MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chloroflexus aurantiacus J-10-fl chromosome

Total Repeats: 83160

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_010175	TGA	2	6	697660	697665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163846135
11002	NC_010175	CGC	2	6	697690	697695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163846135
11003	NC_010175	CAA	2	6	697711	697716	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163846135
11004	NC_010175	CAA	2	6	697732	697737	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163846135
11005	NC_010175	ACA	2	6	697773	697778	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163846135
11006	NC_010175	CTT	2	6	697822	697827	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163846135
11007	NC_010175	GCG	3	9	697851	697859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163846135
11008	NC_010175	TGCC	2	8	697860	697867	0 %	25 %	25 %	50 %	163846135
11009	NC_010175	ATA	2	6	697881	697886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	163846135
11010	NC_010175	GAT	2	6	697946	697951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163846135
11011	NC_010175	ACA	2	6	697952	697957	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163846135
11012	NC_010175	GCG	2	6	698052	698057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163846135
11013	NC_010175	CCG	2	6	698091	698096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163846135
11014	NC_010175	CCG	2	6	698102	698107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163846135
11015	NC_010175	ACCG	2	8	698162	698169	25 %	0 %	25 %	50 %	163846135
11016	NC_010175	TGGT	2	8	698225	698232	0 %	50 %	50 %	0 %	163846135
11017	NC_010175	CCA	2	6	699564	699569	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163846136
11018	NC_010175	GCA	2	6	699586	699591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163846136
11019	NC_010175	GAT	3	9	699645	699653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163846136
11020	NC_010175	GAT	2	6	699705	699710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163846136
11021	NC_010175	CGAG	2	8	699795	699802	25 %	0 %	50 %	25 %	163846136
11022	NC_010175	GCA	2	6	699828	699833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163846136
11023	NC_010175	GCT	2	6	699921	699926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163846136
11024	NC_010175	GATC	2	8	700026	700033	25 %	25 %	25 %	25 %	163846136
11025	NC_010175	ACC	2	6	700105	700110	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163846136
11026	NC_010175	CGC	2	6	700122	700127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163846136
11027	NC_010175	GATC	2	8	700188	700195	25 %	25 %	25 %	25 %	163846136
11028	NC_010175	CTT	2	6	700239	700244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163846136
11029	NC_010175	GTA	2	6	700285	700290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163846136
11030	NC_010175	CCA	2	6	700463	700468	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163846136
11031	NC_010175	CAC	2	6	700475	700480	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163846136
11032	NC_010175	CGC	2	6	701362	701367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163846137
11033	NC_010175	TCAA	2	8	701371	701378	50 %	25 %	0 %	25 %	163846137
11034	NC_010175	GTT	2	6	701582	701587	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163846137
11035	NC_010175	TCA	2	6	701678	701683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163846137
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11037	NC_010175	GAGT	2	8	701699	701706	25 %	25 %	50 %	0 %	163846137
11038	NC_010175	GTT	2	6	701729	701734	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163846137
11039	NC_010175	AGC	2	6	701740	701745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163846137
11040	NC_010175	GTT	2	6	701864	701869	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163846137
11041	NC_010175	AGA	2	6	701879	701884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163846137
11042	NC_010175	GTC	2	6	701991	701996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163846137
11043	NC_010175	GCCAG	2	10	702071	702080	20 %	0 %	40 %	40 %	163846138
11044	NC_010175	TGA	2	6	702168	702173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163846138
11045	NC_010175	GATCGA	2	12	702179	702190	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	163846138
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11047	NC_010175	GCCA	2	8	702419	702426	25 %	0 %	25 %	50 %	163846139
11048	NC_010175	CCA	2	6	702429	702434	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163846139
11049	NC_010175	TCA	2	6	702457	702462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163846139
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11052	NC_010175	CCA	2	6	702542	702547	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163846139
11053	NC_010175	GCGG	2	8	702599	702606	0 %	0 %	75 %	25 %	163846139
11054	NC_010175	ATG	2	6	702633	702638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163846139
11055	NC_010175	TGA	2	6	702643	702648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163846139
11056	NC_010175	GCT	2	6	702680	702685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163846139
11057	NC_010175	GCA	2	6	702709	702714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163846139
11058	NC_010175	CAT	2	6	702719	702724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163846139
11059	NC_010175	CAT	2	6	702728	702733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163846139
11060	NC_010175	AAC	2	6	702743	702748	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163846139
11061	NC_010175	CCA	2	6	702750	702755	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163846139
11062	NC_010175	ACG	2	6	702768	702773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163846139
11063	NC_010175	CTG	2	6	702800	702805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163846139
11064	NC_010175	CAT	2	6	702821	702826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163846139
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11067	NC_010175	GC	3	6	704643	704648	0 %	0 %	50 %	50 %	163846140
11068	NC_010175	AGCG	2	8	704702	704709	25 %	0 %	50 %	25 %	163846140
11069	NC_010175	CGT	2	6	704797	704802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163846140
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11101	NC_010175	CTTA	2	8	707349	707356	25 %	50 %	0 %	25 %	163846141
11102	NC_010175	TGG	2	6	707438	707443	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163846141
11103	NC_010175	CACC	2	8	707444	707451	25 %	0 %	0 %	75 %	163846141
11104	NC_010175	CGG	2	6	707459	707464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163846141
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11107	NC_010175	ATC	2	6	707750	707755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163846142
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11110	NC_010175	GGC	2	6	707999	708004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163846142
11111	NC_010175	ATGCA	2	10	708007	708016	40 %	20 %	20 %	20 %	163846142
11112	NC_010175	CCA	2	6	708042	708047	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163846142
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11116	NC_010175	GCA	2	6	708203	708208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163846142
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11118	NC_010175	ACC	2	6	708284	708289	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163846142
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11232	NC_010175	CCA	2	6	737119	737124	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163846149
11233	NC_010175	AGCGG	2	10	737180	737189	20 %	0 %	60 %	20 %	163846149
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11235	NC_010175	TCGG	2	8	737296	737303	0 %	25 %	50 %	25 %	163846149
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11357	NC_010175	GCTCA	2	10	743474	743483	20 %	20 %	20 %	40 %	163846154
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11472	NC_010175	GCAATC	2	12	751631	751642	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	163846161
11473	NC_010175	CGT	2	6	751680	751685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163846161
11474	NC_010175	TAC	2	6	751749	751754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163846161
11475	NC_010175	GC	3	6	751758	751763	0 %	0 %	50 %	50 %	163846161
11476	NC_010175	TAG	2	6	751829	751834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163846161
11477	NC_010175	GAT	2	6	751866	751871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163846161
11478	NC_010175	CCTGTT	2	12	751956	751967	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	163846161
11479	NC_010175	CCA	2	6	752115	752120	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163846161
11480	NC_010175	GGCT	2	8	752168	752175	0 %	25 %	50 %	25 %	163846161
11481	NC_010175	ATC	2	6	752215	752220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163846161
11482	NC_010175	GCG	2	6	752226	752231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163846161
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11484	NC_010175	GCA	2	6	752331	752336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163846161
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11493	NC_010175	CGG	2	6	753781	753786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163846163
11494	NC_010175	TTGA	2	8	753845	753852	25 %	50 %	25 %	0 %	163846163
11495	NC_010175	CCAG	2	8	753874	753881	25 %	0 %	25 %	50 %	163846163
11496	NC_010175	GCTG	2	8	753882	753889	0 %	25 %	50 %	25 %	163846163
11497	NC_010175	CTG	2	6	754083	754088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163846163
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11499	NC_010175	TCC	2	6	754216	754221	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	163846163
11500	NC_010175	CTAT	2	8	754297	754304	25 %	50 %	0 %	25 %	163846163

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