MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chloroflexus aurantiacus J-10-fl chromosome

Total Repeats: 83160

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10002	NC_010175	CCA	2	6	633414	633419	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163846088
10003	NC_010175	ACC	2	6	633456	633461	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163846088
10004	NC_010175	ATG	2	6	633493	633498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163846088
10005	NC_010175	GTG	2	6	633545	633550	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163846088
10006	NC_010175	GTTT	2	8	633580	633587	0 %	75 %	25 %	0 %	163846088
10007	NC_010175	CTT	2	6	633593	633598	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163846088
10008	NC_010175	TGA	2	6	633599	633604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163846088
10009	NC_010175	ACC	2	6	633658	633663	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163846088
10010	NC_010175	ATG	2	6	633667	633672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163846088
10011	NC_010175	CAA	2	6	633684	633689	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163846088
10012	NC_010175	GTT	2	6	633710	633715	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163846088
10013	NC_010175	ACTT	2	8	634366	634373	25 %	50 %	0 %	25 %	163846089
10014	NC_010175	TCA	2	6	634388	634393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163846089
10015	NC_010175	CAC	2	6	634430	634435	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163846089
10016	NC_010175	TGA	2	6	634799	634804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163846089
10017	NC_010175	ACC	2	6	634845	634850	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163846089
10018	NC_010175	GTCG	2	8	634851	634858	0 %	25 %	50 %	25 %	163846089
10019	NC_010175	CTTC	2	8	634877	634884	0 %	50 %	0 %	50 %	163846089
10020	NC_010175	CAC	2	6	634913	634918	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163846089
10021	NC_010175	ACC	2	6	634962	634967	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163846089
10022	NC_010175	TCA	2	6	635050	635055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163846089
10023	NC_010175	GTA	2	6	635056	635061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163846089
10024	NC_010175	CGG	2	6	635064	635069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163846089
10025	NC_010175	TTG	2	6	635086	635091	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163846089
10026	NC_010175	TAG	2	6	635092	635097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163846089
10027	NC_010175	AG	3	6	635096	635101	50 %	0 %	50 %	0 %	163846089
10028	NC_010175	CGGT	2	8	635165	635172	0 %	25 %	50 %	25 %	163846089
10029	NC_010175	CCA	2	6	635275	635280	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163846089
10030	NC_010175	TGA	2	6	635283	635288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163846089
10031	NC_010175	TTG	2	6	635296	635301	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163846089
10032	NC_010175	TTG	2	6	635305	635310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163846089
10033	NC_010175	TGG	2	6	635345	635350	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163846089
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10036	NC_010175	AG	3	6	635432	635437	50 %	0 %	50 %	0 %	163846089
10037	NC_010175	TACCG	2	10	635439	635448	20 %	20 %	20 %	40 %	163846089
10038	NC_010175	GTTG	2	8	635491	635498	0 %	50 %	50 %	0 %	163846089
10039	NC_010175	AGC	2	6	635502	635507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163846089
10040	NC_010175	GGTT	2	8	635508	635515	0 %	50 %	50 %	0 %	163846089
10041	NC_010175	AGC	2	6	635517	635522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163846089
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10044	NC_010175	ACC	2	6	635834	635839	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163846090
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10046	NC_010175	TTCG	2	8	635907	635914	0 %	50 %	25 %	25 %	163846090
10047	NC_010175	ACCAA	2	10	635915	635924	60 %	0 %	0 %	40 %	163846090
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10049	NC_010175	ACTC	2	8	635979	635986	25 %	25 %	0 %	50 %	163846090
10050	NC_010175	ACGC	2	8	635998	636005	25 %	0 %	25 %	50 %	163846090
10051	NC_010175	CAG	3	9	636019	636027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163846090
10052	NC_010175	ACG	2	6	636073	636078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163846090
10053	NC_010175	TGC	2	6	636122	636127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163846090
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10055	NC_010175	GTCAG	2	10	636398	636407	20 %	20 %	40 %	20 %	163846091
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10061	NC_010175	CT	3	6	636756	636761	0 %	50 %	0 %	50 %	163846091
10062	NC_010175	ACG	2	6	636919	636924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163846091
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10087	NC_010175	CAGC	2	8	638703	638710	25 %	0 %	25 %	50 %	163846092
10088	NC_010175	GCC	2	6	638722	638727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163846092
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10101	NC_010175	AACCC	2	10	639435	639444	40 %	0 %	0 %	60 %	163846092
10102	NC_010175	C	6	6	639442	639447	0 %	0 %	0 %	100 %	163846092
10103	NC_010175	AG	3	6	639558	639563	50 %	0 %	50 %	0 %	163846092
10104	NC_010175	GAT	2	6	639642	639647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163846092
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10112	NC_010175	GC	3	6	640353	640358	0 %	0 %	50 %	50 %	163846093
10113	NC_010175	GGC	2	6	640364	640369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163846093
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10119	NC_010175	GAA	2	6	640665	640670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163846093
10120	NC_010175	CCA	2	6	640710	640715	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163846093
10121	NC_010175	CCT	2	6	640724	640729	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	163846093
10122	NC_010175	ATG	2	6	640791	640796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163846093
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10124	NC_010175	GCCGAT	2	12	640932	640943	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	163846093
10125	NC_010175	GTG	2	6	640975	640980	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163846093
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10151	NC_010175	TGAG	2	8	642693	642700	25 %	25 %	50 %	0 %	163846095
10152	NC_010175	GC	3	6	642820	642825	0 %	0 %	50 %	50 %	163846095
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10221	NC_010175	GTATT	2	10	647331	647340	20 %	60 %	20 %	0 %	163846098
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10225	NC_010175	GCT	2	6	647450	647455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163846099
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10230	NC_010175	GCT	2	6	647863	647868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163846099
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10232	NC_010175	AGC	2	6	647926	647931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163846099
10233	NC_010175	TGA	2	6	648015	648020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163846099
10234	NC_010175	GCT	2	6	648035	648040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163846099
10235	NC_010175	GGT	2	6	648050	648055	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163846099
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10237	NC_010175	CTC	2	6	648155	648160	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	163846099
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10354	NC_010175	TGG	2	6	654726	654731	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163846105
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10473	NC_010175	AAT	2	6	663237	663242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	163846112
10474	NC_010175	AACC	2	8	663296	663303	50 %	0 %	0 %	50 %	163846112
10475	NC_010175	CCGAT	2	10	663304	663313	20 %	20 %	20 %	40 %	163846112
10476	NC_010175	GCCGCT	2	12	663316	663327	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	163846112
10477	NC_010175	GCA	2	6	663388	663393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163846112
10478	NC_010175	GAT	2	6	663435	663440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163846112
10479	NC_010175	GC	3	6	663452	663457	0 %	0 %	50 %	50 %	163846112
10480	NC_010175	TTCA	2	8	663477	663484	25 %	50 %	0 %	25 %	163846112
10481	NC_010175	CGT	2	6	663908	663913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163846113
10482	NC_010175	AGC	2	6	664025	664030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163846113
10483	NC_010175	CG	3	6	664106	664111	0 %	0 %	50 %	50 %	163846113
10484	NC_010175	GATA	2	8	664140	664147	50 %	25 %	25 %	0 %	163846113
10485	NC_010175	GGA	2	6	664173	664178	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	163846113
10486	NC_010175	CA	3	6	664243	664248	50 %	0 %	0 %	50 %	163846113
10487	NC_010175	CG	3	6	664263	664268	0 %	0 %	50 %	50 %	163846113
10488	NC_010175	CA	3	6	664287	664292	50 %	0 %	0 %	50 %	163846113
10489	NC_010175	GCGCCA	2	12	664362	664373	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	163846113
10490	NC_010175	CAAT	2	8	664485	664492	50 %	25 %	0 %	25 %	163846113
10491	NC_010175	AAC	2	6	664596	664601	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163846114
10492	NC_010175	ACC	2	6	664610	664615	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163846114
10493	NC_010175	CTG	2	6	664646	664651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163846114
10494	NC_010175	AAC	2	6	664683	664688	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163846114
10495	NC_010175	CAT	2	6	664708	664713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163846114
10496	NC_010175	CAC	3	9	664786	664794	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163846114
10497	NC_010175	TGG	2	6	664813	664818	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163846114
10498	NC_010175	TTC	2	6	664826	664831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163846114
10499	NC_010175	TCA	2	6	664891	664896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163846114
10500	NC_010175	ATT	2	6	665029	665034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	163846115

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