MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chloroflexus aurantiacus J-10-fl chromosome

Total Repeats: 83160

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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17002	NC_010175	AGC	2	6	1115496	1115501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163846400
17003	NC_010175	GAA	2	6	1115506	1115511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163846400
17004	NC_010175	GTC	2	6	1115551	1115556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163846400
17005	NC_010175	TCA	2	6	1115603	1115608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163846400
17006	NC_010175	CAT	2	6	1115610	1115615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163846400
17007	NC_010175	CGA	2	6	1115625	1115630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163846400
17008	NC_010175	ATC	2	6	1115739	1115744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163846400
17009	NC_010175	TC	3	6	1115746	1115751	0 %	50 %	0 %	50 %	163846400
17010	NC_010175	CAA	2	6	1115767	1115772	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163846400
17011	NC_010175	CCCG	2	8	1115912	1115919	0 %	0 %	25 %	75 %	163846400
17012	NC_010175	AAG	2	6	1116199	1116204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163846401
17013	NC_010175	GTG	2	6	1116233	1116238	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163846401
17014	NC_010175	GACG	2	8	1116311	1116318	25 %	0 %	50 %	25 %	163846401
17015	NC_010175	ACG	2	6	1116336	1116341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163846401
17016	NC_010175	GCCC	2	8	1116394	1116401	0 %	0 %	25 %	75 %	163846401
17017	NC_010175	TTGA	2	8	1116489	1116496	25 %	50 %	25 %	0 %	163846401
17018	NC_010175	GAC	2	6	1116509	1116514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163846401
17019	NC_010175	ACC	2	6	1116532	1116537	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163846401
17020	NC_010175	CGG	2	6	1116540	1116545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163846401
17021	NC_010175	CAC	2	6	1116603	1116608	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163846401
17022	NC_010175	GGTC	2	8	1116620	1116627	0 %	25 %	50 %	25 %	163846401
17023	NC_010175	AGT	2	6	1116638	1116643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163846401
17024	NC_010175	TGG	2	6	1116695	1116700	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163846401
17025	NC_010175	AAT	2	6	1116744	1116749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	163846401
17026	NC_010175	CTG	2	6	1116750	1116755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163846401
17027	NC_010175	CCG	2	6	1116756	1116761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163846401
17028	NC_010175	TCA	2	6	1116772	1116777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163846401
17029	NC_010175	CAA	2	6	1116892	1116897	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163846402
17030	NC_010175	GGT	2	6	1117049	1117054	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163846402
17031	NC_010175	CAG	2	6	1117082	1117087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163846402
17032	NC_010175	GAC	2	6	1117142	1117147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163846402
17033	NC_010175	GCCTG	2	10	1117189	1117198	0 %	20 %	40 %	40 %	163846402
17034	NC_010175	TTC	2	6	1117247	1117252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163846402
17035	NC_010175	GCCTGG	2	12	1117287	1117298	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	163846402
17036	NC_010175	CCTGGG	2	12	1117303	1117314	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	163846402
17037	NC_010175	GGCT	2	8	1117360	1117367	0 %	25 %	50 %	25 %	163846402
17038	NC_010175	CGC	2	6	1117394	1117399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163846402
17039	NC_010175	GAG	2	6	1117424	1117429	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	163846402
17040	NC_010175	CGG	2	6	1117510	1117515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163846402
17041	NC_010175	TGC	2	6	1117565	1117570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163846402
17042	NC_010175	TTC	2	6	1117628	1117633	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163846402
17043	NC_010175	CGC	2	6	1117685	1117690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163846402
17044	NC_010175	CGC	3	9	1117721	1117729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163846402
17045	NC_010175	CTG	2	6	1117739	1117744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163846402
17046	NC_010175	CGC	2	6	1117757	1117762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163846402
17047	NC_010175	CTGC	2	8	1117777	1117784	0 %	25 %	25 %	50 %	163846402
17048	NC_010175	GATCGG	2	12	1117798	1117809	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	163846402
17049	NC_010175	CAA	2	6	1117976	1117981	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163846402
17050	NC_010175	TTG	2	6	1118021	1118026	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163846402
17051	NC_010175	GC	3	6	1118034	1118039	0 %	0 %	50 %	50 %	163846402
17052	NC_010175	ATC	2	6	1118048	1118053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163846402
17053	NC_010175	CCG	2	6	1118074	1118079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163846402
17054	NC_010175	ACG	2	6	1118160	1118165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163846402
17055	NC_010175	CCA	2	6	1118268	1118273	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163846402
17056	NC_010175	ACC	2	6	1118362	1118367	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163846403
17057	NC_010175	CCG	2	6	1118376	1118381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163846403
17058	NC_010175	GGCC	2	8	1118426	1118433	0 %	0 %	50 %	50 %	163846403
17059	NC_010175	CAG	2	6	1118462	1118467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163846403
17060	NC_010175	GCT	3	9	1118549	1118557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163846403
17061	NC_010175	ACC	2	6	1118559	1118564	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163846403
17062	NC_010175	AG	3	6	1118565	1118570	50 %	0 %	50 %	0 %	163846403
17063	NC_010175	CT	3	6	1118611	1118616	0 %	50 %	0 %	50 %	163846403
17064	NC_010175	GCTC	2	8	1118629	1118636	0 %	25 %	25 %	50 %	163846403
17065	NC_010175	CGT	2	6	1118697	1118702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163846403
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17071	NC_010175	ATC	2	6	1119122	1119127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163846404
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17075	NC_010175	CGT	2	6	1119309	1119314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163846404
17076	NC_010175	GC	3	6	1119329	1119334	0 %	0 %	50 %	50 %	163846404
17077	NC_010175	CTG	2	6	1119529	1119534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163846404
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17084	NC_010175	ACCA	2	8	1119697	1119704	50 %	0 %	0 %	50 %	163846404
17085	NC_010175	TCA	2	6	1119774	1119779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163846404
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17088	NC_010175	GCCA	2	8	1119821	1119828	25 %	0 %	25 %	50 %	163846404
17089	NC_010175	GAA	2	6	1119853	1119858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163846404
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17101	NC_010175	ACTG	2	8	1120410	1120417	25 %	25 %	25 %	25 %	163846404
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17103	NC_010175	CTG	2	6	1120573	1120578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163846404
17104	NC_010175	ACT	2	6	1120615	1120620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163846404
17105	NC_010175	CAG	2	6	1120633	1120638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163846404
17106	NC_010175	TCA	2	6	1120650	1120655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163846404
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17113	NC_010175	TGG	2	6	1120992	1120997	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163846404
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17115	NC_010175	CAATCC	2	12	1121076	1121087	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	163846404
17116	NC_010175	CAT	2	6	1121097	1121102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163846404
17117	NC_010175	GTG	3	9	1121240	1121248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163846404
17118	NC_010175	CCG	2	6	1121284	1121289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163846404
17119	NC_010175	GTG	2	6	1121315	1121320	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163846404
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17122	NC_010175	GCA	2	6	1121687	1121692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163846405
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17124	NC_010175	GAC	2	6	1121721	1121726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163846405
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17128	NC_010175	TGC	2	6	1122012	1122017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163846405
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17225	NC_010175	TCG	2	6	1130245	1130250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163846410
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17230	NC_010175	CAC	2	6	1130386	1130391	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163846410
17231	NC_010175	CAC	2	6	1130429	1130434	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163846410
17232	NC_010175	CAG	2	6	1130435	1130440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163846410
17233	NC_010175	ACG	2	6	1130443	1130448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163846410
17234	NC_010175	GAC	2	6	1130473	1130478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163846410
17235	NC_010175	GCCA	2	8	1130503	1130510	25 %	0 %	25 %	50 %	163846410
17236	NC_010175	CAGGCC	2	12	1130601	1130612	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	163846410
17237	NC_010175	CAT	2	6	1130618	1130623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163846410
17238	NC_010175	GCC	2	6	1130693	1130698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163846410
17239	NC_010175	GAG	2	6	1130844	1130849	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	163846410
17240	NC_010175	TCG	2	6	1130872	1130877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163846410
17241	NC_010175	GTG	2	6	1131045	1131050	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163846410
17242	NC_010175	AGA	2	6	1131101	1131106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163846410
17243	NC_010175	TCT	2	6	1131208	1131213	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163846410
17244	NC_010175	GC	3	6	1131248	1131253	0 %	0 %	50 %	50 %	163846410
17245	NC_010175	AG	3	6	1131275	1131280	50 %	0 %	50 %	0 %	163846410
17246	NC_010175	CCA	2	6	1131289	1131294	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163846410
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17248	NC_010175	TCA	2	6	1131334	1131339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163846410
17249	NC_010175	GTC	2	6	1131369	1131374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163846410
17250	NC_010175	CAA	2	6	1131443	1131448	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163846410
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17252	NC_010175	CGA	2	6	1131521	1131526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163846410
17253	NC_010175	GAA	2	6	1131602	1131607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163846410
17254	NC_010175	GCG	2	6	1131608	1131613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163846410
17255	NC_010175	AGC	2	6	1132069	1132074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163846411
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17257	NC_010175	AGG	2	6	1132248	1132253	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	163846411
17258	NC_010175	GC	3	6	1132270	1132275	0 %	0 %	50 %	50 %	163846411
17259	NC_010175	AACC	2	8	1132461	1132468	50 %	0 %	0 %	50 %	163846411
17260	NC_010175	CGA	2	6	1132627	1132632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163846411
17261	NC_010175	TGC	2	6	1132647	1132652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163846411
17262	NC_010175	CGC	2	6	1132686	1132691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163846411
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17264	NC_010175	ATCC	2	8	1132830	1132837	25 %	25 %	0 %	50 %	163846411
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17266	NC_010175	ATC	2	6	1132876	1132881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163846411
17267	NC_010175	GCA	2	6	1133667	1133672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163846412
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17278	NC_010175	GA	3	6	1134811	1134816	50 %	0 %	50 %	0 %	163846413
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17293	NC_010175	CAC	2	6	1135596	1135601	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163846413
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17302	NC_010175	GCG	2	6	1136025	1136030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163846413
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17313	NC_010175	GCTG	2	8	1136594	1136601	0 %	25 %	50 %	25 %	163846414
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17315	NC_010175	GCA	2	6	1136796	1136801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163846414
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17320	NC_010175	CGC	2	6	1138200	1138205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163846415
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17332	NC_010175	GGATG	2	10	1138682	1138691	20 %	20 %	60 %	0 %	163846415
17333	NC_010175	TGG	2	6	1138697	1138702	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163846415
17334	NC_010175	TGC	2	6	1138814	1138819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163846415
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17336	NC_010175	TGA	2	6	1138873	1138878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163846415
17337	NC_010175	CCG	2	6	1138967	1138972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163846415
17338	NC_010175	TGCGC	2	10	1139062	1139071	0 %	20 %	40 %	40 %	163846416
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17341	NC_010175	CGGGC	2	10	1139224	1139233	0 %	0 %	60 %	40 %	163846416
17342	NC_010175	CCG	2	6	1139338	1139343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163846416
17343	NC_010175	TGC	2	6	1139356	1139361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163846416
17344	NC_010175	GGCA	2	8	1139379	1139386	25 %	0 %	50 %	25 %	163846416
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17346	NC_010175	CT	3	6	1139519	1139524	0 %	50 %	0 %	50 %	163846416
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17462	NC_010175	CTG	2	6	1146630	1146635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163846419
17463	NC_010175	CTG	2	6	1146660	1146665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163846419
17464	NC_010175	TGA	2	6	1146685	1146690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163846419
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