MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chloroflexus aurantiacus J-10-fl chromosome

Total Repeats: 83160

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9001	NC_010175	GAT	2	6	571329	571334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163846036
9002	NC_010175	ACCA	2	8	571387	571394	50 %	0 %	0 %	50 %	163846036
9003	NC_010175	GCC	2	6	571412	571417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163846036
9004	NC_010175	CTT	2	6	571557	571562	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163846036
9005	NC_010175	GAC	2	6	571590	571595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163846036
9006	NC_010175	ATCTCC	2	12	571643	571654	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	163846036
9007	NC_010175	AC	3	6	571701	571706	50 %	0 %	0 %	50 %	163846036
9008	NC_010175	ACG	2	6	572023	572028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163846037
9009	NC_010175	GCG	2	6	572119	572124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163846037
9010	NC_010175	CAA	2	6	572126	572131	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163846037
9011	NC_010175	GCC	2	6	572134	572139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163846037
9012	NC_010175	TCA	2	6	572164	572169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163846037
9013	NC_010175	CCAC	2	8	572170	572177	25 %	0 %	0 %	75 %	163846037
9014	NC_010175	CGTG	2	8	572209	572216	0 %	25 %	50 %	25 %	163846037
9015	NC_010175	CAGCG	2	10	572228	572237	20 %	0 %	40 %	40 %	163846037
9016	NC_010175	TTC	2	6	572241	572246	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163846037
9017	NC_010175	GCC	2	6	572317	572322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163846037
9018	NC_010175	CCA	2	6	572327	572332	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163846037
9019	NC_010175	TGG	2	6	572372	572377	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163846037
9020	NC_010175	AGCC	2	8	572397	572404	25 %	0 %	25 %	50 %	163846037
9021	NC_010175	CCG	2	6	572419	572424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163846037
9022	NC_010175	CAA	2	6	572435	572440	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163846037
9023	NC_010175	GAT	2	6	572489	572494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163846037
9024	NC_010175	GCA	2	6	572503	572508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163846037
9025	NC_010175	CCA	2	6	572536	572541	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163846037
9026	NC_010175	CAG	2	6	572641	572646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163846037
9027	NC_010175	ATC	3	9	572656	572664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163846037
9028	NC_010175	AAC	2	6	572754	572759	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163846037
9029	NC_010175	TTCAGC	2	12	572798	572809	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	163846037
9030	NC_010175	TTC	2	6	572942	572947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163846038
9031	NC_010175	GGA	2	6	572958	572963	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	163846038
9032	NC_010175	GCCA	2	8	572973	572980	25 %	0 %	25 %	50 %	163846038
9033	NC_010175	ACC	2	6	573116	573121	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163846038
9034	NC_010175	ACC	2	6	573212	573217	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163846039
9035	NC_010175	AT	3	6	573219	573224	50 %	50 %	0 %	0 %	163846039
9036	NC_010175	CTG	2	6	573263	573268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163846039
9037	NC_010175	GAT	2	6	573287	573292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163846039
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9039	NC_010175	CGG	2	6	573534	573539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163846039
9040	NC_010175	GCT	2	6	573673	573678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163846039
9041	NC_010175	TCG	2	6	573804	573809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163846039
9042	NC_010175	GT	3	6	573880	573885	0 %	50 %	50 %	0 %	163846039
9043	NC_010175	GATC	2	8	573916	573923	25 %	25 %	25 %	25 %	163846039
9044	NC_010175	GC	3	6	573939	573944	0 %	0 %	50 %	50 %	163846039
9045	NC_010175	GGCG	2	8	573949	573956	0 %	0 %	75 %	25 %	163846039
9046	NC_010175	GAT	2	6	574016	574021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163846039
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9049	NC_010175	ATC	2	6	574112	574117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163846039
9050	NC_010175	GCT	3	9	574174	574182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163846039
9051	NC_010175	GCG	2	6	574212	574217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163846039
9052	NC_010175	TCA	2	6	574221	574226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163846039
9053	NC_010175	GCATC	2	10	574237	574246	20 %	20 %	20 %	40 %	163846039
9054	NC_010175	TGCC	2	8	574253	574260	0 %	25 %	25 %	50 %	163846039
9055	NC_010175	GTT	2	6	574351	574356	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163846039
9056	NC_010175	CGA	2	6	574378	574383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163846039
9057	NC_010175	CGAG	2	8	574404	574411	25 %	0 %	50 %	25 %	163846039
9058	NC_010175	GTT	2	6	574432	574437	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163846039
9059	NC_010175	ATGGA	2	10	574606	574615	40 %	20 %	40 %	0 %	163846040
9060	NC_010175	A	6	6	574645	574650	100 %	0 %	0 %	0 %	163846040
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9062	NC_010175	TGG	2	6	574726	574731	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163846040
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9065	NC_010175	CAA	2	6	574881	574886	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163846040
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9242	NC_010175	ACCG	2	8	587508	587515	25 %	0 %	25 %	50 %	163846052
9243	NC_010175	GGC	2	6	587574	587579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163846052
9244	NC_010175	TGC	2	6	587596	587601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163846052
9245	NC_010175	CGA	2	6	587606	587611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163846052
9246	NC_010175	GCGT	2	8	587728	587735	0 %	25 %	50 %	25 %	163846052
9247	NC_010175	GAT	2	6	587745	587750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163846052
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9253	NC_010175	AGC	2	6	587975	587980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163846053
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9255	NC_010175	GC	3	6	588145	588150	0 %	0 %	50 %	50 %	163846053
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9264	NC_010175	TGC	2	6	588572	588577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163846054
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9347	NC_010175	AGC	2	6	592484	592489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163846056
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9349	NC_010175	TAT	2	6	592530	592535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	163846056
9350	NC_010175	GGCA	2	8	592622	592629	25 %	0 %	50 %	25 %	163846056
9351	NC_010175	CGA	2	6	592667	592672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163846056
9352	NC_010175	ACGA	2	8	592781	592788	50 %	0 %	25 %	25 %	163846057
9353	NC_010175	GCTG	2	8	592889	592896	0 %	25 %	50 %	25 %	163846057
9354	NC_010175	ACGGCA	2	12	592936	592947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163846057
9355	NC_010175	GCT	2	6	592959	592964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163846057
9356	NC_010175	TACCGG	2	12	592976	592987	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	163846057
9357	NC_010175	AGC	2	6	593207	593212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163846057
9358	NC_010175	CA	3	6	593256	593261	50 %	0 %	0 %	50 %	163846057
9359	NC_010175	CCG	2	6	593378	593383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163846057
9360	NC_010175	CCGCTG	2	12	593461	593472	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	163846057
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