MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chloroflexus aurantiacus J-10-fl chromosome

Total Repeats: 83160

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15002	NC_010175	TTC	2	6	989913	989918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163846306
15003	NC_010175	GCA	2	6	989965	989970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163846306
15004	NC_010175	CCT	2	6	990021	990026	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	163846306
15005	NC_010175	CTG	2	6	990027	990032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163846306
15006	NC_010175	A	8	8	990046	990053	100 %	0 %	0 %	0 %	163846306
15007	NC_010175	TAT	2	6	990192	990197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	163846306
15008	NC_010175	AGA	2	6	990272	990277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163846306
15009	NC_010175	GACT	2	8	990305	990312	25 %	25 %	25 %	25 %	163846306
15010	NC_010175	CGG	2	6	990437	990442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163846306
15011	NC_010175	TCC	2	6	990526	990531	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	163846307
15012	NC_010175	ATG	2	6	990570	990575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163846307
15013	NC_010175	CT	3	6	990609	990614	0 %	50 %	0 %	50 %	163846307
15014	NC_010175	CTG	2	6	990621	990626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163846307
15015	NC_010175	GAG	2	6	990701	990706	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	163846307
15016	NC_010175	CTGG	2	8	990809	990816	0 %	25 %	50 %	25 %	163846307
15017	NC_010175	ACCG	2	8	990860	990867	25 %	0 %	25 %	50 %	163846307
15018	NC_010175	ACG	2	6	990868	990873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163846307
15019	NC_010175	T	7	7	990874	990880	0 %	100 %	0 %	0 %	163846307
15020	NC_010175	ACGA	2	8	990945	990952	50 %	0 %	25 %	25 %	163846307
15021	NC_010175	GCT	2	6	990977	990982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163846307
15022	NC_010175	GCT	2	6	991001	991006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163846307
15023	NC_010175	CTT	2	6	991078	991083	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163846307
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15025	NC_010175	CCG	2	6	991113	991118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163846307
15026	NC_010175	TGC	2	6	991179	991184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163846307
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15028	NC_010175	GGT	2	6	991292	991297	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163846307
15029	NC_010175	TCT	2	6	991356	991361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163846307
15030	NC_010175	GTA	2	6	991394	991399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163846307
15031	NC_010175	GAC	3	9	991403	991411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163846307
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15033	NC_010175	TTA	2	6	991563	991568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	163846307
15034	NC_010175	GTA	2	6	991655	991660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163846307
15035	NC_010175	AGGG	2	8	991930	991937	25 %	0 %	75 %	0 %	163846307
15036	NC_010175	TGA	2	6	991990	991995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163846307
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15040	NC_010175	CGA	2	6	992044	992049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163846307
15041	NC_010175	GC	3	6	992056	992061	0 %	0 %	50 %	50 %	163846307
15042	NC_010175	GCC	2	6	992075	992080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163846307
15043	NC_010175	GC	3	6	992230	992235	0 %	0 %	50 %	50 %	163846307
15044	NC_010175	GAC	2	6	992244	992249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163846307
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15052	NC_010175	CCG	2	6	992943	992948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163846307
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15056	NC_010175	GAG	2	6	993196	993201	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	163846308
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15065	NC_010175	CGC	2	6	993740	993745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163846308
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15090	NC_010175	AAT	2	6	995336	995341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	163846311
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15103	NC_010175	CCCA	2	8	996285	996292	25 %	0 %	0 %	75 %	163846312
15104	NC_010175	GAAA	2	8	996307	996314	75 %	0 %	25 %	0 %	163846312
15105	NC_010175	GTC	2	6	996324	996329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163846312
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15109	NC_010175	GAT	2	6	996855	996860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163846313
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15119	NC_010175	C	7	7	997591	997597	0 %	0 %	0 %	100 %	163846313
15120	NC_010175	ATC	2	6	997675	997680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163846313
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15124	NC_010175	TCG	2	6	997887	997892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163846313
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15128	NC_010175	GCG	2	6	997974	997979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163846313
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15132	NC_010175	CTG	2	6	998420	998425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163846314
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15151	NC_010175	AGC	2	6	999252	999257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163846314
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15205	NC_010175	GAT	2	6	1002304	1002309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163846317
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15212	NC_010175	GCCCG	2	10	1002550	1002559	0 %	0 %	40 %	60 %	163846317
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15223	NC_010175	GCG	2	6	1003222	1003227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163846318
15224	NC_010175	GTT	2	6	1003231	1003236	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163846318
15225	NC_010175	TCCG	2	8	1003305	1003312	0 %	25 %	25 %	50 %	163846318
15226	NC_010175	ATC	2	6	1003369	1003374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163846318
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15228	NC_010175	CAG	2	6	1003462	1003467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163846318
15229	NC_010175	CCG	2	6	1003492	1003497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163846318
15230	NC_010175	GATCA	2	10	1003600	1003609	40 %	20 %	20 %	20 %	163846318
15231	NC_010175	TCA	2	6	1003643	1003648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163846318
15232	NC_010175	ATC	2	6	1003681	1003686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163846318
15233	NC_010175	GCCA	2	8	1003745	1003752	25 %	0 %	25 %	50 %	163846318
15234	NC_010175	CTG	2	6	1003927	1003932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163846318
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15236	NC_010175	AGA	2	6	1003995	1004000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163846318
15237	NC_010175	ATC	2	6	1004009	1004014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163846318
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15345	NC_010175	TTC	2	6	1012764	1012769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163846322
15346	NC_010175	GGC	2	6	1012861	1012866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163846322
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15348	NC_010175	GCT	2	6	1012907	1012912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163846322
15349	NC_010175	TGA	2	6	1012973	1012978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163846322
15350	NC_010175	GCT	2	6	1012992	1012997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163846322
15351	NC_010175	CCT	2	6	1013042	1013047	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	163846322
15352	NC_010175	CAGG	2	8	1013079	1013086	25 %	0 %	50 %	25 %	163846322
15353	NC_010175	ACCG	2	8	1013094	1013101	25 %	0 %	25 %	50 %	163846322
15354	NC_010175	TCTCTT	2	12	1013135	1013146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163846322
15355	NC_010175	GCC	2	6	1013166	1013171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163846322
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15357	NC_010175	CAAC	2	8	1013209	1013216	50 %	0 %	0 %	50 %	163846323
15358	NC_010175	CGA	2	6	1013383	1013388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163846323
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15360	NC_010175	GCT	2	6	1013434	1013439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163846323
15361	NC_010175	GCC	2	6	1013441	1013446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163846323
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15372	NC_010175	CTC	2	6	1014586	1014591	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	163846324
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15382	NC_010175	TGT	2	6	1015086	1015091	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163846324
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15452	NC_010175	ACG	2	6	1019443	1019448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163846328
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15459	NC_010175	TCG	2	6	1019840	1019845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163846328
15460	NC_010175	AGC	2	6	1019868	1019873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163846328
15461	NC_010175	AC	3	6	1019993	1019998	50 %	0 %	0 %	50 %	163846328
15462	NC_010175	GT	3	6	1020059	1020064	0 %	50 %	50 %	0 %	163846328
15463	NC_010175	CTG	2	6	1020111	1020116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163846328
15464	NC_010175	GAAC	2	8	1020170	1020177	50 %	0 %	25 %	25 %	163846328
15465	NC_010175	TGG	2	6	1020188	1020193	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163846328
15466	NC_010175	AGT	2	6	1020256	1020261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163846328
15467	NC_010175	A	7	7	1020274	1020280	100 %	0 %	0 %	0 %	163846328
15468	NC_010175	CAGC	2	8	1020293	1020300	25 %	0 %	25 %	50 %	163846328
15469	NC_010175	TCA	2	6	1020304	1020309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163846328
15470	NC_010175	TCAC	2	8	1020358	1020365	25 %	25 %	0 %	50 %	163846328
15471	NC_010175	CCG	2	6	1020366	1020371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163846328
15472	NC_010175	CAT	2	6	1020428	1020433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163846328
15473	NC_010175	AAG	2	6	1021445	1021450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163846329
15474	NC_010175	GAT	2	6	1021454	1021459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163846329
15475	NC_010175	T	6	6	1021486	1021491	0 %	100 %	0 %	0 %	163846329
15476	NC_010175	CTGT	2	8	1021505	1021512	0 %	50 %	25 %	25 %	163846329
15477	NC_010175	GCA	2	6	1021554	1021559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163846329
15478	NC_010175	ATC	2	6	1021650	1021655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163846329
15479	NC_010175	CGT	2	6	1021747	1021752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163846329
15480	NC_010175	ACCG	3	12	1022069	1022080	25 %	0 %	25 %	50 %	163846330
15481	NC_010175	TGA	2	6	1022228	1022233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163846330
15482	NC_010175	GC	3	6	1022246	1022251	0 %	0 %	50 %	50 %	163846330
15483	NC_010175	CCG	2	6	1022252	1022257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163846330
15484	NC_010175	TCAGA	2	10	1022291	1022300	40 %	20 %	20 %	20 %	163846330
15485	NC_010175	CTT	2	6	1022345	1022350	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163846330
15486	NC_010175	CAT	2	6	1022387	1022392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163846330
15487	NC_010175	GTT	2	6	1022424	1022429	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163846330
15488	NC_010175	TCGCCA	2	12	1022506	1022517	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	163846330
15489	NC_010175	AG	3	6	1022521	1022526	50 %	0 %	50 %	0 %	163846330
15490	NC_010175	CGA	2	6	1022594	1022599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163846330
15491	NC_010175	CGG	2	6	1022699	1022704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163846330
15492	NC_010175	CTGAT	2	10	1022710	1022719	20 %	40 %	20 %	20 %	163846330
15493	NC_010175	CCA	2	6	1022726	1022731	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163846330
15494	NC_010175	CGG	2	6	1023008	1023013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163846330
15495	NC_010175	GCCGTG	2	12	1023037	1023048	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	163846330
15496	NC_010175	CGC	2	6	1023059	1023064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163846330
15497	NC_010175	GAT	2	6	1023072	1023077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163846330
15498	NC_010175	AAG	2	6	1023142	1023147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163846330
15499	NC_010175	AGT	2	6	1023173	1023178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163846330
15500	NC_010175	AGC	2	6	1023218	1023223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163846330

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