MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chloroflexus aurantiacus J-10-fl chromosome

Total Repeats: 83160

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15501	NC_010175	ATC	2	6	1023370	1023375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163846331
15502	NC_010175	CGG	2	6	1023406	1023411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163846331
15503	NC_010175	GTC	2	6	1023413	1023418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163846331
15504	NC_010175	GCT	2	6	1023444	1023449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163846331
15505	NC_010175	CGGG	2	8	1023585	1023592	0 %	0 %	75 %	25 %	163846331
15506	NC_010175	GATC	2	8	1023600	1023607	25 %	25 %	25 %	25 %	163846331
15507	NC_010175	GAT	3	9	1023616	1023624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163846331
15508	NC_010175	CAC	2	6	1023696	1023701	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163846331
15509	NC_010175	CTG	2	6	1023835	1023840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163846331
15510	NC_010175	ATG	2	6	1023845	1023850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163846331
15511	NC_010175	CAT	2	6	1023933	1023938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163846331
15512	NC_010175	CTG	2	6	1023955	1023960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163846331
15513	NC_010175	CAA	2	6	1024023	1024028	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163846331
15514	NC_010175	GAT	2	6	1024071	1024076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163846331
15515	NC_010175	CAC	2	6	1024102	1024107	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163846331
15516	NC_010175	ACCGGT	2	12	1024162	1024173	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	163846331
15517	NC_010175	CGA	2	6	1024194	1024199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163846331
15518	NC_010175	ACC	2	6	1024279	1024284	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163846331
15519	NC_010175	AACTC	2	10	1024379	1024388	40 %	20 %	0 %	40 %	163846331
15520	NC_010175	GCA	2	6	1024400	1024405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163846331
15521	NC_010175	TGC	2	6	1024425	1024430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163846331
15522	NC_010175	CGC	3	9	1024431	1024439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163846331
15523	NC_010175	AAT	2	6	1024538	1024543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	163846332
15524	NC_010175	GCG	2	6	1024555	1024560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163846332
15525	NC_010175	ATC	2	6	1024585	1024590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163846332
15526	NC_010175	GGC	2	6	1024607	1024612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163846332
15527	NC_010175	CGCC	2	8	1024613	1024620	0 %	0 %	25 %	75 %	163846332
15528	NC_010175	GAGT	2	8	1024675	1024682	25 %	25 %	50 %	0 %	163846332
15529	NC_010175	C	6	6	1024691	1024696	0 %	0 %	0 %	100 %	163846332
15530	NC_010175	ACCC	2	8	1024698	1024705	25 %	0 %	0 %	75 %	163846332
15531	NC_010175	GTC	2	6	1024735	1024740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163846332
15532	NC_010175	AGA	2	6	1024745	1024750	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163846332
15533	NC_010175	TCG	2	6	1024751	1024756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163846332
15534	NC_010175	GCCG	2	8	1024795	1024802	0 %	0 %	50 %	50 %	163846332
15535	NC_010175	TTC	2	6	1024858	1024863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163846332
15536	NC_010175	TCA	2	6	1024955	1024960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163846332
15537	NC_010175	GCGG	2	8	1024967	1024974	0 %	0 %	75 %	25 %	163846332
15538	NC_010175	CGG	2	6	1025016	1025021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163846332
15539	NC_010175	CGG	2	6	1025026	1025031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163846332
15540	NC_010175	TGC	2	6	1025066	1025071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163846332
15541	NC_010175	CCA	2	6	1025072	1025077	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163846332
15542	NC_010175	GGT	2	6	1025131	1025136	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163846332
15543	NC_010175	GCC	2	6	1025140	1025145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163846332
15544	NC_010175	CACGC	2	10	1025161	1025170	20 %	0 %	20 %	60 %	163846332
15545	NC_010175	GTC	2	6	1025176	1025181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163846332
15546	NC_010175	CGG	2	6	1025199	1025204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163846332
15547	NC_010175	CAGC	2	8	1025205	1025212	25 %	0 %	25 %	50 %	163846332
15548	NC_010175	ATC	2	6	1025227	1025232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163846332
15549	NC_010175	CCCG	2	8	1025243	1025250	0 %	0 %	25 %	75 %	163846332
15550	NC_010175	TCGCC	2	10	1025283	1025292	0 %	20 %	20 %	60 %	163846332
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15552	NC_010175	TG	3	6	1025301	1025306	0 %	50 %	50 %	0 %	163846332
15553	NC_010175	CAT	2	6	1025355	1025360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163846332
15554	NC_010175	TGGG	2	8	1025408	1025415	0 %	25 %	75 %	0 %	163846332
15555	NC_010175	GCT	2	6	1025432	1025437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163846332
15556	NC_010175	GAC	2	6	1025523	1025528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163846332
15557	NC_010175	GGCT	2	8	1025589	1025596	0 %	25 %	50 %	25 %	163846332
15558	NC_010175	GGC	2	6	1025608	1025613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163846332
15559	NC_010175	GAC	2	6	1025626	1025631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163846332
15560	NC_010175	CGT	2	6	1025687	1025692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163846332
15561	NC_010175	CGA	2	6	1025709	1025714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163846332
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15564	NC_010175	GTGC	2	8	1025768	1025775	0 %	25 %	50 %	25 %	163846332
15565	NC_010175	CGG	2	6	1026141	1026146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163846333
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15582	NC_010175	GCCAG	2	10	1026821	1026830	20 %	0 %	40 %	40 %	163846334
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15584	NC_010175	TCA	2	6	1027001	1027006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163846334
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15587	NC_010175	ACTC	2	8	1027126	1027133	25 %	25 %	0 %	50 %	163846334
15588	NC_010175	CA	3	6	1027200	1027205	50 %	0 %	0 %	50 %	163846334
15589	NC_010175	TCA	2	6	1027214	1027219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163846334
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15605	NC_010175	GCA	2	6	1028219	1028224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163846335
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15730	NC_010175	GCTCG	2	10	1033957	1033966	0 %	20 %	40 %	40 %	163846340
15731	NC_010175	TCG	2	6	1033986	1033991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163846340
15732	NC_010175	TCA	2	6	1033995	1034000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163846340
15733	NC_010175	GCCA	2	8	1034037	1034044	25 %	0 %	25 %	50 %	163846341
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15735	NC_010175	AGCG	2	8	1034152	1034159	25 %	0 %	50 %	25 %	163846341
15736	NC_010175	GTG	2	6	1034246	1034251	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163846341
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15738	NC_010175	GCA	2	6	1034281	1034286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163846341
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15740	NC_010175	TCG	2	6	1034402	1034407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163846341
15741	NC_010175	CGT	2	6	1034409	1034414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163846341
15742	NC_010175	CCG	2	6	1034471	1034476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163846341
15743	NC_010175	GGC	2	6	1034490	1034495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163846341
15744	NC_010175	GCC	3	9	1034539	1034547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163846341
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15746	NC_010175	ATCAC	2	10	1034605	1034614	40 %	20 %	0 %	40 %	163846341
15747	NC_010175	AG	3	6	1034664	1034669	50 %	0 %	50 %	0 %	163846341
15748	NC_010175	TGA	2	6	1034678	1034683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163846341
15749	NC_010175	TGG	2	6	1034721	1034726	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163846341
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15751	NC_010175	GCT	2	6	1034889	1034894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163846341
15752	NC_010175	GTC	2	6	1035025	1035030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163846341
15753	NC_010175	AGA	2	6	1035080	1035085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163846341
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15758	NC_010175	TTCGG	2	10	1035268	1035277	0 %	40 %	40 %	20 %	163846341
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15761	NC_010175	ACCA	2	8	1035506	1035513	50 %	0 %	0 %	50 %	163846342
15762	NC_010175	TGG	2	6	1035670	1035675	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163846342
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15839	NC_010175	GTA	2	6	1039370	1039375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163846344
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15842	NC_010175	GC	3	6	1039535	1039540	0 %	0 %	50 %	50 %	163846344
15843	NC_010175	ATCTG	2	10	1039581	1039590	20 %	40 %	20 %	20 %	163846344
15844	NC_010175	TCAG	2	8	1039599	1039606	25 %	25 %	25 %	25 %	163846344
15845	NC_010175	GCA	2	6	1039641	1039646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163846344
15846	NC_010175	GGC	2	6	1039656	1039661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163846344
15847	NC_010175	CGAG	2	8	1039779	1039786	25 %	0 %	50 %	25 %	163846344
15848	NC_010175	CAC	2	6	1039799	1039804	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163846344
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15850	NC_010175	AAC	2	6	1039849	1039854	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163846344
15851	NC_010175	CGT	2	6	1039910	1039915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163846344
15852	NC_010175	TGC	2	6	1039916	1039921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163846344
15853	NC_010175	CGT	2	6	1039922	1039927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163846344
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15857	NC_010175	GC	3	6	1040066	1040071	0 %	0 %	50 %	50 %	163846345
15858	NC_010175	CTG	3	9	1040135	1040143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163846345
15859	NC_010175	AGCA	2	8	1040211	1040218	50 %	0 %	25 %	25 %	163846345
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15866	NC_010175	ACGAT	2	10	1040513	1040522	40 %	20 %	20 %	20 %	163846346
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15915	NC_010175	ATC	2	6	1047771	1047776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163846352
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15950	NC_010175	GCC	2	6	1049738	1049743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163846354
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15952	NC_010175	GAC	2	6	1049857	1049862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163846354
15953	NC_010175	CAG	2	6	1049863	1049868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163846354
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15955	NC_010175	CGCC	2	8	1050063	1050070	0 %	0 %	25 %	75 %	163846354
15956	NC_010175	CGG	2	6	1050079	1050084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163846354
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15958	NC_010175	CGA	2	6	1050232	1050237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163846354
15959	NC_010175	CCG	2	6	1050260	1050265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163846354
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15963	NC_010175	GAT	2	6	1050574	1050579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163846354
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