MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chloroflexus aurantiacus J-10-fl chromosome

Total Repeats: 83160

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_010175	GGTTTC	2	12	354422	354433	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	163845872
5502	NC_010175	TGC	2	6	354450	354455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845872
5503	NC_010175	AGA	2	6	354463	354468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163845872
5504	NC_010175	TCG	2	6	354493	354498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845872
5505	NC_010175	CCG	2	6	354542	354547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163845872
5506	NC_010175	AG	3	6	354550	354555	50 %	0 %	50 %	0 %	163845872
5507	NC_010175	TAT	2	6	354563	354568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	163845872
5508	NC_010175	ATT	2	6	354571	354576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	163845872
5509	NC_010175	T	6	6	354629	354634	0 %	100 %	0 %	0 %	163845872
5510	NC_010175	TCC	2	6	354760	354765	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	163845872
5511	NC_010175	ATT	2	6	354830	354835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	163845872
5512	NC_010175	TTG	2	6	354845	354850	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163845872
5513	NC_010175	GAA	2	6	354866	354871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163845872
5514	NC_010175	GCG	2	6	354897	354902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163845872
5515	NC_010175	TGA	2	6	354922	354927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163845872
5516	NC_010175	ATG	2	6	354999	355004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163845872
5517	NC_010175	TGG	2	6	355084	355089	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163845872
5518	NC_010175	TGC	2	6	355132	355137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845872
5519	NC_010175	TGG	2	6	355153	355158	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163845872
5520	NC_010175	CGC	2	6	355322	355327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163845872
5521	NC_010175	GCG	2	6	355375	355380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163845872
5522	NC_010175	GCG	2	6	355582	355587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163845873
5523	NC_010175	CGCT	2	8	355604	355611	0 %	25 %	25 %	50 %	163845873
5524	NC_010175	CAG	2	6	355642	355647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845873
5525	NC_010175	GCA	2	6	355650	355655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845873
5526	NC_010175	CCG	2	6	355671	355676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163845873
5527	NC_010175	AACC	2	8	355744	355751	50 %	0 %	0 %	50 %	163845873
5528	NC_010175	CCG	2	6	355834	355839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163845873
5529	NC_010175	TCT	2	6	355849	355854	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163845873
5530	NC_010175	GCG	2	6	355861	355866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163845873
5531	NC_010175	TGCAGA	2	12	355891	355902	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	163845873
5532	NC_010175	GGC	2	6	355914	355919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163845873
5533	NC_010175	GTG	2	6	355924	355929	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163845873
5534	NC_010175	CGC	2	6	355978	355983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163845873
5535	NC_010175	GGGC	2	8	355985	355992	0 %	0 %	75 %	25 %	163845873
5536	NC_010175	CAT	2	6	355997	356002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163845873
5537	NC_010175	GAT	2	6	356063	356068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163845873
5538	NC_010175	TCAT	2	8	356082	356089	25 %	50 %	0 %	25 %	163845873
5539	NC_010175	TTC	2	6	356148	356153	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163845873
5540	NC_010175	GGT	2	6	356154	356159	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163845873
5541	NC_010175	CGGGT	2	10	356383	356392	0 %	20 %	60 %	20 %	163845873
5542	NC_010175	GAA	2	6	356426	356431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163845873
5543	NC_010175	AGCGGT	2	12	356466	356477	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	163845873
5544	NC_010175	AGACC	2	10	358344	358353	40 %	0 %	20 %	40 %	163845874
5545	NC_010175	CGC	2	6	358463	358468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163845874
5546	NC_010175	TCT	2	6	358529	358534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163845874
5547	NC_010175	ATG	2	6	358562	358567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163845874
5548	NC_010175	CGG	2	6	358587	358592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163845874
5549	NC_010175	GCG	2	6	359457	359462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163845875
5550	NC_010175	GGC	2	6	359524	359529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163845875
5551	NC_010175	GCC	2	6	359532	359537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163845875
5552	NC_010175	ATG	2	6	359763	359768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163845875
5553	NC_010175	ACA	2	6	359898	359903	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163845875
5554	NC_010175	TCA	2	6	359913	359918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163845875
5555	NC_010175	GCC	2	6	359927	359932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163845875
5556	NC_010175	TGG	2	6	359993	359998	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163845875
5557	NC_010175	GAG	2	6	360032	360037	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	163845875
5558	NC_010175	TTC	2	6	360041	360046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163845875
5559	NC_010175	GGT	2	6	360057	360062	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163845875
5560	NC_010175	GTA	2	6	360083	360088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163845875
5561	NC_010175	AGC	2	6	360155	360160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845875
5562	NC_010175	TCG	2	6	360210	360215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845875
5563	NC_010175	CCA	2	6	360388	360393	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163845875
5564	NC_010175	TGA	2	6	363275	363280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163845876
5565	NC_010175	TGG	2	6	363343	363348	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163845876
5566	NC_010175	AC	3	6	363368	363373	50 %	0 %	0 %	50 %	163845876
5567	NC_010175	GGA	2	6	363393	363398	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	163845876
5568	NC_010175	CCG	2	6	363455	363460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163845876
5569	NC_010175	ATT	2	6	363618	363623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	163845876
5570	NC_010175	TGG	2	6	363683	363688	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163845876
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5572	NC_010175	CGA	2	6	363991	363996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845877
5573	NC_010175	TGC	2	6	364016	364021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845877
5574	NC_010175	GC	3	6	364046	364051	0 %	0 %	50 %	50 %	163845877
5575	NC_010175	ATC	2	6	364101	364106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163845877
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5577	NC_010175	TCG	2	6	364237	364242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845877
5578	NC_010175	ACG	2	6	364307	364312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845877
5579	NC_010175	AAC	2	6	364375	364380	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163845877
5580	NC_010175	CGA	2	6	364403	364408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845877
5581	NC_010175	CAG	2	6	364479	364484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845877
5582	NC_010175	G	6	6	364533	364538	0 %	0 %	100 %	0 %	163845877
5583	NC_010175	TGA	2	6	364544	364549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163845877
5584	NC_010175	GGCGC	2	10	364590	364599	0 %	0 %	60 %	40 %	163845877
5585	NC_010175	CGG	2	6	364627	364632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163845877
5586	NC_010175	GCT	2	6	364640	364645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845877
5587	NC_010175	ATC	2	6	364659	364664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163845877
5588	NC_010175	ACC	2	6	364689	364694	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163845877
5589	NC_010175	CAC	2	6	364759	364764	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163845877
5590	NC_010175	TGC	2	6	364810	364815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845877
5591	NC_010175	GTG	2	6	364903	364908	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163845877
5592	NC_010175	GCC	2	6	364965	364970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163845877
5593	NC_010175	AGC	2	6	364971	364976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845877
5594	NC_010175	GCGTG	2	10	365021	365030	0 %	20 %	60 %	20 %	163845877
5595	NC_010175	ACC	2	6	365212	365217	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163845877
5596	NC_010175	ACT	2	6	365252	365257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163845877
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5598	NC_010175	GCGG	2	8	365315	365322	0 %	0 %	75 %	25 %	163845877
5599	NC_010175	CGA	2	6	365339	365344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845877
5600	NC_010175	CAC	2	6	365350	365355	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163845877
5601	NC_010175	CGA	2	6	365377	365382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845877
5602	NC_010175	TGA	2	6	365551	365556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163845878
5603	NC_010175	GCC	2	6	365583	365588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163845878
5604	NC_010175	CGAACA	2	12	365665	365676	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	163845878
5605	NC_010175	GC	3	6	365717	365722	0 %	0 %	50 %	50 %	163845878
5606	NC_010175	GCA	2	6	365761	365766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845878
5607	NC_010175	CAA	2	6	365777	365782	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163845878
5608	NC_010175	CAG	2	6	365789	365794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845878
5609	NC_010175	GAA	2	6	365804	365809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163845878
5610	NC_010175	GCA	2	6	365884	365889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845878
5611	NC_010175	CAA	2	6	365909	365914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163845878
5612	NC_010175	CAG	2	6	365990	365995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845878
5613	NC_010175	GAC	2	6	366008	366013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845878
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5615	NC_010175	CAA	2	6	366131	366136	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163845878
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5617	NC_010175	GCCC	2	8	366186	366193	0 %	0 %	25 %	75 %	163845878
5618	NC_010175	GAG	2	6	366233	366238	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	163845878
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5742	NC_010175	GC	3	6	372164	372169	0 %	0 %	50 %	50 %	163845883
5743	NC_010175	GCCAGC	2	12	372186	372197	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	163845883
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5746	NC_010175	GAT	2	6	372281	372286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163845883
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5861	NC_010175	TGGT	2	8	380112	380119	0 %	50 %	50 %	0 %	163845890
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5863	NC_010175	ACC	2	6	380180	380185	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163845890
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5982	NC_010175	CGG	2	6	385975	385980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163845894
5983	NC_010175	GCG	2	6	386010	386015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163845894
5984	NC_010175	ACCGGC	2	12	386045	386056	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	163845894
5985	NC_010175	TGG	2	6	386079	386084	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163845894
5986	NC_010175	GCTG	2	8	386119	386126	0 %	25 %	50 %	25 %	163845894
5987	NC_010175	CGGCAA	2	12	386137	386148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845894
5988	NC_010175	GCC	2	6	386231	386236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163845894
5989	NC_010175	GAC	2	6	386302	386307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845894
5990	NC_010175	TACCGG	2	12	386380	386391	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	163845894
5991	NC_010175	AGC	2	6	386459	386464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845894
5992	NC_010175	CAC	2	6	386473	386478	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163845894
5993	NC_010175	CTAC	2	8	386512	386519	25 %	25 %	0 %	50 %	163845894
5994	NC_010175	TGA	2	6	388078	388083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163845895
5995	NC_010175	TTC	2	6	388093	388098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163845895
5996	NC_010175	TTG	2	6	388133	388138	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163845895
5997	NC_010175	GAA	2	6	388146	388151	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163845895
5998	NC_010175	GGCA	2	8	388152	388159	25 %	0 %	50 %	25 %	163845895
5999	NC_010175	AG	3	6	388235	388240	50 %	0 %	50 %	0 %	163845895
6000	NC_010175	TTC	2	6	388266	388271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163845895

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