231311	1231316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163846465
18733	NC_010175	GGC	2	6	1231332	1231337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163846465
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18738	NC_010175	TGTGGT	2	12	1231594	1231605	0 %	50 %	50 %	0 %	163846465
18739	NC_010175	GCT	2	6	1231685	1231690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163846465
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18742	NC_010175	TCAG	2	8	1231767	1231774	25 %	25 %	25 %	25 %	163846465
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18832	NC_010175	GCC	2	6	1236106	1236111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163846469
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18835	NC_010175	CAG	3	9	1236312	1236320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163846469
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18837	NC_010175	CGGG	2	8	1236422	1236429	0 %	0 %	75 %	25 %	163846469
18838	NC_010175	CCAG	2	8	1236557	1236564	25 %	0 %	25 %	50 %	163846469
18839	NC_010175	CGAG	2	8	1236626	1236633	25 %	0 %	50 %	25 %	163846469
18840	NC_010175	CGG	2	6	1236662	1236667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163846469
18841	NC_010175	A	6	6	1236693	1236698	100 %	0 %	0 %	0 %	163846469
18842	NC_010175	GT	3	6	1236715	1236720	0 %	50 %	50 %	0 %	163846469
18843	NC_010175	GCG	2	6	1236741	1236746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163846469
18844	NC_010175	TGT	2	6	1236929	1236934	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163846469
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18962	NC_010175	CTG	2	6	1243924	1243929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163846472
18963	NC_010175	ATG	2	6	1243933	1243938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163846472
18964	NC_010175	GAA	2	6	1243999	1244004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163846472
18965	NC_010175	CAC	2	6	1244259	1244264	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163846472
18966	NC_010175	AGT	2	6	1244368	1244373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163846472
18967	NC_010175	AGG	2	6	1244399	1244404	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	163846472
18968	NC_010175	GGC	2	6	1244685	1244690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163846473
18969	NC_010175	CACGGG	2	12	1244753	1244764	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	163846473
18970	NC_010175	GGCCTG	2	12	1244847	1244858	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	163846473
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18973	NC_010175	CCG	2	6	1245069	1245074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163846473
18974	NC_010175	GGC	2	6	1245164	1245169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163846473
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18980	NC_010175	CGG	2	6	1246099	1246104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163846474
18981	NC_010175	CGT	2	6	1246130	1246135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163846474
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18984	NC_010175	CAC	2	6	1246206	1246211	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163846474
18985	NC_010175	TGC	2	6	1246244	1246249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163846474
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18988	NC_010175	CAC	2	6	1246317	1246322	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163846474
18989	NC_010175	GCC	2	6	1246329	1246334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163846474
18990	NC_010175	GC	3	6	1246414	1246419	0 %	0 %	50 %	50 %	163846474
18991	NC_010175	CGG	2	6	1246440	1246445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163846474
18992	NC_010175	CCT	2	6	1246490	1246495	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	163846474
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18994	NC_010175	GGC	2	6	1246557	1246562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163846474
18995	NC_010175	ACC	2	6	1246579	1246584	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163846474
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19000	NC_010175	CGG	2	6	1246789	1246794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163846474

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