MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chloroflexus aurantiacus J-10-fl chromosome

Total Repeats: 83160

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_010175	GC	3	6	325939	325944	0 %	0 %	50 %	50 %	163845851
5002	NC_010175	CTT	2	6	325958	325963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163845851
5003	NC_010175	GGC	2	6	325989	325994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163845851
5004	NC_010175	TCA	2	6	326005	326010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163845851
5005	NC_010175	GCCTCG	2	12	326020	326031	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	163845851
5006	NC_010175	CTG	2	6	326063	326068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845851
5007	NC_010175	GGC	3	9	326106	326114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163845851
5008	NC_010175	TCA	2	6	326125	326130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163845851
5009	NC_010175	GCCTCG	2	12	326140	326151	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	163845851
5010	NC_010175	CTG	2	6	326183	326188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845851
5011	NC_010175	GGC	3	9	326226	326234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163845851
5012	NC_010175	TCA	2	6	326245	326250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163845851
5013	NC_010175	GCCTCG	2	12	326260	326271	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	163845851
5014	NC_010175	CTG	2	6	326303	326308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845851
5015	NC_010175	GCA	2	6	326347	326352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845851
5016	NC_010175	TCG	2	6	326362	326367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845851
5017	NC_010175	GCA	2	6	326368	326373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845851
5018	NC_010175	GCCTCG	2	12	326377	326388	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	163845851
5019	NC_010175	CTG	2	6	326420	326425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845851
5020	NC_010175	GCA	2	6	326464	326469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845851
5021	NC_010175	TCG	2	6	326479	326484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845851
5022	NC_010175	GCCTCG	2	12	326494	326505	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	163845851
5023	NC_010175	CTG	2	6	326537	326542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845851
5024	NC_010175	GGCAGC	2	12	326580	326591	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	163845851
5025	NC_010175	TCA	2	6	326599	326604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163845851
5026	NC_010175	GCCTCG	2	12	326614	326625	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	163845851
5027	NC_010175	GC	3	6	326650	326655	0 %	0 %	50 %	50 %	163845851
5028	NC_010175	CTT	2	6	326669	326674	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163845851
5029	NC_010175	GGC	2	6	326700	326705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163845851
5030	NC_010175	AGC	2	6	326706	326711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845851
5031	NC_010175	TCA	2	6	326719	326724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163845851
5032	NC_010175	CAGA	2	8	326813	326820	50 %	0 %	25 %	25 %	163845851
5033	NC_010175	ACA	2	6	326842	326847	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163845851
5034	NC_010175	AGA	2	6	326910	326915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163845851
5035	NC_010175	AGC	2	6	326926	326931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845851
5036	NC_010175	TCA	2	6	326977	326982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163845851
5037	NC_010175	GAG	2	6	327049	327054	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	163845851
5038	NC_010175	GCA	2	6	327097	327102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845851
5039	NC_010175	ATC	2	6	327117	327122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163845851
5040	NC_010175	CTTC	2	8	327179	327186	0 %	50 %	0 %	50 %	163845851
5041	NC_010175	GTC	2	6	327202	327207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845851
5042	NC_010175	ACTCA	2	10	327252	327261	40 %	20 %	0 %	40 %	163845851
5043	NC_010175	CTG	2	6	327320	327325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845851
5044	NC_010175	TCGG	2	8	327370	327377	0 %	25 %	50 %	25 %	163845851
5045	NC_010175	TCG	2	6	327404	327409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845851
5046	NC_010175	TGG	2	6	327411	327416	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163845851
5047	NC_010175	C	6	6	327454	327459	0 %	0 %	0 %	100 %	163845851
5048	NC_010175	CAGC	2	8	327468	327475	25 %	0 %	25 %	50 %	163845851
5049	NC_010175	CGG	2	6	327507	327512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163845851
5050	NC_010175	ACC	2	6	327525	327530	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163845851
5051	NC_010175	GCG	2	6	327541	327546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163845851
5052	NC_010175	GCCA	2	8	327592	327599	25 %	0 %	25 %	50 %	163845851
5053	NC_010175	GGTTCA	2	12	327640	327651	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	163845851
5054	NC_010175	CAGG	2	8	327658	327665	25 %	0 %	50 %	25 %	163845851
5055	NC_010175	TCA	2	6	327736	327741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163845851
5056	NC_010175	GCG	2	6	327742	327747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163845851
5057	NC_010175	GGT	2	6	327787	327792	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163845851
5058	NC_010175	CCA	2	6	327883	327888	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163845852
5059	NC_010175	AGC	2	6	327909	327914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845852
5060	NC_010175	CG	3	6	327919	327924	0 %	0 %	50 %	50 %	163845852
5061	NC_010175	ATT	2	6	327972	327977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	163845852
5062	NC_010175	TGG	2	6	327992	327997	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163845852
5063	NC_010175	AAT	2	6	328004	328009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	163845852
5064	NC_010175	GC	3	6	328068	328073	0 %	0 %	50 %	50 %	163845852
5065	NC_010175	A	6	6	328091	328096	100 %	0 %	0 %	0 %	163845852
5066	NC_010175	AGC	2	6	328101	328106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845852
5067	NC_010175	GGC	2	6	328118	328123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163845852
5068	NC_010175	AGA	2	6	328216	328221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163845852
5069	NC_010175	CAC	2	6	328235	328240	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163845852
5070	NC_010175	ACG	2	6	328298	328303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845852
5071	NC_010175	AC	3	6	328318	328323	50 %	0 %	0 %	50 %	163845852
5072	NC_010175	TGC	2	6	328361	328366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845852
5073	NC_010175	TACT	2	8	328393	328400	25 %	50 %	0 %	25 %	163845852
5074	NC_010175	AGC	2	6	328425	328430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845852
5075	NC_010175	AGTA	2	8	328608	328615	50 %	25 %	25 %	0 %	163845853
5076	NC_010175	CAG	2	6	328655	328660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845853
5077	NC_010175	GCG	2	6	328688	328693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163845853
5078	NC_010175	ATC	2	6	328702	328707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163845853
5079	NC_010175	GCC	2	6	328774	328779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163845853
5080	NC_010175	CAG	2	6	328853	328858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845853
5081	NC_010175	ACC	2	6	328951	328956	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163845853
5082	NC_010175	GGC	2	6	329031	329036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163845853
5083	NC_010175	GA	3	6	329122	329127	50 %	0 %	50 %	0 %	163845853
5084	NC_010175	GTC	2	6	329135	329140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845853
5085	NC_010175	GC	3	6	329154	329159	0 %	0 %	50 %	50 %	163845853
5086	NC_010175	AGAGC	2	10	329161	329170	40 %	0 %	40 %	20 %	163845853
5087	NC_010175	GCA	2	6	329171	329176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845853
5088	NC_010175	AG	3	6	329217	329222	50 %	0 %	50 %	0 %	163845853
5089	NC_010175	ATG	2	6	329232	329237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163845853
5090	NC_010175	CCAGA	2	10	329241	329250	40 %	0 %	20 %	40 %	163845853
5091	NC_010175	AAG	2	6	329278	329283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163845853
5092	NC_010175	GCA	2	6	329533	329538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845854
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5095	NC_010175	GATGA	2	10	329760	329769	40 %	20 %	40 %	0 %	163845855
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5099	NC_010175	ATC	2	6	330048	330053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163845855
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5101	NC_010175	GCG	2	6	330100	330105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163845855
5102	NC_010175	ATC	2	6	330118	330123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163845855
5103	NC_010175	CCA	2	6	330294	330299	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163845856
5104	NC_010175	GCC	2	6	330323	330328	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163845856
5105	NC_010175	CTG	3	9	330333	330341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845856
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5107	NC_010175	ACC	2	6	330508	330513	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163845856
5108	NC_010175	GGGC	2	8	330518	330525	0 %	0 %	75 %	25 %	163845856
5109	NC_010175	GAT	2	6	330541	330546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163845856
5110	NC_010175	CTG	2	6	330562	330567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845856
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5112	NC_010175	TGGC	2	8	330716	330723	0 %	25 %	50 %	25 %	163845856
5113	NC_010175	GTG	2	6	330728	330733	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163845856
5114	NC_010175	CAC	2	6	330888	330893	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163845856
5115	NC_010175	TTG	2	6	331001	331006	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163845856
5116	NC_010175	AAT	2	6	331037	331042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	163845856
5117	NC_010175	TAA	2	6	331087	331092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	163845856
5118	NC_010175	GAC	2	6	331150	331155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845856
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5120	NC_010175	GGAC	2	8	331578	331585	25 %	0 %	50 %	25 %	163845857
5121	NC_010175	GCC	2	6	331588	331593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163845857
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5481	NC_010175	ACC	2	6	351579	351584	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163845870
5482	NC_010175	CA	3	6	351670	351675	50 %	0 %	0 %	50 %	163845870
5483	NC_010175	TCG	2	6	351678	351683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845870
5484	NC_010175	TCACG	2	10	351745	351754	20 %	20 %	20 %	40 %	163845870
5485	NC_010175	ACCG	2	8	351875	351882	25 %	0 %	25 %	50 %	163845870
5486	NC_010175	A	7	7	351974	351980	100 %	0 %	0 %	0 %	163845870
5487	NC_010175	TCAG	2	8	352026	352033	25 %	25 %	25 %	25 %	163845870
5488	NC_010175	ACC	2	6	352197	352202	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163845870
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5490	NC_010175	CGA	2	6	352239	352244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845870
5491	NC_010175	CATT	2	8	352267	352274	25 %	50 %	0 %	25 %	163845870
5492	NC_010175	CAG	2	6	352988	352993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845871
5493	NC_010175	TGAT	2	8	353196	353203	25 %	50 %	25 %	0 %	163845871
5494	NC_010175	CTG	2	6	353207	353212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845871
5495	NC_010175	CGG	2	6	353218	353223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163845871
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